MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Clostridium acidurici 9a chromosome

Total Repeats: 3261

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018664	GTAAT	2	10	1858	1867	40 %	40 %	20 %	0 %	407472534
2	NC_018664	AAATT	2	10	3413	3422	60 %	40 %	0 %	0 %	407472536
3	NC_018664	TAGAT	2	10	5988	5997	40 %	40 %	20 %	0 %	407472538
4	NC_018664	GAAAA	2	10	7235	7244	80 %	0 %	20 %	0 %	407472539
5	NC_018664	AATAT	2	10	9688	9697	60 %	40 %	0 %	0 %	407472541
6	NC_018664	TAAAA	2	10	9881	9890	80 %	20 %	0 %	0 %	407472541
7	NC_018664	TCGTG	2	10	12170	12179	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
8	NC_018664	ACATA	2	10	13213	13222	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_018664	GGGAG	2	10	13437	13446	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018664	AAGTG	2	10	13797	13806	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018664	AAGAT	2	10	15719	15728	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018664	ATTAA	2	10	16051	16060	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018664	GAAGA	2	10	16896	16905	60 %	0 %	40 %	0 %	407472543
14	NC_018664	GATCT	2	10	18047	18056	20 %	40 %	20 %	20 %	407472545
15	NC_018664	TAAAA	2	10	20321	20330	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018664	TTTTA	2	10	20346	20355	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018664	TAATG	2	10	20401	20410	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018664	TTAAT	2	10	20435	20444	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018664	AGAAA	2	10	21805	21814	80 %	0 %	20 %	0 %	407472548
20	NC_018664	GAATT	2	10	22116	22125	40 %	40 %	20 %	0 %	407472548
21	NC_018664	AAGAA	2	10	22144	22153	80 %	0 %	20 %	0 %	407472548
22	NC_018664	AGTTA	2	10	22494	22503	40 %	40 %	20 %	0 %	407472548
23	NC_018664	AATAA	2	10	23815	23824	80 %	20 %	0 %	0 %	407472549
24	NC_018664	CTAAA	2	10	25415	25424	60 %	20 %	0 %	20 %	407472551
25	NC_018664	CAATC	2	10	26846	26855	40 %	20 %	0 %	40 %	407472553
26	NC_018664	ATTTT	2	10	27307	27316	20 %	80 %	0 %	0 %	407472553
27	NC_018664	TATAA	2	10	27596	27605	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018664	GTAAA	2	10	27700	27709	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018664	TTATT	2	10	27801	27810	20 %	80 %	0 %	0 %	407472554
30	NC_018664	AGAAA	2	10	28475	28484	80 %	0 %	20 %	0 %	407472555
31	NC_018664	GATAA	2	10	28486	28495	60 %	20 %	20 %	0 %	407472555
32	NC_018664	TTTTA	2	10	28580	28589	20 %	80 %	0 %	0 %	407472556
33	NC_018664	TACCT	2	10	28742	28751	20 %	40 %	0 %	40 %	407472556
34	NC_018664	TTTAC	2	10	29382	29391	20 %	60 %	0 %	20 %	407472556
35	NC_018664	TTATA	2	10	29882	29891	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018664	CTATA	2	10	30035	30044	40 %	40 %	0 %	20 %	407472557
37	NC_018664	TTATA	2	10	31962	31971	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018664	GGTAT	2	10	32025	32034	20 %	40 %	40 %	0 %	407472558
39	NC_018664	ATATA	2	10	33364	33373	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018664	AATAT	2	10	33735	33744	60 %	40 %	0 %	0 %	407472560
41	NC_018664	AGTGA	2	10	34954	34963	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018664	ACTAT	2	10	35399	35408	40 %	40 %	0 %	20 %	407472561
43	NC_018664	ATTAT	2	10	35639	35648	40 %	60 %	0 %	0 %	407472561
44	NC_018664	GTTCA	2	10	36258	36267	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
