MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chroococcidiopsis thermalis PCC 7203 chromosome

Total Repeats: 120519

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_019695	CCTTG	2	10	260095	260104	0 %	40 %	20 %	40 %	428205296
5002	NC_019695	CTTT	2	8	260218	260225	0 %	75 %	0 %	25 %	428205296
5003	NC_019695	TGGCGA	2	12	260264	260275	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	428205296
5004	NC_019695	CG	3	6	260343	260348	0 %	0 %	50 %	50 %	428205296
5005	NC_019695	GCGATC	2	12	260370	260381	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	428205296
5006	NC_019695	GAT	2	6	260409	260414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428205296
5007	NC_019695	GGT	2	6	260499	260504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428205296
5008	NC_019695	CGA	2	6	260516	260521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428205296
5009	NC_019695	ATT	2	6	260541	260546	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428205296
5010	NC_019695	TTG	2	6	260629	260634	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428205296
5011	NC_019695	AAT	2	6	260658	260663	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428205296
5012	NC_019695	TCT	2	6	260664	260669	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428205296
5013	NC_019695	AGC	2	6	260705	260710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428205296
5014	NC_019695	CAG	2	6	260779	260784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428205296
5015	NC_019695	TGA	2	6	260839	260844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5016	NC_019695	CTC	2	6	260849	260854	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5017	NC_019695	TAT	2	6	260858	260863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5018	NC_019695	ATC	2	6	260922	260927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5019	NC_019695	TCT	2	6	260941	260946	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5020	NC_019695	AAT	2	6	260989	260994	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5021	NC_019695	AT	3	6	261004	261009	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5022	NC_019695	TTG	2	6	261026	261031	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5023	NC_019695	TCT	2	6	261078	261083	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428205297
5024	NC_019695	CTCAA	2	10	261096	261105	40 %	20 %	0 %	40 %	428205297
5025	NC_019695	GAC	2	6	261115	261120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428205297
5026	NC_019695	TC	3	6	261136	261141	0 %	50 %	0 %	50 %	428205297
5027	NC_019695	GTA	2	6	261160	261165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428205297
5028	NC_019695	TTC	2	6	261199	261204	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428205297
5029	NC_019695	AT	3	6	261296	261301	50 %	50 %	0 %	0 %	428205297
5030	NC_019695	CTT	2	6	261457	261462	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428205297
5031	NC_019695	CA	4	8	261495	261502	50 %	0 %	0 %	50 %	428205297
5032	NC_019695	GGAAGA	2	12	261515	261526	50 %	0 %	50 %	0 %	428205297
5033	NC_019695	TCGAG	2	10	261541	261550	20 %	20 %	40 %	20 %	428205297
5034	NC_019695	ATT	2	6	261583	261588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428205297
5035	NC_019695	GAA	2	6	261606	261611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428205297
5036	NC_019695	CCAT	2	8	261635	261642	25 %	25 %	0 %	50 %	428205297
5037	NC_019695	ATT	2	6	261683	261688	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428205297
5038	NC_019695	CAA	2	6	261711	261716	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428205297
5039	NC_019695	GTT	2	6	261819	261824	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428205297
5040	NC_019695	AAG	2	6	261860	261865	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428205297
5041	NC_019695	AGAT	2	8	261883	261890	50 %	25 %	25 %	0 %	428205297
5042	NC_019695	T	6	6	261945	261950	0 %	100 %	0 %	0 %	428205297
5043	NC_019695	ACG	2	6	261961	261966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428205297
5044	NC_019695	GTT	2	6	262006	262011	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428205297
5045	NC_019695	TCC	2	6	262020	262025	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428205297
5046	NC_019695	AAT	2	6	262137	262142	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428205297
5047	NC_019695	ACTT	2	8	262146	262153	25 %	50 %	0 %	25 %	428205297
5048	NC_019695	AGA	2	6	262223	262228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428205297
5049	NC_019695	AGCT	2	8	262240	262247	25 %	25 %	25 %	25 %	428205297
5050	NC_019695	TTA	2	6	262287	262292	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428205297
5051	NC_019695	TCA	2	6	262327	262332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428205297
5052	NC_019695	AGCA	2	8	262333	262340	50 %	0 %	25 %	25 %	428205297
5053	NC_019695	AGA	2	6	262469	262474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428205298
5054	NC_019695	GAAA	2	8	262534	262541	75 %	0 %	25 %	0 %	428205298
5055	NC_019695	TGG	2	6	262665	262670	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428205298
