MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Chlamydia psittaci NJ1 plasmid pcpNJ1

Total Repeats: 25

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018637	A	8	8	47	54	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018637	T	6	6	221	226	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018637	T	7	7	272	278	0 %	100 %	0 %	0 %	406598911
4	NC_018637	T	7	7	376	382	0 %	100 %	0 %	0 %	406598911
5	NC_018637	T	6	6	1413	1418	0 %	100 %	0 %	0 %	406598912
6	NC_018637	A	6	6	2397	2402	100 %	0 %	0 %	0 %	406598912
7	NC_018637	A	7	7	3061	3067	100 %	0 %	0 %	0 %	406598913
8	NC_018637	A	6	6	3317	3322	100 %	0 %	0 %	0 %	406598913
9	NC_018637	A	8	8	3487	3494	100 %	0 %	0 %	0 %	406598913
10	NC_018637	A	7	7	3599	3605	100 %	0 %	0 %	0 %	406598913
11	NC_018637	A	6	6	3695	3700	100 %	0 %	0 %	0 %	406598913
12	NC_018637	A	8	8	3794	3801	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018637	A	6	6	4216	4221	100 %	0 %	0 %	0 %	406598914
14	NC_018637	T	9	9	4673	4681	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018637	A	6	6	4693	4698	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018637	A	6	6	4825	4830	100 %	0 %	0 %	0 %	406598915
17	NC_018637	T	6	6	4835	4840	0 %	100 %	0 %	0 %	406598915
18	NC_018637	A	7	7	4973	4979	100 %	0 %	0 %	0 %	406598915
19	NC_018637	A	7	7	5156	5162	100 %	0 %	0 %	0 %	406598916
20	NC_018637	T	6	6	5593	5598	0 %	100 %	0 %	0 %	406598916
21	NC_018637	T	7	7	5869	5875	0 %	100 %	0 %	0 %	406598917
22	NC_018637	A	6	6	6127	6132	100 %	0 %	0 %	0 %	406598917
23	NC_018637	A	7	7	6749	6755	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018637	T	6	6	7225	7230	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018637	A	6	6	7368	7373	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.