MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Candidatus Nitrosopumilus koreensis AR1 chromosome

Total Repeats: 38015

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_018655	GATCCA	2	12	211018	211029	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	407461783
5002	NC_018655	GAGAA	2	10	211046	211055	60 %	0 %	40 %	0 %	407461783
5003	NC_018655	ATTAC	2	10	211073	211082	40 %	40 %	0 %	20 %	407461783
5004	NC_018655	AG	3	6	211098	211103	50 %	0 %	50 %	0 %	407461783
5005	NC_018655	GAA	2	6	211156	211161	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407461783
5006	NC_018655	TTGA	2	8	211318	211325	25 %	50 %	25 %	0 %	407461783
5007	NC_018655	TGTT	2	8	211416	211423	0 %	75 %	25 %	0 %	407461783
5008	NC_018655	ATT	2	6	211436	211441	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407461783
5009	NC_018655	TAT	2	6	211520	211525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407461783
5010	NC_018655	AAC	2	6	211551	211556	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407461783
5011	NC_018655	GTG	2	6	211577	211582	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407461783
5012	NC_018655	ATG	2	6	211613	211618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407461783
5013	NC_018655	ATG	2	6	211622	211627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407461783
5014	NC_018655	TGA	2	6	211649	211654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407461783
5015	NC_018655	AAG	2	6	211655	211660	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407461783
5016	NC_018655	ATT	2	6	211717	211722	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407461783
5017	NC_018655	A	6	6	211736	211741	100 %	0 %	0 %	0 %	407461783
5018	NC_018655	GTT	2	6	211844	211849	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407461783
5019	NC_018655	ACTT	2	8	211913	211920	25 %	50 %	0 %	25 %	407461783
5020	NC_018655	ATT	2	6	211985	211990	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407461783
5021	NC_018655	T	6	6	212093	212098	0 %	100 %	0 %	0 %	407461784
5022	NC_018655	GCA	2	6	212116	212121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407461784
5023	NC_018655	TAAT	2	8	212153	212160	50 %	50 %	0 %	0 %	407461784
5024	NC_018655	TTAC	2	8	212167	212174	25 %	50 %	0 %	25 %	407461784
5025	NC_018655	TGGATT	2	12	212274	212285	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	407461784
5026	NC_018655	TGC	2	6	212286	212291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407461784
5027	NC_018655	GCT	2	6	212299	212304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407461784
5028	NC_018655	GAAA	2	8	212320	212327	75 %	0 %	25 %	0 %	407461784
5029	NC_018655	ATT	3	9	212431	212439	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407461784
5030	NC_018655	GCT	2	6	212470	212475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407461784
5031	NC_018655	TTG	2	6	212486	212491	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407461784
5032	NC_018655	GCT	2	6	212497	212502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407461784
5033	NC_018655	CATT	2	8	212642	212649	25 %	50 %	0 %	25 %	407461784
5034	NC_018655	GGA	2	6	212650	212655	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407461784
5035	NC_018655	GTT	2	6	212716	212721	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407461784
5036	NC_018655	GCA	2	6	212755	212760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407461784
5037	NC_018655	TCT	2	6	212810	212815	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407461784
5038	NC_018655	AGAA	2	8	212838	212845	75 %	0 %	25 %	0 %	407461784
5039	NC_018655	TTG	2	6	212879	212884	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407461784
5040	NC_018655	TGGT	2	8	212886	212893	0 %	50 %	50 %	0 %	407461784
5041	NC_018655	ATG	2	6	212911	212916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407461784
5042	NC_018655	TGTT	2	8	212969	212976	0 %	75 %	25 %	0 %	407461784
5043	NC_018655	TGGA	2	8	212991	212998	25 %	25 %	50 %	0 %	407461784
5044	NC_018655	GTT	2	6	213010	213015	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407461784
5045	NC_018655	AGA	2	6	213027	213032	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407461784
5046	NC_018655	TTG	2	6	213163	213168	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407461784
5047	NC_018655	AGAATT	2	12	213187	213198	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	407461784
5048	NC_018655	TGT	2	6	213203	213208	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407461784
5049	NC_018655	TTGG	2	8	213215	213222	0 %	50 %	50 %	0 %	407461784
5050	NC_018655	ATTG	2	8	213228	213235	25 %	50 %	25 %	0 %	407461784
5051	NC_018655	GCTT	2	8	213269	213276	0 %	50 %	25 %	25 %	407461784
5052	NC_018655	GGA	2	6	213298	213303	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407461784
5053	NC_018655	AAT	2	6	213308	213313	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407461784
5054	NC_018655	GAA	2	6	213570	213575	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407461785
5055	NC_018655	A	6	6	213588	213593	100 %	0 %	0 %	0 %	407461785
5056	NC_018655	TTCA	2	8	213698	213705	25 %	50 %	0 %	25 %	407461785
5057	NC_018655	AGG	2	6	213709	213714	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407461785
5058	NC_018655	TGC	2	6	213810	213815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407461786
5059	NC_018655	TGG	2	6	213912	213917	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407461786
5060	NC_018655	TTC	2	6	213928	213933	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407461786
5061	NC_018655	ATT	2	6	213960	213965	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407461786
5062	NC_018655	TTTA	2	8	214005	214012	25 %	75 %	0 %	0 %	407461786
5063	NC_018655	A	7	7	214045	214051	100 %	0 %	0 %	0 %	407461786
5064	NC_018655	AGA	2	6	214063	214068	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407461786
