MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Chamaesiphon minutus PCC 6605

Total Repeats: 4144

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019697	AAGAG	2	10	2097	2106	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019697	TTTTA	2	10	2806	2815	20 %	80 %	0 %	0 %	434384227
3	NC_019697	TGGCG	2	10	3320	3329	0 %	20 %	60 %	20 %	434384228
4	NC_019697	AGGCG	2	10	3683	3692	20 %	0 %	60 %	20 %	434384228
5	NC_019697	CGGTT	2	10	4223	4232	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
6	NC_019697	AACCG	2	10	4357	4366	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
7	NC_019697	CCAAC	2	10	4518	4527	40 %	0 %	0 %	60 %	434384229
8	NC_019697	CTTGC	2	10	5466	5475	0 %	40 %	20 %	40 %	434384230
9	NC_019697	CGATT	2	10	5699	5708	20 %	40 %	20 %	20 %	434384230
10	NC_019697	TGCTC	2	10	6078	6087	0 %	40 %	20 %	40 %	434384231
11	NC_019697	ATTTC	2	10	7034	7043	20 %	60 %	0 %	20 %	434384232
12	NC_019697	TTTGA	2	10	12122	12131	20 %	60 %	20 %	0 %	434384239
13	NC_019697	TCAGT	2	10	12468	12477	20 %	40 %	20 %	20 %	434384239
14	NC_019697	GATCG	2	10	14157	14166	20 %	20 %	40 %	20 %	434384240
15	NC_019697	ACGAT	2	10	14281	14290	40 %	20 %	20 %	20 %	434384240
16	NC_019697	GCAGC	2	10	14553	14562	20 %	0 %	40 %	40 %	434384240
17	NC_019697	TCGGA	2	10	16236	16245	20 %	20 %	40 %	20 %	434384240
18	NC_019697	AGCCG	2	10	16538	16547	20 %	0 %	40 %	40 %	434384240
19	NC_019697	TCCCA	2	10	21685	21694	20 %	20 %	0 %	60 %	434384243
20	NC_019697	CATCG	2	10	24898	24907	20 %	20 %	20 %	40 %	434384247
21	NC_019697	AGTCA	2	10	27018	27027	40 %	20 %	20 %	20 %	434384248
22	NC_019697	GATCG	2	10	27498	27507	20 %	20 %	40 %	20 %	434384248
23	NC_019697	TGACT	2	10	29883	29892	20 %	40 %	20 %	20 %	434384250
24	NC_019697	AGTAA	2	10	31467	31476	60 %	20 %	20 %	0 %	434384250
25	NC_019697	AAGAC	2	10	31848	31857	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
26	NC_019697	GTAGC	2	10	35457	35466	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
27	NC_019697	CAACC	2	10	35612	35621	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
28	NC_019697	GTGGG	2	10	35765	35774	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
29	NC_019697	GAATA	2	10	36454	36463	60 %	20 %	20 %	0 %	434384256
30	NC_019697	GAGAG	2	10	38873	38882	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
31	NC_019697	TTAAC	2	10	40963	40972	40 %	40 %	0 %	20 %	434384261
32	NC_019697	CGATC	2	10	42916	42925	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
33	NC_019697	TTGGC	2	10	44061	44070	0 %	40 %	40 %	20 %	434384264
34	NC_019697	TTGGA	2	10	45686	45695	20 %	40 %	40 %	0 %	434384265
35	NC_019697	GCGAT	2	10	45770	45779	20 %	20 %	40 %	20 %	434384265
36	NC_019697	TTATC	2	10	49159	49168	20 %	60 %	0 %	20 %	434384268
37	NC_019697	AATTT	2	10	49427	49436	40 %	60 %	0 %	0 %	434384268
38	NC_019697	ACCGC	2	10	49763	49772	20 %	0 %	20 %	60 %	434384269
39	NC_019697	TGGAA	2	10	51916	51925	40 %	20 %	40 %	0 %	434384270
40	NC_019697	AAGAA	2	10	55523	55532	80 %	0 %	20 %	0 %	434384271
41	NC_019697	TGTCT	2	10	57018	57027	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
42	NC_019697	GATCG	2	10	57651	57660	20 %	20 %	40 %	20 %	434384273
43	NC_019697	CGATG	2	10	57848	57857	20 %	20 %	40 %	20 %	434384273
44	NC_019697	CGATC	2	10	57899	57908	20 %	20 %	20 %	40 %	434384273
45	NC_019697	AGCCT	2	10	58374	58383	20 %	20 %	20 %	40 %	434384274
46	NC_019697	TTGAG	2	10	58555	58564	20 %	40 %	40 %	0 %	434384274
47	NC_019697	GATCG	2	10	60989	60998	20 %	20 %	40 %	20 %	434384276
48	NC_019697	AACAA	2	10	62625	62634	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
49	NC_019697	ATAGT	2	10	63860	63869	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
50	NC_019697	GATTG	2	10	63891	63900	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
