MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chroococcidiopsis thermalis PCC 7203 chromosome

Total Repeats: 120519

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_019695	CATAAA	2	12	234222	234233	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	428205278
4502	NC_019695	ACC	2	6	234242	234247	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428205278
4503	NC_019695	TAA	2	6	234296	234301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428205278
4504	NC_019695	AAAATA	2	12	234425	234436	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	428205279
4505	NC_019695	CAG	2	6	234444	234449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428205279
4506	NC_019695	GAT	2	6	234491	234496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428205279
4507	NC_019695	CAG	2	6	234570	234575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428205279
4508	NC_019695	GAC	2	6	234639	234644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428205279
4509	NC_019695	AAT	2	6	234793	234798	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428205279
4510	NC_019695	ACA	2	6	234813	234818	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428205279
4511	NC_019695	CAG	2	6	235036	235041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4512	NC_019695	CAA	2	6	235056	235061	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4513	NC_019695	GAG	2	6	235100	235105	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4514	NC_019695	GAGT	2	8	235110	235117	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4515	NC_019695	TGA	2	6	235120	235125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4516	NC_019695	GA	3	6	235124	235129	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4517	NC_019695	TGT	2	6	235161	235166	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4518	NC_019695	TGG	2	6	235218	235223	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4519	NC_019695	ACA	2	6	235237	235242	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4520	NC_019695	GATC	2	8	235321	235328	25 %	25 %	25 %	25 %	428205280
4521	NC_019695	TTGC	2	8	235353	235360	0 %	50 %	25 %	25 %	428205280
4522	NC_019695	GAC	2	6	235469	235474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428205280
4523	NC_019695	TTGA	2	8	235584	235591	25 %	50 %	25 %	0 %	428205281
4524	NC_019695	CGG	2	6	235690	235695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428205281
4525	NC_019695	TC	3	6	235738	235743	0 %	50 %	0 %	50 %	428205281
4526	NC_019695	TCC	2	6	235789	235794	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428205281
4527	NC_019695	CGA	2	6	235832	235837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428205281
4528	NC_019695	GCT	2	6	235864	235869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428205281
4529	NC_019695	CT	3	6	235944	235949	0 %	50 %	0 %	50 %	428205281
4530	NC_019695	CAT	2	6	236150	236155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428205281
4531	NC_019695	AG	3	6	236250	236255	50 %	0 %	50 %	0 %	428205281
4532	NC_019695	CCG	2	6	236268	236273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428205281
4533	NC_019695	TGC	2	6	236275	236280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428205281
4534	NC_019695	CTT	2	6	236294	236299	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428205281
4535	NC_019695	AAT	2	6	236386	236391	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428205281
4536	NC_019695	CGA	2	6	236566	236571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428205281
4537	NC_019695	AG	3	6	236597	236602	50 %	0 %	50 %	0 %	428205281
4538	NC_019695	GAAA	2	8	236631	236638	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4539	NC_019695	GCT	2	6	236655	236660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4540	NC_019695	TGC	2	6	236775	236780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4541	NC_019695	CAG	2	6	236789	236794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4542	NC_019695	A	6	6	236801	236806	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4543	NC_019695	TTGA	2	8	236814	236821	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4544	NC_019695	AGTC	2	8	236920	236927	25 %	25 %	25 %	25 %	428205282
4545	NC_019695	TGG	2	6	237064	237069	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428205282
4546	NC_019695	GC	3	6	237231	237236	0 %	0 %	50 %	50 %	428205282
4547	NC_019695	GCC	2	6	237417	237422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428205282
4548	NC_019695	AGTG	2	8	237452	237459	25 %	25 %	50 %	0 %	428205282
4549	NC_019695	CGG	2	6	237531	237536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428205282
4550	NC_019695	GGT	3	9	237666	237674	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428205282
4551	NC_019695	GAT	2	6	237689	237694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428205282
4552	NC_019695	AGC	2	6	237700	237705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428205282
4553	NC_019695	TCA	2	6	237886	237891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428205282
4554	NC_019695	GCG	2	6	237972	237977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428205282
4555	NC_019695	TTA	2	6	237990	237995	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428205282
