MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chroococcidiopsis thermalis PCC 7203 chromosome

Total Repeats: 120519

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_019695	CAG	2	6	155226	155231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428205196
3002	NC_019695	TGG	2	6	155232	155237	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428205196
3003	NC_019695	CAAGCG	2	12	155277	155288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428205196
3004	NC_019695	TGC	2	6	155293	155298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428205196
3005	NC_019695	CAAG	2	8	155303	155310	50 %	0 %	25 %	25 %	428205196
3006	NC_019695	AAG	2	6	155347	155352	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428205196
3007	NC_019695	GAT	2	6	155391	155396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428205196
3008	NC_019695	CAA	2	6	155457	155462	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428205196
3009	NC_019695	GCG	2	6	155477	155482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428205196
3010	NC_019695	GTTC	2	8	155504	155511	0 %	50 %	25 %	25 %	428205196
3011	NC_019695	AAG	2	6	155518	155523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428205196
3012	NC_019695	TGC	2	6	155650	155655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428205196
3013	NC_019695	ACA	2	6	155708	155713	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428205196
3014	NC_019695	CGG	2	6	155733	155738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428205196
3015	NC_019695	GAA	2	6	155760	155765	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428205196
3016	NC_019695	TTAGAT	2	12	155775	155786	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	428205196
3017	NC_019695	ACA	2	6	155816	155821	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428205196
3018	NC_019695	CAG	2	6	155904	155909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428205196
3019	NC_019695	AAGA	2	8	155920	155927	75 %	0 %	25 %	0 %	428205196
3020	NC_019695	GCA	2	6	155951	155956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428205196
3021	NC_019695	TGC	2	6	155981	155986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428205196
3022	NC_019695	GAA	2	6	156015	156020	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428205196
3023	NC_019695	TGGA	2	8	156046	156053	25 %	25 %	50 %	0 %	428205196
3024	NC_019695	ACC	2	6	156107	156112	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428205196
3025	NC_019695	AGC	2	6	156116	156121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428205196
3026	NC_019695	A	7	7	156160	156166	100 %	0 %	0 %	0 %	428205196
3027	NC_019695	TGC	2	6	156235	156240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3028	NC_019695	AGC	2	6	156331	156336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428205197
3029	NC_019695	TGC	2	6	156392	156397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428205197
3030	NC_019695	GCG	2	6	156451	156456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428205197
3031	NC_019695	GAG	2	6	156487	156492	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428205197
3032	NC_019695	TGCG	2	8	156498	156505	0 %	25 %	50 %	25 %	428205197
3033	NC_019695	CCTCTG	2	12	156591	156602	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	428205197
3034	NC_019695	GCT	2	6	156689	156694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428205197
3035	NC_019695	CAA	2	6	156787	156792	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428205197
3036	NC_019695	GCTG	2	8	157036	157043	0 %	25 %	50 %	25 %	428205197
3037	NC_019695	TG	3	6	157042	157047	0 %	50 %	50 %	0 %	428205197
3038	NC_019695	CGC	2	6	157087	157092	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428205197
3039	NC_019695	GCT	2	6	157121	157126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428205197
3040	NC_019695	GCT	2	6	157140	157145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428205197
3041	NC_019695	GGCG	2	8	157389	157396	0 %	0 %	75 %	25 %	428205197
3042	NC_019695	TGT	2	6	157437	157442	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3043	NC_019695	A	7	7	157452	157458	100 %	0 %	0 %	0 %	428205198
3044	NC_019695	CGA	2	6	157553	157558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428205198
3045	NC_019695	GCA	2	6	157595	157600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428205198
3046	NC_019695	TGT	2	6	157743	157748	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428205198
3047	NC_019695	GA	3	6	157779	157784	50 %	0 %	50 %	0 %	428205198
3048	NC_019695	GAG	2	6	157838	157843	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428205198
3049	NC_019695	CCCG	2	8	157861	157868	0 %	0 %	25 %	75 %	428205198
3050	NC_019695	CAG	2	6	157908	157913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428205198
3051	NC_019695	GCA	2	6	157961	157966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428205198
3052	NC_019695	CTG	2	6	157968	157973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428205198
3053	NC_019695	GA	3	6	157974	157979	50 %	0 %	50 %	0 %	428205198
3054	NC_019695	CCA	2	6	158072	158077	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428205198
3055	NC_019695	AGC	2	6	158122	158127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428205198
3056	NC_019695	CAT	2	6	158137	158142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428205198
3057	NC_019695	CAT	2	6	158155	158160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428205198
3058	NC_019695	AGC	2	6	158236	158241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428205198
3059	NC_019695	ACGGCT	2	12	158281	158292	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	428205198
3060	NC_019695	CCG	2	6	158439	158444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428205198
3061	NC_019695	T	7	7	158587	158593	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3062	NC_019695	CT	3	6	158698	158703	0 %	50 %	0 %	50 %	428205199
3063	NC_019695	TCT	2	6	158726	158731	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428205199
3064	NC_019695	CAA	2	6	158738	158743	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428205199
3065	NC_019695	GCT	2	6	158769	158774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428205199
3066	NC_019695	GAA	2	6	158811	158816	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428205199
3067	NC_019695	TTG	2	6	158820	158825	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428205199
