MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Cycloclasticus sp. P1 chromosome

Total Repeats: 49733

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_018697	AGT	2	6	23200	23205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407715286
502	NC_018697	CGG	2	6	23208	23213	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407715286
503	NC_018697	A	6	6	23224	23229	100 %	0 %	0 %	0 %	407715286
504	NC_018697	TAA	2	6	23242	23247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407715286
505	NC_018697	AAGC	2	8	23265	23272	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
506	NC_018697	ATCA	2	8	23331	23338	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
507	NC_018697	AGA	2	6	23350	23355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
508	NC_018697	GCAAC	2	10	23361	23370	40 %	0 %	20 %	40 %	407715287
509	NC_018697	GGT	2	6	23394	23399	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407715287
510	NC_018697	TG	3	6	23478	23483	0 %	50 %	50 %	0 %	407715287
511	NC_018697	A	7	7	23507	23513	100 %	0 %	0 %	0 %	407715287
512	NC_018697	ATT	2	6	23580	23585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407715287
513	NC_018697	ATT	2	6	23589	23594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407715287
514	NC_018697	GAA	2	6	23595	23600	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407715287
515	NC_018697	TGG	2	6	23677	23682	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407715287
516	NC_018697	AGA	2	6	23702	23707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407715287
517	NC_018697	TAT	2	6	23723	23728	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407715287
518	NC_018697	GAT	2	6	23808	23813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407715287
519	NC_018697	GC	3	6	23833	23838	0 %	0 %	50 %	50 %	407715287
520	NC_018697	GCTG	2	8	23933	23940	0 %	25 %	50 %	25 %	407715287
521	NC_018697	TGA	2	6	23954	23959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407715287
522	NC_018697	CTG	2	6	23971	23976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407715287
523	NC_018697	GTT	3	9	23980	23988	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407715287
524	NC_018697	GTTAA	2	10	24012	24021	40 %	40 %	20 %	0 %	407715287
525	NC_018697	GAC	2	6	24063	24068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407715287
526	NC_018697	TGT	2	6	24073	24078	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407715287
527	NC_018697	ACCAAA	2	12	24101	24112	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407715287
528	NC_018697	GAA	2	6	24135	24140	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407715287
529	NC_018697	AAT	2	6	24147	24152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407715287
530	NC_018697	TGGA	2	8	24223	24230	25 %	25 %	50 %	0 %	407715287
531	NC_018697	ATG	2	6	24238	24243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407715287
532	NC_018697	TGTTGA	2	12	24305	24316	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	407715287
533	NC_018697	TAA	2	6	24335	24340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407715287
534	NC_018697	ATA	2	6	24455	24460	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407715288
535	NC_018697	AGA	2	6	24568	24573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407715288
536	NC_018697	AT	3	6	24586	24591	50 %	50 %	0 %	0 %	407715288
537	NC_018697	ATA	2	6	24620	24625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407715289
538	NC_018697	TGA	2	6	24635	24640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407715289
539	NC_018697	TGG	2	6	24675	24680	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407715289
540	NC_018697	TGGTTG	2	12	24714	24725	0 %	50 %	50 %	0 %	407715289
541	NC_018697	TTA	2	6	24778	24783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407715289
542	NC_018697	CGCAT	2	10	24804	24813	20 %	20 %	20 %	40 %	407715289
543	NC_018697	TGG	2	6	24899	24904	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407715289
544	NC_018697	ATT	2	6	24919	24924	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407715289
545	NC_018697	CTT	2	6	24942	24947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407715289
546	NC_018697	ATG	3	9	24950	24958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407715289
547	NC_018697	TGC	2	6	24962	24967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407715289
548	NC_018697	TGGT	3	12	24969	24980	0 %	50 %	50 %	0 %	407715289
549	NC_018697	TGA	2	6	25067	25072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407715289
550	NC_018697	TCT	2	6	25108	25113	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407715289
551	NC_018697	TGG	2	6	25196	25201	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407715289
552	NC_018697	A	6	6	25277	25282	100 %	0 %	0 %	0 %	407715289
553	NC_018697	GA	3	6	25314	25319	50 %	0 %	50 %	0 %	407715289
554	NC_018697	T	6	6	25326	25331	0 %	100 %	0 %	0 %	407715289
555	NC_018697	TGG	2	6	25379	25384	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407715289
556	NC_018697	TAA	2	6	25442	25447	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407715289
557	NC_018697	GGTGA	2	10	25465	25474	20 %	20 %	60 %	0 %	407715289
558	NC_018697	TAA	2	6	25665	25670	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407715289
559	NC_018697	ATG	2	6	25791	25796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
560	NC_018697	ACA	2	6	25846	25851	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
561	NC_018697	AAAGAA	2	12	25967	25978	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	407715290
562	NC_018697	TTG	2	6	25986	25991	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407715290
563	NC_018697	AAC	2	6	26022	26027	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407715290
564	NC_018697	T	6	6	26174	26179	0 %	100 %	0 %	0 %	407715290