45	NC_018664	ATATA	2	10	39026	39035	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018664	AAAAT	2	10	39152	39161	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018664	TAGAA	2	10	39358	39367	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018664	TATTT	2	10	40113	40122	20 %	80 %	0 %	0 %	407472569
49	NC_018664	ATCTT	2	10	40330	40339	20 %	60 %	0 %	20 %	407472569
50	NC_018664	TTGCT	2	10	41927	41936	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
51	NC_018664	ATTTA	2	10	43280	43289	40 %	60 %	0 %	0 %	407472572
52	NC_018664	TATCA	2	10	43645	43654	40 %	40 %	0 %	20 %	407472573
53	NC_018664	TTTAA	2	10	44571	44580	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018664	ATTTA	2	10	45513	45522	40 %	60 %	0 %	0 %	407472574
55	NC_018664	CTTTT	2	10	47217	47226	0 %	80 %	0 %	20 %	407472575
56	NC_018664	TTTAT	2	10	47299	47308	20 %	80 %	0 %	0 %	407472575
57	NC_018664	GGTCA	2	10	47974	47983	20 %	20 %	40 %	20 %	407472576
58	NC_018664	AATTA	2	10	48953	48962	60 %	40 %	0 %	0 %	407472577
59	NC_018664	AAAAG	2	10	48991	49000	80 %	0 %	20 %	0 %	407472577
60	NC_018664	TATAC	2	10	51657	51666	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
61	NC_018664	AGGAG	2	10	52712	52721	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018664	CTAAA	2	10	53123	53132	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
63	NC_018664	AAAAT	2	10	53481	53490	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018664	TGTTA	2	10	53491	53500	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018664	ATAAG	2	10	55040	55049	60 %	20 %	20 %	0 %	407472581
66	NC_018664	ATGCA	2	10	56887	56896	40 %	20 %	20 %	20 %	407472582
67	NC_018664	TAATA	2	10	56917	56926	60 %	40 %	0 %	0 %	407472582
68	NC_018664	AAGCA	2	10	57148	57157	60 %	0 %	20 %	20 %	407472583
69	NC_018664	CTGGA	2	10	57760	57769	20 %	20 %	40 %	20 %	407472584
70	NC_018664	TTAAT	2	10	58475	58484	40 %	60 %	0 %	0 %	407472585
71	NC_018664	TAGAT	2	10	59445	59454	40 %	40 %	20 %	0 %	407472586
72	NC_018664	AATAA	2	10	61051	61060	80 %	20 %	0 %	0 %	407472586
73	NC_018664	AATGA	2	10	61983	61992	60 %	20 %	20 %	0 %	407472587
74	NC_018664	ATATT	2	10	62763	62772	40 %	60 %	0 %	0 %	407472588
75	NC_018664	TGAAG	2	10	64574	64583	40 %	20 %	40 %	0 %	407472589
76	NC_018664	TTATT	2	10	65477	65486	20 %	80 %	0 %	0 %	407472589
77	NC_018664	ATAAA	2	10	66087	66096	80 %	20 %	0 %	0 %	407472590
78	NC_018664	AATTA	2	10	67155	67164	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018664	AAAAT	2	10	68566	68575	80 %	20 %	0 %	0 %	407472592
80	NC_018664	ATATT	2	10	68791	68800	40 %	60 %	0 %	0 %	407472592
81	NC_018664	TTTTA	2	10	70093	70102	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018664	TTGCT	2	10	72143	72152	0 %	60 %	20 %	20 %	407472595
83	NC_018664	AATTT	2	10	74551	74560	40 %	60 %	0 %	0 %	407472597
84	NC_018664	ATAAA	2	10	74692	74701	80 %	20 %	0 %	0 %	407472597
85	NC_018664	AGTAA	2	10	75858	75867	60 %	20 %	20 %	0 %	407472598
86	NC_018664	GAGTA	2	10	76313	76322	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018664	TGAAA	2	10	76796	76805	60 %	20 %	20 %	0 %	407472600
88	NC_018664	CAAAC	2	10	79855	79864	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
89	NC_018664	TCAGA	2	10	80657	80666	40 %	20 %	20 %	20 %	407472604
90	NC_018664	TAACT	2	10	80751	80760	40 %	40 %	0 %	20 %	407472604
91	NC_018664	ACAAG	2	10	82903	82912	60 %	0 %	20 %	20 %	407472605
92	NC_018664	AAAAG	2	10	83541	83550	80 %	0 %	20 %	0 %	407472606
93	NC_018664	TAGAA	2	10	83966	83975	60 %	20 %	20 %	0 %	407472607
94	NC_018664	AAAGG	2	10	84815	84824	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018664	TCTTT	2	10	84851	84860	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
