MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Chlamydia psittaci MN chromosome

Total Repeats: 2159

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018627	TA	3	6	92	97	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018627	GT	3	6	308	313	0 %	50 %	50 %	0 %	406594902
3	NC_018627	TG	3	6	497	502	0 %	50 %	50 %	0 %	406594902
4	NC_018627	TC	3	6	726	731	0 %	50 %	0 %	50 %	406594902
5	NC_018627	AC	3	6	1294	1299	50 %	0 %	0 %	50 %	406594804
6	NC_018627	GT	3	6	1460	1465	0 %	50 %	50 %	0 %	406594804
7	NC_018627	TC	3	6	1583	1588	0 %	50 %	0 %	50 %	406594804
8	NC_018627	TG	3	6	1887	1892	0 %	50 %	50 %	0 %	406594804
9	NC_018627	GA	3	6	2783	2788	50 %	0 %	50 %	0 %	406594726
10	NC_018627	GA	3	6	3337	3342	50 %	0 %	50 %	0 %	406594534
11	NC_018627	AT	3	6	4224	4229	50 %	50 %	0 %	0 %	406594534
12	NC_018627	CT	3	6	4726	4731	0 %	50 %	0 %	50 %	406594534
13	NC_018627	AC	3	6	6150	6155	50 %	0 %	0 %	50 %	406594817
14	NC_018627	CT	3	6	6466	6471	0 %	50 %	0 %	50 %	406594817
15	NC_018627	GA	3	6	6890	6895	50 %	0 %	50 %	0 %	406594370
16	NC_018627	GT	3	6	7801	7806	0 %	50 %	50 %	0 %	406594370
17	NC_018627	TC	3	6	7872	7877	0 %	50 %	0 %	50 %	406594370
18	NC_018627	AT	3	6	8461	8466	50 %	50 %	0 %	0 %	406594531
19	NC_018627	GT	3	6	8684	8689	0 %	50 %	50 %	0 %	406594531
20	NC_018627	AG	3	6	9228	9233	50 %	0 %	50 %	0 %	406594531
21	NC_018627	TG	3	6	10490	10495	0 %	50 %	50 %	0 %	406594531
22	NC_018627	GT	3	6	10799	10804	0 %	50 %	50 %	0 %	406594531
23	NC_018627	TC	3	6	11260	11265	0 %	50 %	0 %	50 %	406594948
24	NC_018627	AC	3	6	11276	11281	50 %	0 %	0 %	50 %	406594948
25	NC_018627	GC	3	6	11384	11389	0 %	0 %	50 %	50 %	406594948
26	NC_018627	AT	3	6	11520	11525	50 %	50 %	0 %	0 %	406594948
27	NC_018627	GA	3	6	11599	11604	50 %	0 %	50 %	0 %	406594948
28	NC_018627	AG	3	6	11787	11792	50 %	0 %	50 %	0 %	406594948
29	NC_018627	TC	3	6	11840	11845	0 %	50 %	0 %	50 %	406594948
30	NC_018627	GT	3	6	12055	12060	0 %	50 %	50 %	0 %	406594948
31	NC_018627	GA	3	6	12443	12448	50 %	0 %	50 %	0 %	406594948
32	NC_018627	AG	3	6	12512	12517	50 %	0 %	50 %	0 %	406594948
33	NC_018627	GA	3	6	12583	12588	50 %	0 %	50 %	0 %	406594948
34	NC_018627	GT	3	6	12864	12869	0 %	50 %	50 %	0 %	406594948
35	NC_018627	TA	3	6	13805	13810	50 %	50 %	0 %	0 %	406594856
36	NC_018627	TA	3	6	13825	13830	50 %	50 %	0 %	0 %	406594856
37	NC_018627	AT	3	6	14109	14114	50 %	50 %	0 %	0 %	406594874
38	NC_018627	CT	3	6	14789	14794	0 %	50 %	0 %	50 %	406594874
39	NC_018627	TA	3	6	15119	15124	50 %	50 %	0 %	0 %	406594874
40	NC_018627	TG	4	8	15657	15664	0 %	50 %	50 %	0 %	406594874
41	NC_018627	AG	3	6	17696	17701	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018627	GT	3	6	19393	19398	0 %	50 %	50 %	0 %	406594049
43	NC_018627	TA	3	6	19437	19442	50 %	50 %	0 %	0 %	406594049
44	NC_018627	TC	3	6	19543	19548	0 %	50 %	0 %	50 %	406594049
45	NC_018627	GT	3	6	19672	19677	0 %	50 %	50 %	0 %	406594049
46	NC_018627	AC	3	6	20113	20118	50 %	0 %	0 %	50 %	406594049
47	NC_018627	TC	3	6	21144	21149	0 %	50 %	0 %	50 %	406594747
