MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Clostridium acidurici 9a chromosome

Total Repeats: 83225

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_018664	TCT	3	9	20302	20310	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
502	NC_018664	TAAAA	2	10	20321	20330	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_018664	TTTTA	2	10	20346	20355	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_018664	ATTA	2	8	20368	20375	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_018664	A	7	7	20375	20381	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_018664	TAATG	2	10	20401	20410	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
507	NC_018664	AGA	2	6	20411	20416	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
508	NC_018664	ATT	2	6	20425	20430	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
509	NC_018664	TTAAT	2	10	20435	20444	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_018664	AT	4	8	20443	20450	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_018664	TA	3	6	20451	20456	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_018664	ATT	2	6	20481	20486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
513	NC_018664	AATA	2	8	20572	20579	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_018664	ATA	2	6	20591	20596	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_018664	TAC	2	6	20609	20614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
516	NC_018664	ATA	2	6	20635	20640	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_018664	TTG	2	6	20645	20650	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
518	NC_018664	GGT	2	6	20654	20659	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
519	NC_018664	T	6	6	20693	20698	0 %	100 %	0 %	0 %	407472547
520	NC_018664	AAAT	2	8	20703	20710	75 %	25 %	0 %	0 %	407472547
521	NC_018664	AT	3	6	20728	20733	50 %	50 %	0 %	0 %	407472547
522	NC_018664	TCT	2	6	20786	20791	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407472547
523	NC_018664	AAT	2	6	20807	20812	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407472547
524	NC_018664	AT	3	6	20840	20845	50 %	50 %	0 %	0 %	407472547
525	NC_018664	ATC	2	6	20896	20901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407472547
526	NC_018664	ATT	2	6	20935	20940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407472547
527	NC_018664	AGA	2	6	20941	20946	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407472547
528	NC_018664	TTA	2	6	20951	20956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407472547
529	NC_018664	T	6	6	20974	20979	0 %	100 %	0 %	0 %	407472547
530	NC_018664	AAT	2	6	21217	21222	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407472547
531	NC_018664	TAG	2	6	21223	21228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407472547
532	NC_018664	AT	4	8	21276	21283	50 %	50 %	0 %	0 %	407472547
533	NC_018664	TA	3	6	21294	21299	50 %	50 %	0 %	0 %	407472547
534	NC_018664	AGT	2	6	21301	21306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407472547
535	NC_018664	ATAA	2	8	21317	21324	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_018664	ATT	2	6	21357	21362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_018664	T	6	6	21434	21439	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_018664	TTA	2	6	21489	21494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
539	NC_018664	ATA	2	6	21532	21537	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
540	NC_018664	AAAT	2	8	21560	21567	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_018664	AAGG	2	8	21571	21578	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
542	NC_018664	AGA	2	6	21607	21612	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407472548
543	NC_018664	A	7	7	21625	21631	100 %	0 %	0 %	0 %	407472548
544	NC_018664	TAG	2	6	21696	21701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407472548
545	NC_018664	AAG	2	6	21723	21728	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407472548
546	NC_018664	ATA	2	6	21749	21754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407472548
547	NC_018664	AGAAA	2	10	21805	21814	80 %	0 %	20 %	0 %	407472548
548	NC_018664	GATA	2	8	21859	21866	50 %	25 %	25 %	0 %	407472548
549	NC_018664	ATT	2	6	21880	21885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407472548
550	NC_018664	AGT	2	6	21910	21915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407472548
551	NC_018664	CTG	2	6	21933	21938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407472548
552	NC_018664	CTT	2	6	21969	21974	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407472548
553	NC_018664	ATA	2	6	22110	22115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407472548
554	NC_018664	GAATT	2	10	22116	22125	40 %	40 %	20 %	0 %	407472548
555	NC_018664	AGA	2	6	22126	22131	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407472548
556	NC_018664	AAGAA	2	10	22144	22153	80 %	0 %	20 %	0 %	407472548
557	NC_018664	AAT	2	6	22297	22302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407472548
558	NC_018664	ATA	2	6	22320	22325	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407472548
559	NC_018664	TAA	2	6	22333	22338	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407472548
