MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Candidatus Nitrosopumilus koreensis AR1 chromosome

Total Repeats: 4391

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018655	TCAA	2	8	916	923	50 %	25 %	0 %	25 %	407461553
2	NC_018655	CTTT	2	8	1424	1431	0 %	75 %	0 %	25 %	407461554
3	NC_018655	CAAC	2	8	1699	1706	50 %	0 %	0 %	50 %	407461554
4	NC_018655	ATTA	2	8	1876	1883	50 %	50 %	0 %	0 %	407461555
5	NC_018655	TACT	2	8	2007	2014	25 %	50 %	0 %	25 %	407461555
6	NC_018655	TCTG	2	8	3210	3217	0 %	50 %	25 %	25 %	407461557
7	NC_018655	ATTT	2	8	3386	3393	25 %	75 %	0 %	0 %	407461557
8	NC_018655	GTAA	2	8	3745	3752	50 %	25 %	25 %	0 %	407461558
9	NC_018655	AAAC	2	8	4451	4458	75 %	0 %	0 %	25 %	407461558
10	NC_018655	ATCC	2	8	4515	4522	25 %	25 %	0 %	50 %	407461558
11	NC_018655	AGAA	2	8	4948	4955	75 %	0 %	25 %	0 %	407461558
12	NC_018655	ATGA	2	8	5146	5153	50 %	25 %	25 %	0 %	407461558
13	NC_018655	GTTT	2	8	5170	5177	0 %	75 %	25 %	0 %	407461558
14	NC_018655	TTCT	2	8	5672	5679	0 %	75 %	0 %	25 %	407461559
15	NC_018655	TGAT	2	8	5851	5858	25 %	50 %	25 %	0 %	407461559
16	NC_018655	TCTT	2	8	6186	6193	0 %	75 %	0 %	25 %	407461560
17	NC_018655	AAAT	2	8	6414	6421	75 %	25 %	0 %	0 %	407461560
18	NC_018655	TTCT	2	8	7314	7321	0 %	75 %	0 %	25 %	407461561
19	NC_018655	AATT	2	8	7921	7928	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018655	TACT	2	8	7973	7980	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_018655	TTCA	2	8	9402	9409	25 %	50 %	0 %	25 %	407461562
22	NC_018655	CAAA	2	8	9921	9928	75 %	0 %	0 %	25 %	407461562
23	NC_018655	TGAT	2	8	10915	10922	25 %	50 %	25 %	0 %	407461562
24	NC_018655	ATGG	2	8	11437	11444	25 %	25 %	50 %	0 %	407461562
25	NC_018655	CAAA	2	8	11808	11815	75 %	0 %	0 %	25 %	407461562
26	NC_018655	TCAC	2	8	12702	12709	25 %	25 %	0 %	50 %	407461562
27	NC_018655	ACTA	2	8	12956	12963	50 %	25 %	0 %	25 %	407461562
28	NC_018655	TACT	2	8	13256	13263	25 %	50 %	0 %	25 %	407461562
29	NC_018655	AAAC	2	8	13275	13282	75 %	0 %	0 %	25 %	407461562
30	NC_018655	AATG	2	8	13902	13909	50 %	25 %	25 %	0 %	407461562
31	NC_018655	GATG	2	8	14654	14661	25 %	25 %	50 %	0 %	407461562
32	NC_018655	CCAT	2	8	14853	14860	25 %	25 %	0 %	50 %	407461562
33	NC_018655	AATC	2	8	15588	15595	50 %	25 %	0 %	25 %	407461563
34	NC_018655	CTTT	2	8	15763	15770	0 %	75 %	0 %	25 %	407461563
35	NC_018655	TGCA	2	8	16056	16063	25 %	25 %	25 %	25 %	407461563
36	NC_018655	TCTG	2	8	16289	16296	0 %	50 %	25 %	25 %	407461563
37	NC_018655	GATT	2	8	16513	16520	25 %	50 %	25 %	0 %	407461563
38	NC_018655	ATTA	2	8	16645	16652	50 %	50 %	0 %	0 %	407461563
39	NC_018655	TCTA	2	8	17200	17207	25 %	50 %	0 %	25 %	407461564
40	NC_018655	AACG	2	8	17335	17342	50 %	0 %	25 %	25 %	407461564
41	NC_018655	CTTT	2	8	17711	17718	0 %	75 %	0 %	25 %	407461564
42	NC_018655	CTAA	2	8	18466	18473	50 %	25 %	0 %	25 %	407461565
43	NC_018655	AAAC	2	8	18615	18622	75 %	0 %	0 %	25 %	407461565
44	NC_018655	AACG	2	8	18823	18830	50 %	0 %	25 %	25 %	407461565
45	NC_018655	ATGA	2	8	19236	19243	50 %	25 %	25 %	0 %	407461566
46	NC_018655	TATC	2	8	19324	19331	25 %	50 %	0 %	25 %	407461566
