MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chamaesiphon minutus PCC 6605

Total Repeats: 126585

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_019697	AGTT	2	8	195509	195516	25 %	50 %	25 %	0 %	434384401
4002	NC_019697	TAA	2	6	195522	195527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434384401
4003	NC_019697	ACT	2	6	195565	195570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434384401
4004	NC_019697	CGAA	2	8	195588	195595	50 %	0 %	25 %	25 %	434384401
4005	NC_019697	ATT	2	6	195635	195640	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4006	NC_019697	CAC	2	6	195690	195695	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	434384402
4007	NC_019697	TAC	2	6	195717	195722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434384402
4008	NC_019697	AGT	2	6	195774	195779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434384402
4009	NC_019697	ATA	2	6	195782	195787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434384402
4010	NC_019697	GTC	2	6	195802	195807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434384402
4011	NC_019697	CGAT	2	8	195810	195817	25 %	25 %	25 %	25 %	434384402
4012	NC_019697	AGTT	2	8	195846	195853	25 %	50 %	25 %	0 %	434384402
4013	NC_019697	ATG	2	6	195917	195922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434384402
4014	NC_019697	AGCT	2	8	195980	195987	25 %	25 %	25 %	25 %	434384402
4015	NC_019697	TGG	2	6	195999	196004	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	434384402
4016	NC_019697	A	6	6	196151	196156	100 %	0 %	0 %	0 %	434384402
4017	NC_019697	CAG	2	6	196209	196214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434384402
4018	NC_019697	ACT	2	6	196225	196230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434384402
4019	NC_019697	AT	3	6	196342	196347	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4020	NC_019697	GGA	2	6	196431	196436	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	434384403
4021	NC_019697	ATA	2	6	196478	196483	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434384403
4022	NC_019697	AT	3	6	196701	196706	50 %	50 %	0 %	0 %	434384403
4023	NC_019697	CAT	2	6	196710	196715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434384403
4024	NC_019697	GATC	2	8	196731	196738	25 %	25 %	25 %	25 %	434384403
4025	NC_019697	GTCAAA	2	12	196771	196782	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	434384403
4026	NC_019697	GGTT	2	8	196833	196840	0 %	50 %	50 %	0 %	434384403
4027	NC_019697	AG	3	6	196866	196871	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4028	NC_019697	CCA	2	6	196890	196895	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4029	NC_019697	AAT	2	6	196920	196925	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4030	NC_019697	AAACC	2	10	196972	196981	60 %	0 %	0 %	40 %	434384404
4031	NC_019697	AAATT	2	10	197053	197062	60 %	40 %	0 %	0 %	434384404
4032	NC_019697	CTGG	2	8	197172	197179	0 %	25 %	50 %	25 %	434384404
4033	NC_019697	GGT	2	6	197181	197186	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	434384404
4034	NC_019697	AAG	2	6	197191	197196	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434384404
4035	NC_019697	AGC	2	6	197274	197279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434384404
4036	NC_019697	CAT	2	6	197294	197299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434384404
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4039	NC_019697	GTG	2	6	197560	197565	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	434384404
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4041	NC_019697	ATCG	2	8	197586	197593	25 %	25 %	25 %	25 %	434384404
4042	NC_019697	ATA	2	6	197595	197600	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434384404
4043	NC_019697	ATA	2	6	197754	197759	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434384404
4044	NC_019697	AAT	2	6	197785	197790	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434384404
4045	NC_019697	ATA	2	6	197857	197862	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434384404
4046	NC_019697	GATC	2	8	197897	197904	25 %	25 %	25 %	25 %	434384404
4047	NC_019697	CGA	2	6	198008	198013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4048	NC_019697	ATCT	2	8	198036	198043	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4049	NC_019697	TCGA	2	8	198133	198140	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4050	NC_019697	AG	3	6	198221	198226	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4051	NC_019697	A	6	6	198262	198267	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4052	NC_019697	TCGA	2	8	198359	198366	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4053	NC_019697	ACA	2	6	198393	198398	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4054	NC_019697	AGCC	2	8	198501	198508	25 %	0 %	25 %	50 %	434384405
4055	NC_019697	AT	3	6	198534	198539	50 %	50 %	0 %	0 %	434384405
4056	NC_019697	CGGTT	2	10	198615	198624	0 %	40 %	40 %	20 %	434384405
4057	NC_019697	TGC	2	6	198662	198667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434384405
4058	NC_019697	ATCG	2	8	198702	198709	25 %	25 %	25 %	25 %	434384405
4059	NC_019697	GAT	2	6	198821	198826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434384405
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4061	NC_019697	ATC	2	6	198869	198874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434384405
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4063	NC_019697	CCAA	2	8	199108	199115	50 %	0 %	0 %	50 %	434384405
4064	NC_019697	ATT	2	6	199149	199154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434384405
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4067	NC_019697	A	7	7	199273	199279	100 %	0 %	0 %	0 %	434384405
