MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Crinalium epipsammum PCC 9333 plasmid pCRI9333.02

Total Repeats: 1041

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_019734	GCA	2	6	26471	26476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
502	NC_019734	ACA	2	6	26497	26502	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
503	NC_019734	TTAC	2	8	26510	26517	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
504	NC_019734	AGTT	2	8	26563	26570	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
505	NC_019734	TGAT	2	8	26611	26618	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
506	NC_019734	CGT	2	6	26649	26654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
507	NC_019734	CGA	2	6	26706	26711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
508	NC_019734	TGG	2	6	26713	26718	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
509	NC_019734	TTGT	2	8	26772	26779	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
510	NC_019734	AAC	2	6	26851	26856	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
511	NC_019734	TTC	2	6	26876	26881	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
512	NC_019734	TGG	2	6	26884	26889	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
513	NC_019734	CCG	2	6	26917	26922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
514	NC_019734	CAA	2	6	26949	26954	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
515	NC_019734	AGGG	2	8	27021	27028	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
516	NC_019734	GAC	2	6	27233	27238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
517	NC_019734	CGT	2	6	27327	27332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
518	NC_019734	CTG	2	6	27340	27345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
519	NC_019734	AGC	2	6	27356	27361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
520	NC_019734	CTT	2	6	27403	27408	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
521	NC_019734	GCG	3	9	27429	27437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
522	NC_019734	GTA	2	6	27442	27447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
523	NC_019734	TGG	2	6	27506	27511	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
524	NC_019734	ATC	2	6	27520	27525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
525	NC_019734	TTA	2	6	27562	27567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
526	NC_019734	CT	3	6	27682	27687	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
527	NC_019734	GTG	2	6	27849	27854	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
528	NC_019734	AT	3	6	27986	27991	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_019734	T	6	6	28055	28060	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_019734	T	6	6	28071	28076	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
531	NC_019734	TAG	2	6	28144	28149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
532	NC_019734	GCA	2	6	28196	28201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
533	NC_019734	TGG	2	6	28294	28299	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
534	NC_019734	CCG	2	6	28314	28319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
535	NC_019734	T	6	6	28404	28409	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_019734	CTG	2	6	28485	28490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308317
537	NC_019734	GT	3	6	28494	28499	0 %	50 %	50 %	0 %	428308317
538	NC_019734	CGC	2	6	28593	28598	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428308317
539	NC_019734	TTG	2	6	28628	28633	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308317
540	NC_019734	AGT	2	6	28664	28669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308317
541	NC_019734	TCA	2	6	28670	28675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308317
542	NC_019734	GGC	2	6	28680	28685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428308317
543	NC_019734	T	6	6	28686	28691	0 %	100 %	0 %	0 %	428308317
544	NC_019734	GTA	2	6	28746	28751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308317
545	NC_019734	CAT	2	6	28764	28769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308317
546	NC_019734	ATT	2	6	28864	28869	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308318
547	NC_019734	GGC	2	6	28915	28920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428308318
548	NC_019734	ACAAT	2	10	28976	28985	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
549	NC_019734	TAA	2	6	29010	29015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_019734	CGC	2	6	29063	29068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428308319
551	NC_019734	ATGG	2	8	29094	29101	25 %	25 %	50 %	0 %	428308319
552	NC_019734	GCA	2	6	29121	29126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308319
553	NC_019734	ACC	2	6	29187	29192	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428308319
554	NC_019734	A	7	7	29246	29252	100 %	0 %	0 %	0 %	428308319
555	NC_019734	AGG	2	6	29296	29301	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
556	NC_019734	TCG	2	6	29387	29392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308320
557	NC_019734	CAG	2	6	29406	29411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308320
558	NC_019734	AGG	2	6	29469	29474	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
559	NC_019734	AAC	2	6	29483	29488	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
560	NC_019734	T	9	9	29544	29552	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NC_019734	ACC	2	6	29607	29612	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
562	NC_019734	GTCTT	2	10	29641	29650	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
563	NC_019734	TAT	2	6	29652	29657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_019734	T	8	8	29695	29702	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
565	NC_019734	T	7	7	29706	29712	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NC_019734	AAAT	2	8	29716	29723	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_019734	CT	3	6	29765	29770	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
