MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Calothrix sp. PCC 6303 plasmid pCAL6303.02

Total Repeats: 96

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019728	AG	3	6	891	896	50 %	0 %	50 %	0 %	428303568
2	NC_019728	TC	3	6	969	974	0 %	50 %	0 %	50 %	428303568
3	NC_019728	TC	3	6	1651	1656	0 %	50 %	0 %	50 %	428303569
4	NC_019728	CA	3	6	2183	2188	50 %	0 %	0 %	50 %	428303570
5	NC_019728	GA	3	6	3478	3483	50 %	0 %	50 %	0 %	428303571
6	NC_019728	CA	3	6	3630	3635	50 %	0 %	0 %	50 %	428303571
7	NC_019728	AT	3	6	3794	3799	50 %	50 %	0 %	0 %	428303571
8	NC_019728	GA	3	6	4019	4024	50 %	0 %	50 %	0 %	428303571
9	NC_019728	AT	3	6	4133	4138	50 %	50 %	0 %	0 %	428303571
10	NC_019728	TG	3	6	4544	4549	0 %	50 %	50 %	0 %	428303572
11	NC_019728	AT	3	6	4938	4943	50 %	50 %	0 %	0 %	428303572
12	NC_019728	AC	3	6	5127	5132	50 %	0 %	0 %	50 %	428303572
13	NC_019728	AG	3	6	5481	5486	50 %	0 %	50 %	0 %	428303572
14	NC_019728	TC	3	6	5546	5551	0 %	50 %	0 %	50 %	428303572
15	NC_019728	AG	3	6	5652	5657	50 %	0 %	50 %	0 %	428303572
16	NC_019728	TG	3	6	6164	6169	0 %	50 %	50 %	0 %	428303573
17	NC_019728	AT	3	6	6504	6509	50 %	50 %	0 %	0 %	428303573
18	NC_019728	TG	3	6	6590	6595	0 %	50 %	50 %	0 %	428303573
19	NC_019728	TC	4	8	6801	6808	0 %	50 %	0 %	50 %	428303574
20	NC_019728	CT	3	6	7371	7376	0 %	50 %	0 %	50 %	428303574
21	NC_019728	GA	3	6	7683	7688	50 %	0 %	50 %	0 %	428303574
22	NC_019728	TC	3	6	9619	9624	0 %	50 %	0 %	50 %	428303575
23	NC_019728	TA	3	6	9904	9909	50 %	50 %	0 %	0 %	428303575
24	NC_019728	TC	3	6	10039	10044	0 %	50 %	0 %	50 %	428303575
25	NC_019728	AC	3	6	11041	11046	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_019728	AT	3	6	11477	11482	50 %	50 %	0 %	0 %	428303577
27	NC_019728	AG	3	6	11516	11521	50 %	0 %	50 %	0 %	428303577
28	NC_019728	TG	3	6	12564	12569	0 %	50 %	50 %	0 %	428303578
29	NC_019728	AT	3	6	13051	13056	50 %	50 %	0 %	0 %	428303578
30	NC_019728	AG	3	6	13103	13108	50 %	0 %	50 %	0 %	428303578
31	NC_019728	AT	3	6	13133	13138	50 %	50 %	0 %	0 %	428303578
32	NC_019728	AC	3	6	13379	13384	50 %	0 %	0 %	50 %	428303578
33	NC_019728	TA	3	6	13573	13578	50 %	50 %	0 %	0 %	428303578
34	NC_019728	AT	3	6	13774	13779	50 %	50 %	0 %	0 %	428303578
35	NC_019728	AT	3	6	14454	14459	50 %	50 %	0 %	0 %	428303578
36	NC_019728	GA	3	6	14484	14489	50 %	0 %	50 %	0 %	428303578
37	NC_019728	TC	3	6	14738	14743	0 %	50 %	0 %	50 %	428303578
38	NC_019728	AT	3	6	15857	15862	50 %	50 %	0 %	0 %	428303579
39	NC_019728	CT	3	6	15942	15947	0 %	50 %	0 %	50 %	428303579
40	NC_019728	TA	3	6	16145	16150	50 %	50 %	0 %	0 %	428303579
41	NC_019728	CA	3	6	16638	16643	50 %	0 %	0 %	50 %	428303579
42	NC_019728	GC	3	6	17056	17061	0 %	0 %	50 %	50 %	428303579
43	NC_019728	TG	3	6	17481	17486	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_019728	TG	3	6	17974	17979	0 %	50 %	50 %	0 %	428303580
45	NC_019728	CT	3	6	20303	20308	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_019728	CA	3	6	20534	20539	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_019728	TC	3	6	22848	22853	0 %	50 %	0 %	50 %	428303582
48	NC_019728	TA	3	6	24125	24130	50 %	50 %	0 %	0 %	428303582
49	NC_019728	TA	3	6	24132	24137	50 %	50 %	0 %	0 %	428303582
50	NC_019728	TC	3	6	24211	24216	0 %	50 %	0 %	50 %	428303582
51	NC_019728	TG	3	6	24328	24333	0 %	50 %	50 %	0 %	428303582
