MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Carnobacterium maltaromaticum LMA28 complete genome

Total Repeats: 51452

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019425	ACT	2	6	144	149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_019425	ACT	2	6	333	338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_019425	AGG	2	6	389	394	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_019425	ATT	3	9	524	532	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	508605262
5	NC_019425	ATT	2	6	558	563	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	508605262
6	NC_019425	ATT	2	6	638	643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	508605262
7	NC_019425	TTC	2	6	670	675	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	508605262
8	NC_019425	AAT	2	6	683	688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	508605262
9	NC_019425	GCT	2	6	794	799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	508605262
10	NC_019425	GAA	2	6	812	817	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	508605262
11	NC_019425	TTC	2	6	842	847	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	508605262
12	NC_019425	GGA	2	6	851	856	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	508605262
13	NC_019425	TCA	2	6	895	900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	508605262
14	NC_019425	CTA	2	6	905	910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	508605262
15	NC_019425	AGT	2	6	941	946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	508605262
16	NC_019425	TTA	2	6	966	971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	508605262
17	NC_019425	TAT	2	6	1029	1034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	508605262
18	NC_019425	TGA	2	6	1039	1044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	508605262
19	NC_019425	AAG	2	6	1065	1070	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	508605262
20	NC_019425	AAG	2	6	1077	1082	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	508605262
21	NC_019425	TTC	2	6	1085	1090	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	508605262
22	NC_019425	ATG	2	6	1110	1115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	508605262
23	NC_019425	CAA	2	6	1452	1457	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	508605262
24	NC_019425	CGT	2	6	1483	1488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	508605262
25	NC_019425	AAG	2	6	1529	1534	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	508605262
26	NC_019425	TTG	2	6	1548	1553	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	508605262
27	NC_019425	GGT	2	6	1628	1633	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	508605262
28	NC_019425	GAA	2	6	1694	1699	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	508605262
29	NC_019425	AGA	2	6	1714	1719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	508605262
30	NC_019425	GTT	2	6	1745	1750	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_019425	CTA	3	9	1908	1916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_019425	TTA	2	6	1959	1964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_019425	AAG	2	6	1985	1990	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414082104
34	NC_019425	ACA	2	6	2040	2045	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414082104
35	NC_019425	AGA	2	6	2081	2086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414082104
36	NC_019425	AAG	2	6	2143	2148	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414082104
37	NC_019425	GTA	2	6	2182	2187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414082104
38	NC_019425	CTT	2	6	2204	2209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414082104
39	NC_019425	TGA	2	6	2234	2239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414082104
40	NC_019425	ATG	2	6	2241	2246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414082104
41	NC_019425	GTC	2	6	2437	2442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414082104
42	NC_019425	ATT	2	6	2483	2488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414082104
43	NC_019425	ATT	2	6	2526	2531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414082104
44	NC_019425	TTA	2	6	2575	2580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414082104
45	NC_019425	GAT	2	6	2619	2624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414082104
46	NC_019425	ATG	2	6	2643	2648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414082104
47	NC_019425	TGT	2	6	2837	2842	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414082104
48	NC_019425	GAT	2	6	3063	3068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414082104
49	NC_019425	AAT	2	6	3312	3317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_019425	TTA	2	6	3466	3471	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414082105
51	NC_019425	ATT	2	6	3482	3487	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414082105
52	NC_019425	ATT	2	6	3501	3506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414082105
53	NC_019425	AGT	2	6	3507	3512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414082105
54	NC_019425	TTA	2	6	3552	3557	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414082105
55	NC_019425	TCG	2	6	3607	3612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414082105
56	NC_019425	TGA	2	6	3620	3625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414082105
57	NC_019425	AGA	2	6	3685	3690	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	508605263
58	NC_019425	AAG	2	6	3823	3828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	508605263
59	NC_019425	TCC	2	6	3911	3916	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	508605263
60	NC_019425	TTG	2	6	3930	3935	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	508605263
61	NC_019425	TAA	2	6	3940	3945	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	508605263
62	NC_019425	AAC	2	6	4149	4154	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	508605263
63	NC_019425	ATG	2	6	4178	4183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	508605263
64	NC_019425	TCA	2	6	4306	4311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	508605263
65	NC_019425	TGC	2	6	4411	4416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	508605263
66	NC_019425	TGA	2	6	4477	4482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	508605263
67	NC_019425	AAT	2	6	4499	4504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	508605263
68	NC_019425	ACA	2	6	4534	4539	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	508605263
69	NC_019425	AAC	2	6	4543	4548	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	508605263
70	NC_019425	TTA	2	6	4616	4621	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	508605263
71	NC_019425	GAT	2	6	4643	4648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	508605263
72	NC_019425	CAA	2	6	4707	4712	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	508605263
73	NC_019425	TAG	2	6	4765	4770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	508605263
74	NC_019425	GAA	2	6	4807	4812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414082107
75	NC_019425	ATG	2	6	4844	4849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414082107
