MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Campylobacter jejuni subsp. jejuni PT14 chromosome

Total Repeats: 1655

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018709	CAAAG	2	10	94	103	60 %	0 %	20 %	20 %	407941473
2	NC_018709	AAAGA	2	10	1009	1018	80 %	0 %	20 %	0 %	407941473
3	NC_018709	TGAAA	2	10	1194	1203	60 %	20 %	20 %	0 %	407941473
4	NC_018709	GCTTT	2	10	3329	3338	0 %	60 %	20 %	20 %	407941475
5	NC_018709	GTTTT	2	10	4923	4932	0 %	80 %	20 %	0 %	407941476
6	NC_018709	TTGTT	2	10	6485	6494	0 %	80 %	20 %	0 %	407941477
7	NC_018709	TAAAA	2	10	6618	6627	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018709	GTTTT	2	10	7486	7495	0 %	80 %	20 %	0 %	407941478
9	NC_018709	ATTTT	2	10	8703	8712	20 %	80 %	0 %	0 %	407941479
10	NC_018709	AAGAG	2	10	9735	9744	60 %	0 %	40 %	0 %	407941479
11	NC_018709	TGCTT	2	10	10044	10053	0 %	60 %	20 %	20 %	407941479
12	NC_018709	ACTTC	2	10	10397	10406	20 %	40 %	0 %	40 %	407941479
13	NC_018709	TCAAA	2	10	10959	10968	60 %	20 %	0 %	20 %	407941479
14	NC_018709	GACAA	2	10	13566	13575	60 %	0 %	20 %	20 %	407941480
15	NC_018709	CTTAA	2	10	14995	15004	40 %	40 %	0 %	20 %	407941483
16	NC_018709	CATTT	2	10	15545	15554	20 %	60 %	0 %	20 %	407941483
17	NC_018709	GTATT	2	10	15676	15685	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018709	GCGAT	2	10	15815	15824	20 %	20 %	40 %	20 %	407941484
19	NC_018709	AAAAT	2	10	18044	18053	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018709	TTTCA	2	10	18511	18520	20 %	60 %	0 %	20 %	407941486
21	NC_018709	AAGAT	2	10	20063	20072	60 %	20 %	20 %	0 %	407941487
22	NC_018709	ACCAA	2	10	21726	21735	60 %	0 %	0 %	40 %	407941489
23	NC_018709	AAAAT	2	10	21867	21876	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018709	GTTAA	2	10	21894	21903	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018709	AGATA	2	10	23651	23660	60 %	20 %	20 %	0 %	407941490
26	NC_018709	TTTAT	2	10	25655	25664	20 %	80 %	0 %	0 %	407941493
27	NC_018709	ATGGT	2	10	25864	25873	20 %	40 %	40 %	0 %	407941493
28	NC_018709	TTCTT	2	10	26410	26419	0 %	80 %	0 %	20 %	407941493
29	NC_018709	AGATA	2	10	28168	28177	60 %	20 %	20 %	0 %	407941495
30	NC_018709	ATCAA	2	10	29289	29298	60 %	20 %	0 %	20 %	407941495
31	NC_018709	ATACT	2	10	30091	30100	40 %	40 %	0 %	20 %	407941495
32	NC_018709	AATCC	2	10	30542	30551	40 %	20 %	0 %	40 %	407941496
33	NC_018709	TGTTT	2	10	31529	31538	0 %	80 %	20 %	0 %	407941496
34	NC_018709	GCAAA	2	10	31596	31605	60 %	0 %	20 %	20 %	407941496
35	NC_018709	GAAAT	2	10	32014	32023	60 %	20 %	20 %	0 %	407941497
36	NC_018709	AAAGT	2	10	32498	32507	60 %	20 %	20 %	0 %	407941497
37	NC_018709	AAAAT	2	10	33750	33759	80 %	20 %	0 %	0 %	407941498
38	NC_018709	ATTAT	2	10	34495	34504	40 %	60 %	0 %	0 %	407941499
39	NC_018709	AAATC	2	10	35165	35174	60 %	20 %	0 %	20 %	407941499
40	NC_018709	TATAT	2	10	36987	36996	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018709	CTTTT	2	10	37281	37290	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_018709	CTTTT	2	10	37451	37460	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
43	NC_018709	GGTAA	2	10	37763	37772	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018709	TCGTG	2	10	38559	38568	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
45	NC_018709	TCTTT	2	10	39580	39589	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
