MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Crinalium epipsammum PCC 9333 plasmid pCRI9333.01

Total Repeats: 1108

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_019733	ATAC	2	8	24970	24977	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
502	NC_019733	ACT	2	6	25062	25067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308269
503	NC_019733	GTAAAA	2	12	25140	25151	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	428308269
504	NC_019733	A	6	6	25148	25153	100 %	0 %	0 %	0 %	428308269
505	NC_019733	TGG	2	6	25168	25173	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428308269
506	NC_019733	AGA	2	6	25199	25204	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308269
507	NC_019733	AC	3	6	25284	25289	50 %	0 %	0 %	50 %	428308269
508	NC_019733	GA	3	6	25344	25349	50 %	0 %	50 %	0 %	428308269
509	NC_019733	TTGG	2	8	25356	25363	0 %	50 %	50 %	0 %	428308269
510	NC_019733	T	6	6	25381	25386	0 %	100 %	0 %	0 %	428308269
511	NC_019733	CTT	2	6	25420	25425	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428308269
512	NC_019733	AC	3	6	25548	25553	50 %	0 %	0 %	50 %	428308269
513	NC_019733	AGA	2	6	25599	25604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308269
514	NC_019733	GCA	2	6	25608	25613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308269
515	NC_019733	T	7	7	25777	25783	0 %	100 %	0 %	0 %	428308269
516	NC_019733	TCT	2	6	25789	25794	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428308269
517	NC_019733	ATT	2	6	25820	25825	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308269
518	NC_019733	TTC	2	6	25856	25861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428308269
519	NC_019733	AAG	2	6	25864	25869	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308269
520	NC_019733	GTA	2	6	25930	25935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308269
521	NC_019733	TGG	2	6	25968	25973	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428308269
522	NC_019733	TAA	2	6	25978	25983	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308269
523	NC_019733	CAA	2	6	26024	26029	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308269
524	NC_019733	CCT	2	6	26094	26099	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428308269
525	NC_019733	TAA	2	6	26189	26194	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308269
526	NC_019733	AAAAT	2	10	26271	26280	80 %	20 %	0 %	0 %	428308269
527	NC_019733	AGC	2	6	26301	26306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308269
528	NC_019733	AAC	2	6	26385	26390	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
529	NC_019733	CAA	2	6	26395	26400	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
530	NC_019733	GAA	2	6	26457	26462	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
531	NC_019733	T	6	6	26463	26468	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_019733	TAG	2	6	26487	26492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
533	NC_019733	ACT	2	6	26504	26509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
534	NC_019733	TGG	2	6	26524	26529	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
535	NC_019733	CAA	2	6	26592	26597	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
536	NC_019733	AAG	2	6	26635	26640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308270
537	NC_019733	TTC	2	6	26660	26665	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428308270
538	NC_019733	TCA	2	6	26670	26675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308270
539	NC_019733	GCTTG	2	10	26766	26775	0 %	40 %	40 %	20 %	428308270
540	NC_019733	T	6	6	26810	26815	0 %	100 %	0 %	0 %	428308270
541	NC_019733	GA	3	6	26816	26821	50 %	0 %	50 %	0 %	428308270
542	NC_019733	AT	3	6	26895	26900	50 %	50 %	0 %	0 %	428308270
543	NC_019733	ATT	2	6	26922	26927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308270
544	NC_019733	CAATC	2	10	26969	26978	40 %	20 %	0 %	40 %	428308270
545	NC_019733	ATGA	2	8	26983	26990	50 %	25 %	25 %	0 %	428308270
546	NC_019733	AAT	2	6	26998	27003	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308270
547	NC_019733	CTT	2	6	27113	27118	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428308270
548	NC_019733	GCT	2	6	27133	27138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308270
549	NC_019733	CAG	2	6	27145	27150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308270
550	NC_019733	ATT	2	6	27207	27212	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308270
551	NC_019733	CTCCA	2	10	27214	27223	20 %	20 %	0 %	60 %	428308270
552	NC_019733	AAT	2	6	27278	27283	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308270
553	NC_019733	TGC	2	6	27330	27335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308270
554	NC_019733	GA	3	6	27352	27357	50 %	0 %	50 %	0 %	428308270
555	NC_019733	A	6	6	27386	27391	100 %	0 %	0 %	0 %	428308270
556	NC_019733	CCAAAT	2	12	27462	27473	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	428308270
557	NC_019733	C	6	6	27482	27487	0 %	0 %	0 %	100 %	428308270
558	NC_019733	GACA	2	8	27551	27558	50 %	0 %	25 %	25 %	428308270
559	NC_019733	C	6	6	27562	27567	0 %	0 %	0 %	100 %	428308270
560	NC_019733	AT	3	6	27571	27576	50 %	50 %	0 %	0 %	428308270
561	NC_019733	CAT	2	6	27662	27667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308270
562	NC_019733	ATA	3	9	27676	27684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308270
563	NC_019733	GGA	2	6	27685	27690	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428308270
564	NC_019733	GCA	2	6	27847	27852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308270
565	NC_019733	AACC	2	8	27877	27884	50 %	0 %	0 %	50 %	428308270