76	NC_019425	CAA	2	6	4916	4921	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414082107
77	NC_019425	TGA	2	6	4971	4976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414082107
78	NC_019425	GAA	2	6	5017	5022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414082107
79	NC_019425	TGA	2	6	5043	5048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414082107
80	NC_019425	GTC	2	6	5087	5092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414082107
81	NC_019425	GGA	2	6	5146	5151	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	414082107
82	NC_019425	TGG	2	6	5163	5168	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414082107
83	NC_019425	ATT	2	6	5293	5298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414082107
84	NC_019425	AAC	2	6	5319	5324	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414082107
85	NC_019425	ACA	2	6	5362	5367	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414082107
86	NC_019425	CAA	2	6	5526	5531	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414082107
87	NC_019425	CAA	2	6	5572	5577	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414082107
88	NC_019425	TTG	3	9	5582	5590	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414082107
89	NC_019425	AGC	2	6	5592	5597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414082107
90	NC_019425	TTG	2	6	5629	5634	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414082107
91	NC_019425	AAC	2	6	5644	5649	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414082107
92	NC_019425	TCA	2	6	5708	5713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414082107
93	NC_019425	TGA	2	6	5738	5743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414082107
94	NC_019425	GAA	2	6	5752	5757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414082107
95	NC_019425	TCG	2	6	5937	5942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414082107
96	NC_019425	GCT	2	6	5983	5988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414082107
97	NC_019425	AAG	2	6	6013	6018	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414082107
98	NC_019425	TCG	2	6	6098	6103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414082107
99	NC_019425	TGG	2	6	6117	6122	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414082107
100	NC_019425	GAA	2	6	6226	6231	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414082107
101	NC_019425	TGG	2	6	6267	6272	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414082107
102	NC_019425	GTT	2	6	6391	6396	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414082107
103	NC_019425	ACC	2	6	6423	6428	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	414082107
104	NC_019425	AAC	2	6	6566	6571	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414082107
105	NC_019425	CAA	2	6	6578	6583	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414082107
106	NC_019425	CGT	2	6	6598	6603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414082107
107	NC_019425	TGA	2	6	6624	6629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414082107
108	NC_019425	GAA	2	6	6700	6705	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414082107
109	NC_019425	ATT	2	6	6745	6750	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_019425	ACT	2	6	6761	6766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_019425	GAG	2	6	6871	6876	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_019425	GAA	2	6	6894	6899	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414082108
113	NC_019425	TTG	2	6	6976	6981	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414082108
114	NC_019425	TCG	2	6	7025	7030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414082108
115	NC_019425	TTG	2	6	7096	7101	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414082108
116	NC_019425	GCT	2	6	7242	7247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414082108
117	NC_019425	TGC	2	6	7291	7296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414082108
118	NC_019425	CCA	2	6	7437	7442	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	414082108
119	NC_019425	TGA	2	6	7480	7485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414082108
120	NC_019425	CAA	2	6	7498	7503	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414082108
121	NC_019425	TCG	2	6	7577	7582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414082108
122	NC_019425	TTG	2	6	7663	7668	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414082108
123	NC_019425	TGA	2	6	7766	7771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414082108
124	NC_019425	GTT	2	6	7830	7835	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414082108
125	NC_019425	CTT	2	6	7870	7875	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414082108
126	NC_019425	ATT	2	6	7945	7950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414082108
127	NC_019425	TCG	2	6	7973	7978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414082108
128	NC_019425	TGA	2	6	8057	8062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414082108
129	NC_019425	ATC	2	6	8064	8069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414082108
130	NC_019425	ATT	2	6	8073	8078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414082108
131	NC_019425	CAG	2	6	8264	8269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414082108
132	NC_019425	ATT	2	6	8286	8291	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414082108
133	NC_019425	AGA	2	6	8372	8377	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414082108
134	NC_019425	GAA	3	9	8391	8399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414082108
135	NC_019425	TAA	2	6	8447	8452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414082108
136	NC_019425	GGT	2	6	8475	8480	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414082108
137	NC_019425	GAT	2	6	8511	8516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414082108
138	NC_019425	TTA	2	6	8556	8561	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414082108
139	NC_019425	AGC	2	6	8708	8713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414082108
140	NC_019425	TTC	2	6	8730	8735	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414082108
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142	NC_019425	AGA	2	6	8822	8827	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414082108
143	NC_019425	TGA	2	6	8836	8841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414082108
144	NC_019425	ATT	2	6	8874	8879	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414082108
145	NC_019425	GTG	2	6	8947	8952	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414082108
146	NC_019425	GTT	2	6	8985	8990	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414082108
147	NC_019425	GTG	2	6	9088	9093	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414082108
148	NC_019425	ACA	2	6	9150	9155	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414082108
149	NC_019425	GAA	2	6	9165	9170	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414082108
150	NC_019425	TTA	3	9	9199	9207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414082108
151	NC_019425	GAA	3	9	9324	9332	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414082108