51	NC_019697	AGTTG	2	10	65960	65969	20 %	40 %	40 %	0 %	434384281
52	NC_019697	GGGAT	2	10	66875	66884	20 %	20 %	60 %	0 %	434384281
53	NC_019697	CGCCA	2	10	67969	67978	20 %	0 %	20 %	60 %	434384283
54	NC_019697	TGAAT	2	10	68638	68647	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
55	NC_019697	CGATC	2	10	69114	69123	20 %	20 %	20 %	40 %	434384284
56	NC_019697	CCGCA	2	10	69155	69164	20 %	0 %	20 %	60 %	434384284
57	NC_019697	TATCG	2	10	69447	69456	20 %	40 %	20 %	20 %	434384284
58	NC_019697	CAGCA	2	10	70499	70508	40 %	0 %	20 %	40 %	434384285
59	NC_019697	ATCTT	2	10	71313	71322	20 %	60 %	0 %	20 %	434384286
60	NC_019697	TTATT	2	10	75916	75925	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_019697	AACTC	2	10	79406	79415	40 %	20 %	0 %	40 %	434384294
62	NC_019697	CAATA	2	10	80268	80277	60 %	20 %	0 %	20 %	434384295
63	NC_019697	AGCTA	2	10	82919	82928	40 %	20 %	20 %	20 %	434384298
64	NC_019697	TGTCT	2	10	87747	87756	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
65	NC_019697	AATCC	2	10	88290	88299	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
66	NC_019697	TCAAA	2	10	89984	89993	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
67	NC_019697	TCTAT	2	10	90971	90980	20 %	60 %	0 %	20 %	434384307
68	NC_019697	TGGCT	2	10	93481	93490	0 %	40 %	40 %	20 %	434384310
69	NC_019697	CTTGA	2	10	94183	94192	20 %	40 %	20 %	20 %	434384311
70	NC_019697	ATTAT	2	10	96558	96567	40 %	60 %	0 %	0 %	434384313
71	NC_019697	ATTAA	2	10	101082	101091	60 %	40 %	0 %	0 %	434384316
72	NC_019697	TGCTT	2	10	101688	101697	0 %	60 %	20 %	20 %	434384316
73	NC_019697	CAAAC	2	10	102466	102475	60 %	0 %	0 %	40 %	434384318
74	NC_019697	AGGCT	2	10	104662	104671	20 %	20 %	40 %	20 %	434384319
75	NC_019697	TTGCC	2	10	105052	105061	0 %	40 %	20 %	40 %	434384320
76	NC_019697	AGTTT	2	10	107979	107988	20 %	60 %	20 %	0 %	434384323
77	NC_019697	AGGGG	2	10	110740	110749	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
78	NC_019697	CGATC	2	10	111353	111362	20 %	20 %	20 %	40 %	434384326
79	NC_019697	TCGAC	2	10	112200	112209	20 %	20 %	20 %	40 %	434384327
80	NC_019697	AACTA	2	10	112805	112814	60 %	20 %	0 %	20 %	434384329
81	NC_019697	TCACC	2	10	114402	114411	20 %	20 %	0 %	60 %	434384330
82	NC_019697	ATCGC	2	10	116333	116342	20 %	20 %	20 %	40 %	434384332
83	NC_019697	ATGCC	2	10	116375	116384	20 %	20 %	20 %	40 %	434384332
84	NC_019697	TGTCT	2	10	116651	116660	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
85	NC_019697	CGATC	2	10	116793	116802	20 %	20 %	20 %	40 %	434384333
86	NC_019697	CGATC	2	10	118569	118578	20 %	20 %	20 %	40 %	434384334
87	NC_019697	AACTA	2	10	119250	119259	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
88	NC_019697	GATCG	2	10	119512	119521	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
89	NC_019697	CGATC	2	10	120350	120359	20 %	20 %	20 %	40 %	434384336
90	NC_019697	CGATC	2	10	120941	120950	20 %	20 %	20 %	40 %	434384336
91	NC_019697	AGTTT	2	10	122355	122364	20 %	60 %	20 %	0 %	434384339
92	NC_019697	ATTTT	2	10	122441	122450	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_019697	TGTCT	2	10	124901	124910	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
94	NC_019697	TCCAC	2	10	126349	126358	20 %	20 %	0 %	60 %	434384343
95	NC_019697	CATTC	2	10	127759	127768	20 %	40 %	0 %	40 %	434384346
96	NC_019697	AGCCA	2	10	128459	128468	40 %	0 %	20 %	40 %	434384346
97	NC_019697	ATTGG	2	10	131253	131262	20 %	40 %	40 %	0 %	434384350
98	NC_019697	AACCA	2	10	132964	132973	60 %	0 %	0 %	40 %	434384351
99	NC_019697	GCATC	2	10	132975	132984	20 %	20 %	20 %	40 %	434384351
100	NC_019697	TGCGC	2	10	134457	134466	0 %	20 %	40 %	40 %	434384352
101	NC_019697	TATTT	2	10	137738	137747	20 %	80 %	0 %	0 %	434384353
