MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Cyanobium gracile PCC 6307 chromosome

Total Repeats: 2934

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019675	CCGGG	2	10	558	567	0 %	0 %	60 %	40 %	427701341
2	NC_019675	GCCGG	2	10	1517	1526	0 %	0 %	60 %	40 %	427701342
3	NC_019675	TCGGG	2	10	2663	2672	0 %	20 %	60 %	20 %	427701343
4	NC_019675	ATCGA	2	10	3287	3296	40 %	20 %	20 %	20 %	427701344
5	NC_019675	GTGCC	2	10	3527	3536	0 %	20 %	40 %	40 %	427701344
6	NC_019675	GGCCA	2	10	5160	5169	20 %	0 %	40 %	40 %	427701345
7	NC_019675	TGGGG	2	10	5913	5922	0 %	20 %	80 %	0 %	427701346
8	NC_019675	GGACG	2	10	7295	7304	20 %	0 %	60 %	20 %	427701347
9	NC_019675	GGAGG	2	10	8318	8327	20 %	0 %	80 %	0 %	427701348
10	NC_019675	GCGCC	2	10	9538	9547	0 %	0 %	40 %	60 %	427701351
11	NC_019675	GGGTC	2	10	9804	9813	0 %	20 %	60 %	20 %	427701351
12	NC_019675	CGATC	2	10	10332	10341	20 %	20 %	20 %	40 %	427701351
13	NC_019675	TGGCC	2	10	12154	12163	0 %	20 %	40 %	40 %	427701352
14	NC_019675	CGGTG	2	10	17418	17427	0 %	20 %	60 %	20 %	427701358
15	NC_019675	TCGGC	2	10	18680	18689	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
16	NC_019675	GGAAG	2	10	19142	19151	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
17	NC_019675	CCGCG	2	10	19154	19163	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
18	NC_019675	GCGCC	2	10	20759	20768	0 %	0 %	40 %	60 %	427701361
19	NC_019675	CCAGG	2	10	21372	21381	20 %	0 %	40 %	40 %	427701362
20	NC_019675	GCCCG	2	10	21817	21826	0 %	0 %	40 %	60 %	427701362
21	NC_019675	TCGAT	2	10	23567	23576	20 %	40 %	20 %	20 %	427701363
22	NC_019675	GCCCA	2	10	24142	24151	20 %	0 %	20 %	60 %	427701364
23	NC_019675	CAGCG	2	10	25308	25317	20 %	0 %	40 %	40 %	427701365
24	NC_019675	CCGGC	2	10	25412	25421	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
25	NC_019675	GCAGC	2	10	28274	28283	20 %	0 %	40 %	40 %	427701370
26	NC_019675	CCCTG	2	10	28404	28413	0 %	20 %	20 %	60 %	427701370
27	NC_019675	CCAGC	2	10	29264	29273	20 %	0 %	20 %	60 %	427701371
28	NC_019675	GGCCT	2	10	32638	32647	0 %	20 %	40 %	40 %	427701375
29	NC_019675	GGGGC	2	10	34854	34863	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
30	NC_019675	CGGCG	2	10	36892	36901	0 %	0 %	60 %	40 %	427701380
31	NC_019675	CCCGG	2	10	37899	37908	0 %	0 %	40 %	60 %	427701381
32	NC_019675	GCACC	2	10	38971	38980	20 %	0 %	20 %	60 %	427701382
33	NC_019675	GTGCT	2	10	38997	39006	0 %	40 %	40 %	20 %	427701382
34	NC_019675	GGTGT	2	10	39563	39572	0 %	40 %	60 %	0 %	427701382
35	NC_019675	GGTGG	2	10	39699	39708	0 %	20 %	80 %	0 %	427701383
36	NC_019675	CCCCG	2	10	41499	41508	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
37	NC_019675	GCTGG	2	10	41522	41531	0 %	20 %	60 %	20 %	427701385
38	NC_019675	GGCCG	2	10	43588	43597	0 %	0 %	60 %	40 %	427701385
39	NC_019675	GCGGT	2	10	44251	44260	0 %	20 %	60 %	20 %	427701386
40	NC_019675	CCTGG	2	10	44446	44455	0 %	20 %	40 %	40 %	427701387
41	NC_019675	GACCG	2	10	44829	44838	20 %	0 %	40 %	40 %	427701388
42	NC_019675	GCCAG	2	10	48224	48233	20 %	0 %	40 %	40 %	427701390
43	NC_019675	CCCTG	2	10	48678	48687	0 %	20 %	20 %	60 %	427701391
44	NC_019675	GAAGG	2	10	51235	51244	40 %	0 %	60 %	0 %	427701394
45	NC_019675	TCCCC	2	10	51595	51604	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
46	NC_019675	CCCGG	2	10	53623	53632	0 %	0 %	40 %	60 %	427701397
47	NC_019675	GCCAG	2	10	56727	56736	20 %	0 %	40 %	40 %	427701399
