MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Candidatus Nitrosopumilus sp. AR2 chromosome

Total Repeats: 23207

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018656	TTG	2	6	117	122	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018656	AAT	2	6	140	145	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018656	TCC	2	6	290	295	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_018656	GTA	2	6	405	410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018656	CTA	2	6	436	441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_018656	TCA	2	6	483	488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_018656	ATG	2	6	499	504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018656	ATA	2	6	535	540	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018656	TCA	2	6	633	638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_018656	TCA	2	6	657	662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_018656	ACC	2	6	687	692	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_018656	AAT	2	6	734	739	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018656	ATT	2	6	798	803	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018656	ATT	2	6	808	813	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018656	GGA	2	6	822	827	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018656	AGA	2	6	905	910	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018656	AAT	2	6	920	925	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018656	TGA	2	6	1013	1018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018656	ATG	2	6	1138	1143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018656	TTG	2	6	1168	1173	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018656	TTG	2	6	1228	1233	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018656	GAT	2	6	1278	1283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018656	CTG	2	6	1300	1305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_018656	GAT	2	6	1335	1340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018656	TGG	2	6	1427	1432	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018656	AGC	2	6	1460	1465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_018656	TGG	2	6	1490	1495	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018656	ACT	2	6	1496	1501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_018656	CCA	2	6	1590	1595	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_018656	CTA	2	6	1681	1686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_018656	ATC	2	6	1715	1720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_018656	AGA	2	6	1751	1756	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018656	TCA	2	6	1785	1790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_018656	ATT	2	6	1796	1801	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018656	ACA	2	6	1911	1916	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_018656	ATG	2	6	1918	1923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018656	AAT	2	6	1979	1984	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018656	CAT	2	6	2125	2130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_018656	TGA	2	6	2174	2179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018656	ACA	2	6	2209	2214	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_018656	CAT	2	6	2329	2334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_018656	AGT	2	6	2366	2371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018656	TGT	2	6	2411	2416	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018656	ATT	2	6	2496	2501	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018656	GTA	2	6	2544	2549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018656	TGA	2	6	2627	2632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018656	GTG	2	6	2731	2736	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018656	ATA	2	6	2794	2799	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018656	AAT	2	6	2834	2839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018656	TGA	2	6	2867	2872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018656	AAG	2	6	2884	2889	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018656	AGA	2	6	2900	2905	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018656	TAT	2	6	3088	3093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407463878
54	NC_018656	TGA	2	6	3105	3110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407463878
55	NC_018656	TCT	2	6	3149	3154	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407463878
56	NC_018656	TCT	2	6	3200	3205	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407463878
57	NC_018656	ATC	2	6	3332	3337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407463878
58	NC_018656	CAA	2	6	3499	3504	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407463878
59	NC_018656	ATA	2	6	3650	3655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407463878
60	NC_018656	CAA	2	6	3658	3663	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407463878
61	NC_018656	AAC	2	6	3674	3679	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407463878
62	NC_018656	CTT	2	6	3694	3699	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407463878
63	NC_018656	CTT	4	12	3982	3993	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407463878
64	NC_018656	CAT	2	6	4016	4021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407463878
65	NC_018656	ATT	2	6	4073	4078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407463878
66	NC_018656	TAT	2	6	4193	4198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407463878
67	NC_018656	ATC	3	9	4527	4535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407463879
68	NC_018656	AAC	2	6	4584	4589	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407463879
69	NC_018656	TCC	2	6	4614	4619	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407463879
70	NC_018656	CAT	2	6	4670	4675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407463879
71	NC_018656	GAA	2	6	4682	4687	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407463879
72	NC_018656	TCT	2	6	4733	4738	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407463879
