MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Calothrix sp. PCC 7507 chromosome

Total Repeats: 137003

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_019682	GTG	2	6	180040	180045	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3502	NC_019682	TAAG	2	8	180067	180074	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3503	NC_019682	TAG	2	6	180076	180081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3504	NC_019682	CGCTA	2	10	180161	180170	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
3505	NC_019682	TGA	2	6	180207	180212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3506	NC_019682	AATC	2	8	180219	180226	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3507	NC_019682	TAG	2	6	180248	180253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3508	NC_019682	GTTAAG	2	12	180326	180337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715535
3509	NC_019682	GAA	2	6	180362	180367	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427715535
3510	NC_019682	CCA	2	6	180404	180409	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427715535
3511	NC_019682	TTAA	2	8	180434	180441	50 %	50 %	0 %	0 %	427715535
3512	NC_019682	ACT	2	6	180442	180447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427715535
3513	NC_019682	GT	3	6	180495	180500	0 %	50 %	50 %	0 %	427715535
3514	NC_019682	CGA	2	6	180506	180511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427715535
3515	NC_019682	TAG	2	6	180516	180521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715535
3516	NC_019682	T	6	6	180550	180555	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3517	NC_019682	TA	3	6	180633	180638	50 %	50 %	0 %	0 %	427715536
3518	NC_019682	TCAAA	2	10	180692	180701	60 %	20 %	0 %	20 %	427715536
3519	NC_019682	TCA	2	6	180709	180714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427715536
3520	NC_019682	A	6	6	180771	180776	100 %	0 %	0 %	0 %	427715536
3521	NC_019682	TGA	2	6	180850	180855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715536
3522	NC_019682	TTC	2	6	180858	180863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427715536
3523	NC_019682	A	6	6	180930	180935	100 %	0 %	0 %	0 %	427715536
3524	NC_019682	A	6	6	180961	180966	100 %	0 %	0 %	0 %	427715536
3525	NC_019682	AGAT	2	8	181000	181007	50 %	25 %	25 %	0 %	427715536
3526	NC_019682	A	6	6	181087	181092	100 %	0 %	0 %	0 %	427715536
3527	NC_019682	TG	3	6	181096	181101	0 %	50 %	50 %	0 %	427715536
3528	NC_019682	CT	3	6	181133	181138	0 %	50 %	0 %	50 %	427715536
3529	NC_019682	A	6	6	181198	181203	100 %	0 %	0 %	0 %	427715536
3530	NC_019682	TGA	2	6	181237	181242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3531	NC_019682	T	6	6	181310	181315	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3532	NC_019682	ATCTTA	2	12	181329	181340	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3533	NC_019682	A	6	6	181362	181367	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3534	NC_019682	T	6	6	181379	181384	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3535	NC_019682	TTTAAT	2	12	181399	181410	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3536	NC_019682	AAAAAT	2	12	181419	181430	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3537	NC_019682	TG	3	6	181432	181437	0 %	50 %	50 %	0 %	427715537
3538	NC_019682	CAGC	2	8	181455	181462	25 %	0 %	25 %	50 %	427715537
3539	NC_019682	ACA	2	6	181519	181524	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427715537
3540	NC_019682	CAA	2	6	181571	181576	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427715537
3541	NC_019682	TGC	2	6	181694	181699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427715537
3542	NC_019682	CGT	2	6	181707	181712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427715537
3543	NC_019682	TAG	3	9	181720	181728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715537
3544	NC_019682	GGCAAC	2	12	181747	181758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427715537
3545	NC_019682	AAG	2	6	181764	181769	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427715537
3546	NC_019682	TTTTA	2	10	181776	181785	20 %	80 %	0 %	0 %	427715537
3547	NC_019682	GAA	2	6	181851	181856	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427715537
3548	NC_019682	ACA	3	9	181878	181886	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427715537
3549	NC_019682	ATT	2	6	181895	181900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427715537
3550	NC_019682	CAG	2	6	181992	181997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427715537
3551	NC_019682	CAT	2	6	182084	182089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427715537
3552	NC_019682	ATC	2	6	182346	182351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427715538
3553	NC_019682	TAC	2	6	182359	182364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427715538
3554	NC_019682	TAA	2	6	182369	182374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427715538
3555	NC_019682	A	6	6	182373	182378	100 %	0 %	0 %	0 %	427715538
3556	NC_019682	AAG	2	6	182383	182388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427715538
3557	NC_019682	ATT	2	6	182452	182457	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427715538
3558	NC_019682	GAA	2	6	182460	182465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427715538
3559	NC_019682	AGA	3	9	182477	182485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427715538
3560	NC_019682	ATT	2	6	182707	182712	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427715538
3561	NC_019682	ACT	2	6	182772	182777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427715538
3562	NC_019682	TGAT	2	8	182886	182893	25 %	50 %	25 %	0 %	427715539
3563	NC_019682	AGA	2	6	182944	182949	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427715539
3564	NC_019682	GGA	2	6	182950	182955	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427715539
3565	NC_019682	AGC	2	6	182997	183002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427715539
3566	NC_019682	CAA	2	6	183033	183038	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427715539
