MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Calothrix sp. PCC 6303 plasmid pCAL6303.02

Total Repeats: 1219

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_019728	TAC	2	6	45762	45767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1002	NC_019728	AT	3	6	45813	45818	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_019728	TTAA	2	8	45840	45847	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_019728	A	7	7	45856	45862	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_019728	AAT	2	6	45871	45876	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_019728	GAA	2	6	46053	46058	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303607
1007	NC_019728	A	7	7	46146	46152	100 %	0 %	0 %	0 %	428303607
1008	NC_019728	ATC	2	6	46157	46162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303607
1009	NC_019728	GATGG	2	10	46170	46179	20 %	20 %	60 %	0 %	428303607
1010	NC_019728	TAA	2	6	46277	46282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303607
1011	NC_019728	ATC	2	6	46349	46354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303607
1012	NC_019728	TCGAA	2	10	46360	46369	40 %	20 %	20 %	20 %	428303607
1013	NC_019728	ATA	2	6	46408	46413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303607
1014	NC_019728	AAAT	2	8	46478	46485	75 %	25 %	0 %	0 %	428303607
1015	NC_019728	GA	3	6	46498	46503	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_019728	GA	3	6	46521	46526	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_019728	AAT	2	6	46561	46566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_019728	AAT	2	6	46586	46591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_019728	GA	3	6	46724	46729	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_019728	GAA	2	6	46751	46756	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_019728	ATT	2	6	46768	46773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_019728	CTTT	2	8	46792	46799	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1023	NC_019728	AATG	2	8	46845	46852	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_019728	GAA	2	6	46853	46858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_019728	TA	3	6	46888	46893	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_019728	A	6	6	46902	46907	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_019728	AAAGC	2	10	47005	47014	60 %	0 %	20 %	20 %	428303608
1028	NC_019728	GCAA	2	8	47028	47035	50 %	0 %	25 %	25 %	428303608
1029	NC_019728	ACAA	2	8	47039	47046	75 %	0 %	0 %	25 %	428303608
1030	NC_019728	TAA	2	6	47052	47057	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303608
1031	NC_019728	TAA	2	6	47067	47072	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303608
1032	NC_019728	AAT	2	6	47080	47085	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303608
1033	NC_019728	AAAC	2	8	47086	47093	75 %	0 %	0 %	25 %	428303608
1034	NC_019728	AAT	2	6	47095	47100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303608
1035	NC_019728	CAA	2	6	47140	47145	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303608
1036	NC_019728	ACA	2	6	47152	47157	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303608
1037	NC_019728	ATTAGT	2	12	47175	47186	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	428303608
1038	NC_019728	CTT	2	6	47230	47235	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428303608
1039	NC_019728	GGT	2	6	47362	47367	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428303608
1040	NC_019728	GAT	2	6	47383	47388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303608
1041	NC_019728	TGG	2	6	47417	47422	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428303608
1042	NC_019728	TGC	2	6	47436	47441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303608
1043	NC_019728	TAG	2	6	47567	47572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303608
1044	NC_019728	TGG	2	6	47600	47605	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428303608
1045	NC_019728	A	6	6	47632	47637	100 %	0 %	0 %	0 %	428303608
1046	NC_019728	TTA	2	6	47674	47679	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303608
1047	NC_019728	CTA	2	6	47704	47709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303608
1048	NC_019728	ATG	2	6	47780	47785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303608
1049	NC_019728	GTAA	2	8	47794	47801	50 %	25 %	25 %	0 %	428303608
1050	NC_019728	T	6	6	47916	47921	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_019728	AGT	2	6	47931	47936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_019728	TTTA	2	8	47950	47957	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_019728	T	6	6	47997	48002	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_019728	T	6	6	48015	48020	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_019728	CTAT	2	8	48073	48080	25 %	50 %	0 %	25 %	428303609
1056	NC_019728	CAA	2	6	48083	48088	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303609
1057	NC_019728	CCATC	2	10	48124	48133	20 %	20 %	0 %	60 %	428303609
1058	NC_019728	ACC	2	6	48156	48161	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428303609
1059	NC_019728	GAAG	2	8	48207	48214	50 %	0 %	50 %	0 %	428303609
1060	NC_019728	ATT	2	6	48294	48299	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303609
1061	NC_019728	A	6	6	48301	48306	100 %	0 %	0 %	0 %	428303609
