MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Calothrix sp. PCC 6303 plasmid pCAL6303.01

Total Repeats: 1028

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019727	TCG	2	6	177	182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303472
2	NC_019727	AGA	2	6	271	276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303472
3	NC_019727	CAT	2	6	404	409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303472
4	NC_019727	TTA	2	6	463	468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303472
5	NC_019727	GAA	2	6	475	480	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303472
6	NC_019727	ACG	2	6	506	511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303472
7	NC_019727	GCA	2	6	624	629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303472
8	NC_019727	ATC	2	6	876	881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_019727	ATT	2	6	895	900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_019727	TAG	2	6	977	982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_019727	CCA	2	6	1088	1093	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_019727	TTA	2	6	1338	1343	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303473
13	NC_019727	TGG	2	6	1375	1380	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428303473
14	NC_019727	ACT	2	6	1488	1493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303473
15	NC_019727	CTG	2	6	1573	1578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303473
16	NC_019727	ACA	2	6	1676	1681	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303473
17	NC_019727	ATT	2	6	1686	1691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303473
18	NC_019727	TCA	2	6	1793	1798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303474
19	NC_019727	GAA	2	6	1858	1863	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303474
20	NC_019727	CAG	2	6	1865	1870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303474
21	NC_019727	TCA	2	6	1918	1923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303474
22	NC_019727	TAA	2	6	2031	2036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303474
23	NC_019727	GAA	2	6	2080	2085	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303474
24	NC_019727	ATT	2	6	2153	2158	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303474
25	NC_019727	CCT	2	6	2203	2208	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428303474
26	NC_019727	CAT	2	6	2291	2296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303474
27	NC_019727	ACT	2	6	2322	2327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303474
28	NC_019727	CTT	2	6	2418	2423	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428303474
29	NC_019727	AAC	2	6	2445	2450	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303474
30	NC_019727	GAT	2	6	2481	2486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303474
31	NC_019727	AAG	2	6	2645	2650	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303474
32	NC_019727	GGA	2	6	2861	2866	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428303474
33	NC_019727	TGT	2	6	2940	2945	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428303474
34	NC_019727	TGG	2	6	2950	2955	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428303474
35	NC_019727	GAA	2	6	3073	3078	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303474
36	NC_019727	TAG	2	6	3161	3166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303474
37	NC_019727	ATT	2	6	3361	3366	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303474
38	NC_019727	GAG	2	6	3401	3406	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428303474
39	NC_019727	TAC	2	6	3470	3475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303475
40	NC_019727	ATT	2	6	3554	3559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303475
41	NC_019727	ACT	2	6	3575	3580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303475
42	NC_019727	ACG	2	6	3583	3588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303475
43	NC_019727	TGC	2	6	3679	3684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303475
44	NC_019727	AGT	2	6	3859	3864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303475
45	NC_019727	TGG	3	9	3871	3879	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428303475
46	NC_019727	GGT	2	6	3889	3894	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428303475
47	NC_019727	GAA	2	6	3944	3949	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303475
48	NC_019727	TGG	2	6	4038	4043	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428303475
49	NC_019727	AAC	2	6	4122	4127	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303475
50	NC_019727	TAC	2	6	4177	4182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303475
51	NC_019727	TAA	2	6	4399	4404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_019727	AAT	2	6	4439	4444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_019727	GAT	2	6	4458	4463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_019727	GTC	2	6	4646	4651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303476
55	NC_019727	TTC	2	6	4723	4728	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428303476
56	NC_019727	TCT	2	6	4742	4747	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428303476
57	NC_019727	AGC	2	6	4861	4866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303476
58	NC_019727	ACC	2	6	4881	4886	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428303476
59	NC_019727	CAA	2	6	5191	5196	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_019727	CAT	2	6	5213	5218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303477
61	NC_019727	TGC	2	6	5285	5290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303477
62	NC_019727	CAA	2	6	5291	5296	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303477
63	NC_019727	CTA	2	6	5307	5312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303477
64	NC_019727	CAT	2	6	5393	5398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303477
65	NC_019727	ATT	2	6	5411	5416	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303477
66	NC_019727	CTA	2	6	5455	5460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303477
67	NC_019727	TGC	2	6	5474	5479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303477
68	NC_019727	CTA	2	6	5487	5492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303477