560	NC_018664	A	6	6	22337	22342	100 %	0 %	0 %	0 %	407472548
561	NC_018664	CAT	2	6	22359	22364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407472548
562	NC_018664	GAA	2	6	22381	22386	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407472548
563	NC_018664	AT	3	6	22403	22408	50 %	50 %	0 %	0 %	407472548
564	NC_018664	GAA	2	6	22418	22423	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407472548
565	NC_018664	TAGA	2	8	22479	22486	50 %	25 %	25 %	0 %	407472548
566	NC_018664	AGTTA	2	10	22494	22503	40 %	40 %	20 %	0 %	407472548
567	NC_018664	TAA	2	6	22577	22582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407472549
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569	NC_018664	TAGA	2	8	22664	22671	50 %	25 %	25 %	0 %	407472549
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577	NC_018664	TAA	2	6	23042	23047	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407472549
578	NC_018664	TAAA	2	8	23051	23058	75 %	25 %	0 %	0 %	407472549
579	NC_018664	AAT	2	6	23059	23064	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407472549
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581	NC_018664	TAG	2	6	23093	23098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407472549
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583	NC_018664	ATA	3	9	23249	23257	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407472549
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585	NC_018664	TAG	2	6	23372	23377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407472549
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587	NC_018664	AGAT	2	8	23463	23470	50 %	25 %	25 %	0 %	407472549
588	NC_018664	AT	4	8	23477	23484	50 %	50 %	0 %	0 %	407472549
589	NC_018664	AT	3	6	23523	23528	50 %	50 %	0 %	0 %	407472549
590	NC_018664	CAG	2	6	23540	23545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407472549
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595	NC_018664	ATA	2	6	23729	23734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407472549
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598	NC_018664	TTA	2	6	23899	23904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407472549
599	NC_018664	AGA	2	6	23931	23936	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407472549
600	NC_018664	TAA	2	6	23939	23944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407472549
601	NC_018664	A	6	6	23965	23970	100 %	0 %	0 %	0 %	407472549
602	NC_018664	A	6	6	23982	23987	100 %	0 %	0 %	0 %	407472549
603	NC_018664	ATT	2	6	24003	24008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407472549
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605	NC_018664	GAA	2	6	24029	24034	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407472549
606	NC_018664	TAT	2	6	24057	24062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407472549
607	NC_018664	AT	3	6	24081	24086	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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609	NC_018664	TAT	2	6	24113	24118	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407472550
610	NC_018664	AG	3	6	24132	24137	50 %	0 %	50 %	0 %	407472550
611	NC_018664	TGG	2	6	24146	24151	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407472550
612	NC_018664	ATT	2	6	24166	24171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407472550
613	NC_018664	AAT	2	6	24200	24205	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407472550
614	NC_018664	AGA	2	6	24215	24220	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407472550
615	NC_018664	AAAG	2	8	24296	24303	75 %	0 %	25 %	0 %	407472550
616	NC_018664	CTA	2	6	24337	24342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407472550
617	NC_018664	GAAG	2	8	24345	24352	50 %	0 %	50 %	0 %	407472550
618	NC_018664	GA	4	8	24373	24380	50 %	0 %	50 %	0 %	407472550
619	NC_018664	AGT	2	6	24467	24472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407472550
620	NC_018664	ACA	2	6	24486	24491	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407472550
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622	NC_018664	GCA	2	6	24597	24602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407472550
623	NC_018664	A	6	6	24635	24640	100 %	0 %	0 %	0 %	407472550
624	NC_018664	CAC	2	6	24650	24655	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407472550
625	NC_018664	TAGAAG	2	12	24661	24672	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	407472550
626	NC_018664	AGA	2	6	24683	24688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407472550
627	NC_018664	A	6	6	24756	24761	100 %	0 %	0 %	0 %	407472550
628	NC_018664	AGA	2	6	24815	24820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407472550
629	NC_018664	CAT	2	6	24854	24859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407472550
630	NC_018664	ACTC	2	8	24876	24883	25 %	25 %	0 %	50 %	407472550
631	NC_018664	AT	3	6	24910	24915	50 %	50 %	0 %	0 %	407472550
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633	NC_018664	GAT	2	6	24936	24941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407472551
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