1062	NC_019728	CAG	2	6	48341	48346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303609
1063	NC_019728	AAC	2	6	48347	48352	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303609
1064	NC_019728	CAG	2	6	48362	48367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303609
1065	NC_019728	GCA	2	6	48447	48452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303609
1066	NC_019728	GCA	2	6	48459	48464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303609
1067	NC_019728	A	6	6	48529	48534	100 %	0 %	0 %	0 %	428303609
1068	NC_019728	AG	3	6	48639	48644	50 %	0 %	50 %	0 %	428303609
1069	NC_019728	GA	4	8	48666	48673	50 %	0 %	50 %	0 %	428303609
1070	NC_019728	GAT	2	6	48702	48707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303609
1071	NC_019728	AGA	2	6	48731	48736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303609
1072	NC_019728	GTC	2	6	48800	48805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303609
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1074	NC_019728	TGA	2	6	48908	48913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303609
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1081	NC_019728	ACA	2	6	49165	49170	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1082	NC_019728	TCAAG	2	10	49193	49202	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1083	NC_019728	AAT	2	6	49211	49216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_019728	A	7	7	49225	49231	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_019728	TGA	2	6	49354	49359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_019728	TGCT	2	8	49371	49378	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1087	NC_019728	ATTTG	2	10	49503	49512	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_019728	ATA	2	6	49614	49619	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303610
1089	NC_019728	TAA	2	6	49630	49635	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303610
1090	NC_019728	TTG	2	6	49645	49650	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428303610
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1093	NC_019728	CAG	2	6	49692	49697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303610
1094	NC_019728	TA	3	6	49759	49764	50 %	50 %	0 %	0 %	428303610
1095	NC_019728	A	6	6	49774	49779	100 %	0 %	0 %	0 %	428303610
1096	NC_019728	AGA	2	6	49784	49789	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303610
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1098	NC_019728	CTT	2	6	49835	49840	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428303610
1099	NC_019728	TTA	2	6	49854	49859	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303610
1100	NC_019728	ATTTT	2	10	49896	49905	20 %	80 %	0 %	0 %	428303610
1101	NC_019728	GAA	2	6	49925	49930	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303610
1102	NC_019728	A	6	6	50115	50120	100 %	0 %	0 %	0 %	428303610
1103	NC_019728	TAC	2	6	50285	50290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303610
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1105	NC_019728	AGC	2	6	50399	50404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303610
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1107	NC_019728	A	6	6	50556	50561	100 %	0 %	0 %	0 %	428303610
1108	NC_019728	ATG	2	6	50569	50574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303610
1109	NC_019728	GAA	2	6	50628	50633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303610
1110	NC_019728	A	6	6	50648	50653	100 %	0 %	0 %	0 %	428303610
1111	NC_019728	A	6	6	50662	50667	100 %	0 %	0 %	0 %	428303610
1112	NC_019728	CAG	2	6	50670	50675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303610
1113	NC_019728	A	6	6	50678	50683	100 %	0 %	0 %	0 %	428303610
1114	NC_019728	TAC	2	6	50786	50791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303610
1115	NC_019728	CAA	2	6	50865	50870	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303610
1116	NC_019728	A	6	6	50892	50897	100 %	0 %	0 %	0 %	428303610
1117	NC_019728	AAC	2	6	50935	50940	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303610
1118	NC_019728	A	6	6	51000	51005	100 %	0 %	0 %	0 %	428303610
1119	NC_019728	TAT	2	6	51036	51041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_019728	ACA	2	6	51090	51095	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303611
1121	NC_019728	TTATT	2	10	51180	51189	20 %	80 %	0 %	0 %	428303611
1122	NC_019728	TGC	2	6	51292	51297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303611
1123	NC_019728	CTT	2	6	51381	51386	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428303611
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1125	NC_019728	TTG	2	6	51448	51453	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428303611
1126	NC_019728	TAA	2	6	51489	51494	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_019728	CTAAA	2	10	51522	51531	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
1128	NC_019728	AAT	2	6	51592	51597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_019728	AT	3	6	51600	51605	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_019728	T	6	6	51642	51647	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1132	NC_019728	ACT	2	6	51768	51773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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