MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Clostridium acidurici 9a chromosome

Total Repeats: 83225

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3002	NC_018664	ATC	2	6	113074	113079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407472641
3003	NC_018664	AAT	2	6	113090	113095	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407472641
3004	NC_018664	A	6	6	113118	113123	100 %	0 %	0 %	0 %	407472641
3005	NC_018664	GAA	2	6	113133	113138	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407472641
3006	NC_018664	TA	4	8	113185	113192	50 %	50 %	0 %	0 %	407472641
3007	NC_018664	CTT	2	6	113234	113239	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407472641
3008	NC_018664	AGA	2	6	113249	113254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407472641
3009	NC_018664	ACC	2	6	113255	113260	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407472641
3010	NC_018664	TAA	2	6	113275	113280	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407472641
3011	NC_018664	TAA	2	6	113291	113296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407472641
3012	NC_018664	CTA	2	6	113311	113316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407472641
3013	NC_018664	TAG	2	6	113443	113448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407472641
3014	NC_018664	AAGAG	2	10	113492	113501	60 %	0 %	40 %	0 %	407472641
3015	NC_018664	T	6	6	113565	113570	0 %	100 %	0 %	0 %	407472641
3016	NC_018664	GAT	2	6	113583	113588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407472641
3017	NC_018664	AGA	2	6	113591	113596	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407472641
3018	NC_018664	TAT	2	6	113614	113619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407472641
3019	NC_018664	AT	3	6	113637	113642	50 %	50 %	0 %	0 %	407472641
3020	NC_018664	AAAG	2	8	113643	113650	75 %	0 %	25 %	0 %	407472641
3021	NC_018664	TAA	2	6	113651	113656	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407472641
3022	NC_018664	TAAA	2	8	113671	113678	75 %	25 %	0 %	0 %	407472641
3023	NC_018664	A	6	6	113725	113730	100 %	0 %	0 %	0 %	407472641
3024	NC_018664	ATA	2	6	113739	113744	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407472641
3025	NC_018664	TAA	2	6	113752	113757	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407472641
3026	NC_018664	AAAG	2	8	113763	113770	75 %	0 %	25 %	0 %	407472641
3027	NC_018664	GAT	2	6	113807	113812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407472641
3028	NC_018664	AGG	2	6	113827	113832	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407472641
3029	NC_018664	GTA	2	6	113848	113853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407472642
3030	NC_018664	A	6	6	113866	113871	100 %	0 %	0 %	0 %	407472642
3031	NC_018664	TAC	2	6	113884	113889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407472642
3032	NC_018664	ATA	2	6	113900	113905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407472642
3033	NC_018664	AAAG	2	8	113913	113920	75 %	0 %	25 %	0 %	407472642
3034	NC_018664	TAG	2	6	113933	113938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407472642
3035	NC_018664	GTA	2	6	113971	113976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407472642
3036	NC_018664	AT	3	6	113989	113994	50 %	50 %	0 %	0 %	407472642
3037	NC_018664	CTC	2	6	114011	114016	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407472642
3038	NC_018664	AGA	3	9	114042	114050	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407472642
3039	NC_018664	ATG	2	6	114062	114067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407472642
3040	NC_018664	AATC	2	8	114070	114077	50 %	25 %	0 %	25 %	407472642
3041	NC_018664	AAC	2	6	114080	114085	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407472642
3042	NC_018664	ATA	3	9	114167	114175	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407472642
3043	NC_018664	GAAG	2	8	114199	114206	50 %	0 %	50 %	0 %	407472642
3044	NC_018664	AG	3	6	114217	114222	50 %	0 %	50 %	0 %	407472642
3045	NC_018664	GAT	2	6	114297	114302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407472642
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3047	NC_018664	TGT	2	6	114445	114450	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407472642
3048	NC_018664	AT	3	6	114479	114484	50 %	50 %	0 %	0 %	407472642
3049	NC_018664	GTG	2	6	114527	114532	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407472642
3050	NC_018664	TAG	3	9	114539	114547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407472642
3051	NC_018664	TGA	2	6	114591	114596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407472642
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3053	NC_018664	ATA	2	6	114622	114627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407472642
3054	NC_018664	GAA	2	6	114628	114633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407472642
3055	NC_018664	GAA	2	6	114646	114651	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407472642