47	NC_018655	AATG	2	8	19335	19342	50 %	25 %	25 %	0 %	407461566
48	NC_018655	CATT	2	8	22164	22171	25 %	50 %	0 %	25 %	407461567
49	NC_018655	AATT	2	8	22389	22396	50 %	50 %	0 %	0 %	407461567
50	NC_018655	TAGA	2	8	22716	22723	50 %	25 %	25 %	0 %	407461567
51	NC_018655	CAAA	2	8	23098	23105	75 %	0 %	0 %	25 %	407461568
52	NC_018655	ATTG	2	8	23353	23360	25 %	50 %	25 %	0 %	407461568
53	NC_018655	AATT	2	8	23421	23428	50 %	50 %	0 %	0 %	407461568
54	NC_018655	AAAC	2	8	23476	23483	75 %	0 %	0 %	25 %	407461568
55	NC_018655	CTCC	2	8	24054	24061	0 %	25 %	0 %	75 %	407461569
56	NC_018655	AAAC	2	8	24345	24352	75 %	0 %	0 %	25 %	407461569
57	NC_018655	TGTT	2	8	24639	24646	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018655	CAAT	2	8	24810	24817	50 %	25 %	0 %	25 %	407461570
59	NC_018655	AAAG	2	8	25764	25771	75 %	0 %	25 %	0 %	407461572
60	NC_018655	ATGG	2	8	25854	25861	25 %	25 %	50 %	0 %	407461572
61	NC_018655	CAAA	2	8	25905	25912	75 %	0 %	0 %	25 %	407461572
62	NC_018655	GTTG	2	8	26396	26403	0 %	50 %	50 %	0 %	407461572
63	NC_018655	CCAA	2	8	26561	26568	50 %	0 %	0 %	50 %	407461572
64	NC_018655	GTTG	2	8	26751	26758	0 %	50 %	50 %	0 %	407461572
65	NC_018655	CAAA	2	8	27060	27067	75 %	0 %	0 %	25 %	407461573
66	NC_018655	TTTC	2	8	27770	27777	0 %	75 %	0 %	25 %	407461575
67	NC_018655	GTTT	2	8	28187	28194	0 %	75 %	25 %	0 %	407461575
68	NC_018655	AATT	2	8	28230	28237	50 %	50 %	0 %	0 %	407461575
69	NC_018655	CAAT	2	8	28317	28324	50 %	25 %	0 %	25 %	407461575
70	NC_018655	CATT	2	8	28747	28754	25 %	50 %	0 %	25 %	407461575
71	NC_018655	CAAA	2	8	29617	29624	75 %	0 %	0 %	25 %	407461575
72	NC_018655	GGTT	2	8	29711	29718	0 %	50 %	50 %	0 %	407461575
73	NC_018655	TTTA	2	8	29770	29777	25 %	75 %	0 %	0 %	407461575
74	NC_018655	CTTT	2	8	30023	30030	0 %	75 %	0 %	25 %	407461577
75	NC_018655	AATA	2	8	30383	30390	75 %	25 %	0 %	0 %	407461577
76	NC_018655	TTGA	2	8	31046	31053	25 %	50 %	25 %	0 %	407461578
77	NC_018655	CTAA	2	8	31359	31366	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_018655	TAAA	2	8	31398	31405	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018655	GATT	2	8	32674	32681	25 %	50 %	25 %	0 %	407461579
80	NC_018655	GAAT	2	8	33292	33299	50 %	25 %	25 %	0 %	407461580
81	NC_018655	ATTG	2	8	33385	33392	25 %	50 %	25 %	0 %	407461580
82	NC_018655	TTTC	2	8	33789	33796	0 %	75 %	0 %	25 %	407461581
83	NC_018655	AATG	2	8	34006	34013	50 %	25 %	25 %	0 %	407461581
84	NC_018655	AATT	2	8	34209	34216	50 %	50 %	0 %	0 %	407461582
85	NC_018655	CCAA	2	8	34774	34781	50 %	0 %	0 %	50 %	407461582
86	NC_018655	CTTT	2	8	35134	35141	0 %	75 %	0 %	25 %	407461582
87	NC_018655	CATT	2	8	36328	36335	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_018655	CAAT	2	8	36635	36642	50 %	25 %	0 %	25 %	407461584
89	NC_018655	AATT	2	8	36657	36664	50 %	50 %	0 %	0 %	407461584
90	NC_018655	AATT	2	8	36969	36976	50 %	50 %	0 %	0 %	407461584
91	NC_018655	TAAC	2	8	37131	37138	50 %	25 %	0 %	25 %	407461584
92	NC_018655	TCAA	2	8	37234	37241	50 %	25 %	0 %	25 %	407461584
93	NC_018655	TTCT	2	8	37413	37420	0 %	75 %	0 %	25 %	407461585
94	NC_018655	TGTT	2	8	37453	37460	0 %	75 %	25 %	0 %	407461585
