MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chamaesiphon minutus PCC 6605

Total Repeats: 126585

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_019697	AGT	2	6	221501	221506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4502	NC_019697	CAA	2	6	221558	221563	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434384419
4503	NC_019697	TC	3	6	221599	221604	0 %	50 %	0 %	50 %	434384419
4504	NC_019697	AGA	2	6	221626	221631	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434384419
4505	NC_019697	TGGC	2	8	221648	221655	0 %	25 %	50 %	25 %	434384419
4506	NC_019697	GAC	2	6	221690	221695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434384419
4507	NC_019697	AAG	2	6	221724	221729	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434384419
4508	NC_019697	ATC	2	6	221807	221812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434384420
4509	NC_019697	GTT	2	6	221815	221820	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434384420
4510	NC_019697	CAG	2	6	221846	221851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434384420
4511	NC_019697	GAA	2	6	221878	221883	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434384420
4512	NC_019697	GGCT	2	8	221897	221904	0 %	25 %	50 %	25 %	434384420
4513	NC_019697	GCC	2	6	222016	222021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	434384420
4514	NC_019697	ATT	2	6	222023	222028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434384420
4515	NC_019697	CAG	2	6	222031	222036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434384420
4516	NC_019697	A	6	6	222047	222052	100 %	0 %	0 %	0 %	434384420
4517	NC_019697	ATCG	2	8	222156	222163	25 %	25 %	25 %	25 %	434384420
4518	NC_019697	GTCT	2	8	222171	222178	0 %	50 %	25 %	25 %	434384420
4519	NC_019697	GATC	2	8	222182	222189	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4520	NC_019697	A	6	6	222277	222282	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4521	NC_019697	TAA	2	6	222283	222288	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4522	NC_019697	ATT	2	6	222413	222418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4523	NC_019697	A	7	7	222517	222523	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4524	NC_019697	TGA	2	6	222718	222723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434384421
4525	NC_019697	ACCG	2	8	222763	222770	25 %	0 %	25 %	50 %	434384421
4526	NC_019697	ATC	2	6	222822	222827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4527	NC_019697	TTAGT	2	10	222828	222837	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
4528	NC_019697	TCAA	2	8	222882	222889	50 %	25 %	0 %	25 %	434384422
4529	NC_019697	ATC	2	6	222924	222929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434384422
4530	NC_019697	ATCG	2	8	222963	222970	25 %	25 %	25 %	25 %	434384422
4531	NC_019697	AT	4	8	223075	223082	50 %	50 %	0 %	0 %	434384422
4532	NC_019697	A	6	6	223164	223169	100 %	0 %	0 %	0 %	434384422
4533	NC_019697	A	7	7	223181	223187	100 %	0 %	0 %	0 %	434384422
4534	NC_019697	ATT	2	6	223209	223214	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434384422
4535	NC_019697	ATG	2	6	223233	223238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434384422
4536	NC_019697	GGT	2	6	223271	223276	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	434384422
4537	NC_019697	TC	3	6	223279	223284	0 %	50 %	0 %	50 %	434384422
4538	NC_019697	ATC	2	6	223314	223319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434384422
4539	NC_019697	TAG	2	6	223449	223454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4540	NC_019697	T	7	7	223523	223529	0 %	100 %	0 %	0 %	434384423
4541	NC_019697	CTT	2	6	223532	223537	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434384423
4542	NC_019697	CTC	2	6	223542	223547	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	434384423
4543	NC_019697	TCT	2	6	223583	223588	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434384423
4544	NC_019697	TCA	2	6	223606	223611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434384423
4545	NC_019697	CGTC	2	8	223627	223634	0 %	25 %	25 %	50 %	434384423
4546	NC_019697	ACC	2	6	223698	223703	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	434384423
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4549	NC_019697	GAC	2	6	223932	223937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434384423
4550	NC_019697	CCAG	2	8	223944	223951	25 %	0 %	25 %	50 %	434384423
4551	NC_019697	CTT	2	6	223988	223993	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434384423
4552	NC_019697	GGC	3	9	224043	224051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	434384423
4553	NC_019697	GTA	2	6	224058	224063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434384423
4554	NC_019697	CGA	2	6	224081	224086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434384423
4555	NC_019697	GCG	2	6	224098	224103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	434384423
4556	NC_019697	CGA	2	6	224138	224143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434384423
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4558	NC_019697	TCA	2	6	224167	224172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434384423
4559	NC_019697	TCG	2	6	224216	224221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434384423
4560	NC_019697	TTG	2	6	224226	224231	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434384423
4561	NC_019697	T	6	6	224310	224315	0 %	100 %	0 %	0 %	434384423
4562	NC_019697	TTA	2	6	224422	224427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434384423
4563	NC_019697	TGA	2	6	224441	224446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434384423