48	NC_019675	GCCAG	2	10	58178	58187	20 %	0 %	40 %	40 %	427701401
49	NC_019675	GCAGC	2	10	61908	61917	20 %	0 %	40 %	40 %	427701404
50	NC_019675	GGATC	2	10	61943	61952	20 %	20 %	40 %	20 %	427701404
51	NC_019675	GCCGG	2	10	63749	63758	0 %	0 %	60 %	40 %	427701405
52	NC_019675	GATCA	2	10	63784	63793	40 %	20 %	20 %	20 %	427701405
53	NC_019675	GCCAG	2	10	64130	64139	20 %	0 %	40 %	40 %	427701406
54	NC_019675	CCCGG	2	10	64726	64735	0 %	0 %	40 %	60 %	427701408
55	NC_019675	TCGGG	2	10	69109	69118	0 %	20 %	60 %	20 %	427701412
56	NC_019675	CGCTC	2	10	71442	71451	0 %	20 %	20 %	60 %	427701414
57	NC_019675	GATCG	2	10	73412	73421	20 %	20 %	40 %	20 %	427701418
58	NC_019675	CCCCA	2	10	73687	73696	20 %	0 %	0 %	80 %	427701418
59	NC_019675	GCCCT	2	10	73997	74006	0 %	20 %	20 %	60 %	427701419
60	NC_019675	GGCCG	2	10	74306	74315	0 %	0 %	60 %	40 %	427701419
61	NC_019675	CCTGG	2	10	74813	74822	0 %	20 %	40 %	40 %	427701419
62	NC_019675	CGTCG	2	10	80398	80407	0 %	20 %	40 %	40 %	427701423
63	NC_019675	GTCTG	2	10	83689	83698	0 %	40 %	40 %	20 %	427701425
64	NC_019675	CTGGC	2	10	83763	83772	0 %	20 %	40 %	40 %	427701425
65	NC_019675	TGGCC	2	10	87010	87019	0 %	20 %	40 %	40 %	427701428
66	NC_019675	CTGGT	2	10	87074	87083	0 %	40 %	40 %	20 %	427701428
67	NC_019675	TTGAG	2	10	88727	88736	20 %	40 %	40 %	0 %	427701431
68	NC_019675	AGCTC	2	10	89338	89347	20 %	20 %	20 %	40 %	427701432
69	NC_019675	CCTTC	2	10	90979	90988	0 %	40 %	0 %	60 %	427701434
70	NC_019675	ACGTC	2	10	91228	91237	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
71	NC_019675	CCAGC	2	10	91334	91343	20 %	0 %	20 %	60 %	427701435
72	NC_019675	CTTCG	2	10	92618	92627	0 %	40 %	20 %	40 %	427701437
73	NC_019675	GGCCG	2	10	93017	93026	0 %	0 %	60 %	40 %	427701438
74	NC_019675	CTGGT	2	10	93740	93749	0 %	40 %	40 %	20 %	427701438
75	NC_019675	AGCAG	2	10	93774	93783	40 %	0 %	40 %	20 %	427701438
76	NC_019675	GCCCC	2	10	93918	93927	0 %	0 %	20 %	80 %	427701438
77	NC_019675	GATCG	2	10	96428	96437	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
78	NC_019675	GCGCT	2	10	96717	96726	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
79	NC_019675	CGGCC	2	10	97160	97169	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
80	NC_019675	GCAGG	2	10	97586	97595	20 %	0 %	60 %	20 %	427701442
81	NC_019675	ATCCC	2	10	98175	98184	20 %	20 %	0 %	60 %	427701444
82	NC_019675	GCCGC	2	10	98858	98867	0 %	0 %	40 %	60 %	427701445
83	NC_019675	GCAGC	2	10	100653	100662	20 %	0 %	40 %	40 %	427701446
84	NC_019675	GGCTG	2	10	101363	101372	0 %	20 %	60 %	20 %	427701446
85	NC_019675	GGCCT	2	10	101960	101969	0 %	20 %	40 %	40 %	427701447
86	NC_019675	CGGCG	2	10	102013	102022	0 %	0 %	60 %	40 %	427701447
87	NC_019675	AGGGC	2	10	104663	104672	20 %	0 %	60 %	20 %	427701451
88	NC_019675	GCTGG	2	10	108589	108598	0 %	20 %	60 %	20 %	427701454
89	NC_019675	CCCGG	2	10	108744	108753	0 %	0 %	40 %	60 %	427701454
90	NC_019675	GCCCA	2	10	109442	109451	20 %	0 %	20 %	60 %	427701454
91	NC_019675	ATGGC	2	10	110671	110680	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
92	NC_019675	TGGTT	2	10	114148	114157	0 %	60 %	40 %	0 %	427701457
93	NC_019675	TCAGC	2	10	114336	114345	20 %	20 %	20 %	40 %	427701457
94	NC_019675	GAAGG	2	10	115000	115009	40 %	0 %	60 %	0 %	427701457
95	NC_019675	CCTCC	2	10	115123	115132	0 %	20 %	0 %	80 %	427701457
96	NC_019675	CGGTG	2	10	117595	117604	0 %	20 %	60 %	20 %	427701458
