MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chroococcidiopsis thermalis PCC 7203 plasmid pCHRO.01

Total Repeats: 7058

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_019699	GTA	2	6	26987	26992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
502	NC_019699	CTG	2	6	27011	27016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
503	NC_019699	TAA	2	6	27040	27045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_019699	AAC	2	6	27080	27085	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
505	NC_019699	T	6	6	27166	27171	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_019699	TAA	2	6	27191	27196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_019699	GTT	2	6	27215	27220	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
508	NC_019699	CTT	2	6	27229	27234	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
509	NC_019699	ACG	2	6	27243	27248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
510	NC_019699	TTG	2	6	27260	27265	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
511	NC_019699	GCA	2	6	27354	27359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
512	NC_019699	TTG	2	6	27442	27447	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
513	NC_019699	TTG	2	6	27455	27460	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
514	NC_019699	CATC	2	8	27538	27545	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
515	NC_019699	CCG	2	6	27561	27566	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
516	NC_019699	CGC	2	6	27682	27687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
517	NC_019699	TGG	2	6	27787	27792	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
518	NC_019699	AAG	2	6	27817	27822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
519	NC_019699	ACG	2	6	27828	27833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
520	NC_019699	CAG	2	6	27913	27918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
521	NC_019699	CAA	2	6	28028	28033	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
522	NC_019699	GC	3	6	28036	28041	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
523	NC_019699	CCA	2	6	28066	28071	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
524	NC_019699	AGATA	2	10	28095	28104	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
525	NC_019699	GAC	2	6	28163	28168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
526	NC_019699	AAT	2	6	28172	28177	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_019699	ACC	2	6	28227	28232	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
528	NC_019699	TGCT	2	8	28256	28263	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
529	NC_019699	ACG	2	6	28277	28282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
530	NC_019699	CAT	2	6	28309	28314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
531	NC_019699	ACC	2	6	28317	28322	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
532	NC_019699	TCC	2	6	28343	28348	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
533	NC_019699	ATC	3	9	28389	28397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
534	NC_019699	AGT	2	6	28401	28406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
535	NC_019699	AGGGC	2	10	28414	28423	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
536	NC_019699	TCA	2	6	28453	28458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
537	NC_019699	GAT	2	6	28484	28489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
538	NC_019699	TGTT	2	8	28653	28660	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
539	NC_019699	CGC	2	6	28702	28707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
540	NC_019699	TCC	2	6	28813	28818	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
541	NC_019699	CTC	2	6	28822	28827	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
542	NC_019699	T	6	6	29025	29030	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_019699	CCG	2	6	29048	29053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
544	NC_019699	GAG	2	6	29065	29070	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
545	NC_019699	CGC	2	6	29099	29104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
546	NC_019699	GGC	2	6	29136	29141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
547	NC_019699	GGCG	2	8	29197	29204	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
548	NC_019699	AT	3	6	29207	29212	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
549	NC_019699	CCAA	2	8	29222	29229	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
550	NC_019699	AGA	3	9	29261	29269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
551	NC_019699	CTT	2	6	29338	29343	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
552	NC_019699	GCG	2	6	29383	29388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
553	NC_019699	ATG	3	9	29451	29459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
554	NC_019699	ACC	2	6	29469	29474	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
555	NC_019699	ATT	2	6	29517	29522	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_019699	AGGT	2	8	29704	29711	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
557	NC_019699	TTG	2	6	29723	29728	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
558	NC_019699	GGC	2	6	29740	29745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
559	NC_019699	CTT	2	6	29830	29835	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
560	NC_019699	CTA	2	6	30041	30046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428204759
561	NC_019699	AAC	2	6	30239	30244	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428204759
562	NC_019699	TGC	2	6	30342	30347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428204759
563	NC_019699	TTG	2	6	30353	30358	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428204759
564	NC_019699	TG	3	6	30368	30373	0 %	50 %	50 %	0 %	428204759
565	NC_019699	CAG	2	6	30380	30385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428204759
