MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Candidatus Nitrososphaera gargensis Ga9.2 chromosome

Total Repeats: 57898

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_018719	ATC	2	6	211147	211152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408402899
4502	NC_018719	GCT	2	6	211165	211170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408402899
4503	NC_018719	CTGC	2	8	211299	211306	0 %	25 %	25 %	50 %	408402899
4504	NC_018719	CTC	2	6	211331	211336	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408402899
4505	NC_018719	CTT	2	6	211378	211383	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408402899
4506	NC_018719	ATC	2	6	211401	211406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408402899
4507	NC_018719	CTG	2	6	211409	211414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408402899
4508	NC_018719	GCA	2	6	211434	211439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408402899
4509	NC_018719	CAA	2	6	211586	211591	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408402899
4510	NC_018719	GAC	2	6	211598	211603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408402899
4511	NC_018719	AAC	2	6	211619	211624	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408402899
4512	NC_018719	CCAT	2	8	211665	211672	25 %	25 %	0 %	50 %	408402899
4513	NC_018719	CAAG	2	8	211707	211714	50 %	0 %	25 %	25 %	408402899
4514	NC_018719	ATT	2	6	211720	211725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408402899
4515	NC_018719	CAG	2	6	211796	211801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408402900
4516	NC_018719	GCA	2	6	211811	211816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408402900
4517	NC_018719	GCAAC	2	10	211823	211832	40 %	0 %	20 %	40 %	408402900
4518	NC_018719	TGT	2	6	211851	211856	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408402900
4519	NC_018719	CGC	2	6	211857	211862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408402900
4520	NC_018719	TGCC	2	8	211910	211917	0 %	25 %	25 %	50 %	408402900
4521	NC_018719	GAGC	2	8	211941	211948	25 %	0 %	50 %	25 %	408402900
4522	NC_018719	GCT	2	6	212072	212077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408402900
4523	NC_018719	TAG	2	6	212113	212118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408402900
4524	NC_018719	TGT	2	6	212257	212262	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408402900
4525	NC_018719	GGC	2	6	212263	212268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408402900
4526	NC_018719	GCT	2	6	212280	212285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408402900
4527	NC_018719	CAGA	2	8	212345	212352	50 %	0 %	25 %	25 %	408402900
4528	NC_018719	TGC	2	6	212416	212421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408402900
4529	NC_018719	TC	3	6	212429	212434	0 %	50 %	0 %	50 %	408402900
4530	NC_018719	ACG	2	6	212462	212467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408402900
4531	NC_018719	TGA	2	6	212474	212479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408402900
4532	NC_018719	CTG	2	6	212621	212626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408402900
4533	NC_018719	TCC	2	6	212656	212661	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408402900
4534	NC_018719	GCATT	2	10	212684	212693	20 %	40 %	20 %	20 %	408402900
4535	NC_018719	GTC	2	6	212736	212741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408402900
4536	NC_018719	TTG	2	6	212926	212931	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408402900
4537	NC_018719	TAG	2	6	212941	212946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408402900
4538	NC_018719	GTT	2	6	212964	212969	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408402900
4539	NC_018719	CGT	2	6	212978	212983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408402900
4540	NC_018719	CTG	2	6	213052	213057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408402900
4541	NC_018719	GCC	2	6	213087	213092	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408402900
4542	NC_018719	TGT	2	6	213167	213172	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408402900
4543	NC_018719	GCC	2	6	213220	213225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408402900
4544	NC_018719	ACG	2	6	213226	213231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408402900
4545	NC_018719	GAC	2	6	213238	213243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408402900
4546	NC_018719	TGG	2	6	213311	213316	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408402900
4547	NC_018719	TCG	2	6	213398	213403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408402900
4548	NC_018719	AGC	2	6	213501	213506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408402900
4549	NC_018719	AGC	2	6	213520	213525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408402900
4550	NC_018719	TCT	3	9	213600	213608	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408402901
4551	NC_018719	TGC	2	6	213627	213632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408402901
4552	NC_018719	ATG	2	6	213634	213639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408402901
4553	NC_018719	CAG	2	6	213660	213665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408402901