48	NC_018627	GA	3	6	22446	22451	50 %	0 %	50 %	0 %	406594213
49	NC_018627	GA	3	6	23669	23674	50 %	0 %	50 %	0 %	406594213
50	NC_018627	TA	3	6	25503	25508	50 %	50 %	0 %	0 %	406594484
51	NC_018627	GA	4	8	25609	25616	50 %	0 %	50 %	0 %	406594484
52	NC_018627	TA	3	6	26513	26518	50 %	50 %	0 %	0 %	406594484
53	NC_018627	TA	3	6	27376	27381	50 %	50 %	0 %	0 %	406594343
54	NC_018627	TC	3	6	27461	27466	0 %	50 %	0 %	50 %	406594343
55	NC_018627	TA	3	6	27754	27759	50 %	50 %	0 %	0 %	406594343
56	NC_018627	TA	3	6	28053	28058	50 %	50 %	0 %	0 %	406594343
57	NC_018627	TA	3	6	28510	28515	50 %	50 %	0 %	0 %	406594343
58	NC_018627	GA	3	6	28762	28767	50 %	0 %	50 %	0 %	406594343
59	NC_018627	AG	3	6	29925	29930	50 %	0 %	50 %	0 %	406594146
60	NC_018627	AG	3	6	30586	30591	50 %	0 %	50 %	0 %	406594468
61	NC_018627	GA	3	6	31108	31113	50 %	0 %	50 %	0 %	406594988
62	NC_018627	GA	4	8	31238	31245	50 %	0 %	50 %	0 %	406594988
63	NC_018627	TC	3	6	31851	31856	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_018627	GT	3	6	33082	33087	0 %	50 %	50 %	0 %	406593996
65	NC_018627	AG	3	6	34605	34610	50 %	0 %	50 %	0 %	406594615
66	NC_018627	AG	3	6	34677	34682	50 %	0 %	50 %	0 %	406594615
67	NC_018627	AT	3	6	34723	34728	50 %	50 %	0 %	0 %	406594615
68	NC_018627	CG	3	6	35124	35129	0 %	0 %	50 %	50 %	406594615
69	NC_018627	AT	3	6	35443	35448	50 %	50 %	0 %	0 %	406594615
70	NC_018627	GA	3	6	35924	35929	50 %	0 %	50 %	0 %	406594996
71	NC_018627	TA	3	6	37497	37502	50 %	50 %	0 %	0 %	406594996
72	NC_018627	TC	3	6	37735	37740	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_018627	GA	3	6	38467	38472	50 %	0 %	50 %	0 %	406594065
74	NC_018627	CG	3	6	38496	38501	0 %	0 %	50 %	50 %	406594065
75	NC_018627	TA	3	6	38502	38507	50 %	50 %	0 %	0 %	406594065
76	NC_018627	GC	3	6	39834	39839	0 %	0 %	50 %	50 %	406594761
77	NC_018627	AG	3	6	39845	39850	50 %	0 %	50 %	0 %	406594761
78	NC_018627	AG	3	6	40725	40730	50 %	0 %	50 %	0 %	406594506
79	NC_018627	GC	3	6	41442	41447	0 %	0 %	50 %	50 %	406594506
80	NC_018627	AT	3	6	41774	41779	50 %	50 %	0 %	0 %	406594506
81	NC_018627	CT	3	6	41884	41889	0 %	50 %	0 %	50 %	406594506
82	NC_018627	CA	3	6	44107	44112	50 %	0 %	0 %	50 %	406594572
83	NC_018627	CA	3	6	44318	44323	50 %	0 %	0 %	50 %	406594316
84	NC_018627	AG	3	6	45650	45655	50 %	0 %	50 %	0 %	406594098
85	NC_018627	CA	3	6	47058	47063	50 %	0 %	0 %	50 %	406594853
86	NC_018627	TC	4	8	47817	47824	0 %	50 %	0 %	50 %	406594853
87	NC_018627	TA	3	6	48246	48251	50 %	50 %	0 %	0 %	406594614
88	NC_018627	AT	3	6	48260	48265	50 %	50 %	0 %	0 %	406594614
89	NC_018627	AT	3	6	48512	48517	50 %	50 %	0 %	0 %	406594614
90	NC_018627	CT	3	6	48569	48574	0 %	50 %	0 %	50 %	406594614
91	NC_018627	TA	3	6	48872	48877	50 %	50 %	0 %	0 %	406594614
92	NC_018627	AG	3	6	49400	49405	50 %	0 %	50 %	0 %	406594614
93	NC_018627	GC	3	6	49969	49974	0 %	0 %	50 %	50 %	406594792
94	NC_018627	TC	3	6	50374	50379	0 %	50 %	0 %	50 %	406594792
95	NC_018627	TA	3	6	50547	50552	50 %	50 %	0 %	0 %	406594792