102	NC_019697	GGTTT	2	10	140305	140314	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
103	NC_019697	TATCG	2	10	143940	143949	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
104	NC_019697	CTCAT	2	10	144137	144146	20 %	40 %	0 %	40 %	434384359
105	NC_019697	GTTTG	2	10	145908	145917	0 %	60 %	40 %	0 %	434384360
106	NC_019697	AGCAA	2	10	147223	147232	60 %	0 %	20 %	20 %	434384361
107	NC_019697	CGGGA	2	10	150358	150367	20 %	0 %	60 %	20 %	434384363
108	NC_019697	ATGCA	2	10	153110	153119	40 %	20 %	20 %	20 %	434384365
109	NC_019697	AGAAA	2	10	154293	154302	80 %	0 %	20 %	0 %	434384365
110	NC_019697	CATGC	2	10	155290	155299	20 %	20 %	20 %	40 %	434384365
111	NC_019697	TGTCT	2	10	157632	157641	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
112	NC_019697	TTCGG	2	10	158279	158288	0 %	40 %	40 %	20 %	434384367
113	NC_019697	AAGAA	2	10	159853	159862	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
114	NC_019697	TCCCA	2	10	161103	161112	20 %	20 %	0 %	60 %	434384370
115	NC_019697	GCGGT	2	10	161428	161437	0 %	20 %	60 %	20 %	434384370
116	NC_019697	GCATA	2	10	162688	162697	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
117	NC_019697	TTTGC	2	10	165043	165052	0 %	60 %	20 %	20 %	434384375
118	NC_019697	GAGAG	2	10	168471	168480	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
119	NC_019697	ATCAA	2	10	175095	175104	60 %	20 %	0 %	20 %	434384383
120	NC_019697	CGCCT	2	10	175457	175466	0 %	20 %	20 %	60 %	434384383
121	NC_019697	CAACC	2	10	176724	176733	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
122	NC_019697	GGATC	2	10	177016	177025	20 %	20 %	40 %	20 %	434384385
123	NC_019697	ACTGC	2	10	177210	177219	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
124	NC_019697	ATTAT	2	10	181130	181139	40 %	60 %	0 %	0 %	434384389
125	NC_019697	AGGGG	2	10	183465	183474	20 %	0 %	80 %	0 %	434384391
126	NC_019697	TGTCT	2	10	183844	183853	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
127	NC_019697	ATCGC	2	10	184495	184504	20 %	20 %	20 %	40 %	434384392
128	NC_019697	GTGCT	2	10	190894	190903	0 %	40 %	40 %	20 %	434384396
129	NC_019697	AAACC	2	10	196972	196981	60 %	0 %	0 %	40 %	434384404
130	NC_019697	AAATT	2	10	197053	197062	60 %	40 %	0 %	0 %	434384404
131	NC_019697	CGGTT	2	10	198615	198624	0 %	40 %	40 %	20 %	434384405
132	NC_019697	TAAAT	2	10	199772	199781	60 %	40 %	0 %	0 %	434384406
133	NC_019697	CGTAG	2	10	200398	200407	20 %	20 %	40 %	20 %	434384406
134	NC_019697	CAATC	2	10	203572	203581	40 %	20 %	0 %	40 %	434384408
135	NC_019697	TCATA	2	10	204185	204194	40 %	40 %	0 %	20 %	434384408
136	NC_019697	AACTA	2	10	205208	205217	60 %	20 %	0 %	20 %	434384409
137	NC_019697	TAGCA	2	10	206323	206332	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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172	NC_019697	AAATT	2	10	260922	260931	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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191	NC_019697	TTGTC	5	25	289463	289487	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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194	NC_019697	ACCCC	2	10	292093	292102	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
195	NC_019697	ACCCG	2	10	292603	292612	20 %	0 %	20 %	60 %	434384481
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197	NC_019697	TCGGC	2	10	300657	300666	0 %	20 %	40 %	40 %	434384489
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251	NC_019697	GTCCC	2	10	385969	385978	0 %	20 %	20 %	60 %	434384566
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256	NC_019697	CACTA	2	10	393178	393187	40 %	20 %	0 %	40 %	434384570
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260	NC_019697	GCTTG	2	10	398882	398891	0 %	40 %	40 %	20 %	434384573
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