MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Crinalium epipsammum PCC 9333 plasmid pCRI9333.01

Total Repeats: 1108

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_019733	CAAT	2	8	49143	49150	50 %	25 %	0 %	25 %	428308285
1002	NC_019733	AAAG	2	8	49167	49174	75 %	0 %	25 %	0 %	428308285
1003	NC_019733	TCT	2	6	49421	49426	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428308285
1004	NC_019733	TTC	2	6	49571	49576	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428308285
1005	NC_019733	CTT	2	6	49578	49583	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428308285
1006	NC_019733	GTT	2	6	49588	49593	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308285
1007	NC_019733	TAG	2	6	49695	49700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308285
1008	NC_019733	GCT	2	6	49707	49712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308285
1009	NC_019733	TAA	2	6	49768	49773	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308285
1010	NC_019733	CTG	2	6	49798	49803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308285
1011	NC_019733	GTT	2	6	49837	49842	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308285
1012	NC_019733	CAC	2	6	49879	49884	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428308285
1013	NC_019733	CAAT	2	8	49919	49926	50 %	25 %	0 %	25 %	428308285
1014	NC_019733	GCA	2	6	49942	49947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308285
1015	NC_019733	ATA	2	6	49949	49954	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308285
1016	NC_019733	TTA	2	6	49968	49973	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308285
1017	NC_019733	CCG	2	6	50058	50063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428308285
1018	NC_019733	CAA	2	6	50088	50093	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308285
1019	NC_019733	TCA	2	6	50156	50161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308285
1020	NC_019733	CTG	2	6	50229	50234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308285
1021	NC_019733	CTA	2	6	50355	50360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308285
1022	NC_019733	CAA	2	6	50430	50435	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308285
1023	NC_019733	CGG	2	6	50445	50450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428308285
1024	NC_019733	AAAG	2	8	50462	50469	75 %	0 %	25 %	0 %	428308285
1025	NC_019733	ATC	2	6	50488	50493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308285
1026	NC_019733	TCG	2	6	50507	50512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308285
1027	NC_019733	TTG	2	6	50522	50527	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308285
1028	NC_019733	TTG	2	6	50608	50613	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308285
1029	NC_019733	CTG	2	6	50631	50636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308285
1030	NC_019733	CCA	2	6	50791	50796	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428308285
1031	NC_019733	GGTT	2	8	50840	50847	0 %	50 %	50 %	0 %	428308285
1032	NC_019733	TGC	2	6	50866	50871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308285
1033	NC_019733	CTGC	2	8	50918	50925	0 %	25 %	25 %	50 %	428308285
1034	NC_019733	TTC	2	6	50952	50957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428308285
1035	NC_019733	CCA	2	6	51004	51009	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428308285
1036	NC_019733	GACCC	2	10	51018	51027	20 %	0 %	20 %	60 %	428308285
1037	NC_019733	TGC	2	6	51079	51084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308285
1038	NC_019733	GAGT	2	8	51106	51113	25 %	25 %	50 %	0 %	428308285
1039	NC_019733	CTGC	2	8	51131	51138	0 %	25 %	25 %	50 %	428308285
1040	NC_019733	ATTT	2	8	51150	51157	25 %	75 %	0 %	0 %	428308285
1041	NC_019733	CCA	2	6	51217	51222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428308285
1042	NC_019733	GACCC	2	10	51231	51240	20 %	0 %	20 %	60 %	428308285
1043	NC_019733	GAGT	2	8	51319	51326	25 %	25 %	50 %	0 %	428308285
1044	NC_019733	TGC	2	6	51348	51353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308285
1045	NC_019733	T	6	6	51370	51375	0 %	100 %	0 %	0 %	428308285
1046	NC_019733	CTG	2	6	51453	51458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308285
1047	NC_019733	CTA	2	6	51507	51512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308285
