MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Candidatus Nitrosopumilus sp. AR2 chromosome

Total Repeats: 1854

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018656	AC	3	6	46	51	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_018656	CT	3	6	327	332	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_018656	TC	3	6	4604	4609	0 %	50 %	0 %	50 %	407463879
4	NC_018656	AT	3	6	5757	5762	50 %	50 %	0 %	0 %	407463880
5	NC_018656	AT	3	6	6089	6094	50 %	50 %	0 %	0 %	407463880
6	NC_018656	CT	3	6	7768	7773	0 %	50 %	0 %	50 %	407463882
7	NC_018656	AC	3	6	7777	7782	50 %	0 %	0 %	50 %	407463882
8	NC_018656	AT	3	6	9752	9757	50 %	50 %	0 %	0 %	407463882
9	NC_018656	GA	3	6	12936	12941	50 %	0 %	50 %	0 %	407463887
10	NC_018656	TC	3	6	14708	14713	0 %	50 %	0 %	50 %	407463889
11	NC_018656	GA	3	6	15322	15327	50 %	0 %	50 %	0 %	407463890
12	NC_018656	TC	3	6	17401	17406	0 %	50 %	0 %	50 %	407463892
13	NC_018656	AG	3	6	17951	17956	50 %	0 %	50 %	0 %	407463892
14	NC_018656	TC	4	8	18287	18294	0 %	50 %	0 %	50 %	407463893
15	NC_018656	CT	4	8	20853	20860	0 %	50 %	0 %	50 %	407463896
16	NC_018656	CT	3	6	21570	21575	0 %	50 %	0 %	50 %	407463896
17	NC_018656	TG	3	6	22142	22147	0 %	50 %	50 %	0 %	407463897
18	NC_018656	CT	3	6	22799	22804	0 %	50 %	0 %	50 %	407463898
19	NC_018656	CT	3	6	23347	23352	0 %	50 %	0 %	50 %	407463898
20	NC_018656	AT	3	6	25002	25007	50 %	50 %	0 %	0 %	407463900
21	NC_018656	TC	3	6	25237	25242	0 %	50 %	0 %	50 %	407463900
22	NC_018656	TA	3	6	25757	25762	50 %	50 %	0 %	0 %	407463900
23	NC_018656	TC	3	6	27535	27540	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_018656	CT	3	6	27832	27837	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_018656	GT	3	6	27899	27904	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018656	CT	3	6	28817	28822	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_018656	GT	3	6	29015	29020	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018656	AT	3	6	29055	29060	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018656	CA	3	6	30152	30157	50 %	0 %	0 %	50 %	407463903
30	NC_018656	GA	3	6	30870	30875	50 %	0 %	50 %	0 %	407463903
31	NC_018656	TC	3	6	32311	32316	0 %	50 %	0 %	50 %	407463905
32	NC_018656	TA	3	6	32571	32576	50 %	50 %	0 %	0 %	407463905
33	NC_018656	AT	3	6	34032	34037	50 %	50 %	0 %	0 %	407463907
34	NC_018656	AT	3	6	36749	36754	50 %	50 %	0 %	0 %	407463909
35	NC_018656	GA	3	6	36762	36767	50 %	0 %	50 %	0 %	407463909
36	NC_018656	TC	4	8	37498	37505	0 %	50 %	0 %	50 %	407463910
37	NC_018656	CA	3	6	39696	39701	50 %	0 %	0 %	50 %	407463911
38	NC_018656	AG	3	6	40091	40096	50 %	0 %	50 %	0 %	407463912
39	NC_018656	AT	3	6	40140	40145	50 %	50 %	0 %	0 %	407463912
40	NC_018656	AT	3	6	41150	41155	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018656	TC	3	6	44523	44528	0 %	50 %	0 %	50 %	407463915
42	NC_018656	TC	3	6	45552	45557	0 %	50 %	0 %	50 %	407463915
43	NC_018656	TC	3	6	46076	46081	0 %	50 %	0 %	50 %	407463915
44	NC_018656	GA	3	6	46102	46107	50 %	0 %	50 %	0 %	407463915
45	NC_018656	TC	3	6	48524	48529	0 %	50 %	0 %	50 %	407463919
46	NC_018656	AT	3	6	51858	51863	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018656	TA	3	6	53184	53189	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018656	GA	3	6	53683	53688	50 %	0 %	50 %	0 %	407463927
49	NC_018656	AC	3	6	56423	56428	50 %	0 %	0 %	50 %	407463930
50	NC_018656	TG	3	6	56566	56571	0 %	50 %	50 %	0 %	407463930
51	NC_018656	TC	3	6	56757	56762	0 %	50 %	0 %	50 %	407463931
52	NC_018656	TC	3	6	57377	57382	0 %	50 %	0 %	50 %	407463931
53	NC_018656	GA	3	6	57415	57420	50 %	0 %	50 %	0 %	407463931
54	NC_018656	AT	3	6	59013	59018	50 %	50 %	0 %	0 %	407463933
55	NC_018656	AT	3	6	60183	60188	50 %	50 %	0 %	0 %	407463934
56	NC_018656	GA	3	6	60497	60502	50 %	0 %	50 %	0 %	407463935
57	NC_018656	GT	3	6	60580	60585	0 %	50 %	50 %	0 %	407463935
58	NC_018656	AT	3	6	60741	60746	50 %	50 %	0 %	0 %	407463935
59	NC_018656	AT	3	6	61034	61039	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018656	TA	3	6	61801	61806	50 %	50 %	0 %	0 %	407463936