4554	NC_018719	TTG	2	6	213769	213774	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408402901
4555	NC_018719	ACG	2	6	213916	213921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408402901
4556	NC_018719	TCC	2	6	213960	213965	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408402901
4557	NC_018719	TC	3	6	213973	213978	0 %	50 %	0 %	50 %	408402901
4558	NC_018719	TTA	2	6	213994	213999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408402901
4559	NC_018719	TCT	2	6	214000	214005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408402901
4560	NC_018719	GTT	2	6	214006	214011	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408402901
4561	NC_018719	TGT	2	6	214025	214030	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408402901
4562	NC_018719	CTT	2	6	214037	214042	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408402901
4563	NC_018719	CAT	2	6	214043	214048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408402901
4564	NC_018719	CTC	2	6	214058	214063	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408402901
4565	NC_018719	CTT	2	6	214067	214072	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408402901
4566	NC_018719	TCCAT	2	10	214078	214087	20 %	40 %	0 %	40 %	408402901
4567	NC_018719	ACG	2	6	214132	214137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408402901
4568	NC_018719	CAGC	2	8	214196	214203	25 %	0 %	25 %	50 %	408402901
4569	NC_018719	GTT	2	6	214206	214211	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408402901
4570	NC_018719	CGGC	2	8	214283	214290	0 %	0 %	50 %	50 %	408402901
4571	NC_018719	TC	3	6	214314	214319	0 %	50 %	0 %	50 %	408402901
4572	NC_018719	GT	3	6	214336	214341	0 %	50 %	50 %	0 %	408402901
4573	NC_018719	CAGC	2	8	214379	214386	25 %	0 %	25 %	50 %	408402901
4574	NC_018719	TCGAT	2	10	214436	214445	20 %	40 %	20 %	20 %	408402901
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4578	NC_018719	CCTG	2	8	214904	214911	0 %	25 %	25 %	50 %	408402902
4579	NC_018719	ATC	2	6	214923	214928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408402902
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4585	NC_018719	CTTT	2	8	215181	215188	0 %	75 %	0 %	25 %	408402903
4586	NC_018719	GCA	2	6	215215	215220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408402903
4587	NC_018719	GTA	2	6	215250	215255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408402903
4588	NC_018719	CGC	2	6	215309	215314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408402903
4589	NC_018719	GCTCC	2	10	215426	215435	0 %	20 %	20 %	60 %	408402903
4590	NC_018719	TTATCG	2	12	215450	215461	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	408402903
4591	NC_018719	TCG	2	6	215476	215481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408402903
4592	NC_018719	CAT	2	6	215561	215566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408402903
4593	NC_018719	AGA	2	6	215625	215630	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408402903
4594	NC_018719	CAG	2	6	215637	215642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408402903
4595	NC_018719	AAT	2	6	215664	215669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408402903
4596	NC_018719	TCA	2	6	215687	215692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408402903
4597	NC_018719	GTCTT	2	10	215699	215708	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
4598	NC_018719	TTC	2	6	215731	215736	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408402904
4599	NC_018719	CCT	2	6	215871	215876	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408402904
4600	NC_018719	GTA	2	6	216046	216051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408402904
4601	NC_018719	TTC	2	6	216181	216186	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408402904
4602	NC_018719	CTT	2	6	216216	216221	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408402904
4603	NC_018719	CTA	2	6	216222	216227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408402904
4604	NC_018719	CTT	2	6	216228	216233	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408402904
4605	NC_018719	CTGC	2	8	216237	216244	0 %	25 %	25 %	50 %	408402904
4606	NC_018719	TC	3	6	216257	216262	0 %	50 %	0 %	50 %	408402905
4607	NC_018719	AAT	2	6	216312	216317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408402905
4608	NC_018719	CAG	2	6	216381	216386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408402905
4609	NC_018719	CAT	2	6	216426	216431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408402905
4610	NC_018719	CAG	2	6	216435	216440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408402905
4611	NC_018719	GGGT	2	8	216544	216551	0 %	25 %	75 %	0 %	408402905
4612	NC_018719	ATA	2	6	216565	216570	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408402905
4613	NC_018719	GCTT	2	8	216620	216627	0 %	50 %	25 %	25 %	408402905
4614	NC_018719	TAA	2	6	216694	216699	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4615	NC_018719	ATA	2	6	216722	216727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4616	NC_018719	TA	4	8	216735	216742	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4617	NC_018719	GC	3	6	216821	216826	0 %	0 %	50 %	50 %	408402906