96	NC_018627	TA	3	6	52209	52214	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018627	GT	3	6	53099	53104	0 %	50 %	50 %	0 %	406594229
98	NC_018627	AT	3	6	53286	53291	50 %	50 %	0 %	0 %	406594229
99	NC_018627	AG	3	6	55429	55434	50 %	0 %	50 %	0 %	406594642
100	NC_018627	CT	3	6	57048	57053	0 %	50 %	0 %	50 %	406594447
101	NC_018627	GA	3	6	57076	57081	50 %	0 %	50 %	0 %	406594447
102	NC_018627	CA	3	6	57539	57544	50 %	0 %	0 %	50 %	406594447
103	NC_018627	AT	3	6	58495	58500	50 %	50 %	0 %	0 %	406594521
104	NC_018627	GA	3	6	59323	59328	50 %	0 %	50 %	0 %	406594521
105	NC_018627	AG	3	6	60301	60306	50 %	0 %	50 %	0 %	406594291
106	NC_018627	AG	3	6	60602	60607	50 %	0 %	50 %	0 %	406594291
107	NC_018627	GA	3	6	61846	61851	50 %	0 %	50 %	0 %	406594291
108	NC_018627	AG	3	6	62134	62139	50 %	0 %	50 %	0 %	406594291
109	NC_018627	TC	3	6	62586	62591	0 %	50 %	0 %	50 %	406594291
110	NC_018627	AG	3	6	63229	63234	50 %	0 %	50 %	0 %	406594291
111	NC_018627	TG	3	6	63302	63307	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018627	TC	3	6	64781	64786	0 %	50 %	0 %	50 %	406594863
113	NC_018627	TG	3	6	65546	65551	0 %	50 %	50 %	0 %	406594863
114	NC_018627	CA	4	8	65833	65840	50 %	0 %	0 %	50 %	406594863
115	NC_018627	GA	4	8	66572	66579	50 %	0 %	50 %	0 %	406594929
116	NC_018627	AT	3	6	67351	67356	50 %	50 %	0 %	0 %	406594442
117	NC_018627	GA	4	8	67458	67465	50 %	0 %	50 %	0 %	406594442
118	NC_018627	AG	3	6	67571	67576	50 %	0 %	50 %	0 %	406594442
119	NC_018627	TG	3	6	67920	67925	0 %	50 %	50 %	0 %	406594442
120	NC_018627	GT	3	6	68164	68169	0 %	50 %	50 %	0 %	406594442
121	NC_018627	TA	3	6	68605	68610	50 %	50 %	0 %	0 %	406594818
122	NC_018627	TA	3	6	69308	69313	50 %	50 %	0 %	0 %	406594818
123	NC_018627	AG	3	6	70231	70236	50 %	0 %	50 %	0 %	406594720
124	NC_018627	GA	3	6	71754	71759	50 %	0 %	50 %	0 %	406594384
125	NC_018627	GT	3	6	72030	72035	0 %	50 %	50 %	0 %	406594384
126	NC_018627	GT	3	6	73692	73697	0 %	50 %	50 %	0 %	406594692
127	NC_018627	GA	3	6	74634	74639	50 %	0 %	50 %	0 %	406594765
128	NC_018627	TC	3	6	75222	75227	0 %	50 %	0 %	50 %	406593968
129	NC_018627	TC	3	6	76027	76032	0 %	50 %	0 %	50 %	406593968
130	NC_018627	GC	3	6	76259	76264	0 %	0 %	50 %	50 %	406594859
131	NC_018627	TC	3	6	76326	76331	0 %	50 %	0 %	50 %	406594859
132	NC_018627	TC	3	6	76429	76434	0 %	50 %	0 %	50 %	406594859
133	NC_018627	CA	3	6	76564	76569	50 %	0 %	0 %	50 %	406594859
134	NC_018627	CT	3	6	76752	76757	0 %	50 %	0 %	50 %	406594859
135	NC_018627	CG	3	6	76862	76867	0 %	0 %	50 %	50 %	406594859
136	NC_018627	GA	3	6	78853	78858	50 %	0 %	50 %	0 %	406594136
137	NC_018627	AG	3	6	79187	79192	50 %	0 %	50 %	0 %	406594136
138	NC_018627	AC	3	6	80171	80176	50 %	0 %	0 %	50 %	406594007
139	NC_018627	AC	3	6	80325	80330	50 %	0 %	0 %	50 %	406594007
140	NC_018627	AG	3	6	81214	81219	50 %	0 %	50 %	0 %	406594800
141	NC_018627	CT	3	6	81394	81399	0 %	50 %	0 %	50 %	406594800
142	NC_018627	AC	3	6	81741	81746	50 %	0 %	0 %	50 %	406594800
143	NC_018627	AC	3	6	81943	81948	50 %	0 %	0 %	50 %	406594076
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