MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Candidatus Nitrososphaera gargensis Ga9.2 chromosome

Total Repeats: 57898

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_018719	GC	3	6	236326	236331	0 %	0 %	50 %	50 %	408402930
5002	NC_018719	GGC	2	6	236349	236354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408402930
5003	NC_018719	GTA	2	6	236402	236407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408402930
5004	NC_018719	GAT	2	6	236428	236433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408402930
5005	NC_018719	GCT	2	6	236470	236475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408402930
5006	NC_018719	CCT	2	6	236618	236623	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408402930
5007	NC_018719	AC	3	6	236637	236642	50 %	0 %	0 %	50 %	408402930
5008	NC_018719	TTC	2	6	236715	236720	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408402930
5009	NC_018719	GTCT	2	8	236770	236777	0 %	50 %	25 %	25 %	408402930
5010	NC_018719	GGC	2	6	236786	236791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408402930
5011	NC_018719	CTG	2	6	236801	236806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408402930
5012	NC_018719	CAAGCC	2	12	236812	236823	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	408402930
5013	NC_018719	TCC	2	6	236875	236880	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5014	NC_018719	GAT	2	6	236892	236897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5015	NC_018719	TCA	2	6	236903	236908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5016	NC_018719	CAG	2	6	236978	236983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5017	NC_018719	AATAT	2	10	237005	237014	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5018	NC_018719	A	7	7	237223	237229	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5019	NC_018719	T	7	7	237272	237278	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5020	NC_018719	TACT	2	8	237401	237408	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5021	NC_018719	GAA	2	6	237468	237473	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5022	NC_018719	TACAT	2	10	237514	237523	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
5023	NC_018719	GCA	2	6	237541	237546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5024	NC_018719	GCT	2	6	237639	237644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5025	NC_018719	GAA	2	6	237711	237716	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408402931
5026	NC_018719	GCC	2	6	237797	237802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408402931
5027	NC_018719	ATG	2	6	237905	237910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408402932
5028	NC_018719	A	6	6	237946	237951	100 %	0 %	0 %	0 %	408402932
5029	NC_018719	AAT	2	6	238041	238046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408402932
5030	NC_018719	A	6	6	238090	238095	100 %	0 %	0 %	0 %	408402932
5031	NC_018719	AAG	2	6	238136	238141	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408402932
5032	NC_018719	TGG	2	6	238149	238154	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408402932
5033	NC_018719	TAT	2	6	238229	238234	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408402933
5034	NC_018719	AAC	2	6	238271	238276	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408402933
5035	NC_018719	GATA	2	8	238297	238304	50 %	25 %	25 %	0 %	408402933
5036	NC_018719	TTG	2	6	238335	238340	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408402933
5037	NC_018719	CAG	3	9	238392	238400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408402933
5038	NC_018719	GCT	2	6	238510	238515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408402933
5039	NC_018719	ATT	2	6	238536	238541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408402933
5040	NC_018719	AATC	2	8	238614	238621	50 %	25 %	0 %	25 %	408402934
5041	NC_018719	GCAAA	2	10	238701	238710	60 %	0 %	20 %	20 %	408402934
5042	NC_018719	GCA	2	6	238721	238726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408402934
5043	NC_018719	AAT	2	6	238752	238757	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408402934
5044	NC_018719	TAC	2	6	239026	239031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408402934
5045	NC_018719	ATT	2	6	239052	239057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5046	NC_018719	CTA	2	6	239170	239175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408402935
5047	NC_018719	GA	4	8	239214	239221	50 %	0 %	50 %	0 %	408402935
5048	NC_018719	CAAACG	2	12	239292	239303	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	408402935
5049	NC_018719	AGG	2	6	239316	239321	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408402935
5050	NC_018719	GT	3	6	239382	239387	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5051	NC_018719	CCG	2	6	239510	239515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408402936