5056	NC_019695	TAG	2	6	262804	262809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428205298
5057	NC_019695	GAACCA	2	12	262884	262895	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	428205298
5058	NC_019695	CTG	2	6	262930	262935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428205298
5059	NC_019695	ATT	2	6	263046	263051	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428205298
5060	NC_019695	TGA	2	6	263132	263137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428205298
5061	NC_019695	GCA	2	6	263160	263165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428205298
5062	NC_019695	TTCG	2	8	263224	263231	0 %	50 %	25 %	25 %	428205298
5063	NC_019695	AAC	2	6	263239	263244	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428205298
5064	NC_019695	TAAT	2	8	263254	263261	50 %	50 %	0 %	0 %	428205298
5065	NC_019695	TTTG	2	8	263276	263283	0 %	75 %	25 %	0 %	428205298
5066	NC_019695	CGAC	2	8	263294	263301	25 %	0 %	25 %	50 %	428205298
5067	NC_019695	CAG	2	6	263412	263417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428205298
5068	NC_019695	GATG	2	8	263476	263483	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5069	NC_019695	GATC	2	8	263559	263566	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5070	NC_019695	A	6	6	263579	263584	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5071	NC_019695	TAGT	2	8	263585	263592	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5072	NC_019695	A	6	6	263603	263608	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5073	NC_019695	TTG	2	6	263659	263664	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428205299
5074	NC_019695	CTT	2	6	263686	263691	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428205299
5075	NC_019695	TAT	2	6	263695	263700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428205299
5076	NC_019695	CCAG	2	8	263740	263747	25 %	0 %	25 %	50 %	428205299
5077	NC_019695	CTC	2	6	263767	263772	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428205299
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5080	NC_019695	GCA	2	6	263822	263827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428205299
5081	NC_019695	TGAC	2	8	263854	263861	25 %	25 %	25 %	25 %	428205299
5082	NC_019695	A	6	6	263916	263921	100 %	0 %	0 %	0 %	428205299
5083	NC_019695	ATT	2	6	263967	263972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428205299
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5086	NC_019695	TCT	2	6	264196	264201	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428205299
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5089	NC_019695	T	7	7	264351	264357	0 %	100 %	0 %	0 %	428205299
5090	NC_019695	ATT	2	6	264368	264373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428205299
5091	NC_019695	TTA	2	6	264413	264418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5092	NC_019695	TAG	2	6	264449	264454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5093	NC_019695	AAC	2	6	264481	264486	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5094	NC_019695	AT	3	6	264515	264520	50 %	50 %	0 %	0 %	428205300
5095	NC_019695	TAC	2	6	264585	264590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428205300
5096	NC_019695	CTT	2	6	264643	264648	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428205300
5097	NC_019695	TAA	2	6	264734	264739	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428205300
5098	NC_019695	CAT	2	6	264747	264752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428205300
5099	NC_019695	A	8	8	264840	264847	100 %	0 %	0 %	0 %	428205300
5100	NC_019695	CGAT	2	8	264858	264865	25 %	25 %	25 %	25 %	428205300
5101	NC_019695	CATAT	2	10	264941	264950	40 %	40 %	0 %	20 %	428205301
5102	NC_019695	CGG	2	6	264960	264965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428205301
5103	NC_019695	CAA	2	6	264989	264994	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428205301
5104	NC_019695	AGA	2	6	264995	265000	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428205301
5105	NC_019695	AT	3	6	265121	265126	50 %	50 %	0 %	0 %	428205301
5106	NC_019695	TTG	2	6	265186	265191	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428205301
5107	NC_019695	T	6	6	265198	265203	0 %	100 %	0 %	0 %	428205301
5108	NC_019695	GTA	2	6	265212	265217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428205301
5109	NC_019695	ATGG	2	8	265371	265378	25 %	25 %	50 %	0 %	428205301
5110	NC_019695	TAG	2	6	265387	265392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428205301
5111	NC_019695	TCTTG	2	10	265418	265427	0 %	60 %	20 %	20 %	428205301
5112	NC_019695	ATT	2	6	265430	265435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428205301
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5114	NC_019695	GAT	2	6	265535	265540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428205301
5115	NC_019695	AAG	2	6	265557	265562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428205301
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5117	NC_019695	CAG	2	6	265614	265619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428205301
5118	NC_019695	GA	3	6	265674	265679	50 %	0 %	50 %	0 %	428205301
