MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Calothrix sp. PCC 7507 chromosome

Total Repeats: 137003

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_019682	ACA	2	6	153400	153405	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427715515
3002	NC_019682	ACA	2	6	153455	153460	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427715515
3003	NC_019682	CGC	2	6	153474	153479	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427715515
3004	NC_019682	AG	3	6	153492	153497	50 %	0 %	50 %	0 %	427715515
3005	NC_019682	CAA	2	6	153529	153534	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427715515
3006	NC_019682	TGA	2	6	153587	153592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715515
3007	NC_019682	CCA	2	6	153626	153631	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427715515
3008	NC_019682	CAG	2	6	153738	153743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427715515
3009	NC_019682	TAA	2	6	153744	153749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427715515
3010	NC_019682	GGGT	2	8	153756	153763	0 %	25 %	75 %	0 %	427715515
3011	NC_019682	CCA	2	6	153985	153990	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427715515
3012	NC_019682	AAATA	2	10	153994	154003	80 %	20 %	0 %	0 %	427715515
3013	NC_019682	TGG	2	6	154119	154124	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427715515
3014	NC_019682	T	6	6	154156	154161	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3015	NC_019682	ACTG	2	8	154221	154228	25 %	25 %	25 %	25 %	427715516
3016	NC_019682	TGC	2	6	154235	154240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427715516
3017	NC_019682	CAGC	2	8	154355	154362	25 %	0 %	25 %	50 %	427715516
3018	NC_019682	CTG	2	6	154372	154377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427715516
3019	NC_019682	AC	3	6	154436	154441	50 %	0 %	0 %	50 %	427715516
3020	NC_019682	TGG	2	6	154462	154467	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427715516
3021	NC_019682	AGTTG	2	10	154564	154573	20 %	40 %	40 %	0 %	427715516
3022	NC_019682	AGT	2	6	154607	154612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715516
3023	NC_019682	T	6	6	154682	154687	0 %	100 %	0 %	0 %	427715516
3024	NC_019682	GCCAAT	2	12	154709	154720	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	427715516
3025	NC_019682	ATC	2	6	154748	154753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427715516
3026	NC_019682	AGC	2	6	154760	154765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427715516
3027	NC_019682	CCA	2	6	154800	154805	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427715516
3028	NC_019682	CAATCA	2	12	154873	154884	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	427715516
3029	NC_019682	A	6	6	154903	154908	100 %	0 %	0 %	0 %	427715516
3030	NC_019682	CGCCAT	2	12	154939	154950	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	427715516
3031	NC_019682	TTAA	2	8	154974	154981	50 %	50 %	0 %	0 %	427715516
3032	NC_019682	ACC	2	6	155004	155009	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427715516
3033	NC_019682	GCGATG	2	12	155019	155030	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	427715516
3034	NC_019682	GTA	2	6	155089	155094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715516
3035	NC_019682	CTG	2	6	155125	155130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427715516
3036	NC_019682	CATA	2	8	155180	155187	50 %	25 %	0 %	25 %	427715516
3037	NC_019682	TC	3	6	155275	155280	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3038	NC_019682	TC	3	6	155301	155306	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3039	NC_019682	ATTA	2	8	155466	155473	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3040	NC_019682	AGC	2	6	155483	155488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3041	NC_019682	AAG	2	6	155605	155610	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3042	NC_019682	CAC	2	6	155659	155664	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3043	NC_019682	TTC	2	6	155855	155860	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427715517
3044	NC_019682	CAA	2	6	155875	155880	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427715517
3045	NC_019682	CTT	2	6	155887	155892	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427715517