5052	NC_018719	GCC	2	6	239516	239521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408402936
5053	NC_018719	ACA	2	6	239576	239581	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408402936
5054	NC_018719	GC	3	6	239593	239598	0 %	0 %	50 %	50 %	408402936
5055	NC_018719	AAG	2	6	239612	239617	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408402936
5056	NC_018719	AAG	2	6	239621	239626	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408402936
5057	NC_018719	GGCG	2	8	239636	239643	0 %	0 %	75 %	25 %	408402936
5058	NC_018719	CGG	2	6	239677	239682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408402936
5059	NC_018719	TGA	2	6	239692	239697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408402936
5060	NC_018719	CACG	2	8	239745	239752	25 %	0 %	25 %	50 %	408402936
5061	NC_018719	AAGG	2	8	239822	239829	50 %	0 %	50 %	0 %	408402936
5062	NC_018719	AGA	2	6	239862	239867	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408402936
5063	NC_018719	CGG	2	6	239874	239879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408402936
5064	NC_018719	GAA	3	9	239915	239923	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408402936
5065	NC_018719	ATCT	2	8	240029	240036	25 %	50 %	0 %	25 %	408402936
5066	NC_018719	AAC	2	6	240079	240084	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408402936
5067	NC_018719	CAAT	2	8	240149	240156	50 %	25 %	0 %	25 %	408402936
5068	NC_018719	GAA	2	6	240275	240280	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408402936
5069	NC_018719	TGGCTT	2	12	240513	240524	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	408402936
5070	NC_018719	CGA	2	6	240601	240606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408402936
5071	NC_018719	CAT	2	6	240619	240624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408402936
5072	NC_018719	AGC	2	6	240643	240648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408402936
5073	NC_018719	AGA	2	6	240668	240673	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408402936
5074	NC_018719	AT	3	6	240865	240870	50 %	50 %	0 %	0 %	408402936
5075	NC_018719	GCG	2	6	240903	240908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408402936
5076	NC_018719	GGAGC	2	10	240922	240931	20 %	0 %	60 %	20 %	408402936
5077	NC_018719	TATGAT	2	12	240935	240946	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	408402936
5078	NC_018719	TCG	2	6	241177	241182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408402937
5079	NC_018719	CTA	2	6	241194	241199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408402937
5080	NC_018719	A	8	8	241283	241290	100 %	0 %	0 %	0 %	408402937
5081	NC_018719	CTA	3	9	241495	241503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408402937
5082	NC_018719	CAA	2	6	241516	241521	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408402937
5083	NC_018719	A	6	6	241536	241541	100 %	0 %	0 %	0 %	408402937
5084	NC_018719	GAA	2	6	241641	241646	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408402937
5085	NC_018719	ACA	2	6	241707	241712	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408402937
5086	NC_018719	ATTGTG	2	12	241741	241752	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	408402937
5087	NC_018719	AGG	2	6	241834	241839	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408402937
5088	NC_018719	AGAA	2	8	241901	241908	75 %	0 %	25 %	0 %	408402938
5089	NC_018719	CAT	2	6	241921	241926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408402938
5090	NC_018719	CGG	2	6	241984	241989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408402938
5091	NC_018719	GCG	2	6	242042	242047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408402938
5092	NC_018719	TAC	2	6	242060	242065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408402938
5093	NC_018719	GAA	2	6	242084	242089	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408402938
5094	NC_018719	GAT	2	6	242173	242178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408402938
5095	NC_018719	AAT	2	6	242230	242235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408402938
5096	NC_018719	AGG	2	6	242252	242257	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408402938
5097	NC_018719	CAG	2	6	242272	242277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5098	NC_018719	ACA	2	6	242357	242362	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408402939
5099	NC_018719	CAAGGG	2	12	242379	242390	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	408402939
5100	NC_018719	AGG	2	6	242437	242442	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408402939
5101	NC_018719	ACAA	2	8	242471	242478	75 %	0 %	0 %	25 %	408402939
5102	NC_018719	GAA	2	6	242499	242504	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408402939
5103	NC_018719	CGC	2	6	242574	242579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408402939
5104	NC_018719	AGG	2	6	242609	242614	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408402939