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4566	NC_019697	ATCG	2	8	224742	224749	25 %	25 %	25 %	25 %	434384423
4567	NC_019697	CG	3	6	224748	224753	0 %	0 %	50 %	50 %	434384423
4568	NC_019697	ATCG	2	8	224760	224767	25 %	25 %	25 %	25 %	434384423
4569	NC_019697	ATCG	2	8	224813	224820	25 %	25 %	25 %	25 %	434384423
4570	NC_019697	TCG	2	6	224827	224832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434384423
4571	NC_019697	GTCG	2	8	224885	224892	0 %	25 %	50 %	25 %	434384423
4572	NC_019697	GATA	2	8	224912	224919	50 %	25 %	25 %	0 %	434384423
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4587	NC_019697	ATCTTC	2	12	225612	225623	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	434384423
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4589	NC_019697	ATA	2	6	225711	225716	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434384423
4590	NC_019697	AAT	2	6	225717	225722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434384423
4591	NC_019697	TAA	2	6	225771	225776	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434384423
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4593	NC_019697	CGAT	2	8	225823	225830	25 %	25 %	25 %	25 %	434384423
4594	NC_019697	TCA	2	6	226030	226035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434384423
4595	NC_019697	ATA	2	6	226051	226056	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434384423
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4598	NC_019697	CCAG	2	8	226196	226203	25 %	0 %	25 %	50 %	434384424
4599	NC_019697	CGAT	2	8	226411	226418	25 %	25 %	25 %	25 %	434384424
4600	NC_019697	AT	3	6	226471	226476	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4601	NC_019697	AGA	2	6	226483	226488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4602	NC_019697	GAA	2	6	226490	226495	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4603	NC_019697	GAA	2	6	226531	226536	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434384425
4604	NC_019697	TGGA	2	8	226636	226643	25 %	25 %	50 %	0 %	434384425
4605	NC_019697	TCGA	2	8	226687	226694	25 %	25 %	25 %	25 %	434384425
4606	NC_019697	TGC	2	6	226731	226736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4607	NC_019697	CGAT	2	8	226801	226808	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4608	NC_019697	ATT	2	6	226905	226910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434384426
4609	NC_019697	A	6	6	226946	226951	100 %	0 %	0 %	0 %	434384426
4610	NC_019697	CGAT	2	8	227078	227085	25 %	25 %	25 %	25 %	434384426
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4746	NC_019697	ATA	2	6	233252	233257	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4754	NC_019697	CGAT	2	8	233589	233596	25 %	25 %	25 %	25 %	434384434
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4869	NC_019697	AT	3	6	239258	239263	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4870	NC_019697	CA	3	6	239480	239485	50 %	0 %	0 %	50 %	434384440
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4874	NC_019697	TGC	2	6	239810	239815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434384440
4875	NC_019697	GACT	2	8	239836	239843	25 %	25 %	25 %	25 %	434384440
4876	NC_019697	GCT	2	6	239991	239996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434384440
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4881	NC_019697	GTT	2	6	240089	240094	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4882	NC_019697	GTT	2	6	240132	240137	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4883	NC_019697	TGC	2	6	240197	240202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4885	NC_019697	C	6	6	240244	240249	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4886	NC_019697	TCC	2	6	240274	240279	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4887	NC_019697	CCT	2	6	240294	240299	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4888	NC_019697	GGGTG	2	10	240316	240325	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
4889	NC_019697	CCG	2	6	240335	240340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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4891	NC_019697	AG	3	6	240373	240378	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4892	NC_019697	CGAT	2	8	240387	240394	25 %	25 %	25 %	25 %	434384441
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4894	NC_019697	CG	3	6	240472	240477	0 %	0 %	50 %	50 %	434384441
4895	NC_019697	AAGA	2	8	240513	240520	75 %	0 %	25 %	0 %	434384441
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4980	NC_019697	AC	3	6	244795	244800	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4981	NC_019697	AAC	2	6	244802	244807	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4985	NC_019697	ACCC	2	8	244927	244934	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
4986	NC_019697	T	6	6	244977	244982	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4987	NC_019697	TTTG	2	8	244984	244991	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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4993	NC_019697	TTAC	2	8	245176	245183	25 %	50 %	0 %	25 %	434384446
4994	NC_019697	CTG	2	6	245321	245326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434384446
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4998	NC_019697	TAT	2	6	245501	245506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434384446
4999	NC_019697	TTA	2	6	245507	245512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434384446
5000	NC_019697	GAT	2	6	245521	245526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434384446

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