152	NC_019425	GAT	2	6	9381	9386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414082108
153	NC_019425	GAA	2	6	9399	9404	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414082108
154	NC_019425	AGG	2	6	9664	9669	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
155	NC_019425	AGC	2	6	9745	9750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414082109
156	NC_019425	TTG	2	6	9753	9758	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414082109
157	NC_019425	AAT	2	6	9796	9801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414082109
158	NC_019425	TGA	2	6	9937	9942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414082109
159	NC_019425	TAT	2	6	9943	9948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414082109
160	NC_019425	AGA	2	6	9967	9972	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414082109
161	NC_019425	GAT	2	6	10029	10034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414082110
162	NC_019425	GTT	2	6	10042	10047	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414082110
163	NC_019425	CTT	2	6	10109	10114	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414082110
164	NC_019425	CTG	2	6	10199	10204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414082110
165	NC_019425	CAA	2	6	10282	10287	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414082110
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167	NC_019425	CAA	2	6	10349	10354	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414082110
168	NC_019425	GTA	2	6	10385	10390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414082110
169	NC_019425	TGG	2	6	10392	10397	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414082110
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176	NC_019425	AGG	2	6	10598	10603	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
177	NC_019425	TAA	2	6	10606	10611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414082111
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179	NC_019425	ATA	2	6	10678	10683	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414082111
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183	NC_019425	ATT	2	6	10820	10825	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414082111
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185	NC_019425	GTA	2	6	11005	11010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
186	NC_019425	AGT	2	6	11043	11048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
187	NC_019425	TAG	3	9	11179	11187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414082112
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189	NC_019425	TAT	2	6	11254	11259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414082112
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192	NC_019425	GAA	2	6	11379	11384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414082112
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200	NC_019425	TAT	2	6	11846	11851	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414082112
201	NC_019425	GTT	2	6	11997	12002	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414082112
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209	NC_019425	TAT	2	6	12308	12313	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414082112
210	NC_019425	TTA	2	6	12358	12363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414082112
211	NC_019425	TGG	2	6	12364	12369	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414082112
212	NC_019425	ATC	3	9	12370	12378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414082112
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225	NC_019425	GGT	2	6	12975	12980	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414082112
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234	NC_019425	ACT	2	6	13440	13445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414082113
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237	NC_019425	TAA	2	6	13570	13575	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
238	NC_019425	CAA	2	6	13684	13689	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414082114
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241	NC_019425	CCA	2	6	13968	13973	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	414082114
242	NC_019425	CTT	2	6	14008	14013	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414082114
243	NC_019425	CAG	2	6	14089	14094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414082114
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245	NC_019425	GCT	2	6	14130	14135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414082114
246	NC_019425	GTA	2	6	14208	14213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414082114
247	NC_019425	TAA	3	9	14239	14247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414082114
248	NC_019425	TTG	2	6	14313	14318	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
249	NC_019425	ATT	2	6	14367	14372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
250	NC_019425	AAT	2	6	14396	14401	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
251	NC_019425	TAA	2	6	14402	14407	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
252	NC_019425	AAC	2	6	14485	14490	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	508605264
253	NC_019425	TAA	2	6	14506	14511	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	508605264
254	NC_019425	AGA	2	6	14572	14577	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
255	NC_019425	GTT	2	6	14659	14664	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
256	NC_019425	TAG	2	6	14710	14715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
257	NC_019425	ATA	2	6	14725	14730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
258	NC_019425	CTT	2	6	14754	14759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
259	NC_019425	TAT	2	6	14852	14857	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414082116
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262	NC_019425	ATT	2	6	14904	14909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414082116
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268	NC_019425	AAT	2	6	15152	15157	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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270	NC_019425	GTT	2	6	15269	15274	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
271	NC_019425	TTA	2	6	15350	15355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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370	NC_019425	AGG	2	6	23517	23522	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
371	NC_019425	TTA	2	6	23572	23577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414082125
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380	NC_019425	TGA	3	9	24231	24239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414082125
381	NC_019425	TGT	2	6	24345	24350	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414082125
382	NC_019425	ATG	2	6	24362	24367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414082125
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499	NC_019425	AAT	2	6	33884	33889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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