5105	NC_018719	AAG	2	6	242939	242944	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408402940
5106	NC_018719	AGG	2	6	243009	243014	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408402940
5107	NC_018719	GCTT	2	8	243019	243026	0 %	50 %	25 %	25 %	408402940
5108	NC_018719	CTA	2	6	243081	243086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5109	NC_018719	A	6	6	243179	243184	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5110	NC_018719	GGA	2	6	243192	243197	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5111	NC_018719	TAC	2	6	243246	243251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5112	NC_018719	ATC	2	6	243289	243294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5113	NC_018719	AAT	2	6	243327	243332	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5114	NC_018719	AGT	2	6	243336	243341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5115	NC_018719	GCT	2	6	243349	243354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5116	NC_018719	GAA	2	6	243411	243416	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5117	NC_018719	GAT	2	6	243459	243464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5118	NC_018719	GGCT	2	8	243474	243481	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5119	NC_018719	GGC	2	6	243540	243545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5120	NC_018719	TGCAA	2	10	243661	243670	40 %	20 %	20 %	20 %	408402941
5121	NC_018719	A	6	6	243684	243689	100 %	0 %	0 %	0 %	408402941
5122	NC_018719	AGT	2	6	243761	243766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408402941
5123	NC_018719	CAA	2	6	243846	243851	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408402942
5124	NC_018719	GAT	2	6	243859	243864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408402942
5125	NC_018719	ACA	2	6	243865	243870	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408402942
5126	NC_018719	TCTA	2	8	243887	243894	25 %	50 %	0 %	25 %	408402942
5127	NC_018719	CGG	2	6	243900	243905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408402942
5128	NC_018719	A	7	7	243932	243938	100 %	0 %	0 %	0 %	408402942
5129	NC_018719	A	6	6	243958	243963	100 %	0 %	0 %	0 %	408402942
5130	NC_018719	ACT	2	6	243983	243988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408402942
5131	NC_018719	GTCA	2	8	244099	244106	25 %	25 %	25 %	25 %	408402942
5132	NC_018719	AAAT	2	8	244119	244126	75 %	25 %	0 %	0 %	408402942
5133	NC_018719	AAG	2	6	244375	244380	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408402942
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5137	NC_018719	CAGA	2	8	244583	244590	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5138	NC_018719	CCA	2	6	244658	244663	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408402943
5139	NC_018719	CTG	2	6	244679	244684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408402943
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5143	NC_018719	TCC	2	6	244956	244961	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408402943
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5162	NC_018719	A	6	6	245810	245815	100 %	0 %	0 %	0 %	408402943
5163	NC_018719	TGG	2	6	245886	245891	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5164	NC_018719	CAA	2	6	245921	245926	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5220	NC_018719	AT	4	8	249213	249220	50 %	50 %	0 %	0 %	408402950
5221	NC_018719	ACT	2	6	249271	249276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5222	NC_018719	TAC	2	6	249282	249287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5225	NC_018719	AAT	2	6	249455	249460	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5226	NC_018719	AAG	2	6	249515	249520	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408402951
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5229	NC_018719	CAGA	2	8	250042	250049	50 %	0 %	25 %	25 %	408402951
5230	NC_018719	GAC	2	6	250162	250167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408402951
5231	NC_018719	GCAG	2	8	250248	250255	25 %	0 %	50 %	25 %	408402951
5232	NC_018719	AGG	3	9	250361	250369	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408402951
5233	NC_018719	GCT	2	6	250377	250382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408402951
5234	NC_018719	GAA	2	6	250423	250428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408402951
5235	NC_018719	AG	3	6	250441	250446	50 %	0 %	50 %	0 %	408402951
5236	NC_018719	GCG	2	6	250457	250462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408402951
5237	NC_018719	AGCGCC	2	12	250590	250601	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
5238	NC_018719	CAG	2	6	250665	250670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408402952
5239	NC_018719	ACA	3	9	250675	250683	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408402952
5240	NC_018719	TCA	2	6	250727	250732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408402952
