MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chamaesiphon minutus PCC 6605

Total Repeats: 126585

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_019697	CAC	2	6	147055	147060	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	434384361
3002	NC_019697	GC	3	6	147080	147085	0 %	0 %	50 %	50 %	434384361
3003	NC_019697	ATA	2	6	147182	147187	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434384361
3004	NC_019697	AGCAA	2	10	147223	147232	60 %	0 %	20 %	20 %	434384361
3005	NC_019697	TAA	2	6	147255	147260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434384361
3006	NC_019697	TCGA	2	8	147272	147279	25 %	25 %	25 %	25 %	434384361
3007	NC_019697	CAT	2	6	147336	147341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434384361
3008	NC_019697	CTG	2	6	147359	147364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434384361
3009	NC_019697	TG	3	6	147363	147368	0 %	50 %	50 %	0 %	434384361
3010	NC_019697	GC	3	6	147413	147418	0 %	0 %	50 %	50 %	434384361
3011	NC_019697	CTG	3	9	147533	147541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434384361
3012	NC_019697	TCCG	2	8	147547	147554	0 %	25 %	25 %	50 %	434384361
3013	NC_019697	TGC	2	6	147585	147590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434384361
3014	NC_019697	AAT	2	6	147591	147596	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434384361
3015	NC_019697	AAAT	2	8	147618	147625	75 %	25 %	0 %	0 %	434384361
3016	NC_019697	ATAA	2	8	147637	147644	75 %	25 %	0 %	0 %	434384361
3017	NC_019697	CCAA	2	8	148031	148038	50 %	0 %	0 %	50 %	434384361
3018	NC_019697	CAA	2	6	148053	148058	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434384361
3019	NC_019697	TTC	2	6	148126	148131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434384361
3020	NC_019697	TTA	2	6	148200	148205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3021	NC_019697	GAA	2	6	148255	148260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3022	NC_019697	GAC	2	6	148365	148370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434384362
3023	NC_019697	ACC	2	6	148389	148394	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	434384362
3024	NC_019697	AAT	2	6	148470	148475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434384362
3025	NC_019697	CCG	2	6	148477	148482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	434384362
3026	NC_019697	CCA	2	6	148507	148512	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	434384362
3027	NC_019697	ATG	2	6	148525	148530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434384362
3028	NC_019697	CCA	2	6	148648	148653	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	434384362
3029	NC_019697	TAA	2	6	148686	148691	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434384362
3030	NC_019697	GC	3	6	148697	148702	0 %	0 %	50 %	50 %	434384362
3031	NC_019697	ATC	2	6	148755	148760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434384362
3032	NC_019697	CGA	2	6	148766	148771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434384362
3033	NC_019697	TAA	2	6	148788	148793	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434384362
3034	NC_019697	GCA	2	6	148813	148818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434384362
3035	NC_019697	AAT	2	6	148890	148895	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434384362
3036	NC_019697	CAT	2	6	148931	148936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434384362
3037	NC_019697	ACT	2	6	148981	148986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434384362
3038	NC_019697	ATT	2	6	148998	149003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434384362
3039	NC_019697	GTCC	2	8	149058	149065	0 %	25 %	25 %	50 %	434384362
3040	NC_019697	TTGT	2	8	149079	149086	0 %	75 %	25 %	0 %	434384362
3041	NC_019697	CTT	2	6	149087	149092	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434384362
3042	NC_019697	TCGA	2	8	149121	149128	25 %	25 %	25 %	25 %	434384362
3043	NC_019697	TAG	2	6	149159	149164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434384362
3044	NC_019697	ATA	2	6	149173	149178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434384362
3045	NC_019697	AGT	2	6	149181	149186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434384362
3046	NC_019697	TAAC	2	8	149200	149207	50 %	25 %	0 %	25 %	434384362
3047	NC_019697	GAA	2	6	149212	149217	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434384362
3048	NC_019697	CG	3	6	149268	149273	0 %	0 %	50 %	50 %	434384362
3049	NC_019697	GGT	2	6	149296	149301	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	434384362
3050	NC_019697	CAC	2	6	149306	149311	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	434384362
3051	NC_019697	ATAA	2	8	149347	149354	75 %	25 %	0 %	0 %	434384362
3052	NC_019697	ACCGAT	2	12	149409	149420	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	434384362
3053	NC_019697	AAT	3	9	149445	149453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434384362
3054	NC_019697	TGT	2	6	149616	149621	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3055	NC_019697	ATC	2	6	149638	149643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3056	NC_019697	TCG	2	6	149653	149658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3057	NC_019697	ATT	2	6	149677	149682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434384363
3058	NC_019697	G	6	6	149718	149723	0 %	0 %	100 %	0 %	434384363
3059	NC_019697	GGT	2	6	149786	149791	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	434384363
3060	NC_019697	CTT	2	6	149803	149808	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434384363
3061	NC_019697	TA	3	6	149837	149842	50 %	50 %	0 %	0 %	434384363
3062	NC_019697	CGA	2	6	150007	150012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434384363