97	NC_019675	CCTGG	2	10	117913	117922	0 %	20 %	40 %	40 %	427701458
98	NC_019675	AGTGG	2	10	119176	119185	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
99	NC_019675	TGACC	2	10	123490	123499	20 %	20 %	20 %	40 %	427701460
100	NC_019675	CTTTA	2	10	124452	124461	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
101	NC_019675	CAAGG	2	10	124920	124929	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
102	NC_019675	CAGGA	2	10	125052	125061	40 %	0 %	40 %	20 %	427701462
103	NC_019675	GGGCC	2	10	125476	125485	0 %	0 %	60 %	40 %	427701463
104	NC_019675	CGGCG	2	10	125617	125626	0 %	0 %	60 %	40 %	427701463
105	NC_019675	GGATC	2	10	125862	125871	20 %	20 %	40 %	20 %	427701463
106	NC_019675	CCGGG	2	10	126677	126686	0 %	0 %	60 %	40 %	427701464
107	NC_019675	CCGCC	2	10	126957	126966	0 %	0 %	20 %	80 %	427701464
108	NC_019675	GGCGC	2	10	128104	128113	0 %	0 %	60 %	40 %	427701464
109	NC_019675	GGGCG	2	10	130774	130783	0 %	0 %	80 %	20 %	427701465
110	NC_019675	GCCAG	2	10	131357	131366	20 %	0 %	40 %	40 %	427701466
111	NC_019675	GGCCC	2	10	131667	131676	0 %	0 %	40 %	60 %	427701466
112	NC_019675	GCCCC	2	10	133856	133865	0 %	0 %	20 %	80 %	427701468
113	NC_019675	CCTCT	2	10	135186	135195	0 %	40 %	0 %	60 %	427701470
114	NC_019675	CGAAG	2	10	135813	135822	40 %	0 %	40 %	20 %	427701472
115	NC_019675	TCTGC	2	10	137851	137860	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
116	NC_019675	ACGCC	2	10	139024	139033	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
117	NC_019675	CCCTT	2	10	141967	141976	0 %	40 %	0 %	60 %	427701477
118	NC_019675	GAGCA	2	10	145829	145838	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
119	NC_019675	CACCG	2	10	145891	145900	20 %	0 %	20 %	60 %	427701481
120	NC_019675	AGGCA	2	10	148724	148733	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
121	NC_019675	TAATT	2	10	148771	148780	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_019675	CAAAC	2	10	152185	152194	60 %	0 %	0 %	40 %	427701483
123	NC_019675	CAAGG	2	10	152242	152251	40 %	0 %	40 %	20 %	427701483
124	NC_019675	GGCGA	2	10	154290	154299	20 %	0 %	60 %	20 %	427701486
125	NC_019675	AGCGG	2	10	155179	155188	20 %	0 %	60 %	20 %	427701486
126	NC_019675	GCACC	2	10	156329	156338	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
127	NC_019675	AATGG	2	10	158166	158175	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
128	NC_019675	TATAT	2	10	159108	159117	40 %	60 %	0 %	0 %	427701488
129	NC_019675	CTGAT	2	10	159332	159341	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
130	NC_019675	TCCCT	2	10	160097	160106	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
131	NC_019675	TGCGG	2	10	161538	161547	0 %	20 %	60 %	20 %	427701490
132	NC_019675	CCCTG	2	10	161623	161632	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
133	NC_019675	TGGCC	2	10	162581	162590	0 %	20 %	40 %	40 %	427701491
134	NC_019675	CGGCG	2	10	162744	162753	0 %	0 %	60 %	40 %	427701491
135	NC_019675	GGCCA	2	10	162771	162780	20 %	0 %	40 %	40 %	427701491
136	NC_019675	GGGGC	2	10	163476	163485	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
137	NC_019675	CAGAA	2	10	167439	167448	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
138	NC_019675	GGGGT	2	10	168018	168027	0 %	20 %	80 %	0 %	427701499
139	NC_019675	GCCGC	2	10	168359	168368	0 %	0 %	40 %	60 %	427701499
140	NC_019675	CGGTG	2	10	171650	171659	0 %	20 %	60 %	20 %	427701500
