MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Chlamydia psittaci WS/RT/E30 plasmid pcpWSRTE30

Total Repeats: 22

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018640	AT	3	6	466	471	50 %	50 %	0 %	0 %	406598937
2	NC_018640	TA	3	6	606	611	50 %	50 %	0 %	0 %	406598937
3	NC_018640	AG	3	6	738	743	50 %	0 %	50 %	0 %	406598937
4	NC_018640	AG	3	6	981	986	50 %	0 %	50 %	0 %	406598937
5	NC_018640	TA	3	6	1266	1271	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018640	TG	3	6	1516	1521	0 %	50 %	50 %	0 %	406598938
7	NC_018640	AC	3	6	1675	1680	50 %	0 %	0 %	50 %	406598938
8	NC_018640	AT	3	6	1978	1983	50 %	50 %	0 %	0 %	406598938
9	NC_018640	AC	3	6	2021	2026	50 %	0 %	0 %	50 %	406598938
10	NC_018640	CA	4	8	2342	2349	50 %	0 %	0 %	50 %	406598938
11	NC_018640	AT	3	6	2590	2595	50 %	50 %	0 %	0 %	406598939
12	NC_018640	AT	3	6	2611	2616	50 %	50 %	0 %	0 %	406598939
13	NC_018640	AG	3	6	3236	3241	50 %	0 %	50 %	0 %	406598939
14	NC_018640	TC	3	6	4302	4307	0 %	50 %	0 %	50 %	406598940
15	NC_018640	AT	3	6	4657	4662	50 %	50 %	0 %	0 %	406598940
16	NC_018640	TC	3	6	5578	5583	0 %	50 %	0 %	50 %	406598941
17	NC_018640	AT	3	6	5671	5676	50 %	50 %	0 %	0 %	406598941
18	NC_018640	AT	3	6	5735	5740	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018640	GA	3	6	5798	5803	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018640	TG	3	6	6576	6581	0 %	50 %	50 %	0 %	406598943
21	NC_018640	GA	3	6	7177	7182	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018640	GT	3	6	7508	7513	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.