3068	NC_019695	A	6	6	158880	158885	100 %	0 %	0 %	0 %	428205199
3069	NC_019695	CTGT	2	8	158918	158925	0 %	50 %	25 %	25 %	428205199
3070	NC_019695	GAA	2	6	159000	159005	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428205199
3071	NC_019695	TCCA	2	8	159015	159022	25 %	25 %	0 %	50 %	428205199
3072	NC_019695	TTTGG	2	10	159171	159180	0 %	60 %	40 %	0 %	428205199
3073	NC_019695	AAAG	2	8	159193	159200	75 %	0 %	25 %	0 %	428205199
3074	NC_019695	CCAT	2	8	159262	159269	25 %	25 %	0 %	50 %	428205199
3075	NC_019695	GATTG	2	10	159356	159365	20 %	40 %	40 %	0 %	428205199
3076	NC_019695	CAT	2	6	159417	159422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428205199
3077	NC_019695	GGC	2	6	159440	159445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428205199
3078	NC_019695	TTG	2	6	159483	159488	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428205199
3079	NC_019695	TAG	2	6	159548	159553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428205199
3080	NC_019695	GCA	3	9	159619	159627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428205199
3081	NC_019695	GTG	2	6	159700	159705	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428205199
3082	NC_019695	CTG	2	6	159710	159715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428205199
3083	NC_019695	AGC	2	6	159729	159734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428205199
3084	NC_019695	CGG	2	6	159812	159817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428205199
3085	NC_019695	AAT	2	6	159821	159826	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428205199
3086	NC_019695	TGC	2	6	159930	159935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428205199
3087	NC_019695	CTG	2	6	159972	159977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428205199
3088	NC_019695	CTT	2	6	160049	160054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428205199
3089	NC_019695	GAG	2	6	160104	160109	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428205199
3090	NC_019695	TGC	2	6	160180	160185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428205199
3091	NC_019695	CTG	2	6	160188	160193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428205199
3092	NC_019695	ATAG	2	8	160207	160214	50 %	25 %	25 %	0 %	428205199
3093	NC_019695	CCA	2	6	160217	160222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428205199
3094	NC_019695	ATA	2	6	160237	160242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428205199
3095	NC_019695	CAGG	2	8	160253	160260	25 %	0 %	50 %	25 %	428205199
3096	NC_019695	GGA	2	6	160283	160288	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428205199
3097	NC_019695	TAA	2	6	160320	160325	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428205199
3098	NC_019695	CAG	2	6	160328	160333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428205199
3099	NC_019695	GAAGG	2	10	160349	160358	40 %	0 %	60 %	0 %	428205199
3100	NC_019695	GCGA	2	8	160405	160412	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3101	NC_019695	T	7	7	160468	160474	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3102	NC_019695	TTTAA	2	10	160528	160537	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3103	NC_019695	GACAA	2	10	160662	160671	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
3104	NC_019695	CCA	2	6	160672	160677	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3105	NC_019695	TTG	2	6	160741	160746	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428205200
3106	NC_019695	TTG	2	6	160864	160869	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428205200
3107	NC_019695	TGT	2	6	160872	160877	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428205200
3108	NC_019695	ATA	2	6	160886	160891	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428205200
3109	NC_019695	TTC	2	6	160924	160929	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428205200
3110	NC_019695	TGC	2	6	161027	161032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428205200
3111	NC_019695	AG	4	8	161041	161048	50 %	0 %	50 %	0 %	428205200
3112	NC_019695	TTTG	2	8	161058	161065	0 %	75 %	25 %	0 %	428205200
3113	NC_019695	AGC	2	6	161092	161097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428205200
3114	NC_019695	GCTC	2	8	161108	161115	0 %	25 %	25 %	50 %	428205200
3115	NC_019695	A	6	6	161442	161447	100 %	0 %	0 %	0 %	428205200
3116	NC_019695	AGAT	2	8	161449	161456	50 %	25 %	25 %	0 %	428205200
3117	NC_019695	AG	3	6	161511	161516	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3118	NC_019695	TAAA	2	8	161601	161608	75 %	25 %	0 %	0 %	428205201
3119	NC_019695	ATG	3	9	161647	161655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428205201
3120	NC_019695	CAG	3	9	161657	161665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428205201
3121	NC_019695	AAG	2	6	161767	161772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428205201
3122	NC_019695	ATG	4	12	161977	161988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428205201
3123	NC_019695	ATAA	2	8	162090	162097	75 %	25 %	0 %	0 %	428205201
3124	NC_019695	TGGA	2	8	162098	162105	25 %	25 %	50 %	0 %	428205201
3125	NC_019695	TTC	2	6	162168	162173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428205201
3126	NC_019695	GGAAA	2	10	162202	162211	60 %	0 %	40 %	0 %	428205201
3127	NC_019695	GAC	2	6	162222	162227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428205201
3128	NC_019695	TAC	2	6	162239	162244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428205201
3129	NC_019695	GCA	3	9	162268	162276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428205201
3130	NC_019695	GAG	2	6	162286	162291	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428205201
3131	NC_019695	TCCG	2	8	162317	162324	0 %	25 %	25 %	50 %	428205201
3132	NC_019695	CGT	2	6	162456	162461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428205201
3133	NC_019695	GCG	2	6	162524	162529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428205202
3134	NC_019695	TGA	2	6	162565	162570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428205202
3135	NC_019695	CTG	2	6	162619	162624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428205202
3136	NC_019695	CGG	2	6	162712	162717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428205202
3137	NC_019695	CG	3	6	162746	162751	0 %	0 %	50 %	50 %	428205202
3138	NC_019695	AAG	2	6	162769	162774	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428205202