566	NC_019699	TCGT	2	8	30392	30399	0 %	50 %	25 %	25 %	428204759
567	NC_019699	AGC	2	6	30432	30437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428204759
568	NC_019699	TGA	2	6	30492	30497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428204759
569	NC_019699	TGC	2	6	30500	30505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428204759
570	NC_019699	CGG	2	6	30647	30652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428204759
571	NC_019699	GAA	2	6	30685	30690	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428204759
572	NC_019699	GTTT	2	8	30738	30745	0 %	75 %	25 %	0 %	428204759
573	NC_019699	GAT	2	6	30829	30834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428204759
574	NC_019699	AGC	2	6	30855	30860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428204759
575	NC_019699	GACTC	2	10	30904	30913	20 %	20 %	20 %	40 %	428204760
576	NC_019699	CTA	2	6	30918	30923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428204760
577	NC_019699	TCCA	2	8	31012	31019	25 %	25 %	0 %	50 %	428204760
578	NC_019699	A	6	6	31023	31028	100 %	0 %	0 %	0 %	428204760
579	NC_019699	TC	3	6	31091	31096	0 %	50 %	0 %	50 %	428204760
580	NC_019699	ACC	2	6	31275	31280	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428204760
581	NC_019699	GAA	3	9	31294	31302	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428204760
582	NC_019699	TAG	2	6	31380	31385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428204760
583	NC_019699	ACT	2	6	31473	31478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428204760
584	NC_019699	CAG	2	6	31557	31562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428204760
585	NC_019699	GGA	2	6	31619	31624	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428204760
586	NC_019699	T	6	6	31641	31646	0 %	100 %	0 %	0 %	428204760
587	NC_019699	ATC	2	6	31657	31662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428204760
588	NC_019699	TCT	2	6	31733	31738	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428204760
589	NC_019699	GAG	2	6	31773	31778	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428204760
590	NC_019699	CAA	2	6	31792	31797	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428204760
591	NC_019699	T	6	6	31799	31804	0 %	100 %	0 %	0 %	428204760
592	NC_019699	ATG	2	6	31890	31895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428204760
593	NC_019699	ACA	2	6	31960	31965	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428204760
594	NC_019699	AGA	2	6	31969	31974	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428204760
595	NC_019699	TC	3	6	31990	31995	0 %	50 %	0 %	50 %	428204760
596	NC_019699	ATG	2	6	32201	32206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428204760
597	NC_019699	ACA	2	6	32215	32220	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428204760
598	NC_019699	CTC	2	6	32231	32236	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428204760
599	NC_019699	CTG	2	6	32252	32257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428204760
600	NC_019699	AATTC	2	10	32279	32288	40 %	40 %	0 %	20 %	428204760
601	NC_019699	GA	3	6	32350	32355	50 %	0 %	50 %	0 %	428204760
602	NC_019699	TAC	2	6	32379	32384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428204760
603	NC_019699	TAC	2	6	32410	32415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428204760
604	NC_019699	CAT	2	6	32476	32481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428204761
605	NC_019699	CGGAA	2	10	32540	32549	40 %	0 %	40 %	20 %	428204761
606	NC_019699	TGCGGA	2	12	32550	32561	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	428204761
607	NC_019699	GAT	2	6	32667	32672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428204761
608	NC_019699	CACTTG	2	12	32722	32733	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	428204761
609	NC_019699	TCC	3	9	32804	32812	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428204761
610	NC_019699	GTT	2	6	32871	32876	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428204761
611	NC_019699	C	6	6	32951	32956	0 %	0 %	0 %	100 %	428204761
612	NC_019699	GCT	2	6	32965	32970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428204761
613	NC_019699	CAT	2	6	32977	32982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428204761
614	NC_019699	CAT	2	6	32998	33003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428204761
615	NC_019699	CT	3	6	33055	33060	0 %	50 %	0 %	50 %	428204761
616	NC_019699	AGC	2	6	33104	33109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428204761
617	NC_019699	GTA	2	6	33228	33233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428204761
618	NC_019699	TTTGA	2	10	33262	33271	20 %	60 %	20 %	0 %	428204761
619	NC_019699	CAGT	2	8	33279	33286	25 %	25 %	25 %	25 %	428204761
620	NC_019699	CAT	3	9	33304	33312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428204761
621	NC_019699	AAT	2	6	33427	33432	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428204761
622	NC_019699	AAAC	2	8	33433	33440	75 %	0 %	0 %	25 %	428204761
623	NC_019699	ACC	2	6	33448	33453	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428204761
624	NC_019699	TGG	2	6	33482	33487	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428204761
625	NC_019699	GAT	2	6	33513	33518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428204761
626	NC_019699	CT	3	6	33548	33553	0 %	50 %	0 %	50 %	428204761
627	NC_019699	TGGGT	2	10	33630	33639	0 %	40 %	60 %	0 %	428204761
628	NC_019699	GTT	2	6	33643	33648	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428204761
629	NC_019699	GAG	2	6	33693	33698	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428204761
630	NC_019699	AGA	2	6	33722	33727	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428204761
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632	NC_019699	GTG	2	6	33899	33904	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428204761
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