46	NC_018709	TAACT	2	10	39594	39603	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
47	NC_018709	CCGTA	2	10	41439	41448	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
48	NC_018709	AAGAA	2	10	42883	42892	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018709	AAAAT	2	10	43543	43552	80 %	20 %	0 %	0 %	407941501
50	NC_018709	TTGAC	2	10	45268	45277	20 %	40 %	20 %	20 %	407941502
51	NC_018709	AAGAA	2	10	46172	46181	80 %	0 %	20 %	0 %	407941502
52	NC_018709	ATGTT	2	10	46270	46279	20 %	60 %	20 %	0 %	407941502
53	NC_018709	GATTT	2	10	48522	48531	20 %	60 %	20 %	0 %	407941503
54	NC_018709	ATAAA	2	10	50188	50197	80 %	20 %	0 %	0 %	407941504
55	NC_018709	AATTT	2	10	50623	50632	40 %	60 %	0 %	0 %	407941504
56	NC_018709	AAATT	2	10	52227	52236	60 %	40 %	0 %	0 %	407941504
57	NC_018709	CAAGA	2	10	52413	52422	60 %	0 %	20 %	20 %	407941504
58	NC_018709	AAGCT	2	10	52526	52535	40 %	20 %	20 %	20 %	407941504
59	NC_018709	AGCTT	2	10	52540	52549	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
60	NC_018709	AGCAA	2	10	53690	53699	60 %	0 %	20 %	20 %	407941506
61	NC_018709	CAAAT	2	10	54589	54598	60 %	20 %	0 %	20 %	407941507
62	NC_018709	ACAAA	2	10	55617	55626	80 %	0 %	0 %	20 %	407941507
63	NC_018709	TACTC	2	10	56869	56878	20 %	40 %	0 %	40 %	407941508
64	NC_018709	GATAA	2	10	57267	57276	60 %	20 %	20 %	0 %	407941509
65	NC_018709	ACCGC	2	10	58185	58194	20 %	0 %	20 %	60 %	407941510
66	NC_018709	CTTTT	2	10	58351	58360	0 %	80 %	0 %	20 %	407941510
67	NC_018709	TTTCA	2	10	58598	58607	20 %	60 %	0 %	20 %	407941510
68	NC_018709	AAGAT	2	10	59990	59999	60 %	20 %	20 %	0 %	407941511
69	NC_018709	TAATG	2	10	60042	60051	40 %	40 %	20 %	0 %	407941511
70	NC_018709	GATAA	2	10	60367	60376	60 %	20 %	20 %	0 %	407941512
71	NC_018709	AAATT	2	10	61276	61285	60 %	40 %	0 %	0 %	407941512
72	NC_018709	TACTA	2	10	63132	63141	40 %	40 %	0 %	20 %	407941514
73	NC_018709	TGCTT	2	10	63926	63935	0 %	60 %	20 %	20 %	407941514
74	NC_018709	AATAT	2	10	64111	64120	60 %	40 %	0 %	0 %	407941514
75	NC_018709	CATTT	2	10	64710	64719	20 %	60 %	0 %	20 %	407941515
76	NC_018709	AATTT	2	10	64724	64733	40 %	60 %	0 %	0 %	407941515
77	NC_018709	ATTTC	2	10	64826	64835	20 %	60 %	0 %	20 %	407941515
78	NC_018709	TGATT	2	10	64877	64886	20 %	60 %	20 %	0 %	407941515
79	NC_018709	TTTTA	2	10	64944	64953	20 %	80 %	0 %	0 %	407941515
80	NC_018709	GATAA	2	10	65878	65887	60 %	20 %	20 %	0 %	407941515
81	NC_018709	TCAAA	2	10	66429	66438	60 %	20 %	0 %	20 %	407941516
82	NC_018709	TGTGT	2	10	66924	66933	0 %	60 %	40 %	0 %	407941516
83	NC_018709	AATAA	2	10	67103	67112	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018709	AAAAT	2	10	68146	68155	80 %	20 %	0 %	0 %	407941518
85	NC_018709	ATATT	2	10	70312	70321	40 %	60 %	0 %	0 %	407941523
86	NC_018709	TTTAT	2	10	70699	70708	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018709	CAAGA	2	10	72757	72766	60 %	0 %	20 %	20 %	407941526
88	NC_018709	GAGCA	2	10	73129	73138	40 %	0 %	40 %	20 %	407941526
89	NC_018709	ATCAA	2	10	73608	73617	60 %	20 %	0 %	20 %	407941527
90	NC_018709	CTCTT	2	10	76603	76612	0 %	60 %	0 %	40 %	407941531
91	NC_018709	TTTTC	2	10	76644	76653	0 %	80 %	0 %	20 %	407941531
92	NC_018709	TCTCT	2	10	76908	76917	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
93	NC_018709	ATCTC	2	10	77459	77468	20 %	40 %	0 %	40 %	407941532
