MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chamaesiphon minutus PCC 6605

Total Repeats: 126585

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5002	NC_019697	CCAT	2	8	245714	245721	25 %	25 %	0 %	50 %	434384446
5003	NC_019697	TCGA	2	8	245773	245780	25 %	25 %	25 %	25 %	434384446
5004	NC_019697	GCA	2	6	245786	245791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434384446
5005	NC_019697	GC	3	6	245828	245833	0 %	0 %	50 %	50 %	434384446
5006	NC_019697	CAA	2	6	246010	246015	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434384446
5007	NC_019697	GC	3	6	246061	246066	0 %	0 %	50 %	50 %	434384446
5008	NC_019697	CCG	2	6	246095	246100	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	434384446
5009	NC_019697	AGA	2	6	246141	246146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434384446
5010	NC_019697	CGA	2	6	246147	246152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434384446
5011	NC_019697	T	6	6	246155	246160	0 %	100 %	0 %	0 %	434384446
5012	NC_019697	ATT	2	6	246201	246206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434384446
5013	NC_019697	ATCG	2	8	246232	246239	25 %	25 %	25 %	25 %	434384446
5014	NC_019697	CGA	2	6	246370	246375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434384447
5015	NC_019697	TCC	2	6	246453	246458	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	434384447
5016	NC_019697	TCAT	2	8	246528	246535	25 %	50 %	0 %	25 %	434384447
5017	NC_019697	ACT	2	6	246546	246551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434384447
5018	NC_019697	CTT	2	6	246660	246665	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434384447
5019	NC_019697	ATT	2	6	246674	246679	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434384447
5020	NC_019697	TC	3	6	246763	246768	0 %	50 %	0 %	50 %	434384447
5021	NC_019697	CAC	2	6	246779	246784	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	434384447
5022	NC_019697	A	6	6	246816	246821	100 %	0 %	0 %	0 %	434384447
5023	NC_019697	GC	3	6	246825	246830	0 %	0 %	50 %	50 %	434384447
5024	NC_019697	AGA	3	9	246856	246864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434384447
5025	NC_019697	AAACT	2	10	246903	246912	60 %	20 %	0 %	20 %	434384447
5026	NC_019697	GTC	2	6	246920	246925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434384447
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5029	NC_019697	GGATT	2	10	247107	247116	20 %	40 %	40 %	0 %	434384447
5030	NC_019697	CGAT	2	8	247142	247149	25 %	25 %	25 %	25 %	434384447
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5034	NC_019697	TATT	2	8	247343	247350	25 %	75 %	0 %	0 %	434384447
5035	NC_019697	ACC	2	6	247396	247401	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	434384447
5036	NC_019697	GCA	2	6	247412	247417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434384447
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5039	NC_019697	ATCG	2	8	247618	247625	25 %	25 %	25 %	25 %	434384447
5040	NC_019697	AAT	2	6	247652	247657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5041	NC_019697	AGA	2	6	247680	247685	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5042	NC_019697	CAA	2	6	247858	247863	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434384448
5043	NC_019697	ATA	2	6	247870	247875	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434384448
5044	NC_019697	TCC	2	6	247906	247911	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	434384448
5045	NC_019697	CAT	2	6	247964	247969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434384448
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5047	NC_019697	CGAT	2	8	248031	248038	25 %	25 %	25 %	25 %	434384449
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5053	NC_019697	AAT	2	6	248174	248179	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434384449
5054	NC_019697	TGG	2	6	248319	248324	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	434384449
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5060	NC_019697	ATA	2	6	248684	248689	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434384449
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5062	NC_019697	ATCG	2	8	248736	248743	25 %	25 %	25 %	25 %	434384449
5063	NC_019697	TTC	2	6	248809	248814	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434384449
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5065	NC_019697	TCGA	2	8	248933	248940	25 %	25 %	25 %	25 %	434384449
5066	NC_019697	CG	4	8	248948	248955	0 %	0 %	50 %	50 %	434384449
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5070	NC_019697	TTA	3	9	249140	249148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434384449
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5073	NC_019697	GTCT	2	8	249250	249257	0 %	50 %	25 %	25 %	434384449
5074	NC_019697	CTT	2	6	249324	249329	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434384449
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5081	NC_019697	GAGGGT	2	12	249562	249573	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	434384449
5082	NC_019697	TTGGG	2	10	249576	249585	0 %	40 %	60 %	0 %	434384449
5083	NC_019697	GTT	2	6	249606	249611	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5085	NC_019697	TGTCT	2	10	249666	249675	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
5086	NC_019697	CAAA	2	8	249726	249733	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5087	NC_019697	GC	3	6	249739	249744	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5088	NC_019697	G	7	7	249757	249763	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5089	NC_019697	CCG	2	6	249782	249787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5090	NC_019697	CCATA	2	10	249809	249818	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
5091	NC_019697	TCGA	2	8	249834	249841	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5092	NC_019697	ATC	2	6	249890	249895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5094	NC_019697	TAT	2	6	249962	249967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434384450
5095	NC_019697	T	6	6	250008	250013	0 %	100 %	0 %	0 %	434384450
5096	NC_019697	ATC	2	6	250014	250019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434384450
5097	NC_019697	CGA	2	6	250071	250076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434384450
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5099	NC_019697	GTC	2	6	250334	250339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434384450
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5101	NC_019697	TTA	2	6	250550	250555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5102	NC_019697	ATT	2	6	250571	250576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5103	NC_019697	TAA	2	6	250589	250594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5104	NC_019697	ACGC	2	8	250636	250643	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5105	NC_019697	TCGA	2	8	250650	250657	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5106	NC_019697	TTG	2	6	250708	250713	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434384451