5241	NC_018719	ACA	2	6	250736	250741	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408402952
5242	NC_018719	TGT	2	6	250758	250763	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408402952
5243	NC_018719	AAG	2	6	250816	250821	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408402952
5244	NC_018719	GGC	2	6	250824	250829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408402952
5245	NC_018719	TGA	2	6	250843	250848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408402952
5246	NC_018719	TGT	2	6	250920	250925	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5247	NC_018719	CAAG	2	8	250926	250933	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5248	NC_018719	A	6	6	250968	250973	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5249	NC_018719	CAT	2	6	250976	250981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5373	NC_018719	AATC	2	8	257677	257684	50 %	25 %	0 %	25 %	408402964
5374	NC_018719	GCAAA	2	10	257764	257773	60 %	0 %	20 %	20 %	408402964
5375	NC_018719	GCA	2	6	257784	257789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408402964
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5377	NC_018719	TAC	2	6	258089	258094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408402964
5378	NC_018719	ATT	2	6	258115	258120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5379	NC_018719	CTA	2	6	258233	258238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408402965
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5384	NC_018719	CCG	2	6	258573	258578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408402966
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5401	NC_018719	GAA	2	6	259338	259343	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408402966
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5409	NC_018719	GGAGC	2	10	259985	259994	20 %	0 %	60 %	20 %	408402966
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5414	NC_018719	CTA	3	9	260558	260566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408402967
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5422	NC_018719	CAT	2	6	260984	260989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408402968
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5444	NC_018719	TAC	2	6	262309	262314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5450	NC_018719	GAT	2	6	262522	262527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5452	NC_018719	GGC	2	6	262603	262608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5453	NC_018719	TGCAA	2	10	262724	262733	40 %	20 %	20 %	20 %	408402971
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5462	NC_018719	A	6	6	263021	263026	100 %	0 %	0 %	0 %	408402972
5463	NC_018719	ACT	2	6	263046	263051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408402972
5464	NC_018719	GTCA	2	8	263162	263169	25 %	25 %	25 %	25 %	408402972
5465	NC_018719	AAAT	2	8	263182	263189	75 %	25 %	0 %	0 %	408402972
5466	NC_018719	AAG	2	6	263438	263443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408402972
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5475	NC_018719	ACCG	2	8	263857	263864	25 %	0 %	25 %	50 %	408402974
5476	NC_018719	ATT	2	6	263882	263887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408402974
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5479	NC_018719	ACG	2	6	264078	264083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408402974
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5481	NC_018719	TTG	2	6	264138	264143	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408402974
5482	NC_018719	TAC	2	6	264251	264256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408402974
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5484	NC_018719	C	6	6	264458	264463	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5485	NC_018719	TAA	2	6	264641	264646	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5486	NC_018719	AG	3	6	264726	264731	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5487	NC_018719	CCA	2	6	264755	264760	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408402975
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5493	NC_018719	GAA	2	6	265101	265106	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408402976
5494	NC_018719	GACAAG	2	12	265164	265175	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	408402976
5495	NC_018719	TAT	2	6	265254	265259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408402976
5496	NC_018719	CCGT	2	8	265261	265268	0 %	25 %	25 %	50 %	408402976
5497	NC_018719	ACT	2	6	265296	265301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408402976
5498	NC_018719	AAGC	2	8	265314	265321	50 %	0 %	25 %	25 %	408402976
5499	NC_018719	CGA	2	6	265358	265363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408402976
5500	NC_018719	AGC	2	6	265396	265401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408402976

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