3567	NC_019682	AAT	2	6	183238	183243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3568	NC_019682	T	6	6	183263	183268	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3569	NC_019682	TAG	2	6	183304	183309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3570	NC_019682	CTT	2	6	183434	183439	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3571	NC_019682	CTA	2	6	183506	183511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427715540
3572	NC_019682	ACT	2	6	183553	183558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427715540
3573	NC_019682	AGG	2	6	183684	183689	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427715540
3574	NC_019682	AACC	2	8	183784	183791	50 %	0 %	0 %	50 %	427715540
3575	NC_019682	AGT	2	6	183834	183839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3576	NC_019682	A	7	7	183891	183897	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3577	NC_019682	T	6	6	183898	183903	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3578	NC_019682	AGA	2	6	183948	183953	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3579	NC_019682	TGC	2	6	184011	184016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3580	NC_019682	TTC	2	6	184024	184029	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3581	NC_019682	TCT	2	6	184115	184120	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3582	NC_019682	TATC	2	8	184269	184276	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3583	NC_019682	GTCTG	2	10	184463	184472	0 %	40 %	40 %	20 %	427715541
3584	NC_019682	TTG	2	6	184473	184478	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427715541
3585	NC_019682	CAC	2	6	184536	184541	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427715541
3586	NC_019682	CTT	2	6	184589	184594	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427715541
3587	NC_019682	CAG	2	6	184621	184626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427715541
3588	NC_019682	AAGT	2	8	184692	184699	50 %	25 %	25 %	0 %	427715541
3589	NC_019682	TAC	2	6	184798	184803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427715541
3590	NC_019682	ATTA	2	8	184914	184921	50 %	50 %	0 %	0 %	427715541
3591	NC_019682	AGA	2	6	185079	185084	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427715542
3592	NC_019682	AAC	2	6	185105	185110	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427715542
3593	NC_019682	AAAC	2	8	185128	185135	75 %	0 %	0 %	25 %	427715542
3594	NC_019682	GAG	2	6	185159	185164	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427715542
3595	NC_019682	GTT	2	6	185234	185239	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427715542
3596	NC_019682	AAT	2	6	185258	185263	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427715542
3597	NC_019682	T	7	7	185295	185301	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3598	NC_019682	AAG	2	6	185312	185317	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3599	NC_019682	AATT	2	8	185329	185336	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3600	NC_019682	ATG	2	6	185369	185374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3601	NC_019682	GAA	2	6	185406	185411	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3602	NC_019682	GCA	2	6	185461	185466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427715543
3603	NC_019682	TGC	2	6	185476	185481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427715543
3604	NC_019682	GCG	2	6	185550	185555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427715543
3605	NC_019682	CTA	2	6	185573	185578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427715543
3606	NC_019682	CAA	2	6	185660	185665	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427715543
3607	NC_019682	GTA	2	6	185738	185743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715543
3608	NC_019682	GAAA	2	8	185748	185755	75 %	0 %	25 %	0 %	427715543
3609	NC_019682	AGA	2	6	185761	185766	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427715543
3610	NC_019682	TGT	2	6	185767	185772	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427715543
3611	NC_019682	A	6	6	185813	185818	100 %	0 %	0 %	0 %	427715543
3612	NC_019682	AGC	2	6	185842	185847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427715543
3613	NC_019682	AGC	2	6	185869	185874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427715543
3614	NC_019682	GAA	2	6	185912	185917	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427715543
3615	NC_019682	AAGA	2	8	186011	186018	75 %	0 %	25 %	0 %	427715543
3616	NC_019682	AGC	2	6	186105	186110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427715543
3617	NC_019682	CAG	2	6	186145	186150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3618	NC_019682	A	7	7	186154	186160	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3619	NC_019682	ATG	2	6	186253	186258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3620	NC_019682	CAA	2	6	186311	186316	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427715544
3621	NC_019682	TCG	2	6	186430	186435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427715544
3622	NC_019682	ATG	2	6	186492	186497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715544
3623	NC_019682	TGT	2	6	186673	186678	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3624	NC_019682	GTA	2	6	186735	186740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715545
3625	NC_019682	AAT	2	6	186767	186772	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427715545
3626	NC_019682	A	6	6	186900	186905	100 %	0 %	0 %	0 %	427715545
3627	NC_019682	TAT	2	6	187019	187024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427715545
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3683	NC_019682	A	6	6	190156	190161	100 %	0 %	0 %	0 %	427715547
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3996	NC_019682	CA	3	6	206630	206635	50 %	0 %	0 %	50 %	427715565
3997	NC_019682	TAA	2	6	206697	206702	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427715565
3998	NC_019682	CGC	2	6	206709	206714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427715565
3999	NC_019682	TCA	2	6	206774	206779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427715565
4000	NC_019682	GGTA	2	8	206806	206813	25 %	25 %	50 %	0 %	427715565

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