61	NC_018656	TA	3	6	62186	62191	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018656	CA	3	6	63534	63539	50 %	0 %	0 %	50 %	407463938
63	NC_018656	CT	3	6	65544	65549	0 %	50 %	0 %	50 %	407463940
64	NC_018656	AC	3	6	66509	66514	50 %	0 %	0 %	50 %	407463942
65	NC_018656	AC	3	6	69404	69409	50 %	0 %	0 %	50 %	407463947
66	NC_018656	GA	3	6	69850	69855	50 %	0 %	50 %	0 %	407463948
67	NC_018656	GA	3	6	70036	70041	50 %	0 %	50 %	0 %	407463948
68	NC_018656	AT	3	6	72755	72760	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018656	CA	3	6	72970	72975	50 %	0 %	0 %	50 %	407463952
70	NC_018656	AT	3	6	73791	73796	50 %	50 %	0 %	0 %	407463953
71	NC_018656	AT	3	6	74709	74714	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018656	TC	3	6	75886	75891	0 %	50 %	0 %	50 %	407463956
73	NC_018656	AT	3	6	76093	76098	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018656	TG	3	6	76423	76428	0 %	50 %	50 %	0 %	407463957
75	NC_018656	TC	4	8	77128	77135	0 %	50 %	0 %	50 %	407463957
76	NC_018656	TC	3	6	78666	78671	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_018656	TC	3	6	78724	78729	0 %	50 %	0 %	50 %	407463959
78	NC_018656	TA	3	6	79922	79927	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018656	TC	3	6	82572	82577	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_018656	TC	3	6	83805	83810	0 %	50 %	0 %	50 %	407463964
81	NC_018656	TG	3	6	85102	85107	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018656	AT	3	6	86047	86052	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018656	TG	3	6	88896	88901	0 %	50 %	50 %	0 %	407463973
84	NC_018656	AT	3	6	90640	90645	50 %	50 %	0 %	0 %	407463975
85	NC_018656	TC	3	6	90764	90769	0 %	50 %	0 %	50 %	407463975
86	NC_018656	CA	4	8	92334	92341	50 %	0 %	0 %	50 %	407463976
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88	NC_018656	TA	3	6	94792	94797	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018656	AT	3	6	95943	95948	50 %	50 %	0 %	0 %	407463979
90	NC_018656	AT	3	6	96601	96606	50 %	50 %	0 %	0 %	407463979
91	NC_018656	GT	3	6	97269	97274	0 %	50 %	50 %	0 %	407463980
92	NC_018656	AT	3	6	98434	98439	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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104	NC_018656	AG	3	6	108635	108640	50 %	0 %	50 %	0 %	407463996
105	NC_018656	AT	3	6	110418	110423	50 %	50 %	0 %	0 %	407463997
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109	NC_018656	CT	3	6	113804	113809	0 %	50 %	0 %	50 %	407464001
110	NC_018656	TC	3	6	114036	114041	0 %	50 %	0 %	50 %	407464002
111	NC_018656	AG	3	6	116954	116959	50 %	0 %	50 %	0 %	407464004
112	NC_018656	CA	3	6	117099	117104	50 %	0 %	0 %	50 %	407464005
113	NC_018656	AT	3	6	117844	117849	50 %	50 %	0 %	0 %	407464006
114	NC_018656	AT	3	6	118063	118068	50 %	50 %	0 %	0 %	407464006
115	NC_018656	CT	3	6	118184	118189	0 %	50 %	0 %	50 %	407464006
116	NC_018656	TC	3	6	118357	118362	0 %	50 %	0 %	50 %	407464007
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118	NC_018656	AG	3	6	119261	119266	50 %	0 %	50 %	0 %	407464008
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120	NC_018656	AT	3	6	120106	120111	50 %	50 %	0 %	0 %	407464009
121	NC_018656	TG	3	6	122678	122683	0 %	50 %	50 %	0 %	407464011
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123	NC_018656	TG	3	6	124853	124858	0 %	50 %	50 %	0 %	407464013
124	NC_018656	TA	3	6	125548	125553	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018656	TA	3	6	126921	126926	50 %	50 %	0 %	0 %	407464015
126	NC_018656	AG	3	6	127414	127419	50 %	0 %	50 %	0 %	407464015
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135	NC_018656	AT	3	6	136863	136868	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_018656	CT	3	6	136928	136933	0 %	50 %	0 %	50 %	407464027
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141	NC_018656	AT	3	6	141298	141303	50 %	50 %	0 %	0 %	407464036
142	NC_018656	AG	3	6	142064	142069	50 %	0 %	50 %	0 %	407464038
143	NC_018656	CA	3	6	146397	146402	50 %	0 %	0 %	50 %	407464040
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