52	NC_019728	TA	3	6	24356	24361	50 %	50 %	0 %	0 %	428303582
53	NC_019728	TA	4	8	25136	25143	50 %	50 %	0 %	0 %	428303583
54	NC_019728	GT	3	6	25274	25279	0 %	50 %	50 %	0 %	428303583
55	NC_019728	AG	3	6	25767	25772	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_019728	CT	3	6	27084	27089	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_019728	GA	3	6	27218	27223	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_019728	TC	3	6	27489	27494	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_019728	CT	3	6	28027	28032	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_019728	TC	3	6	28040	28045	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_019728	CT	3	6	28093	28098	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_019728	TC	3	6	28129	28134	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_019728	TA	3	6	29143	29148	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_019728	TA	3	6	30308	30313	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_019728	TA	3	6	31602	31607	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_019728	TC	3	6	34133	34138	0 %	50 %	0 %	50 %	428303595
67	NC_019728	AT	3	6	36371	36376	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_019728	CT	3	6	36573	36578	0 %	50 %	0 %	50 %	428303598
69	NC_019728	TG	3	6	37487	37492	0 %	50 %	50 %	0 %	428303599
70	NC_019728	CT	3	6	38414	38419	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_019728	TG	3	6	38640	38645	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_019728	AC	3	6	39520	39525	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_019728	AT	3	6	39593	39598	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_019728	TC	3	6	39719	39724	0 %	50 %	0 %	50 %	428303602
75	NC_019728	TA	5	10	40186	40195	50 %	50 %	0 %	0 %	428303602
76	NC_019728	CT	3	6	41175	41180	0 %	50 %	0 %	50 %	428303602
77	NC_019728	CG	3	6	41847	41852	0 %	0 %	50 %	50 %	428303602
78	NC_019728	TA	3	6	42892	42897	50 %	50 %	0 %	0 %	428303603
79	NC_019728	TG	3	6	43178	43183	0 %	50 %	50 %	0 %	428303604
80	NC_019728	CA	3	6	43380	43385	50 %	0 %	0 %	50 %	428303604
81	NC_019728	GA	3	6	43615	43620	50 %	0 %	50 %	0 %	428303604
82	NC_019728	TA	3	6	43921	43926	50 %	50 %	0 %	0 %	428303605
83	NC_019728	AT	3	6	43978	43983	50 %	50 %	0 %	0 %	428303605
84	NC_019728	AT	3	6	45813	45818	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_019728	GA	3	6	46498	46503	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_019728	GA	3	6	46521	46526	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_019728	GA	3	6	46724	46729	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_019728	TA	3	6	46888	46893	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_019728	AG	3	6	48639	48644	50 %	0 %	50 %	0 %	428303609
90	NC_019728	GA	4	8	48666	48673	50 %	0 %	50 %	0 %	428303609
91	NC_019728	AT	3	6	48978	48983	50 %	50 %	0 %	0 %	428303609
92	NC_019728	TA	3	6	49759	49764	50 %	50 %	0 %	0 %	428303610
93	NC_019728	AT	3	6	51600	51605	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_019728	TA	3	6	51777	51782	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_019728	TA	3	6	53492	53497	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_019728	TA	3	6	55598	55603	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.