69	NC_019727	CTG	2	6	5614	5619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303477
70	NC_019727	CTA	2	6	5676	5681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303477
71	NC_019727	CAA	2	6	5714	5719	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303477
72	NC_019727	TGC	2	6	5789	5794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303477
73	NC_019727	AAC	2	6	5803	5808	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303477
74	NC_019727	TGA	2	6	5923	5928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303477
75	NC_019727	TGG	2	6	6042	6047	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428303478
76	NC_019727	CAA	2	6	6083	6088	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303478
77	NC_019727	ATG	2	6	6266	6271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303478
78	NC_019727	TAC	2	6	6274	6279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303478
79	NC_019727	CTG	2	6	6496	6501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303478
80	NC_019727	ATG	2	6	6629	6634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303478
81	NC_019727	ATG	2	6	6662	6667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303478
82	NC_019727	GAA	2	6	6711	6716	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303478
83	NC_019727	AAT	2	6	6724	6729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303478
84	NC_019727	AGA	2	6	6741	6746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303478
85	NC_019727	CCG	2	6	6791	6796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428303478
86	NC_019727	TTA	2	6	6823	6828	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303478
87	NC_019727	CAA	2	6	6847	6852	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303478
88	NC_019727	ATC	2	6	6999	7004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303478
89	NC_019727	ACC	2	6	7020	7025	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428303478
90	NC_019727	GCT	2	6	7033	7038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303478
91	NC_019727	GAT	2	6	7090	7095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303478
92	NC_019727	ATT	2	6	7122	7127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303478
93	NC_019727	CTT	2	6	7144	7149	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428303478
94	NC_019727	ATT	2	6	7174	7179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_019727	ATA	2	6	7260	7265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_019727	CAT	2	6	7340	7345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303479
97	NC_019727	CGT	2	6	7380	7385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303479
98	NC_019727	ATT	2	6	7444	7449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303479
99	NC_019727	TAA	3	9	7550	7558	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303479
100	NC_019727	CAA	2	6	7809	7814	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303479
101	NC_019727	ATG	2	6	7858	7863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303479
102	NC_019727	AGC	2	6	7880	7885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303479
103	NC_019727	AAC	2	6	7960	7965	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303479
104	NC_019727	AGA	2	6	7994	7999	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303479
105	NC_019727	CTG	2	6	8040	8045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303479
106	NC_019727	ACG	2	6	8090	8095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303479
107	NC_019727	ACC	2	6	8160	8165	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428303479
108	NC_019727	GAA	2	6	8220	8225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303479
109	NC_019727	TCA	2	6	8425	8430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303480
110	NC_019727	GAT	2	6	8458	8463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303480
111	NC_019727	AAT	2	6	8659	8664	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303480
112	NC_019727	GTT	2	6	8687	8692	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428303480
113	NC_019727	TGC	2	6	8870	8875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303480
114	NC_019727	ATA	2	6	8901	8906	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303480
115	NC_019727	TCA	2	6	8953	8958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303480
116	NC_019727	TTG	2	6	8966	8971	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428303480
117	NC_019727	TTA	2	6	8973	8978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303480
118	NC_019727	GAC	2	6	9053	9058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303480
119	NC_019727	CTT	2	6	9251	9256	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428303480
120	NC_019727	ACA	2	6	9381	9386	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303480
121	NC_019727	ATC	2	6	9440	9445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303480
122	NC_019727	TTC	2	6	9473	9478	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428303480
123	NC_019727	GCT	2	6	9501	9506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303480
124	NC_019727	GTT	2	6	9507	9512	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428303480
125	NC_019727	ATA	2	6	9519	9524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303480
126	NC_019727	CTG	2	6	9598	9603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303480
127	NC_019727	TTG	2	6	9691	9696	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428303480
128	NC_019727	AGT	2	6	9813	9818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303480
129	NC_019727	TTC	2	6	9902	9907	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428303480
130	NC_019727	CTT	2	6	9922	9927	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428303480
131	NC_019727	CTA	2	6	10084	10089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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256	NC_019727	TGT	2	6	20102	20107	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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381	NC_019727	TTA	2	6	30166	30171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
382	NC_019727	CAA	2	6	30210	30215	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
383	NC_019727	TGC	2	6	30293	30298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303496
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