4618	NC_018719	GCA	2	6	216841	216846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408402906
4619	NC_018719	CTA	2	6	216857	216862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408402906
4620	NC_018719	TAT	2	6	216891	216896	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408402906
4621	NC_018719	GTT	2	6	216907	216912	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408402906
4622	NC_018719	TGG	2	6	216936	216941	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408402906
4623	NC_018719	TGC	2	6	216971	216976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408402906
4624	NC_018719	AGC	2	6	217216	217221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408402906
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4630	NC_018719	GC	3	6	217637	217642	0 %	0 %	50 %	50 %	408402906
4631	NC_018719	GCC	3	9	217665	217673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408402906
4632	NC_018719	AGCA	2	8	217707	217714	50 %	0 %	25 %	25 %	408402906
4633	NC_018719	TGT	2	6	217745	217750	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408402906
4634	NC_018719	TGT	2	6	217767	217772	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408402906
4635	NC_018719	CTCGAT	2	12	217977	217988	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	408402906
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4638	NC_018719	CTGC	2	8	218041	218048	0 %	25 %	25 %	50 %	408402906
4639	NC_018719	GCT	2	6	218133	218138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408402906
4640	NC_018719	AAGG	2	8	218151	218158	50 %	0 %	50 %	0 %	408402906
4641	NC_018719	CTG	2	6	218285	218290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408402906
4642	NC_018719	CTG	3	9	218292	218300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408402906
4643	NC_018719	GC	3	6	218301	218306	0 %	0 %	50 %	50 %	408402906
4644	NC_018719	GCAG	2	8	218326	218333	25 %	0 %	50 %	25 %	408402906
4645	NC_018719	TCTGCC	2	12	218442	218453	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	408402906
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4652	NC_018719	GCC	2	6	218757	218762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408402906
4653	NC_018719	GCG	2	6	218776	218781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408402906
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4657	NC_018719	CA	3	6	218992	218997	50 %	0 %	0 %	50 %	408402906
4658	NC_018719	ACT	2	6	219055	219060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408402906
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4661	NC_018719	CGC	2	6	219210	219215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408402906
4662	NC_018719	CTG	3	9	219285	219293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408402906
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4705	NC_018719	TAAA	2	8	221054	221061	75 %	25 %	0 %	0 %	408402910
4706	NC_018719	TAT	2	6	221069	221074	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408402910
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4712	NC_018719	GCT	2	6	221464	221469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408402910
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4719	NC_018719	AGAA	2	8	221639	221646	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4720	NC_018719	GGAAG	2	10	221651	221660	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
4721	NC_018719	TTG	2	6	221730	221735	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408402911
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4723	NC_018719	TTG	2	6	221973	221978	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408402911
4724	NC_018719	CTG	2	6	221979	221984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408402911
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4728	NC_018719	CAG	2	6	222193	222198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408402911
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4730	NC_018719	GTC	2	6	222353	222358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408402911
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4733	NC_018719	TCC	2	6	222633	222638	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408402912
4734	NC_018719	CGG	2	6	222673	222678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408402912
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4736	NC_018719	CAAG	2	8	222719	222726	50 %	0 %	25 %	25 %	408402912
4737	NC_018719	TA	3	6	222830	222835	50 %	50 %	0 %	0 %	408402912
4738	NC_018719	GAC	2	6	222839	222844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408402912
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4740	NC_018719	CCTGA	2	10	222866	222875	20 %	20 %	20 %	40 %	408402912
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4742	NC_018719	GGCC	2	8	222950	222957	0 %	0 %	50 %	50 %	408402912
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4992	NC_018719	TGA	2	6	235870	235875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408402930
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4994	NC_018719	CGT	2	6	235924	235929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408402930
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