MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chroococcidiopsis thermalis PCC 7203 plasmid pCHRO.01

Total Repeats: 7058

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_019699	CAG	2	6	239244	239249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428204951
4502	NC_019699	TA	3	6	239284	239289	50 %	50 %	0 %	0 %	428204951
4503	NC_019699	TGACCC	2	12	239322	239333	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	428204951
4504	NC_019699	TTGT	2	8	239362	239369	0 %	75 %	25 %	0 %	428204951
4505	NC_019699	ACA	2	6	239375	239380	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428204951
4506	NC_019699	ATCG	2	8	239414	239421	25 %	25 %	25 %	25 %	428204951
4507	NC_019699	CAAC	2	8	239425	239432	50 %	0 %	0 %	50 %	428204951
4508	NC_019699	TTG	2	6	239521	239526	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428204951
4509	NC_019699	TGT	2	6	239539	239544	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428204951
4510	NC_019699	CTT	2	6	239563	239568	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4511	NC_019699	GTC	2	6	239608	239613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4512	NC_019699	ATTC	2	8	239645	239652	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4513	NC_019699	TTC	2	6	239660	239665	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4514	NC_019699	GAA	2	6	239681	239686	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4515	NC_019699	TGAA	2	8	239753	239760	50 %	25 %	25 %	0 %	428204952
4516	NC_019699	GTT	2	6	239819	239824	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428204952
4517	NC_019699	GATC	2	8	239828	239835	25 %	25 %	25 %	25 %	428204952
4518	NC_019699	AAT	2	6	239844	239849	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428204952
4519	NC_019699	GTA	2	6	239963	239968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428204952
4520	NC_019699	GCT	2	6	239987	239992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428204952
4521	NC_019699	T	7	7	240113	240119	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4522	NC_019699	TC	3	6	240151	240156	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4523	NC_019699	AACT	2	8	240159	240166	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4524	NC_019699	GTAA	2	8	240191	240198	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4525	NC_019699	AAC	2	6	240321	240326	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428204953
4526	NC_019699	ATG	2	6	240363	240368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428204953
4527	NC_019699	A	7	7	240370	240376	100 %	0 %	0 %	0 %	428204953
4528	NC_019699	GTG	2	6	240454	240459	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428204953
4529	NC_019699	AAG	2	6	240510	240515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428204953
4530	NC_019699	TGT	2	6	240571	240576	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428204953
4531	NC_019699	GGT	2	6	240599	240604	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428204953
4532	NC_019699	GAT	2	6	240608	240613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428204953
4533	NC_019699	TTG	2	6	240736	240741	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428204953
4534	NC_019699	A	7	7	240782	240788	100 %	0 %	0 %	0 %	428204953
4535	NC_019699	CAG	2	6	240864	240869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428204953
4536	NC_019699	TGT	2	6	240871	240876	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428204953
4537	NC_019699	TGC	2	6	240982	240987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428204953
4538	NC_019699	AGC	2	6	241021	241026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428204953
4539	NC_019699	TGG	2	6	241036	241041	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428204953
4540	NC_019699	GAT	2	6	241076	241081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428204953
4541	NC_019699	ACGAT	2	10	241110	241119	40 %	20 %	20 %	20 %	428204953
4542	NC_019699	GA	3	6	241122	241127	50 %	0 %	50 %	0 %	428204953
4543	NC_019699	ACG	2	6	241152	241157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428204953
4544	NC_019699	CTAG	2	8	241193	241200	25 %	25 %	25 %	25 %	428204953
4545	NC_019699	TTG	2	6	241355	241360	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428204953
4546	NC_019699	AGC	2	6	241399	241404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428204953
4547	NC_019699	GGT	2	6	241550	241555	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428204953
4548	NC_019699	GCA	2	6	241603	241608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428204953
4549	NC_019699	CTT	2	6	241634	241639	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4550	NC_019699	GC	3	6	241671	241676	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4551	NC_019699	AGA	2	6	241719	241724	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4552	NC_019699	TAC	2	6	241727	241732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4553	NC_019699	GAA	2	6	241774	241779	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4554	NC_019699	TTA	2	6	241791	241796	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4555	NC_019699	TTCAC	2	10	241880	241889	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
4556	NC_019699	CAC	3	9	241887	241895	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4557	NC_019699	GAAA	2	8	241945	241952	75 %	0 %	25 %	0 %	428204954
4558	NC_019699	CTA	2	6	241984	241989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428204954
4559	NC_019699	CGCAG	2	10	241994	242003	20 %	0 %	40 %	40 %	428204954
4560	NC_019699	GCA	2	6	242035	242040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428204954
4561	NC_019699	TGA	2	6	242063	242068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428204954
4562	NC_019699	AAG	2	6	242144	242149	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428204954
4563	NC_019699	ATTTT	2	10	242212	242221	20 %	80 %	0 %	0 %	428204954
4564	NC_019699	TTG	2	6	242222	242227	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428204954
4565	NC_019699	AAC	2	6	242284	242289	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428204954
4566	NC_019699	ACTT	2	8	242314	242321	25 %	50 %	0 %	25 %	428204954