96	NC_018664	AAAAG	2	10	86084	86093	80 %	0 %	20 %	0 %	407472608
97	NC_018664	AGATA	2	10	86527	86536	60 %	20 %	20 %	0 %	407472609
98	NC_018664	AGAGA	2	10	86798	86807	60 %	0 %	40 %	0 %	407472609
99	NC_018664	ACTGG	2	10	87331	87340	20 %	20 %	40 %	20 %	407472610
100	NC_018664	TGAGT	2	10	87941	87950	20 %	40 %	40 %	0 %	407472610
101	NC_018664	AAAAG	2	10	88208	88217	80 %	0 %	20 %	0 %	407472610
102	NC_018664	AGTAT	2	10	89034	89043	40 %	40 %	20 %	0 %	407472611
103	NC_018664	ATAAA	2	10	90814	90823	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018664	TACCT	2	10	91280	91289	20 %	40 %	0 %	40 %	407472613
105	NC_018664	TGGAA	2	10	92077	92086	40 %	20 %	40 %	0 %	407472614
106	NC_018664	TATCT	2	10	93842	93851	20 %	60 %	0 %	20 %	407472617
107	NC_018664	ACTTA	2	10	94592	94601	40 %	40 %	0 %	20 %	407472618
108	NC_018664	ACTTC	2	10	94848	94857	20 %	40 %	0 %	40 %	407472618
109	NC_018664	ATAAA	2	10	96066	96075	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018664	TAATA	2	10	97226	97235	60 %	40 %	0 %	0 %	407472620
111	NC_018664	ATTTA	2	10	99309	99318	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018664	GATAA	2	10	100052	100061	60 %	20 %	20 %	0 %	407472624
113	NC_018664	ATATA	2	10	101678	101687	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018664	TCAAC	2	10	102753	102762	40 %	20 %	0 %	40 %	407472626
115	NC_018664	ATGGA	2	10	105164	105173	40 %	20 %	40 %	0 %	407472630
116	NC_018664	AAATA	2	10	105734	105743	80 %	20 %	0 %	0 %	407472631
117	NC_018664	ATATG	2	10	106520	106529	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018664	TATAC	2	10	107724	107733	40 %	40 %	0 %	20 %	407472634
119	NC_018664	GAAAA	2	10	109342	109351	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018664	AATAA	2	10	109468	109477	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_018664	ATATT	2	10	111554	111563	40 %	60 %	0 %	0 %	407472638
122	NC_018664	AAGAG	2	10	113492	113501	60 %	0 %	40 %	0 %	407472641
123	NC_018664	AATAG	2	10	115651	115660	60 %	20 %	20 %	0 %	407472644
124	NC_018664	TTACT	2	10	115670	115679	20 %	60 %	0 %	20 %	407472644
125	NC_018664	ATCAC	2	10	116631	116640	40 %	20 %	0 %	40 %	407472645
126	NC_018664	GAAGT	2	10	119709	119718	40 %	20 %	40 %	0 %	407472649
127	NC_018664	AAATG	2	10	119819	119828	60 %	20 %	20 %	0 %	407472649
128	NC_018664	GATTA	2	10	121577	121586	40 %	40 %	20 %	0 %	407472650
129	NC_018664	TAGAA	2	10	123177	123186	60 %	20 %	20 %	0 %	407472652
130	NC_018664	AAAAT	2	10	123785	123794	80 %	20 %	0 %	0 %	407472652
131	NC_018664	ATATA	2	10	124366	124375	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_018664	TAGAG	2	10	124771	124780	40 %	20 %	40 %	0 %	407472653
133	NC_018664	CAGTA	2	10	125515	125524	40 %	20 %	20 %	20 %	407472654
134	NC_018664	AATAA	2	10	127891	127900	80 %	20 %	0 %	0 %	407472656
135	NC_018664	TTTAA	2	10	127904	127913	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_018664	AAGAA	2	10	128115	128124	80 %	0 %	20 %	0 %	407472657
137	NC_018664	AAAAT	2	10	128512	128521	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_018664	TAAAA	2	10	129364	129373	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_018664	CTTAT	2	10	131114	131123	20 %	60 %	0 %	20 %	407472662
140	NC_018664	TTTAT	2	10	131291	131300	20 %	80 %	0 %	0 %	407472662
141	NC_018664	AGGGG	2	10	132332	132341	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
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