4068	NC_019697	GCG	2	6	199466	199471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4069	NC_019697	A	7	7	199523	199529	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4070	NC_019697	GTGG	2	8	199560	199567	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
4071	NC_019697	GCA	2	6	199574	199579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4072	NC_019697	AGT	2	6	199654	199659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434384406
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4074	NC_019697	GCTA	2	8	199792	199799	25 %	25 %	25 %	25 %	434384406
4075	NC_019697	A	6	6	199947	199952	100 %	0 %	0 %	0 %	434384406
4076	NC_019697	GGC	2	6	200038	200043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	434384406
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4082	NC_019697	CGTAG	2	10	200398	200407	20 %	20 %	40 %	20 %	434384406
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4088	NC_019697	GCG	2	6	200868	200873	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4089	NC_019697	T	6	6	200994	200999	0 %	100 %	0 %	0 %	434384407
4090	NC_019697	TGA	2	6	201003	201008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434384407
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4098	NC_019697	ATCG	2	8	201432	201439	25 %	25 %	25 %	25 %	434384407
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4100	NC_019697	TCGA	2	8	201474	201481	25 %	25 %	25 %	25 %	434384407
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4103	NC_019697	ATCG	2	8	201643	201650	25 %	25 %	25 %	25 %	434384407
4104	NC_019697	TGA	2	6	201669	201674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434384407
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4107	NC_019697	TGC	2	6	201733	201738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434384407
4108	NC_019697	ATGG	2	8	201745	201752	25 %	25 %	50 %	0 %	434384407
4109	NC_019697	TTGA	2	8	201817	201824	25 %	50 %	25 %	0 %	434384407
4110	NC_019697	T	7	7	201834	201840	0 %	100 %	0 %	0 %	434384407
4111	NC_019697	TCT	2	6	201853	201858	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434384407
4112	NC_019697	TCA	2	6	201869	201874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434384407
4113	NC_019697	ATC	2	6	201892	201897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434384407
4114	NC_019697	ATCG	2	8	201903	201910	25 %	25 %	25 %	25 %	434384407
4115	NC_019697	CGAT	2	8	201911	201918	25 %	25 %	25 %	25 %	434384407
4116	NC_019697	GCT	2	6	202001	202006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4117	NC_019697	TCGA	2	8	202123	202130	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4118	NC_019697	TAA	2	6	202135	202140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4119	NC_019697	T	6	6	202193	202198	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4120	NC_019697	CGCT	2	8	202231	202238	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4121	NC_019697	TAT	2	6	202307	202312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4122	NC_019697	ACT	2	6	202314	202319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4123	NC_019697	ATCG	2	8	202338	202345	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4124	NC_019697	ATCG	2	8	202355	202362	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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4126	NC_019697	AGATCG	2	12	202404	202415	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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4252	NC_019697	CGA	2	6	209649	209654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4253	NC_019697	CGG	2	6	209673	209678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4254	NC_019697	ACTG	2	8	209697	209704	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4255	NC_019697	CGGG	2	8	209724	209731	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4256	NC_019697	TG	3	6	209753	209758	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4257	NC_019697	TGGC	2	8	209778	209785	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4258	NC_019697	CATC	2	8	209802	209809	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4259	NC_019697	TGGC	2	8	209820	209827	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4260	NC_019697	GAT	2	6	209941	209946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4262	NC_019697	AGT	2	6	209990	209995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4264	NC_019697	TGA	2	6	210078	210083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434384413
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4329	NC_019697	TTA	2	6	213029	213034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4331	NC_019697	ACT	2	6	213153	213158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4333	NC_019697	TTA	2	6	213214	213219	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4343	NC_019697	GCTAG	2	10	213853	213862	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
4344	NC_019697	GAT	2	6	213868	213873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4354	NC_019697	GCG	2	6	214457	214462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4355	NC_019697	ATT	2	6	214511	214516	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4364	NC_019697	CTGG	2	8	214942	214949	0 %	25 %	50 %	25 %	434384417
4365	NC_019697	TAT	2	6	214973	214978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434384417
4366	NC_019697	TATT	2	8	214994	215001	25 %	75 %	0 %	0 %	434384417
4367	NC_019697	GCCATC	2	12	215003	215014	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	434384417
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4370	NC_019697	AAGC	2	8	215348	215355	50 %	0 %	25 %	25 %	434384417
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4498	NC_019697	TGA	2	6	221312	221317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4499	NC_019697	ATCG	2	8	221327	221334	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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