MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Chamaesiphon minutus PCC 6605 plasmid pCHA6605.02

Total Repeats: 626

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_019698	AAT	2	6	24163	24168	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434389918
502	NC_019698	AGA	2	6	24177	24182	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434389918
503	NC_019698	GAA	2	6	24223	24228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434389918
504	NC_019698	AT	3	6	24255	24260	50 %	50 %	0 %	0 %	434389918
505	NC_019698	GCTG	2	8	24362	24369	0 %	25 %	50 %	25 %	434389918
506	NC_019698	ATT	2	6	24379	24384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434389918
507	NC_019698	TAA	2	6	24408	24413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434389918
508	NC_019698	GAA	2	6	24427	24432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434389918
509	NC_019698	TAA	2	6	24471	24476	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434389918
510	NC_019698	TGTAGA	2	12	24498	24509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434389918
511	NC_019698	TAA	2	6	24518	24523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434389918
512	NC_019698	A	6	6	24522	24527	100 %	0 %	0 %	0 %	434389918
513	NC_019698	CAG	2	6	24598	24603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434389918
514	NC_019698	TGC	2	6	24650	24655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434389918
515	NC_019698	AT	4	8	24698	24705	50 %	50 %	0 %	0 %	434389918
516	NC_019698	AAG	2	6	24736	24741	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434389918
517	NC_019698	TA	3	6	24763	24768	50 %	50 %	0 %	0 %	434389918
518	NC_019698	AATG	2	8	24847	24854	50 %	25 %	25 %	0 %	434389918
519	NC_019698	AT	3	6	24918	24923	50 %	50 %	0 %	0 %	434389918
520	NC_019698	CGAT	2	8	24978	24985	25 %	25 %	25 %	25 %	434389918
521	NC_019698	TAT	2	6	25059	25064	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434389918
522	NC_019698	TGA	2	6	25173	25178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434389918
523	NC_019698	ATAA	2	8	25213	25220	75 %	25 %	0 %	0 %	434389918
524	NC_019698	A	6	6	25235	25240	100 %	0 %	0 %	0 %	434389918
525	NC_019698	ATA	2	6	25292	25297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434389918
526	NC_019698	ATT	2	6	25335	25340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434389918
527	NC_019698	GAA	2	6	25498	25503	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434389918
528	NC_019698	TTAA	2	8	25534	25541	50 %	50 %	0 %	0 %	434389918
529	NC_019698	AAAAT	2	10	25585	25594	80 %	20 %	0 %	0 %	434389918
530	NC_019698	A	6	6	25618	25623	100 %	0 %	0 %	0 %	434389918
531	NC_019698	CAT	2	6	25655	25660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434389918
532	NC_019698	AT	3	6	25682	25687	50 %	50 %	0 %	0 %	434389918
533	NC_019698	ATTA	2	8	25689	25696	50 %	50 %	0 %	0 %	434389918
534	NC_019698	TAGGTG	2	12	25697	25708	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	434389918
535	NC_019698	CCTT	2	8	25745	25752	0 %	50 %	0 %	50 %	434389918
536	NC_019698	ATA	2	6	25778	25783	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434389918
537	NC_019698	AGCA	2	8	25830	25837	50 %	0 %	25 %	25 %	434389918
538	NC_019698	T	6	6	25898	25903	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
539	NC_019698	AT	3	6	25909	25914	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
540	NC_019698	A	6	6	26118	26123	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_019698	AGA	2	6	26127	26132	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
542	NC_019698	ATA	2	6	26154	26159	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_019698	AGTT	2	8	26182	26189	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
544	NC_019698	CGAT	2	8	26194	26201	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
545	NC_019698	ATC	2	6	26228	26233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
546	NC_019698	ACCT	2	8	26257	26264	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
547	NC_019698	TATT	2	8	26304	26311	25 %	75 %	0 %	0 %	434389919
548	NC_019698	ATT	2	6	26315	26320	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434389919
549	NC_019698	GGCT	2	8	26407	26414	0 %	25 %	50 %	25 %	434389919
550	NC_019698	AGA	2	6	26422	26427	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434389919
551	NC_019698	CTG	2	6	26433	26438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434389919
552	NC_019698	GAT	2	6	26462	26467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434389919
553	NC_019698	TGC	2	6	26608	26613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
554	NC_019698	ATT	2	6	26724	26729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_019698	AATA	2	8	26754	26761	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_019698	ACA	2	6	26803	26808	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434389920
557	NC_019698	GCTG	2	8	26825	26832	0 %	25 %	50 %	25 %	434389920
558	NC_019698	GGT	2	6	26841	26846	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	434389920
559	NC_019698	TAA	2	6	27022	27027	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434389920
560	NC_019698	TGA	2	6	27047	27052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434389920
561	NC_019698	CAAG	2	8	27125	27132	50 %	0 %	25 %	25 %	434389920
562	NC_019698	ATT	2	6	27151	27156	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434389920