5107	NC_019697	CGC	2	6	250756	250761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	434384451
5108	NC_019697	TCGA	2	8	250786	250793	25 %	25 %	25 %	25 %	434384451
5109	NC_019697	TGA	3	9	250817	250825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434384451
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5111	NC_019697	AT	3	6	250895	250900	50 %	50 %	0 %	0 %	434384451
5112	NC_019697	GTG	2	6	250912	250917	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	434384451
5113	NC_019697	CTC	2	6	250996	251001	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	434384451
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5115	NC_019697	TGA	2	6	251087	251092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434384451
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5118	NC_019697	TAG	2	6	251160	251165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5119	NC_019697	TAAT	2	8	251207	251214	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5120	NC_019697	TC	3	6	251246	251251	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5121	NC_019697	TCGA	2	8	251268	251275	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5122	NC_019697	ATT	2	6	251276	251281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5123	NC_019697	AG	3	6	251283	251288	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5124	NC_019697	AAT	2	6	251316	251321	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5125	NC_019697	GAT	2	6	251514	251519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434384452
5126	NC_019697	ATA	2	6	251541	251546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434384452
5127	NC_019697	TCA	2	6	251565	251570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434384452
5128	NC_019697	ACC	2	6	251602	251607	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	434384452
5129	NC_019697	CAC	2	6	251679	251684	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	434384452
5130	NC_019697	TAA	2	6	251731	251736	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434384452
5131	NC_019697	CAT	2	6	251745	251750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434384452
5132	NC_019697	AGT	2	6	251843	251848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434384452
5133	NC_019697	ATC	2	6	251897	251902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434384452
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5135	NC_019697	CAA	2	6	252006	252011	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434384453
5136	NC_019697	TCGA	2	8	252013	252020	25 %	25 %	25 %	25 %	434384453
5137	NC_019697	AAT	2	6	252029	252034	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434384453
5138	NC_019697	TGG	2	6	252036	252041	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	434384453
5139	NC_019697	AAT	2	6	252043	252048	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434384453
5140	NC_019697	ATG	2	6	252068	252073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434384453
5141	NC_019697	GGTT	2	8	252116	252123	0 %	50 %	50 %	0 %	434384453
5142	NC_019697	GCC	2	6	252127	252132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	434384453
5143	NC_019697	ATC	3	9	252142	252150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434384453
5144	NC_019697	ATCG	2	8	252168	252175	25 %	25 %	25 %	25 %	434384453
5145	NC_019697	CAA	2	6	252231	252236	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434384453
5146	NC_019697	ACA	2	6	252293	252298	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434384453
5147	NC_019697	CTA	2	6	252303	252308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434384453
5148	NC_019697	TGC	2	6	252321	252326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434384453
5149	NC_019697	TCT	2	6	252328	252333	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434384454
5150	NC_019697	GGATC	2	10	252446	252455	20 %	20 %	40 %	20 %	434384454
5151	NC_019697	TCG	2	6	252518	252523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5152	NC_019697	ATG	2	6	252589	252594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434384455
5153	NC_019697	CCA	2	6	252595	252600	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	434384455
5154	NC_019697	TCA	2	6	252610	252615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434384455
5155	NC_019697	ACTCC	2	10	252623	252632	20 %	20 %	0 %	60 %	434384455
5156	NC_019697	AGCA	2	8	252782	252789	50 %	0 %	25 %	25 %	434384455
5157	NC_019697	AAT	2	6	252922	252927	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5158	NC_019697	GACA	2	8	253006	253013	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5159	NC_019697	CGC	2	6	253076	253081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5160	NC_019697	CAT	2	6	253140	253145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5161	NC_019697	AGAGTG	2	12	253211	253222	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	434384456
5162	NC_019697	CAC	2	6	253259	253264	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	434384456
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5164	NC_019697	TCC	2	6	253458	253463	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	434384456
5165	NC_019697	AT	3	6	253572	253577	50 %	50 %	0 %	0 %	434384456
5166	NC_019697	CAG	2	6	253629	253634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434384456
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5196	NC_019697	CAT	2	6	254687	254692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434384456
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5201	NC_019697	GAG	2	6	254817	254822	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	434384456
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5220	NC_019697	ATA	2	6	255622	255627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434384456
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5229	NC_019697	CTT	2	6	255869	255874	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434384456
5230	NC_019697	CTG	2	6	255877	255882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434384456
5231	NC_019697	CAT	2	6	255908	255913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434384456
5232	NC_019697	TGC	2	6	255926	255931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434384456
5233	NC_019697	CCG	2	6	255937	255942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	434384456
5234	NC_019697	CGC	2	6	255989	255994	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	434384456