3056	NC_018664	AAG	2	6	114660	114665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407472642
3057	NC_018664	AGA	2	6	114729	114734	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407472642
3058	NC_018664	TAA	2	6	114766	114771	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407472642
3059	NC_018664	AT	3	6	114785	114790	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3060	NC_018664	A	7	7	114799	114805	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3061	NC_018664	AAT	2	6	114875	114880	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407472643
3062	NC_018664	GCAT	2	8	114900	114907	25 %	25 %	25 %	25 %	407472643
3063	NC_018664	ACT	2	6	115071	115076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3064	NC_018664	AGT	2	6	115098	115103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3065	NC_018664	T	7	7	115103	115109	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3066	NC_018664	AAT	2	6	115120	115125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3067	NC_018664	GAT	2	6	115162	115167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407472644
3068	NC_018664	AAT	2	6	115188	115193	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407472644
3069	NC_018664	AGT	2	6	115272	115277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407472644
3070	NC_018664	AGGAAC	2	12	115284	115295	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	407472644
3071	NC_018664	AT	3	6	115342	115347	50 %	50 %	0 %	0 %	407472644
3072	NC_018664	AAG	3	9	115361	115369	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407472644
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3074	NC_018664	A	6	6	115415	115420	100 %	0 %	0 %	0 %	407472644
3075	NC_018664	AAG	2	6	115445	115450	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407472644
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3077	NC_018664	AT	3	6	115503	115508	50 %	50 %	0 %	0 %	407472644
3078	NC_018664	AGCA	2	8	115599	115606	50 %	0 %	25 %	25 %	407472644
3079	NC_018664	T	8	8	115630	115637	0 %	100 %	0 %	0 %	407472644
3080	NC_018664	AATAG	2	10	115651	115660	60 %	20 %	20 %	0 %	407472644
3081	NC_018664	AT	3	6	115664	115669	50 %	50 %	0 %	0 %	407472644
3082	NC_018664	TTACT	2	10	115670	115679	20 %	60 %	0 %	20 %	407472644
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3087	NC_018664	A	6	6	115900	115905	100 %	0 %	0 %	0 %	407472645
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3089	NC_018664	TAA	2	6	115968	115973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407472645
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3093	NC_018664	A	6	6	116084	116089	100 %	0 %	0 %	0 %	407472645
3094	NC_018664	TTCT	2	8	116265	116272	0 %	75 %	0 %	25 %	407472645
3095	NC_018664	TC	3	6	116308	116313	0 %	50 %	0 %	50 %	407472645
3096	NC_018664	A	6	6	116321	116326	100 %	0 %	0 %	0 %	407472645
3097	NC_018664	GAAA	2	8	116327	116334	75 %	0 %	25 %	0 %	407472645
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3100	NC_018664	AGA	2	6	116413	116418	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407472645
3101	NC_018664	AAT	2	6	116428	116433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407472645
3102	NC_018664	AT	3	6	116445	116450	50 %	50 %	0 %	0 %	407472645
3103	NC_018664	GAA	2	6	116480	116485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407472645
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3105	NC_018664	TAGA	2	8	116514	116521	50 %	25 %	25 %	0 %	407472645
3106	NC_018664	AGA	2	6	116530	116535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407472645
3107	NC_018664	GTA	2	6	116552	116557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407472645
3108	NC_018664	AGA	2	6	116593	116598	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407472645
3109	NC_018664	ATCAC	2	10	116631	116640	40 %	20 %	0 %	40 %	407472645
3110	NC_018664	TA	3	6	116643	116648	50 %	50 %	0 %	0 %	407472645
3111	NC_018664	A	6	6	116666	116671	100 %	0 %	0 %	0 %	407472645
3112	NC_018664	TA	3	6	116721	116726	50 %	50 %	0 %	0 %	407472645
3113	NC_018664	AAG	2	6	116727	116732	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407472645
3114	NC_018664	A	7	7	116745	116751	100 %	0 %	0 %	0 %	407472645
3115	NC_018664	ATTT	2	8	116789	116796	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3116	NC_018664	ATT	2	6	116799	116804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407472646
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3118	NC_018664	T	6	6	116899	116904	0 %	100 %	0 %	0 %	407472646
3119	NC_018664	TAT	2	6	116908	116913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407472646
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3122	NC_018664	TCC	2	6	117048	117053	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3123	NC_018664	AT	3	6	117105	117110	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3124	NC_018664	A	7	7	117138	117144	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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