5119	NC_019695	TAA	2	6	265704	265709	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428205301
5120	NC_019695	ATT	2	6	265715	265720	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428205301
5121	NC_019695	AATT	2	8	265748	265755	50 %	50 %	0 %	0 %	428205301
5122	NC_019695	ATTTA	2	10	265766	265775	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5123	NC_019695	ATA	2	6	265802	265807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5124	NC_019695	GGTT	2	8	265817	265824	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5125	NC_019695	T	6	6	265887	265892	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5127	NC_019695	AAT	2	6	266022	266027	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5128	NC_019695	GTT	2	6	266062	266067	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5129	NC_019695	TTC	2	6	266348	266353	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5158	NC_019695	T	6	6	268061	268066	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5159	NC_019695	TA	3	6	268077	268082	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5233	NC_019695	AAATC	2	10	271790	271799	60 %	20 %	0 %	20 %	428205305
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5372	NC_019695	CAT	2	6	279644	279649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428205311
5373	NC_019695	CCATAC	2	12	279832	279843	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	428205311
5374	NC_019695	GAC	2	6	279845	279850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428205311
5375	NC_019695	GT	3	6	279870	279875	0 %	50 %	50 %	0 %	428205311
5376	NC_019695	TGGA	2	8	279876	279883	25 %	25 %	50 %	0 %	428205311
5377	NC_019695	TGT	2	6	279907	279912	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428205311
5378	NC_019695	GCT	3	9	279951	279959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428205311
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5380	NC_019695	GCA	2	6	280103	280108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5381	NC_019695	GCT	2	6	280179	280184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5382	NC_019695	AGC	2	6	280253	280258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5383	NC_019695	AGT	2	6	280281	280286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5384	NC_019695	AAAG	2	8	280288	280295	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5385	NC_019695	ACTTGG	2	12	280360	280371	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
5386	NC_019695	A	6	6	280386	280391	100 %	0 %	0 %	0 %	428205312
5387	NC_019695	CTAC	2	8	280479	280486	25 %	25 %	0 %	50 %	428205312
5388	NC_019695	TA	3	6	280516	280521	50 %	50 %	0 %	0 %	428205312
5389	NC_019695	TAC	2	6	280538	280543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428205312
5390	NC_019695	ATT	2	6	280581	280586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428205312
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5392	NC_019695	A	7	7	280668	280674	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5393	NC_019695	CTA	2	6	280728	280733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5394	NC_019695	GAA	2	6	280889	280894	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428205313
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5399	NC_019695	TAA	2	6	281186	281191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428205313
5400	NC_019695	TTC	2	6	281270	281275	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428205313
5401	NC_019695	TGAA	2	8	281298	281305	50 %	25 %	25 %	0 %	428205313
5402	NC_019695	TAA	2	6	281359	281364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428205313
5403	NC_019695	TAA	2	6	281384	281389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428205313
5404	NC_019695	GCC	2	6	281415	281420	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428205313
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5439	NC_019695	ATTA	2	8	283014	283021	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5440	NC_019695	CTA	2	6	283029	283034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5485	NC_019695	A	6	6	285005	285010	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5489	NC_019695	TTTTGA	2	12	285127	285138	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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5491	NC_019695	GTT	3	9	285208	285216	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5492	NC_019695	AG	3	6	285230	285235	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5493	NC_019695	T	6	6	285243	285248	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5494	NC_019695	ATT	2	6	285300	285305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5495	NC_019695	TGGT	2	8	285377	285384	0 %	50 %	50 %	0 %	428205316
5496	NC_019695	CGA	2	6	285467	285472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428205316
5497	NC_019695	GCAG	2	8	285506	285513	25 %	0 %	50 %	25 %	428205316
5498	NC_019695	ATT	3	9	285536	285544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428205317
5499	NC_019695	ACA	2	6	285551	285556	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428205317
5500	NC_019695	GT	3	6	285592	285597	0 %	50 %	50 %	0 %	428205317

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