563	NC_019698	TAT	2	6	27168	27173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434389920
564	NC_019698	TGGT	2	8	27263	27270	0 %	50 %	50 %	0 %	434389920
565	NC_019698	TCAC	2	8	27458	27465	25 %	25 %	0 %	50 %	434389920
566	NC_019698	GATA	2	8	27606	27613	50 %	25 %	25 %	0 %	434389920
567	NC_019698	GAA	2	6	27615	27620	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434389920
568	NC_019698	AT	3	6	27701	27706	50 %	50 %	0 %	0 %	434389920
569	NC_019698	T	7	7	27764	27770	0 %	100 %	0 %	0 %	434389920
570	NC_019698	TTGT	2	8	27793	27800	0 %	75 %	25 %	0 %	434389920
571	NC_019698	TTCT	2	8	27801	27808	0 %	75 %	0 %	25 %	434389920
572	NC_019698	ACT	2	6	27967	27972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434389920
573	NC_019698	GAGC	2	8	28146	28153	25 %	0 %	50 %	25 %	434389920
574	NC_019698	AAG	2	6	28228	28233	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434389920
575	NC_019698	TAGC	2	8	28339	28346	25 %	25 %	25 %	25 %	434389920
576	NC_019698	TTA	2	6	28451	28456	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434389920
577	NC_019698	TAC	2	6	28575	28580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434389920
578	NC_019698	A	6	6	28629	28634	100 %	0 %	0 %	0 %	434389920
579	NC_019698	A	7	7	28778	28784	100 %	0 %	0 %	0 %	434389920
580	NC_019698	TCGAT	2	10	28814	28823	20 %	40 %	20 %	20 %	434389920
581	NC_019698	AAT	2	6	28887	28892	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434389920
582	NC_019698	CTT	2	6	28962	28967	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434389920
583	NC_019698	TCT	2	6	28974	28979	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434389920
584	NC_019698	AAC	2	6	29030	29035	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434389920
585	NC_019698	ACA	2	6	29046	29051	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434389920
586	NC_019698	GCA	2	6	29094	29099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434389920
587	NC_019698	AGA	2	6	29108	29113	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434389920
588	NC_019698	GAA	2	6	29121	29126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434389920
589	NC_019698	A	6	6	29157	29162	100 %	0 %	0 %	0 %	434389920
590	NC_019698	GAGG	2	8	29166	29173	25 %	0 %	75 %	0 %	434389920
591	NC_019698	AGA	2	6	29177	29182	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434389920
592	NC_019698	TCA	2	6	29189	29194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434389920
593	NC_019698	AATT	2	8	29204	29211	50 %	50 %	0 %	0 %	434389920
594	NC_019698	T	7	7	29341	29347	0 %	100 %	0 %	0 %	434389920
595	NC_019698	ATT	2	6	29360	29365	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434389920
596	NC_019698	ACA	2	6	29417	29422	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434389920
597	NC_019698	TCA	2	6	29480	29485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434389920
598	NC_019698	AAC	2	6	29599	29604	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434389920
599	NC_019698	TCACT	2	10	29618	29627	20 %	40 %	0 %	40 %	434389920
600	NC_019698	TCA	2	6	29737	29742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434389920
601	NC_019698	TCT	2	6	29893	29898	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434389920
602	NC_019698	CAA	2	6	29904	29909	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434389920
603	NC_019698	CTG	2	6	29929	29934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434389920
604	NC_019698	GATG	2	8	29956	29963	25 %	25 %	50 %	0 %	434389920
605	NC_019698	GGC	2	6	30134	30139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	434389920
606	NC_019698	CAAA	2	8	30177	30184	75 %	0 %	0 %	25 %	434389921
607	NC_019698	CAA	2	6	30220	30225	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434389921
608	NC_019698	GTCG	2	8	30268	30275	0 %	25 %	50 %	25 %	434389921
609	NC_019698	TTAT	2	8	30454	30461	25 %	75 %	0 %	0 %	434389921
610	NC_019698	A	7	7	30501	30507	100 %	0 %	0 %	0 %	434389921
611	NC_019698	TAG	2	6	30516	30521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434389921
612	NC_019698	GAG	2	6	30557	30562	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	434389921
613	NC_019698	AGT	2	6	30567	30572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434389921
614	NC_019698	GTG	3	9	30584	30592	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	434389921
615	NC_019698	G	7	7	30637	30643	0 %	0 %	100 %	0 %	434389921
616	NC_019698	AGT	2	6	30681	30686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434389921
617	NC_019698	CAGG	2	8	30689	30696	25 %	0 %	50 %	25 %	434389921
618	NC_019698	GGT	2	6	30706	30711	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	434389922
619	NC_019698	AATTGG	2	12	30724	30735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434389922
620	NC_019698	TAA	2	6	30744	30749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434389922
621	NC_019698	TTA	2	6	30765	30770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434389922
622	NC_019698	TCG	2	6	30784	30789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434389922
623	NC_019698	GCT	2	6	30901	30906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434389922
624	NC_019698	TTG	2	6	30930	30935	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434389922
625	NC_019698	AATT	2	8	30990	30997	50 %	50 %	0 %	0 %	434389922
626	NC_019698	TTGATT	2	12	31006	31017	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	434389922

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