568	NC_019734	TA	5	10	29828	29837	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_019734	GGT	2	6	29838	29843	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
570	NC_019734	AC	4	8	29926	29933	50 %	0 %	0 %	50 %	428308321
571	NC_019734	A	6	6	29974	29979	100 %	0 %	0 %	0 %	428308321
572	NC_019734	AAT	2	6	30028	30033	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308321
573	NC_019734	CTG	2	6	30045	30050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308321
574	NC_019734	TCGC	2	8	30074	30081	0 %	25 %	25 %	50 %	428308321
575	NC_019734	GAA	2	6	30103	30108	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308321
576	NC_019734	AC	3	6	30228	30233	50 %	0 %	0 %	50 %	428308321
577	NC_019734	TAG	2	6	30251	30256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308321
578	NC_019734	TAC	2	6	30288	30293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308321
579	NC_019734	TAA	2	6	30339	30344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308321
580	NC_019734	GATT	2	8	30369	30376	25 %	50 %	25 %	0 %	428308321
581	NC_019734	A	6	6	30415	30420	100 %	0 %	0 %	0 %	428308321
582	NC_019734	CAAA	2	8	30428	30435	75 %	0 %	0 %	25 %	428308321
583	NC_019734	AGA	2	6	30513	30518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308321
584	NC_019734	ACA	2	6	30527	30532	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308321
585	NC_019734	CAT	2	6	30585	30590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308321
586	NC_019734	AGC	2	6	30612	30617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308321
587	NC_019734	ACT	2	6	30690	30695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308321
588	NC_019734	TAACAA	3	18	31011	31028	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	428308321
589	NC_019734	ATAACA	2	12	31046	31057	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	428308321
590	NC_019734	GAC	2	6	31108	31113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308321
591	NC_019734	AAACA	2	10	31123	31132	80 %	0 %	0 %	20 %	428308321
592	NC_019734	CTG	2	6	31196	31201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308321
593	NC_019734	GCT	2	6	31323	31328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308321
594	NC_019734	ATT	2	6	31336	31341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308321
595	NC_019734	AGA	2	6	31383	31388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308321
596	NC_019734	GGTTG	2	10	31390	31399	0 %	40 %	60 %	0 %	428308321
597	NC_019734	CAA	2	6	31419	31424	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308321
598	NC_019734	TAC	2	6	31564	31569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308321
599	NC_019734	ATT	2	6	31592	31597	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308321
600	NC_019734	T	6	6	31622	31627	0 %	100 %	0 %	0 %	428308321
601	NC_019734	GTG	2	6	31811	31816	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428308321
602	NC_019734	TCT	2	6	31817	31822	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428308321
603	NC_019734	A	6	6	31985	31990	100 %	0 %	0 %	0 %	428308321
604	NC_019734	ATC	2	6	32024	32029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308321
605	NC_019734	CAT	2	6	32148	32153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308321
606	NC_019734	CCAC	2	8	32206	32213	25 %	0 %	0 %	75 %	428308321
607	NC_019734	ACG	2	6	32240	32245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308321
608	NC_019734	AGA	2	6	32301	32306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308321
609	NC_019734	TGC	2	6	32330	32335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308321
610	NC_019734	TGA	3	9	32670	32678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308321
611	NC_019734	TGG	2	6	32691	32696	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428308321
612	NC_019734	CGG	2	6	32697	32702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428308321
613	NC_019734	TCC	3	9	32712	32720	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428308321
614	NC_019734	TGG	2	6	32733	32738	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428308321
615	NC_019734	AAC	2	6	32802	32807	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308321
616	NC_019734	A	6	6	32876	32881	100 %	0 %	0 %	0 %	428308321
617	NC_019734	AAAC	2	8	32899	32906	75 %	0 %	0 %	25 %	428308321
618	NC_019734	TCAA	2	8	32991	32998	50 %	25 %	0 %	25 %	428308321
619	NC_019734	GCC	2	6	33003	33008	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428308321
620	NC_019734	AGG	2	6	33029	33034	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428308321
621	NC_019734	AGC	2	6	33093	33098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308321
622	NC_019734	A	7	7	33124	33130	100 %	0 %	0 %	0 %	428308321
623	NC_019734	CAA	3	9	33184	33192	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308321
624	NC_019734	TGA	2	6	33285	33290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308321
625	NC_019734	TGG	2	6	33360	33365	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428308321
626	NC_019734	GA	4	8	33566	33573	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
627	NC_019734	CTG	2	6	33656	33661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
628	NC_019734	AAT	2	6	33686	33691	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
629	NC_019734	ACA	2	6	33702	33707	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
630	NC_019734	T	6	6	33719	33724	0 %	100 %	0 %	0 %	428308322
631	NC_019734	TCT	2	6	33742	33747	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428308322
632	NC_019734	T	6	6	33865	33870	0 %	100 %	0 %	0 %	428308322
633	NC_019734	GCT	2	6	33901	33906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308322
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764	NC_019734	A	6	6	40818	40823	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
765	NC_019734	TTA	2	6	40869	40874	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308330
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