566	NC_019733	A	6	6	27885	27890	100 %	0 %	0 %	0 %	428308270
567	NC_019733	TGG	2	6	27970	27975	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428308270
568	NC_019733	ATG	2	6	28020	28025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308270
569	NC_019733	ACT	2	6	28094	28099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308270
570	NC_019733	CGG	2	6	28128	28133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428308270
571	NC_019733	GTA	2	6	28252	28257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308270
572	NC_019733	AAACCA	2	12	28269	28280	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308270
573	NC_019733	ACAA	2	8	28302	28309	75 %	0 %	0 %	25 %	428308270
574	NC_019733	TTA	2	6	28391	28396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
575	NC_019733	TTC	2	6	28437	28442	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
576	NC_019733	CTTT	2	8	28456	28463	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
577	NC_019733	CTA	2	6	28591	28596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308271
578	NC_019733	CTT	2	6	28630	28635	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428308271
579	NC_019733	AGAT	2	8	28757	28764	50 %	25 %	25 %	0 %	428308271
580	NC_019733	T	6	6	28801	28806	0 %	100 %	0 %	0 %	428308271
581	NC_019733	TCT	2	6	28833	28838	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428308271
582	NC_019733	T	6	6	28855	28860	0 %	100 %	0 %	0 %	428308271
583	NC_019733	AT	3	6	28872	28877	50 %	50 %	0 %	0 %	428308271
584	NC_019733	AAC	2	6	28895	28900	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308271
585	NC_019733	TTA	2	6	28911	28916	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308271
586	NC_019733	CCA	2	6	28950	28955	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428308271
587	NC_019733	GAA	2	6	28967	28972	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308271
588	NC_019733	TCA	2	6	28986	28991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308271
589	NC_019733	CAG	2	6	29002	29007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308271
590	NC_019733	AAT	2	6	29018	29023	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308271
591	NC_019733	TAA	2	6	29143	29148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308271
592	NC_019733	TAG	2	6	29238	29243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308271
593	NC_019733	CAAT	2	8	29262	29269	50 %	25 %	0 %	25 %	428308271
594	NC_019733	GGAC	2	8	29286	29293	25 %	0 %	50 %	25 %	428308271
595	NC_019733	AAC	2	6	29392	29397	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308271
596	NC_019733	TGG	2	6	29398	29403	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428308271
597	NC_019733	A	6	6	29604	29609	100 %	0 %	0 %	0 %	428308271
598	NC_019733	CAAG	2	8	29616	29623	50 %	0 %	25 %	25 %	428308271
599	NC_019733	TCT	2	6	29631	29636	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428308271
600	NC_019733	TTC	2	6	29666	29671	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428308272
601	NC_019733	AAT	2	6	29679	29684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308272
602	NC_019733	TGG	2	6	29700	29705	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428308272
603	NC_019733	AG	3	6	29708	29713	50 %	0 %	50 %	0 %	428308272
604	NC_019733	CAT	2	6	29727	29732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308272
605	NC_019733	GGCA	2	8	29781	29788	25 %	0 %	50 %	25 %	428308272
606	NC_019733	CCA	2	6	29831	29836	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428308272
607	NC_019733	TCA	2	6	29874	29879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308272
608	NC_019733	TGC	2	6	29940	29945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308272
609	NC_019733	TGC	2	6	29997	30002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308272
610	NC_019733	GCA	2	6	30059	30064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308272
611	NC_019733	AAAGGA	2	12	30121	30132	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308272
612	NC_019733	GTG	2	6	30145	30150	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428308272
613	NC_019733	TTC	2	6	30157	30162	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428308272
614	NC_019733	TTCC	2	8	30187	30194	0 %	50 %	0 %	50 %	428308272
615	NC_019733	CAA	2	6	30300	30305	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308272
616	NC_019733	CAG	2	6	30307	30312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308272
617	NC_019733	TCC	2	6	30316	30321	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428308272
618	NC_019733	ATGGGT	2	12	30374	30385	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	428308272
619	NC_019733	CAAA	2	8	30528	30535	75 %	0 %	0 %	25 %	428308272
620	NC_019733	AAT	2	6	30559	30564	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308272
621	NC_019733	GGCAT	2	10	30586	30595	20 %	20 %	40 %	20 %	428308272
622	NC_019733	TCA	2	6	30618	30623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308272
623	NC_019733	T	6	6	30636	30641	0 %	100 %	0 %	0 %	428308273
624	NC_019733	GCA	2	6	30683	30688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308273
625	NC_019733	CGT	2	6	30740	30745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308273
626	NC_019733	CTT	2	6	30788	30793	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428308273
627	NC_019733	GTTT	2	8	30849	30856	0 %	75 %	25 %	0 %	428308273
628	NC_019733	CTG	2	6	30929	30934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308273
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630	NC_019733	T	7	7	30961	30967	0 %	100 %	0 %	0 %	428308273
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