141	NC_019675	TGCTC	2	10	171712	171721	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
142	NC_019675	CCCCG	2	10	178240	178249	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
143	NC_019675	CGGTG	2	10	178291	178300	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
144	NC_019675	GAACA	2	10	179301	179310	60 %	0 %	20 %	20 %	427701506
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146	NC_019675	CAGCA	2	10	180291	180300	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
147	NC_019675	CTGGC	2	10	181087	181096	0 %	20 %	40 %	40 %	427701507
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180	NC_019675	CGGGG	2	10	215334	215343	0 %	0 %	80 %	20 %	427701545
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185	NC_019675	GGCCC	2	10	222086	222095	0 %	0 %	40 %	60 %	427701552
186	NC_019675	GGTGG	2	10	223820	223829	0 %	20 %	80 %	0 %	427701553
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196	NC_019675	CGGCT	2	10	234205	234214	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
197	NC_019675	GCGAG	2	10	234339	234348	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
198	NC_019675	GCAAG	2	10	234772	234781	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
199	NC_019675	GCCGT	2	10	239436	239445	0 %	20 %	40 %	40 %	427701561
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220	NC_019675	CTCAT	2	10	259473	259482	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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236	NC_019675	TCCTG	2	10	283256	283265	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
237	NC_019675	GAGTG	2	10	284462	284471	20 %	20 %	60 %	0 %	427701591
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245	NC_019675	TAGAT	2	10	295004	295013	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
246	NC_019675	AGGGC	2	10	295321	295330	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
247	NC_019675	AAACG	2	10	295845	295854	60 %	0 %	20 %	20 %	427701597
248	NC_019675	AATTG	2	10	297597	297606	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
249	NC_019675	CCGCT	2	10	299305	299314	0 %	20 %	20 %	60 %	427701602
250	NC_019675	TCGCC	2	10	300194	300203	0 %	20 %	20 %	60 %	427701602
251	NC_019675	CATCC	2	10	304786	304795	20 %	20 %	0 %	60 %	427701608
252	NC_019675	CTTGG	2	10	306629	306638	0 %	40 %	40 %	20 %	427701610
253	NC_019675	CAACG	2	10	307115	307124	40 %	0 %	20 %	40 %	427701610
254	NC_019675	TGCTC	2	10	308059	308068	0 %	40 %	20 %	40 %	427701611
255	NC_019675	CCAAG	2	10	310508	310517	40 %	0 %	20 %	40 %	427701613
256	NC_019675	TGCCC	2	10	310680	310689	0 %	20 %	20 %	60 %	427701613
257	NC_019675	GAGCA	2	10	311776	311785	40 %	0 %	40 %	20 %	427701613
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261	NC_019675	TCGGG	2	10	314944	314953	0 %	20 %	60 %	20 %	427701615
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263	NC_019675	TCTGC	2	10	317932	317941	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
264	NC_019675	TGCCG	2	10	319605	319614	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
265	NC_019675	TGTGC	2	10	319765	319774	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
266	NC_019675	AAGGG	2	10	320365	320374	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
267	NC_019675	GCACC	2	10	322856	322865	20 %	0 %	20 %	60 %	427701619
268	NC_019675	CGGGC	2	10	322898	322907	0 %	0 %	60 %	40 %	427701619
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