3046	NC_019682	TTTG	2	8	156068	156075	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3047	NC_019682	ATC	2	6	156086	156091	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3048	NC_019682	CAAT	2	8	156128	156135	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3049	NC_019682	TTA	2	6	156161	156166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3050	NC_019682	T	6	6	156180	156185	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3051	NC_019682	AAT	2	6	156216	156221	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3052	NC_019682	TAAA	2	8	156328	156335	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3053	NC_019682	ATA	2	6	156348	156353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3054	NC_019682	T	7	7	156374	156380	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3055	NC_019682	CCA	2	6	156419	156424	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3056	NC_019682	TGG	2	6	156436	156441	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3057	NC_019682	AAT	2	6	156496	156501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3058	NC_019682	ATG	2	6	156530	156535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3059	NC_019682	TA	3	6	156586	156591	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3060	NC_019682	A	7	7	156739	156745	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3061	NC_019682	TAA	2	6	156794	156799	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3062	NC_019682	AAATG	2	10	156816	156825	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
3063	NC_019682	TTA	2	6	156893	156898	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3064	NC_019682	AT	3	6	156903	156908	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3065	NC_019682	TAA	2	6	156970	156975	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427715518
3066	NC_019682	TGA	2	6	157033	157038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715518
3067	NC_019682	TGT	2	6	157046	157051	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427715518
3068	NC_019682	TAA	2	6	157067	157072	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427715518
3069	NC_019682	AAAT	2	8	157208	157215	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3070	NC_019682	TATT	2	8	157244	157251	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3071	NC_019682	AAT	2	6	157281	157286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3072	NC_019682	TCA	2	6	157298	157303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3073	NC_019682	A	6	6	157312	157317	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3074	NC_019682	GAA	2	6	157369	157374	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3075	NC_019682	AAC	2	6	157398	157403	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427715519
3076	NC_019682	TTA	2	6	157511	157516	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427715519
3077	NC_019682	ATTT	2	8	157621	157628	25 %	75 %	0 %	0 %	427715519
3078	NC_019682	GAA	2	6	157637	157642	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427715519
3079	NC_019682	CAC	2	6	157817	157822	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427715519
3080	NC_019682	CATC	2	8	157865	157872	25 %	25 %	0 %	50 %	427715519
3081	NC_019682	ACGA	2	8	157933	157940	50 %	0 %	25 %	25 %	427715519
3082	NC_019682	GAA	2	6	158009	158014	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427715519
3083	NC_019682	CAA	2	6	158022	158027	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427715519
3084	NC_019682	CCA	2	6	158058	158063	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427715519
3085	NC_019682	AAG	2	6	158137	158142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427715519
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3088	NC_019682	GCA	2	6	158303	158308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427715519
3089	NC_019682	AGC	2	6	158318	158323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427715519
3090	NC_019682	AAC	2	6	158368	158373	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427715519
3091	NC_019682	TGC	2	6	158392	158397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427715519
3092	NC_019682	GAA	2	6	158412	158417	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427715519
3093	NC_019682	AGA	2	6	158444	158449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427715519
3094	NC_019682	TACC	2	8	158531	158538	25 %	25 %	0 %	50 %	427715519
3095	NC_019682	AATT	2	8	158566	158573	50 %	50 %	0 %	0 %	427715519
3096	NC_019682	AGC	2	6	158594	158599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427715519
3097	NC_019682	ACG	2	6	158617	158622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427715519
3098	NC_019682	CTG	2	6	158673	158678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427715519
3099	NC_019682	C	6	6	158708	158713	0 %	0 %	0 %	100 %	427715519
3100	NC_019682	AAC	2	6	158722	158727	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427715519
3101	NC_019682	A	7	7	158743	158749	100 %	0 %	0 %	0 %	427715519
3102	NC_019682	AGA	2	6	158775	158780	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427715519
3103	NC_019682	AG	4	8	158851	158858	50 %	0 %	50 %	0 %	427715519
3104	NC_019682	AGA	2	6	158930	158935	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427715519
3105	NC_019682	ATTG	2	8	159026	159033	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3106	NC_019682	ACCA	2	8	159064	159071	50 %	0 %	0 %	50 %	427715520
3107	NC_019682	ACA	2	6	159074	159079	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427715520
3108	NC_019682	TGG	2	6	159116	159121	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427715520
3109	NC_019682	TGAT	2	8	159139	159146	25 %	50 %	25 %	0 %	427715520