4567	NC_019699	GCT	2	6	242419	242424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428204954
4568	NC_019699	TTG	2	6	242468	242473	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428204954
4569	NC_019699	TGT	2	6	242481	242486	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428204954
4570	NC_019699	TAG	2	6	242513	242518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428204954
4571	NC_019699	GTG	2	6	242519	242524	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428204954
4572	NC_019699	GGT	2	6	242530	242535	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428204954
4573	NC_019699	ATCG	2	8	242595	242602	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4574	NC_019699	AGC	2	6	242610	242615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4575	NC_019699	CAAA	2	8	242648	242655	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4576	NC_019699	AGCA	2	8	242670	242677	50 %	0 %	25 %	25 %	428204955
4577	NC_019699	CCG	2	6	242740	242745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428204955
4578	NC_019699	TGGC	2	8	242817	242824	0 %	25 %	50 %	25 %	428204955
4579	NC_019699	TGG	2	6	242859	242864	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428204955
4580	NC_019699	T	6	6	242885	242890	0 %	100 %	0 %	0 %	428204955
4581	NC_019699	CGC	2	6	242908	242913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428204955
4582	NC_019699	TCGCT	2	10	242938	242947	0 %	40 %	20 %	40 %	428204955
4583	NC_019699	A	7	7	242979	242985	100 %	0 %	0 %	0 %	428204955
4584	NC_019699	CGTCGC	2	12	242994	243005	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	428204955
4585	NC_019699	TC	3	6	243009	243014	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4586	NC_019699	TAT	2	6	243055	243060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428204956
4587	NC_019699	A	6	6	243085	243090	100 %	0 %	0 %	0 %	428204956
4588	NC_019699	TC	3	6	243189	243194	0 %	50 %	0 %	50 %	428204956
4589	NC_019699	TCAAA	2	10	243247	243256	60 %	20 %	0 %	20 %	428204956
4590	NC_019699	ATTC	2	8	243278	243285	25 %	50 %	0 %	25 %	428204956
4591	NC_019699	GTTC	2	8	243381	243388	0 %	50 %	25 %	25 %	428204956
4592	NC_019699	GAC	2	6	243392	243397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428204956
4593	NC_019699	GCC	2	6	243402	243407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428204956
4594	NC_019699	CG	3	6	243486	243491	0 %	0 %	50 %	50 %	428204956
4595	NC_019699	AACT	2	8	243492	243499	50 %	25 %	0 %	25 %	428204956
4596	NC_019699	AGA	2	6	243562	243567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428204956
4597	NC_019699	ACG	2	6	243579	243584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428204956
4598	NC_019699	TCC	2	6	243675	243680	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428204956
4599	NC_019699	GCA	2	6	243787	243792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428204956
4600	NC_019699	ACC	2	6	243811	243816	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428204956
4601	NC_019699	GAA	2	6	243842	243847	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428204956
4602	NC_019699	CAT	2	6	243887	243892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428204956
4603	NC_019699	CTA	2	6	243893	243898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428204956
4604	NC_019699	GAAAAC	2	12	243899	243910	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	428204956
4605	NC_019699	GGTTG	2	10	243992	244001	0 %	40 %	60 %	0 %	428204956
4606	NC_019699	TTAT	2	8	244021	244028	25 %	75 %	0 %	0 %	428204956
4607	NC_019699	GAG	2	6	244202	244207	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428204956
4608	NC_019699	AT	3	6	244229	244234	50 %	50 %	0 %	0 %	428204956
4609	NC_019699	CCAT	2	8	244248	244255	25 %	25 %	0 %	50 %	428204956
4610	NC_019699	AGT	2	6	244261	244266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428204956
4611	NC_019699	ATC	2	6	244321	244326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428204956
4612	NC_019699	GTC	2	6	244346	244351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428204956
4613	NC_019699	AAG	2	6	244506	244511	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428204956
4614	NC_019699	GAA	2	6	244529	244534	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428204956
4615	NC_019699	ACAA	2	8	244563	244570	75 %	0 %	0 %	25 %	428204956
4616	NC_019699	CGT	2	6	244663	244668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428204956
4617	NC_019699	T	6	6	244724	244729	0 %	100 %	0 %	0 %	428204956
4618	NC_019699	GAT	2	6	244733	244738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428204956
4619	NC_019699	AAAG	2	8	244820	244827	75 %	0 %	25 %	0 %	428204956
4620	NC_019699	AACTC	2	10	244901	244910	40 %	20 %	0 %	40 %	428204956
4621	NC_019699	ATT	2	6	245058	245063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428204956
4622	NC_019699	AAG	2	6	245109	245114	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428204956
4623	NC_019699	TCGC	2	8	245184	245191	0 %	25 %	25 %	50 %	428204956
4624	NC_019699	GCT	3	9	245288	245296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428204956
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4656	NC_019699	AGGG	2	8	246927	246934	25 %	0 %	75 %	0 %	428204958
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4989	NC_019699	TAG	2	6	262415	262420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4993	NC_019699	GAA	2	6	262746	262751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428204974
4994	NC_019699	ATT	2	6	262779	262784	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428204974
4995	NC_019699	TTGG	2	8	262790	262797	0 %	50 %	50 %	0 %	428204974
4996	NC_019699	GA	3	6	262798	262803	50 %	0 %	50 %	0 %	428204974
4997	NC_019699	GGA	2	6	262826	262831	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428204974
4998	NC_019699	CAG	2	6	262842	262847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428204974
4999	NC_019699	TTGA	2	8	262854	262861	25 %	50 %	25 %	0 %	428204974
5000	NC_019699	TGC	2	6	262874	262879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428204974

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