565	NC_018697	TGT	2	6	26209	26214	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407715290
566	NC_018697	AGA	2	6	26272	26277	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407715290
567	NC_018697	T	6	6	26333	26338	0 %	100 %	0 %	0 %	407715290
568	NC_018697	TGA	2	6	26344	26349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407715290
569	NC_018697	GAA	2	6	26399	26404	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407715290
570	NC_018697	CCT	2	6	26486	26491	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407715290
571	NC_018697	TGCG	2	8	26511	26518	0 %	25 %	50 %	25 %	407715290
572	NC_018697	GAA	2	6	26537	26542	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407715290
573	NC_018697	TCA	2	6	26563	26568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407715290
574	NC_018697	GAA	2	6	26626	26631	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407715290
575	NC_018697	CAAT	2	8	26753	26760	50 %	25 %	0 %	25 %	407715290
576	NC_018697	ATT	2	6	26779	26784	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407715290
577	NC_018697	TAT	2	6	26839	26844	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407715290
578	NC_018697	CAA	2	6	26883	26888	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407715290
579	NC_018697	GTC	2	6	26997	27002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407715290
580	NC_018697	CCA	2	6	27137	27142	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407715290
581	NC_018697	GAA	3	9	27143	27151	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407715290
582	NC_018697	TGA	2	6	27181	27186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407715290
583	NC_018697	GT	3	6	27234	27239	0 %	50 %	50 %	0 %	407715290
584	NC_018697	TGA	2	6	27244	27249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407715290
585	NC_018697	TGAT	2	8	27252	27259	25 %	50 %	25 %	0 %	407715290
586	NC_018697	ATTAA	2	10	27266	27275	60 %	40 %	0 %	0 %	407715290
587	NC_018697	GAA	2	6	27281	27286	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407715290
588	NC_018697	TAC	2	6	27332	27337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407715290
589	NC_018697	TAATG	2	10	27355	27364	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
590	NC_018697	T	8	8	27386	27393	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
591	NC_018697	TAT	2	6	27465	27470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407715291
592	NC_018697	T	7	7	27482	27488	0 %	100 %	0 %	0 %	407715291
593	NC_018697	AT	3	6	27519	27524	50 %	50 %	0 %	0 %	407715291
594	NC_018697	AC	3	6	27554	27559	50 %	0 %	0 %	50 %	407715291
595	NC_018697	GCC	2	6	27588	27593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407715291
596	NC_018697	A	8	8	27627	27634	100 %	0 %	0 %	0 %	407715291
597	NC_018697	AGA	2	6	27645	27650	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407715291
598	NC_018697	TAT	2	6	27696	27701	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407715291
599	NC_018697	AAG	3	9	27779	27787	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407715291
600	NC_018697	ATT	2	6	27798	27803	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407715291
601	NC_018697	AAG	2	6	27821	27826	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407715291
602	NC_018697	GTG	2	6	27851	27856	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407715291
603	NC_018697	TGT	2	6	27861	27866	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407715291
604	NC_018697	TTTA	2	8	27926	27933	25 %	75 %	0 %	0 %	407715291
605	NC_018697	AAG	2	6	27936	27941	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407715291
606	NC_018697	CAT	2	6	27947	27952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407715291
607	NC_018697	TAAAA	2	10	27983	27992	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
608	NC_018697	ATG	2	6	28031	28036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
609	NC_018697	TTA	2	6	28047	28052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_018697	TAC	2	6	28067	28072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
611	NC_018697	A	6	6	28104	28109	100 %	0 %	0 %	0 %	407715292
612	NC_018697	AAC	2	6	28138	28143	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407715292
613	NC_018697	TGTC	2	8	28144	28151	0 %	50 %	25 %	25 %	407715292
614	NC_018697	A	7	7	28171	28177	100 %	0 %	0 %	0 %	407715292
615	NC_018697	TA	3	6	28188	28193	50 %	50 %	0 %	0 %	407715292
616	NC_018697	GAA	2	6	28206	28211	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407715292
617	NC_018697	AAG	2	6	28370	28375	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407715292
618	NC_018697	ATA	2	6	28405	28410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407715292
619	NC_018697	GAA	2	6	28422	28427	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407715292
620	NC_018697	GCT	2	6	28430	28435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407715292
621	NC_018697	GATC	2	8	28469	28476	25 %	25 %	25 %	25 %	407715292
622	NC_018697	ATG	2	6	28477	28482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407715292
623	NC_018697	ATT	2	6	28487	28492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407715292
624	NC_018697	G	6	6	28567	28572	0 %	0 %	100 %	0 %	407715292
625	NC_018697	TA	3	6	28617	28622	50 %	50 %	0 %	0 %	407715292
626	NC_018697	TTA	2	6	28627	28632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407715292
627	NC_018697	TCA	2	6	28680	28685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407715292
628	NC_018697	ATC	2	6	28696	28701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407715292
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630	NC_018697	TGG	2	6	28883	28888	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407715292
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