1048	NC_019733	CG	3	6	51563	51568	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1049	NC_019733	ACC	2	6	51587	51592	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1050	NC_019733	ATT	2	6	51689	51694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_019733	TTA	2	6	51710	51715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_019733	AAC	2	6	51783	51788	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1053	NC_019733	AAG	2	6	51829	51834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_019733	TTG	2	6	51844	51849	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_019733	TGA	2	6	51932	51937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_019733	TAA	2	6	52009	52014	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_019733	GTTT	2	8	52092	52099	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_019733	CAG	2	6	52106	52111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1059	NC_019733	TTC	2	6	52205	52210	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1060	NC_019733	A	6	6	52215	52220	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_019733	TAAT	2	8	52276	52283	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_019733	TC	3	6	52347	52352	0 %	50 %	0 %	50 %	428308286
1063	NC_019733	AAG	2	6	52439	52444	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308286
1064	NC_019733	TCG	2	6	52456	52461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308286
1065	NC_019733	TTG	2	6	52569	52574	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308286
1066	NC_019733	AT	3	6	52600	52605	50 %	50 %	0 %	0 %	428308286
1067	NC_019733	TG	3	6	52619	52624	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_019733	TAA	2	6	52635	52640	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_019733	CTT	2	6	52661	52666	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428308287
1070	NC_019733	TGC	2	6	52695	52700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308287
1071	NC_019733	CTT	2	6	52706	52711	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428308287
1072	NC_019733	TTAC	2	8	52783	52790	25 %	50 %	0 %	25 %	428308287
1073	NC_019733	GGT	2	6	52957	52962	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428308287
1074	NC_019733	TGT	2	6	52996	53001	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308287
1075	NC_019733	TG	3	6	53029	53034	0 %	50 %	50 %	0 %	428308287
1076	NC_019733	TTGAT	2	10	53089	53098	20 %	60 %	20 %	0 %	428308287
1077	NC_019733	GTT	2	6	53134	53139	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308287
1078	NC_019733	TGA	2	6	53232	53237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308287
1079	NC_019733	AATC	2	8	53304	53311	50 %	25 %	0 %	25 %	428308287
1080	NC_019733	CAA	2	6	53332	53337	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308288
1081	NC_019733	ATC	2	6	53411	53416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308288
1082	NC_019733	GCA	2	6	53448	53453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308288
1083	NC_019733	AACT	2	8	53549	53556	50 %	25 %	0 %	25 %	428308288
1084	NC_019733	CAG	2	6	53670	53675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308289
1085	NC_019733	TGA	2	6	53816	53821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308289
1086	NC_019733	ACA	2	6	53822	53827	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308289
1087	NC_019733	CTTT	2	8	53865	53872	0 %	75 %	0 %	25 %	428308289
1088	NC_019733	GT	3	6	53873	53878	0 %	50 %	50 %	0 %	428308289
1089	NC_019733	TG	3	6	53897	53902	0 %	50 %	50 %	0 %	428308289
1090	NC_019733	TAC	2	6	53956	53961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308289
1091	NC_019733	TG	3	6	53994	53999	0 %	50 %	50 %	0 %	428308289
1092	NC_019733	AGC	2	6	54022	54027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308289
1093	NC_019733	CCA	2	6	54107	54112	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428308289
1094	NC_019733	TTGAT	2	10	54154	54163	20 %	60 %	20 %	0 %	428308290
1095	NC_019733	TGC	2	6	54199	54204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308290
1096	NC_019733	TTC	2	6	54301	54306	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428308290
1097	NC_019733	AGC	2	6	54340	54345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308290
1098	NC_019733	AGA	2	6	54495	54500	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308290
1099	NC_019733	TTG	2	6	54508	54513	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308290
1100	NC_019733	CAA	2	6	54546	54551	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308290
1101	NC_019733	AATA	2	8	54621	54628	75 %	25 %	0 %	0 %	428308290
1102	NC_019733	GCC	2	6	54641	54646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428308291
1103	NC_019733	CTG	3	9	54711	54719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308291
1104	NC_019733	TTG	2	6	54732	54737	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308291
1105	NC_019733	CAG	2	6	54813	54818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308291
1106	NC_019733	AG	3	6	54817	54822	50 %	0 %	50 %	0 %	428308291
1107	NC_019733	TCC	2	6	54865	54870	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1108	NC_019733	TA	4	8	54918	54925	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

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