94	NC_018709	GCCAA	2	10	77597	77606	40 %	0 %	20 %	40 %	407941532
95	NC_018709	TTTTG	2	10	78841	78850	0 %	80 %	20 %	0 %	407941533
96	NC_018709	AGTAA	2	10	79414	79423	60 %	20 %	20 %	0 %	407941534
97	NC_018709	TAAGG	2	10	83314	83323	40 %	20 %	40 %	0 %	407941538
98	NC_018709	ATTTT	2	10	83367	83376	20 %	80 %	0 %	0 %	407941538
99	NC_018709	TAGGA	2	10	83643	83652	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018709	AAAAT	2	10	83669	83678	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018709	ATTTT	2	10	83679	83688	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018709	TAAGA	2	10	84095	84104	60 %	20 %	20 %	0 %	407941539
103	NC_018709	TTAAT	2	10	84404	84413	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018709	TATTT	2	10	84472	84481	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018709	TATAA	2	10	84489	84498	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018709	TTTGC	2	10	85168	85177	0 %	60 %	20 %	20 %	407941541
107	NC_018709	TGGAC	2	10	85517	85526	20 %	20 %	40 %	20 %	407941542
108	NC_018709	TAAAA	2	10	88266	88275	80 %	20 %	0 %	0 %	407941544
109	NC_018709	CAAAA	2	10	88799	88808	80 %	0 %	0 %	20 %	407941544
110	NC_018709	TAAAA	2	10	89238	89247	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018709	TAAAA	2	10	91509	91518	80 %	20 %	0 %	0 %	407941547
112	NC_018709	GAAAT	2	10	92381	92390	60 %	20 %	20 %	0 %	407941549
113	NC_018709	TGGTT	2	10	92565	92574	0 %	60 %	40 %	0 %	407941549
114	NC_018709	TCCAT	2	10	93178	93187	20 %	40 %	0 %	40 %	407941549
115	NC_018709	TATTT	2	10	93725	93734	20 %	80 %	0 %	0 %	407941550
116	NC_018709	TTTTA	2	10	93737	93746	20 %	80 %	0 %	0 %	407941550
117	NC_018709	TATTT	2	10	94085	94094	20 %	80 %	0 %	0 %	407941550
118	NC_018709	TTGGC	2	10	94599	94608	0 %	40 %	40 %	20 %	407941551
119	NC_018709	AAGAT	2	10	94686	94695	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018709	GTAAA	2	10	95335	95344	60 %	20 %	20 %	0 %	407941552
121	NC_018709	AGAAT	2	10	95865	95874	60 %	20 %	20 %	0 %	407941553
122	NC_018709	AAGAA	2	10	96547	96556	80 %	0 %	20 %	0 %	407941554
123	NC_018709	CCTTG	2	10	96988	96997	0 %	40 %	20 %	40 %	407941554
124	NC_018709	AGGTA	2	10	97504	97513	40 %	20 %	40 %	0 %	407941554
125	NC_018709	GTGCA	2	10	99162	99171	20 %	20 %	40 %	20 %	407941555
126	NC_018709	ACCTT	2	10	100273	100282	20 %	40 %	0 %	40 %	407941556
127	NC_018709	TATTT	2	10	100788	100797	20 %	80 %	0 %	0 %	407941557
128	NC_018709	TCAAA	2	10	100846	100855	60 %	20 %	0 %	20 %	407941557
129	NC_018709	TTAGA	2	10	101117	101126	40 %	40 %	20 %	0 %	407941557
130	NC_018709	GCTTT	2	10	101208	101217	0 %	60 %	20 %	20 %	407941558
131	NC_018709	GTTTA	2	10	101725	101734	20 %	60 %	20 %	0 %	407941558
132	NC_018709	TAAAA	2	10	101790	101799	80 %	20 %	0 %	0 %	407941558
133	NC_018709	AAATG	2	10	101976	101985	60 %	20 %	20 %	0 %	407941559
134	NC_018709	AGGCA	2	10	102612	102621	40 %	0 %	40 %	20 %	407941559
135	NC_018709	TAAAA	2	10	102975	102984	80 %	20 %	0 %	0 %	407941559
136	NC_018709	AAATT	2	10	103970	103979	60 %	40 %	0 %	0 %	407941560
137	NC_018709	AAAGC	2	10	104665	104674	60 %	0 %	20 %	20 %	407941561
138	NC_018709	AAGAA	2	10	106039	106048	80 %	0 %	20 %	0 %	407941563
139	NC_018709	ACTCA	2	10	108175	108184	40 %	20 %	0 %	40 %	407941566
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