3110	NC_019682	ATT	2	6	159266	159271	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427715520
3111	NC_019682	ATCG	2	8	159321	159328	25 %	25 %	25 %	25 %	427715520
3112	NC_019682	GGT	2	6	159507	159512	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427715520
3113	NC_019682	CT	3	6	159546	159551	0 %	50 %	0 %	50 %	427715520
3114	NC_019682	CAG	2	6	159585	159590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427715520
3115	NC_019682	ACC	2	6	159676	159681	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3116	NC_019682	GCA	2	6	159711	159716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3117	NC_019682	GA	3	6	159742	159747	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3118	NC_019682	GCC	2	6	159774	159779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3119	NC_019682	CTACGC	2	12	159831	159842	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
3120	NC_019682	CACG	2	8	159870	159877	25 %	0 %	25 %	50 %	427715521
3121	NC_019682	CAA	2	6	159910	159915	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427715521
3122	NC_019682	CT	3	6	159930	159935	0 %	50 %	0 %	50 %	427715521
3123	NC_019682	AACC	2	8	159975	159982	50 %	0 %	0 %	50 %	427715521
3124	NC_019682	ACC	3	9	160154	160162	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427715521
3125	NC_019682	AAC	2	6	160166	160171	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427715521
3126	NC_019682	TGT	2	6	160272	160277	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427715521
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3128	NC_019682	AAC	2	6	160302	160307	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427715521
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3130	NC_019682	ATC	2	6	160484	160489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427715521
3131	NC_019682	CTG	2	6	160645	160650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427715521
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3136	NC_019682	TTC	2	6	160947	160952	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3138	NC_019682	TAC	2	6	161072	161077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3139	NC_019682	CCA	2	6	161088	161093	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3140	NC_019682	AAT	2	6	161099	161104	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3141	NC_019682	CAT	2	6	161122	161127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3142	NC_019682	TAC	2	6	161147	161152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3143	NC_019682	GGT	2	6	161238	161243	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3146	NC_019682	A	7	7	161400	161406	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3150	NC_019682	TGT	2	6	161797	161802	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3154	NC_019682	CTG	2	6	162022	162027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3156	NC_019682	TTG	2	6	162108	162113	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3165	NC_019682	GCG	2	6	162535	162540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3166	NC_019682	CCA	2	6	162556	162561	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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3173	NC_019682	TTTGCT	2	12	163037	163048	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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3238	NC_019682	TTTG	2	8	166699	166706	0 %	75 %	25 %	0 %	427715522
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3241	NC_019682	A	6	6	166888	166893	100 %	0 %	0 %	0 %	427715522
3242	NC_019682	CCG	2	6	166938	166943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427715522
3243	NC_019682	A	7	7	166960	166966	100 %	0 %	0 %	0 %	427715522
3244	NC_019682	T	6	6	166993	166998	0 %	100 %	0 %	0 %	427715522
3245	NC_019682	AAGG	2	8	167014	167021	50 %	0 %	50 %	0 %	427715522
3246	NC_019682	GAT	3	9	167071	167079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715522
3247	NC_019682	AAG	2	6	167091	167096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427715522
3248	NC_019682	AATT	2	8	167106	167113	50 %	50 %	0 %	0 %	427715522
3249	NC_019682	TTAA	2	8	167125	167132	50 %	50 %	0 %	0 %	427715522
3250	NC_019682	TAGGT	2	10	167175	167184	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
3251	NC_019682	CAAA	2	8	167239	167246	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3252	NC_019682	CTTAA	2	10	167258	167267	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
3253	NC_019682	CAAT	2	8	167306	167313	50 %	25 %	0 %	25 %	427715523
3254	NC_019682	C	6	6	167391	167396	0 %	0 %	0 %	100 %	427715523
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3497	NC_019682	A	6	6	179794	179799	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3498	NC_019682	AT	4	8	179865	179872	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3499	NC_019682	AGG	2	6	179902	179907	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3500	NC_019682	TCA	2	6	179960	179965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

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