5235	NC_019697	TAA	2	6	256026	256031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434384456
5236	NC_019697	GTC	2	6	256032	256037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434384456
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5240	NC_019697	CAG	2	6	256163	256168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434384456
5241	NC_019697	GTG	2	6	256207	256212	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	434384456
5242	NC_019697	GCC	2	6	256236	256241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	434384456
5243	NC_019697	TCA	2	6	256264	256269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434384456
5244	NC_019697	GAC	2	6	256275	256280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434384456
5245	NC_019697	GTT	2	6	256296	256301	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434384456
5246	NC_019697	ACC	2	6	256326	256331	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	434384456
5247	NC_019697	AGT	2	6	256360	256365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434384456
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5311	NC_019697	TCGAT	2	10	259177	259186	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
5312	NC_019697	TCGA	2	8	259228	259235	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5313	NC_019697	T	6	6	259273	259278	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5314	NC_019697	ATCG	2	8	259300	259307	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5315	NC_019697	AAT	2	6	259355	259360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5316	NC_019697	ACT	2	6	259392	259397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5320	NC_019697	GCT	2	6	259592	259597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434384457
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5327	NC_019697	A	6	6	259810	259815	100 %	0 %	0 %	0 %	434384457
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5336	NC_019697	ACTGG	2	10	260363	260372	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
5337	NC_019697	GA	3	6	260409	260414	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5338	NC_019697	CGAT	2	8	260436	260443	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5339	NC_019697	TAT	2	6	260454	260459	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5340	NC_019697	GCA	2	6	260507	260512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5341	NC_019697	TCGA	3	12	260643	260654	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5342	NC_019697	ATCG	2	8	260663	260670	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5343	NC_019697	TCGA	2	8	260699	260706	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5344	NC_019697	CGAT	2	8	260742	260749	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5345	NC_019697	AAACA	2	10	260761	260770	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
5346	NC_019697	CGAT	2	8	260844	260851	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5347	NC_019697	ATCG	2	8	260863	260870	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5348	NC_019697	CTA	2	6	260882	260887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5349	NC_019697	TCGA	2	8	260899	260906	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5350	NC_019697	AAATT	2	10	260922	260931	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5351	NC_019697	CGAT	2	8	260942	260949	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5352	NC_019697	CAG	2	6	261028	261033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5353	NC_019697	TAC	2	6	261086	261091	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434384458
5354	NC_019697	GCTC	2	8	261204	261211	0 %	25 %	25 %	50 %	434384458
5355	NC_019697	GGTG	2	8	261255	261262	0 %	25 %	75 %	0 %	434384458
5356	NC_019697	AGC	2	6	261393	261398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434384458
5357	NC_019697	TATT	2	8	261457	261464	25 %	75 %	0 %	0 %	434384458
5358	NC_019697	ATT	2	6	261487	261492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434384458
5359	NC_019697	TCAT	2	8	261494	261501	25 %	50 %	0 %	25 %	434384458
5360	NC_019697	GGGAA	2	10	261544	261553	40 %	0 %	60 %	0 %	434384458
5361	NC_019697	ATTT	2	8	261626	261633	25 %	75 %	0 %	0 %	434384458
5362	NC_019697	ACTAGA	2	12	261645	261656	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	434384458
5363	NC_019697	TA	3	6	261713	261718	50 %	50 %	0 %	0 %	434384458
5364	NC_019697	AGG	2	6	261731	261736	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	434384458
5365	NC_019697	CAA	2	6	261739	261744	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434384458
5366	NC_019697	GTC	2	6	261749	261754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434384458
5367	NC_019697	AGG	2	6	261755	261760	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	434384458
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5369	NC_019697	TGT	2	6	261890	261895	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434384458
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5372	NC_019697	ATA	2	6	262152	262157	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5373	NC_019697	TCC	2	6	262211	262216	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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5405	NC_019697	GATC	3	12	263821	263832	25 %	25 %	25 %	25 %	434384461
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5423	NC_019697	CGAT	2	8	264675	264682	25 %	25 %	25 %	25 %	434384461
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5427	NC_019697	TTCAG	2	10	264903	264912	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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5480	NC_019697	CGAT	2	8	268093	268100	25 %	25 %	25 %	25 %	434384462
5481	NC_019697	GTC	2	6	268107	268112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434384462
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5483	NC_019697	AAT	2	6	268159	268164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434384462
5484	NC_019697	TAA	2	6	268236	268241	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5485	NC_019697	AC	3	6	268259	268264	50 %	0 %	0 %	50 %	434384463
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5490	NC_019697	GCT	2	6	268600	268605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434384463
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5493	NC_019697	CG	3	6	268786	268791	0 %	0 %	50 %	50 %	434384463
5494	NC_019697	GGC	2	6	268804	268809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	434384463
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5497	NC_019697	GTG	2	6	268963	268968	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5498	NC_019697	GGGT	2	8	268971	268978	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
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