95	NC_018655	TCTG	2	8	37529	37536	0 %	50 %	25 %	25 %	407461585
96	NC_018655	ATCT	2	8	37591	37598	25 %	50 %	0 %	25 %	407461585
97	NC_018655	TTGA	2	8	38668	38675	25 %	50 %	25 %	0 %	407461586
98	NC_018655	CATA	2	8	39396	39403	50 %	25 %	0 %	25 %	407461587
99	NC_018655	CTAT	2	8	39838	39845	25 %	50 %	0 %	25 %	407461588
100	NC_018655	TGGA	2	8	40220	40227	25 %	25 %	50 %	0 %	407461588
101	NC_018655	ATTA	2	8	40590	40597	50 %	50 %	0 %	0 %	407461588
102	NC_018655	GAAA	2	8	41605	41612	75 %	0 %	25 %	0 %	407461588
103	NC_018655	AAAC	2	8	41933	41940	75 %	0 %	0 %	25 %	407461588
104	NC_018655	CAAA	2	8	42216	42223	75 %	0 %	0 %	25 %	407461588
105	NC_018655	CTTG	2	8	42397	42404	0 %	50 %	25 %	25 %	407461589
106	NC_018655	TTTG	2	8	42484	42491	0 %	75 %	25 %	0 %	407461589
107	NC_018655	ATTG	2	8	43209	43216	25 %	50 %	25 %	0 %	407461589
108	NC_018655	GTCA	2	8	43551	43558	25 %	25 %	25 %	25 %	407461589
109	NC_018655	AATT	2	8	43638	43645	50 %	50 %	0 %	0 %	407461589
110	NC_018655	TTAC	2	8	44029	44036	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
111	NC_018655	AGAA	2	8	44269	44276	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018655	AAAT	2	8	44644	44651	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018655	ATTA	2	8	45213	45220	50 %	50 %	0 %	0 %	407461590
114	NC_018655	CTAA	2	8	45550	45557	50 %	25 %	0 %	25 %	407461590
115	NC_018655	CCAT	2	8	45811	45818	25 %	25 %	0 %	50 %	407461591
116	NC_018655	TGAA	2	8	46069	46076	50 %	25 %	25 %	0 %	407461591
117	NC_018655	TTTC	2	8	46250	46257	0 %	75 %	0 %	25 %	407461591
118	NC_018655	CAAA	2	8	46269	46276	75 %	0 %	0 %	25 %	407461591
119	NC_018655	TAAT	2	8	46541	46548	50 %	50 %	0 %	0 %	407461592
120	NC_018655	TCTT	2	8	47057	47064	0 %	75 %	0 %	25 %	407461592
121	NC_018655	TTCT	2	8	47136	47143	0 %	75 %	0 %	25 %	407461592
122	NC_018655	AGTT	2	8	47570	47577	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018655	ATTC	2	8	47898	47905	25 %	50 %	0 %	25 %	407461593
124	NC_018655	GAAA	2	8	48883	48890	75 %	0 %	25 %	0 %	407461594
125	NC_018655	TTGG	2	8	49508	49515	0 %	50 %	50 %	0 %	407461595
126	NC_018655	CATT	2	8	49677	49684	25 %	50 %	0 %	25 %	407461595
127	NC_018655	TGAT	2	8	49986	49993	25 %	50 %	25 %	0 %	407461595
128	NC_018655	AATT	2	8	50202	50209	50 %	50 %	0 %	0 %	407461595
129	NC_018655	GAAA	2	8	50522	50529	75 %	0 %	25 %	0 %	407461595
130	NC_018655	TTCT	2	8	51442	51449	0 %	75 %	0 %	25 %	407461596
131	NC_018655	CAAA	2	8	51698	51705	75 %	0 %	0 %	25 %	407461596
132	NC_018655	GAAA	2	8	51928	51935	75 %	0 %	25 %	0 %	407461596
133	NC_018655	CCAA	2	8	52202	52209	50 %	0 %	0 %	50 %	407461596
134	NC_018655	AAAC	2	8	52344	52351	75 %	0 %	0 %	25 %	407461596
135	NC_018655	CATC	2	8	52582	52589	25 %	25 %	0 %	50 %	407461597
136	NC_018655	ATTT	2	8	53235	53242	25 %	75 %	0 %	0 %	407461599
137	NC_018655	ATTG	2	8	53266	53273	25 %	50 %	25 %	0 %	407461599
138	NC_018655	CTTT	2	8	53336	53343	0 %	75 %	0 %	25 %	407461599
139	NC_018655	TTCC	2	8	53913	53920	0 %	50 %	0 %	50 %	407461599
140	NC_018655	CAAT	2	8	54302	54309	50 %	25 %	0 %	25 %	407461599
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