3063	NC_019697	CCA	2	6	150025	150030	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	434384363
3064	NC_019697	AATC	2	8	150248	150255	50 %	25 %	0 %	25 %	434384363
3065	NC_019697	CGA	2	6	150268	150273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434384363
3066	NC_019697	CGGGA	2	10	150358	150367	20 %	0 %	60 %	20 %	434384363
3067	NC_019697	GGC	2	6	150389	150394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	434384363
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3069	NC_019697	TTG	2	6	150470	150475	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434384363
3070	NC_019697	CGG	2	6	150487	150492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	434384363
3071	NC_019697	GCT	2	6	150518	150523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434384363
3072	NC_019697	TTG	2	6	150545	150550	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434384363
3073	NC_019697	GAG	2	6	150557	150562	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	434384363
3074	NC_019697	GCGG	2	8	150569	150576	0 %	0 %	75 %	25 %	434384363
3075	NC_019697	CAG	2	6	150586	150591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434384363
3076	NC_019697	TCGA	2	8	150596	150603	25 %	25 %	25 %	25 %	434384363
3077	NC_019697	CGAT	2	8	150638	150645	25 %	25 %	25 %	25 %	434384363
3078	NC_019697	CTTGGG	2	12	150655	150666	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	434384363
3079	NC_019697	TTG	2	6	150719	150724	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434384363
3080	NC_019697	CGAT	2	8	150730	150737	25 %	25 %	25 %	25 %	434384363
3081	NC_019697	TAAATT	2	12	150743	150754	50 %	50 %	0 %	0 %	434384363
3082	NC_019697	GGCTTG	2	12	150755	150766	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	434384363
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3084	NC_019697	TTTA	2	8	150821	150828	25 %	75 %	0 %	0 %	434384363
3085	NC_019697	GGCTTG	2	12	150833	150844	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	434384363
3086	NC_019697	TGGCTT	2	12	150853	150864	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	434384363
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3088	NC_019697	GGCTTG	2	12	150911	150922	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	434384363
3089	NC_019697	GGC	2	6	150950	150955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	434384363
3090	NC_019697	T	6	6	150985	150990	0 %	100 %	0 %	0 %	434384363
3091	NC_019697	ACG	2	6	150999	151004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434384363
3092	NC_019697	CCG	2	6	151042	151047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	434384363
3093	NC_019697	AGC	2	6	151127	151132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434384363
3094	NC_019697	GGCT	2	8	151163	151170	0 %	25 %	50 %	25 %	434384363
3095	NC_019697	GCC	2	6	151200	151205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	434384363
3096	NC_019697	TTG	2	6	151213	151218	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434384363
3097	NC_019697	TTAT	2	8	151260	151267	25 %	75 %	0 %	0 %	434384363
3098	NC_019697	AGG	2	6	151283	151288	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3099	NC_019697	CCCT	2	8	151344	151351	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
3100	NC_019697	CGA	2	6	151381	151386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3101	NC_019697	AGT	2	6	151473	151478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3102	NC_019697	TCGA	2	8	151521	151528	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3103	NC_019697	TCGA	2	8	151570	151577	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3104	NC_019697	ATG	2	6	151635	151640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3105	NC_019697	ACAA	2	8	151647	151654	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3106	NC_019697	TTTC	2	8	151692	151699	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3107	NC_019697	AT	3	6	151712	151717	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3108	NC_019697	TC	4	8	151751	151758	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3109	NC_019697	ATGTCT	2	12	151801	151812	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	434384364
3110	NC_019697	AAGA	2	8	151846	151853	75 %	0 %	25 %	0 %	434384364
3111	NC_019697	AGA	2	6	151866	151871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434384364
3112	NC_019697	GCT	2	6	151897	151902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434384364
3113	NC_019697	CAA	2	6	151918	151923	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434384364
3114	NC_019697	TAC	2	6	152048	152053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434384364
3115	NC_019697	TTAT	2	8	152089	152096	25 %	75 %	0 %	0 %	434384364
3116	NC_019697	CGAT	2	8	152138	152145	25 %	25 %	25 %	25 %	434384364
3117	NC_019697	ACA	2	6	152177	152182	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434384364
3118	NC_019697	GC	3	6	152186	152191	0 %	0 %	50 %	50 %	434384364
3119	NC_019697	AATA	2	8	152224	152231	75 %	25 %	0 %	0 %	434384364
3120	NC_019697	A	6	6	152266	152271	100 %	0 %	0 %	0 %	434384364
3121	NC_019697	CAA	2	6	152295	152300	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434384364
3122	NC_019697	CG	3	6	152359	152364	0 %	0 %	50 %	50 %	434384364
3123	NC_019697	GCC	2	6	152383	152388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	434384364
3124	NC_019697	TAC	2	6	152448	152453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434384364
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3499	NC_019697	CTGG	2	8	170811	170818	0 %	25 %	50 %	25 %	434384381
3500	NC_019697	GTTT	2	8	170845	170852	0 %	75 %	25 %	0 %	434384381

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