MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Calothrix sp. PCC 7507 chromosome

Total Repeats: 137003

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_019682	GAT	2	6	26435	26440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715375
502	NC_019682	TCC	2	6	26532	26537	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427715375
503	NC_019682	TTG	2	6	26579	26584	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427715375
504	NC_019682	AAT	2	6	26603	26608	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427715375
505	NC_019682	ATA	2	6	26660	26665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427715375
506	NC_019682	AAG	2	6	26722	26727	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427715375
507	NC_019682	AAT	2	6	26747	26752	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427715375
508	NC_019682	GCTA	2	8	26831	26838	25 %	25 %	25 %	25 %	427715375
509	NC_019682	ACC	2	6	26844	26849	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427715375
510	NC_019682	TTC	2	6	26856	26861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427715375
511	NC_019682	CCA	2	6	26862	26867	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427715375
512	NC_019682	CAG	2	6	26941	26946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427715375
513	NC_019682	TCT	2	6	27027	27032	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427715375
514	NC_019682	TAA	2	6	27062	27067	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427715375
515	NC_019682	CAC	2	6	27079	27084	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427715375
516	NC_019682	ACC	2	6	27087	27092	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427715375
517	NC_019682	ACC	2	6	27104	27109	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427715375
518	NC_019682	CAGG	2	8	27124	27131	25 %	0 %	50 %	25 %	427715375
519	NC_019682	TGA	2	6	27142	27147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715375
520	NC_019682	TTG	2	6	27160	27165	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427715375
521	NC_019682	TCTGCT	2	12	27198	27209	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	427715375
522	NC_019682	T	6	6	27254	27259	0 %	100 %	0 %	0 %	427715375
523	NC_019682	TTA	2	6	27300	27305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427715375
524	NC_019682	CTT	3	9	27337	27345	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427715375
525	NC_019682	TTG	2	6	27350	27355	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427715375
526	NC_019682	TTG	2	6	27362	27367	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427715375
527	NC_019682	GT	3	6	27373	27378	0 %	50 %	50 %	0 %	427715375
528	NC_019682	CCA	2	6	27397	27402	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427715375
529	NC_019682	CTG	2	6	27416	27421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427715375
530	NC_019682	CTG	2	6	27508	27513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427715375
531	NC_019682	GTT	2	6	27517	27522	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427715375
532	NC_019682	TTG	2	6	27568	27573	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427715375
533	NC_019682	AAT	2	6	27650	27655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427715375
534	NC_019682	TAGT	2	8	27751	27758	25 %	50 %	25 %	0 %	427715375
535	NC_019682	CAG	2	6	27800	27805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427715375
536	NC_019682	T	6	6	27865	27870	0 %	100 %	0 %	0 %	427715375
537	NC_019682	TCT	2	6	27916	27921	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427715375
538	NC_019682	AAT	2	6	27923	27928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427715375
539	NC_019682	TAGC	2	8	28003	28010	25 %	25 %	25 %	25 %	427715375
540	NC_019682	TGA	2	6	28033	28038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715375
541	NC_019682	TGC	2	6	28052	28057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427715375
542	NC_019682	CTG	2	6	28078	28083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427715375
543	NC_019682	AAT	2	6	28157	28162	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427715375
544	NC_019682	CTCA	2	8	28184	28191	25 %	25 %	0 %	50 %	427715375
545	NC_019682	TGC	2	6	28203	28208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427715375
546	NC_019682	TGG	2	6	28241	28246	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427715375
547	NC_019682	G	6	6	28283	28288	0 %	0 %	100 %	0 %	427715375
548	NC_019682	AAAAC	2	10	28332	28341	80 %	0 %	0 %	20 %	427715375
549	NC_019682	TGG	2	6	28397	28402	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427715375
550	NC_019682	ATTA	2	8	28421	28428	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_019682	TCC	2	6	28464	28469	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
552	NC_019682	GAA	2	6	28534	28539	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427715376
553	NC_019682	CAA	3	9	28620	28628	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427715376
554	NC_019682	CAT	2	6	28632	28637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427715376
555	NC_019682	AT	3	6	28662	28667	50 %	50 %	0 %	0 %	427715376
556	NC_019682	CAA	2	6	28791	28796	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427715376
557	NC_019682	ACT	2	6	28798	28803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427715376
558	NC_019682	TTGA	2	8	28819	28826	25 %	50 %	25 %	0 %	427715376
559	NC_019682	CAT	2	6	28914	28919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427715376
560	NC_019682	CCG	2	6	29050	29055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427715376
561	NC_019682	GTACTT	2	12	29058	29069	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	427715376
562	NC_019682	TCG	3	9	29085	29093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427715376
563	NC_019682	ACC	2	6	29095	29100	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427715376