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3142	NC_019695	CAG	2	6	163004	163009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428205202
3143	NC_019695	GCG	2	6	163073	163078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428205202
3144	NC_019695	AGC	2	6	163112	163117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428205202
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3146	NC_019695	GCGATC	2	12	163143	163154	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	428205202
3147	NC_019695	TTG	2	6	163203	163208	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428205202
3148	NC_019695	TGG	2	6	163312	163317	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428205202
3149	NC_019695	TGC	2	6	163379	163384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428205202
3150	NC_019695	AAGGAG	2	12	163491	163502	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3151	NC_019695	CGAT	2	8	163518	163525	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3152	NC_019695	TTA	2	6	163587	163592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428205203
3153	NC_019695	TGT	2	6	163597	163602	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428205203
3154	NC_019695	TACCT	2	10	163662	163671	20 %	40 %	0 %	40 %	428205203
3155	NC_019695	T	6	6	163809	163814	0 %	100 %	0 %	0 %	428205203
3156	NC_019695	TAT	2	6	163931	163936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428205203
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3158	NC_019695	AAGCC	2	10	163960	163969	40 %	0 %	20 %	40 %	428205203
3159	NC_019695	CTT	2	6	164045	164050	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428205203
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3161	NC_019695	T	7	7	164189	164195	0 %	100 %	0 %	0 %	428205203
3162	NC_019695	TAC	2	6	164241	164246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428205203
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3164	NC_019695	T	6	6	164298	164303	0 %	100 %	0 %	0 %	428205203
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3171	NC_019695	TGT	2	6	164679	164684	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3172	NC_019695	TTA	2	6	164743	164748	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3173	NC_019695	ATCG	2	8	164889	164896	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3174	NC_019695	CCA	2	6	164971	164976	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3175	NC_019695	ATA	2	6	164995	165000	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3176	NC_019695	TAT	2	6	165065	165070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3177	NC_019695	CTT	2	6	165128	165133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428205204
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3194	NC_019695	AGTG	2	8	165956	165963	25 %	25 %	50 %	0 %	428205205
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3200	NC_019695	A	6	6	166220	166225	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3201	NC_019695	GTA	2	6	166346	166351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428205206
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3212	NC_019695	AT	3	6	166935	166940	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3213	NC_019695	TCAA	2	8	166965	166972	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3214	NC_019695	T	6	6	167051	167056	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3215	NC_019695	GCGATC	2	12	167083	167094	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3219	NC_019695	A	7	7	167275	167281	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3220	NC_019695	CTG	2	6	167289	167294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3230	NC_019695	ATC	2	6	167991	167996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428205207
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3232	NC_019695	GTC	2	6	168063	168068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428205207
3233	NC_019695	GTG	2	6	168189	168194	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428205207
3234	NC_019695	ATAC	2	8	168271	168278	50 %	25 %	0 %	25 %	428205207
3235	NC_019695	GCA	2	6	168403	168408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428205207
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3237	NC_019695	GAC	2	6	168470	168475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428205207
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3239	NC_019695	GCG	2	6	168494	168499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428205207
3240	NC_019695	GCAA	2	8	168587	168594	50 %	0 %	25 %	25 %	428205207
3241	NC_019695	AGC	2	6	168611	168616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428205207
3242	NC_019695	TCG	2	6	168631	168636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428205207
3243	NC_019695	AGA	2	6	168671	168676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428205207
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3464	NC_019695	C	6	6	180516	180521	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3465	NC_019695	G	6	6	180529	180534	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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3467	NC_019695	G	6	6	180581	180586	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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3485	NC_019695	TAG	2	6	181397	181402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3488	NC_019695	ATCT	2	8	181445	181452	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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3490	NC_019695	AAT	2	6	181507	181512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3493	NC_019695	ATCG	2	8	181680	181687	25 %	25 %	25 %	25 %	428205218
3494	NC_019695	AGCCA	2	10	181769	181778	40 %	0 %	20 %	40 %	428205218
3495	NC_019695	CTG	2	6	181789	181794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428205218
3496	NC_019695	CAA	2	6	181841	181846	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428205218
3497	NC_019695	ACATGG	2	12	181879	181890	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	428205218
3498	NC_019695	ATA	2	6	181958	181963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428205219
3499	NC_019695	TTG	2	6	181971	181976	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428205219
3500	NC_019695	GCT	2	6	181990	181995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428205219

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