73	NC_018656	CAA	2	6	4772	4777	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407463879
74	NC_018656	GTT	2	6	4826	4831	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407463879
75	NC_018656	TAA	2	6	4896	4901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407463879
76	NC_018656	CAT	2	6	4910	4915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407463879
77	NC_018656	TCA	2	6	4969	4974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407463879
78	NC_018656	TCA	2	6	5044	5049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407463879
79	NC_018656	CAT	2	6	5078	5083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407463879
80	NC_018656	ACA	2	6	5324	5329	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_018656	GCA	2	6	5561	5566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407463880
82	NC_018656	GCT	2	6	5618	5623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407463880
83	NC_018656	TGA	2	6	5800	5805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407463880
84	NC_018656	TGA	2	6	5833	5838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407463880
85	NC_018656	ATT	2	6	6005	6010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407463880
86	NC_018656	AAC	2	6	6100	6105	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407463880
87	NC_018656	CCA	2	6	6116	6121	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407463880
88	NC_018656	CAA	2	6	6224	6229	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407463880
89	NC_018656	ATT	2	6	6238	6243	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407463880
90	NC_018656	CAT	2	6	6336	6341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407463880
91	NC_018656	ATA	2	6	6390	6395	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407463880
92	NC_018656	GAT	2	6	6586	6591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407463881
93	NC_018656	TCC	2	6	6802	6807	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407463881
94	NC_018656	CTA	2	6	6827	6832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407463881
95	NC_018656	GAA	2	6	7083	7088	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407463881
96	NC_018656	ATT	2	6	7107	7112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407463881
97	NC_018656	TGA	2	6	7122	7127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407463881
98	NC_018656	AAT	2	6	7188	7193	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407463881
99	NC_018656	CTT	2	6	7220	7225	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407463881
100	NC_018656	TGA	2	6	7239	7244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407463881
101	NC_018656	TGA	2	6	7407	7412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407463881
102	NC_018656	GCA	2	6	7510	7515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407463881
103	NC_018656	CCT	2	6	7635	7640	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407463882
104	NC_018656	TTG	2	6	7669	7674	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407463882
105	NC_018656	ATT	2	6	7677	7682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407463882
106	NC_018656	AAT	2	6	7793	7798	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407463882
107	NC_018656	GCA	2	6	7833	7838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407463882
108	NC_018656	TCT	2	6	7849	7854	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407463882
109	NC_018656	GGT	2	6	7887	7892	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407463882
110	NC_018656	GGA	2	6	7893	7898	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407463882
111	NC_018656	CAA	2	6	7899	7904	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407463882
112	NC_018656	ATC	2	6	7946	7951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407463882
113	NC_018656	CTT	2	6	7986	7991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407463882
114	NC_018656	GCA	2	6	8028	8033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407463882
115	NC_018656	GTT	2	6	8081	8086	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407463882
116	NC_018656	CGT	2	6	8138	8143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407463882
117	NC_018656	CCA	2	6	8175	8180	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407463882
118	NC_018656	GCA	2	6	8187	8192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407463882
119	NC_018656	AAT	2	6	8231	8236	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407463882
120	NC_018656	AAT	2	6	8315	8320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407463882
121	NC_018656	AAT	2	6	8438	8443	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407463882
122	NC_018656	TTG	2	6	8512	8517	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407463882
123	NC_018656	AGA	2	6	8575	8580	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407463882
124	NC_018656	CAA	2	6	8607	8612	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407463882
125	NC_018656	ATG	2	6	8644	8649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407463882
126	NC_018656	ATG	2	6	8665	8670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407463882
127	NC_018656	ATA	2	6	8695	8700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407463882
128	NC_018656	AGC	2	6	8762	8767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407463882
129	NC_018656	TTC	2	6	8830	8835	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407463882
130	NC_018656	TTC	2	6	9000	9005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407463882
131	NC_018656	ATT	2	6	9038	9043	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407463882
132	NC_018656	GGA	2	6	9099	9104	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407463882
133	NC_018656	CCA	3	9	9138	9146	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407463882
134	NC_018656	ATT	2	6	9437	9442	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407463882
135	NC_018656	GAT	2	6	9453	9458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407463882
136	NC_018656	AGA	2	6	9521	9526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407463882
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