4556	NC_019695	TGC	2	6	238018	238023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428205282
4557	NC_019695	ACC	2	6	238031	238036	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428205282
4558	NC_019695	GCA	2	6	238095	238100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428205282
4559	NC_019695	CAA	2	6	238175	238180	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428205283
4560	NC_019695	ACC	2	6	238241	238246	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428205283
4561	NC_019695	TCAG	2	8	238284	238291	25 %	25 %	25 %	25 %	428205283
4562	NC_019695	CTT	2	6	238315	238320	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428205283
4563	NC_019695	GTA	2	6	238370	238375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428205283
4564	NC_019695	TCT	2	6	238428	238433	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428205283
4565	NC_019695	TGG	2	6	238439	238444	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428205283
4566	NC_019695	GTC	2	6	238455	238460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428205283
4567	NC_019695	ACC	2	6	238499	238504	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428205283
4568	NC_019695	GCA	2	6	238590	238595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428205283
4569	NC_019695	GTA	2	6	238607	238612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428205283
4570	NC_019695	TTA	2	6	238731	238736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428205283
4571	NC_019695	TCA	2	6	238828	238833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428205283
4572	NC_019695	AGG	2	6	238853	238858	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428205283
4573	NC_019695	ATC	2	6	238943	238948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428205283
4574	NC_019695	GCA	2	6	239082	239087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428205283
4575	NC_019695	TTG	2	6	239109	239114	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428205283
4576	NC_019695	TCT	2	6	239193	239198	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428205283
4577	NC_019695	TGC	2	6	239232	239237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428205283
4578	NC_019695	TGC	2	6	239242	239247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428205283
4579	NC_019695	TCT	2	6	239286	239291	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428205283
4580	NC_019695	GCA	2	6	239304	239309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428205283
4581	NC_019695	CTAG	2	8	239376	239383	25 %	25 %	25 %	25 %	428205283
4582	NC_019695	CGT	2	6	239430	239435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428205283
4583	NC_019695	TCAA	2	8	239451	239458	50 %	25 %	0 %	25 %	428205283
4584	NC_019695	TAT	2	6	239464	239469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428205283
4585	NC_019695	TAA	2	6	239494	239499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428205283
4586	NC_019695	TA	3	6	239506	239511	50 %	50 %	0 %	0 %	428205283
4587	NC_019695	TGC	2	6	239541	239546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428205283
4588	NC_019695	TTC	2	6	239612	239617	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428205283
4589	NC_019695	GGC	2	6	239630	239635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428205283
4590	NC_019695	GCT	2	6	239640	239645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428205283
4591	NC_019695	AGG	2	6	239660	239665	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428205283
4592	NC_019695	ATGTCA	2	12	239689	239700	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	428205283
4593	NC_019695	GTT	2	6	239729	239734	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428205283
4594	NC_019695	TGC	2	6	239837	239842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428205283
4595	NC_019695	CTA	2	6	239866	239871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428205283
4596	NC_019695	TGC	2	6	240107	240112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428205283
4597	NC_019695	CAG	2	6	240143	240148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428205283
4598	NC_019695	TGG	2	6	240194	240199	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428205283
4599	NC_019695	TAA	2	6	240215	240220	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428205283
4600	NC_019695	CCG	2	6	240306	240311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4601	NC_019695	TCG	2	6	240340	240345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4602	NC_019695	GTG	2	6	240460	240465	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428205284
4603	NC_019695	AT	3	6	240508	240513	50 %	50 %	0 %	0 %	428205284
4604	NC_019695	TGTC	2	8	240612	240619	0 %	50 %	25 %	25 %	428205284
4605	NC_019695	CGC	2	6	240681	240686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428205284
4606	NC_019695	ACC	2	6	240696	240701	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428205284
4607	NC_019695	AATC	2	8	240725	240732	50 %	25 %	0 %	25 %	428205284
4608	NC_019695	ACT	2	6	240759	240764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428205284
4609	NC_019695	GCT	2	6	241065	241070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428205285
4610	NC_019695	AGT	2	6	241102	241107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428205285