5065	NC_018655	TGA	2	6	214155	214160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407461786
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5067	NC_018655	ATT	2	6	214205	214210	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407461786
5068	NC_018655	TTG	2	6	214337	214342	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407461787
5069	NC_018655	TGT	2	6	214389	214394	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407461787
5070	NC_018655	TGC	2	6	214417	214422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407461787
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5072	NC_018655	ATTGCA	2	12	214493	214504	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	407461787
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5074	NC_018655	ATTA	2	8	214531	214538	50 %	50 %	0 %	0 %	407461787
5075	NC_018655	GTAT	2	8	214551	214558	25 %	50 %	25 %	0 %	407461787
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5081	NC_018655	GAA	3	9	214918	214926	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407461788
5082	NC_018655	A	6	6	214928	214933	100 %	0 %	0 %	0 %	407461788
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5086	NC_018655	CAA	2	6	215066	215071	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407461788
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5089	NC_018655	TGA	2	6	215222	215227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407461788
5090	NC_018655	TGCAAT	3	18	215304	215321	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	407461788
5091	NC_018655	TTG	2	6	215459	215464	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407461788
5092	NC_018655	TGG	2	6	215535	215540	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407461788
5093	NC_018655	TCT	2	6	215574	215579	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407461788
5094	NC_018655	TTTG	2	8	215613	215620	0 %	75 %	25 %	0 %	407461788
5095	NC_018655	ATG	2	6	215662	215667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407461788
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5100	NC_018655	GT	3	6	215984	215989	0 %	50 %	50 %	0 %	407461788
5101	NC_018655	AAG	2	6	216026	216031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407461788
5102	NC_018655	ATG	2	6	216055	216060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407461788
5103	NC_018655	CTT	2	6	216061	216066	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407461788
5104	NC_018655	GTT	2	6	216082	216087	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407461788
5105	NC_018655	TGA	2	6	216308	216313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407461789
5106	NC_018655	GGT	2	6	216406	216411	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407461789
5107	NC_018655	GTTG	2	8	216451	216458	0 %	50 %	50 %	0 %	407461789
5108	NC_018655	TTCTGG	2	12	216523	216534	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	407461789
5109	NC_018655	ATG	2	6	216535	216540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407461789
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5111	NC_018655	TAT	2	6	216569	216574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407461789
5112	NC_018655	TCT	2	6	216593	216598	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407461789
5113	NC_018655	AAAG	2	8	216660	216667	75 %	0 %	25 %	0 %	407461789
5114	NC_018655	AAG	2	6	216680	216685	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407461789
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5117	NC_018655	GTGAT	2	10	216764	216773	20 %	40 %	40 %	0 %	407461789
5118	NC_018655	GAT	3	9	216771	216779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407461789
5119	NC_018655	TGG	2	6	216906	216911	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407461789
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5121	NC_018655	CTG	2	6	216977	216982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407461789
5122	NC_018655	GCA	2	6	217000	217005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407461789
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5233	NC_018655	TAT	2	6	222295	222300	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5234	NC_018655	GAAT	2	8	222301	222308	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5235	NC_018655	GTT	2	6	222346	222351	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407461794
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5240	NC_018655	TCAA	2	8	222613	222620	50 %	25 %	0 %	25 %	407461794
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5242	NC_018655	A	6	6	222724	222729	100 %	0 %	0 %	0 %	407461794
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5244	NC_018655	A	7	7	222819	222825	100 %	0 %	0 %	0 %	407461794
5245	NC_018655	ATT	2	6	222859	222864	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407461794
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5248	NC_018655	A	6	6	223060	223065	100 %	0 %	0 %	0 %	407461794
5249	NC_018655	AGG	2	6	223098	223103	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407461794
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5364	NC_018655	TGA	2	6	227692	227697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407461799
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5492	NC_018655	CAA	2	6	232984	232989	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407461805
5493	NC_018655	TGC	2	6	233208	233213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407461805
5494	NC_018655	GCT	2	6	233245	233250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407461805
5495	NC_018655	CAA	2	6	233260	233265	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407461805
5496	NC_018655	GCT	2	6	233335	233340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407461805
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5500	NC_018655	AATC	2	8	233605	233612	50 %	25 %	0 %	25 %	407461806

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