564	NC_019682	ACG	2	6	29136	29141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427715376
565	NC_019682	AAC	2	6	29215	29220	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427715376
566	NC_019682	T	6	6	29262	29267	0 %	100 %	0 %	0 %	427715376
567	NC_019682	CTT	2	6	29274	29279	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427715376
568	NC_019682	ATTA	2	8	29341	29348	50 %	50 %	0 %	0 %	427715376
569	NC_019682	TAA	2	6	29406	29411	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427715376
570	NC_019682	T	6	6	29436	29441	0 %	100 %	0 %	0 %	427715376
571	NC_019682	TGC	2	6	29446	29451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427715376
572	NC_019682	TAG	2	6	29485	29490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715376
573	NC_019682	ACA	2	6	29495	29500	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427715376
574	NC_019682	GCT	2	6	29522	29527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427715376
575	NC_019682	ACA	2	6	29558	29563	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427715376
576	NC_019682	AGG	2	6	29599	29604	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427715376
577	NC_019682	ACTA	2	8	29620	29627	50 %	25 %	0 %	25 %	427715376
578	NC_019682	G	6	6	29661	29666	0 %	0 %	100 %	0 %	427715376
579	NC_019682	TTC	2	6	29671	29676	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427715376
580	NC_019682	TGG	2	6	29686	29691	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427715376
581	NC_019682	CTG	2	6	29706	29711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427715376
582	NC_019682	CAA	2	6	29763	29768	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427715376
583	NC_019682	TGT	2	6	29782	29787	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427715376
584	NC_019682	A	7	7	29789	29795	100 %	0 %	0 %	0 %	427715376
585	NC_019682	ATG	2	6	29991	29996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
586	NC_019682	T	6	6	30009	30014	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
587	NC_019682	TGC	2	6	30199	30204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
588	NC_019682	ACA	2	6	30222	30227	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
589	NC_019682	CCCAA	2	10	30344	30353	40 %	0 %	0 %	60 %	427715377
590	NC_019682	GTA	2	6	30507	30512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715377
591	NC_019682	CGG	2	6	30550	30555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427715377
592	NC_019682	CTC	3	9	30620	30628	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427715377
593	NC_019682	AGT	2	6	30663	30668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715377
594	NC_019682	T	8	8	30716	30723	0 %	100 %	0 %	0 %	427715377
595	NC_019682	TTG	2	6	30731	30736	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427715377
596	NC_019682	AGGG	2	8	30764	30771	25 %	0 %	75 %	0 %	427715377
597	NC_019682	TGCCAT	2	12	30831	30842	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	427715377
598	NC_019682	ACA	2	6	30895	30900	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427715377
599	NC_019682	TAC	3	9	30902	30910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427715377
600	NC_019682	ATC	2	6	30951	30956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427715377
601	NC_019682	A	7	7	31257	31263	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
602	NC_019682	AGA	2	6	31298	31303	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
603	NC_019682	TCT	2	6	31340	31345	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427715378
604	NC_019682	CTT	2	6	31473	31478	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427715378
605	NC_019682	AAG	2	6	31493	31498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427715378
606	NC_019682	CTAATG	2	12	31529	31540	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	427715378
607	NC_019682	GCG	2	6	31573	31578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427715378
608	NC_019682	AGC	2	6	31604	31609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427715378
609	NC_019682	TTG	2	6	31626	31631	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427715378
610	NC_019682	CCA	2	6	31682	31687	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427715378
611	NC_019682	TTGGT	2	10	31697	31706	0 %	60 %	40 %	0 %	427715378
612	NC_019682	AGGTA	2	10	31774	31783	40 %	20 %	40 %	0 %	427715378
613	NC_019682	AGGTA	2	10	31796	31805	40 %	20 %	40 %	0 %	427715378
614	NC_019682	GGGA	2	8	31907	31914	25 %	0 %	75 %	0 %	427715378
615	NC_019682	TAAA	2	8	31942	31949	75 %	25 %	0 %	0 %	427715378
616	NC_019682	A	6	6	31947	31952	100 %	0 %	0 %	0 %	427715378
617	NC_019682	C	6	6	31955	31960	0 %	0 %	0 %	100 %	427715378
618	NC_019682	GTA	2	6	31991	31996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715378
619	NC_019682	GCA	2	6	32042	32047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427715378
620	NC_019682	AGCC	2	8	32108	32115	25 %	0 %	25 %	50 %	427715378
621	NC_019682	TAA	2	6	32149	32154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427715378
622	NC_019682	ATT	2	6	32285	32290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_019682	TAA	2	6	32294	32299	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
624	NC_019682	TAAAT	2	10	32308	32317	60 %	40 %	0 %	0 %	427715379
625	NC_019682	GCT	2	6	32339	32344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427715379
626	NC_019682	TTA	2	6	32365	32370	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427715379
627	NC_019682	ATA	2	6	32416	32421	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427715379
628	NC_019682	GCTG	2	8	32484	32491	0 %	25 %	50 %	25 %	427715379
629	NC_019682	GCT	2	6	32535	32540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427715379
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755	NC_019682	GTCT	2	8	39171	39178	0 %	50 %	25 %	25 %	427715385
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