4611	NC_019695	GGTGTT	2	12	241132	241143	0 %	50 %	50 %	0 %	428205285
4612	NC_019695	ACT	2	6	241148	241153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428205285
4613	NC_019695	CAC	2	6	241169	241174	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428205285
4614	NC_019695	TGT	2	6	241284	241289	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428205285
4615	NC_019695	GTTG	2	8	241291	241298	0 %	50 %	50 %	0 %	428205285
4616	NC_019695	ACC	2	6	241392	241397	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428205285
4617	NC_019695	ATC	2	6	241451	241456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428205285
4618	NC_019695	CCGT	2	8	241508	241515	0 %	25 %	25 %	50 %	428205285
4619	NC_019695	AAG	2	6	241521	241526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428205285
4620	NC_019695	AAC	2	6	241564	241569	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428205285
4621	NC_019695	AT	4	8	241596	241603	50 %	50 %	0 %	0 %	428205285
4622	NC_019695	TGG	2	6	241604	241609	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428205285
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4631	NC_019695	GCTG	2	8	242092	242099	0 %	25 %	50 %	25 %	428205285
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4654	NC_019695	TCT	2	6	243201	243206	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428205285
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4743	NC_019695	CTG	2	6	247352	247357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428205286
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4751	NC_019695	GATC	2	8	247733	247740	25 %	25 %	25 %	25 %	428205286
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4755	NC_019695	CAG	2	6	248003	248008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428205286
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4757	NC_019695	TAGCA	2	10	248091	248100	40 %	20 %	20 %	20 %	428205286
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4763	NC_019695	CAC	2	6	248233	248238	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428205287
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4769	NC_019695	AGTAC	2	10	248494	248503	40 %	20 %	20 %	20 %	428205287
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4773	NC_019695	ACC	2	6	248641	248646	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428205287
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4802	NC_019695	TTG	2	6	250260	250265	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428205287
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4825	NC_019695	ACTGCT	2	12	251332	251343	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	428205287
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4827	NC_019695	GTT	2	6	251390	251395	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428205287
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4830	NC_019695	ATG	2	6	251615	251620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4842	NC_019695	CTG	2	6	252146	252151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428205288
4843	NC_019695	CAG	2	6	252160	252165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428205288
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4853	NC_019695	AAAC	2	8	252673	252680	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4854	NC_019695	CAT	2	6	252739	252744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4855	NC_019695	TCT	2	6	252763	252768	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428205290
4856	NC_019695	TCGA	2	8	252873	252880	25 %	25 %	25 %	25 %	428205290
4857	NC_019695	CAT	2	6	252887	252892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428205290
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4859	NC_019695	A	7	7	252991	252997	100 %	0 %	0 %	0 %	428205290
4860	NC_019695	CAA	2	6	253017	253022	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428205290
4861	NC_019695	CG	3	6	253032	253037	0 %	0 %	50 %	50 %	428205290
4862	NC_019695	GA	3	6	253038	253043	50 %	0 %	50 %	0 %	428205290
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4864	NC_019695	ATC	2	6	253116	253121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428205290
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4989	NC_019695	GCA	2	6	259493	259498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428205295
4990	NC_019695	A	6	6	259513	259518	100 %	0 %	0 %	0 %	428205295
4991	NC_019695	AGTT	2	8	259568	259575	25 %	50 %	25 %	0 %	428205295
4992	NC_019695	ATTGT	2	10	259601	259610	20 %	60 %	20 %	0 %	428205295
4993	NC_019695	TG	3	6	259651	259656	0 %	50 %	50 %	0 %	428205295
4994	NC_019695	ATA	2	6	259730	259735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428205295
4995	NC_019695	GGC	2	6	259823	259828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428205295
4996	NC_019695	TTAA	2	8	259885	259892	50 %	50 %	0 %	0 %	428205295
4997	NC_019695	AGT	2	6	259921	259926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4998	NC_019695	ACT	2	6	259999	260004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4999	NC_019695	CAG	2	6	260040	260045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428205296
5000	NC_019695	CAG	2	6	260065	260070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428205296

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