MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia psittaci MN chromosome

Total Repeats: 24827

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4002	NC_018627	TCT	2	6	190353	190358	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406594112
4003	NC_018627	CAC	2	6	190391	190396	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406594112
4004	NC_018627	AAG	2	6	190531	190536	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406594112
4005	NC_018627	CTT	2	6	190588	190593	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406594112
4006	NC_018627	TTAT	2	8	190672	190679	25 %	75 %	0 %	0 %	406594112
4007	NC_018627	TTC	3	9	190687	190695	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406594112
4008	NC_018627	ATG	2	6	190735	190740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406594112
4009	NC_018627	GAT	2	6	190794	190799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406594112
4010	NC_018627	GT	3	6	190824	190829	0 %	50 %	50 %	0 %	406594112
4011	NC_018627	GGT	2	6	190879	190884	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406594112
4012	NC_018627	GCA	2	6	190940	190945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406594112
4013	NC_018627	TTC	2	6	191010	191015	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406594112
4014	NC_018627	GATAA	2	10	191017	191026	60 %	20 %	20 %	0 %	406594112
4015	NC_018627	ATTT	2	8	191029	191036	25 %	75 %	0 %	0 %	406594112
4016	NC_018627	CTAT	2	8	191104	191111	25 %	50 %	0 %	25 %	406594112
4017	NC_018627	TGA	2	6	191114	191119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406594112
4018	NC_018627	TCT	2	6	191149	191154	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406594112
4019	NC_018627	TAA	2	6	191208	191213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406594112
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4021	NC_018627	TTA	2	6	191251	191256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406594112
4022	NC_018627	TCT	2	6	191331	191336	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406594112
4023	NC_018627	CTT	3	9	191367	191375	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406594112
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4029	NC_018627	A	6	6	191531	191536	100 %	0 %	0 %	0 %	406594112
4030	NC_018627	GAA	2	6	191543	191548	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406594112
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4033	NC_018627	TGG	2	6	191601	191606	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406594112
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4040	NC_018627	AGAT	2	8	191787	191794	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4041	NC_018627	ACG	2	6	191810	191815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4044	NC_018627	TCT	2	6	191897	191902	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406594476
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4056	NC_018627	TTG	2	6	192764	192769	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406594476
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4061	NC_018627	A	6	6	192880	192885	100 %	0 %	0 %	0 %	406594476
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4070	NC_018627	A	6	6	193198	193203	100 %	0 %	0 %	0 %	406594476
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4089	NC_018627	TTTAT	2	10	193989	193998	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4107	NC_018627	GTT	2	6	194896	194901	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406594178
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4113	NC_018627	CAT	2	6	195098	195103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406594178
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4118	NC_018627	CCCTA	2	10	195285	195294	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
4119	NC_018627	AGT	2	6	195333	195338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4120	NC_018627	ATT	2	6	195410	195415	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4121	NC_018627	TATT	2	8	195446	195453	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4122	NC_018627	CAG	2	6	195457	195462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4123	NC_018627	TAAA	3	12	195477	195488	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4125	NC_018627	TAA	2	6	195627	195632	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4253	NC_018627	GTT	2	6	200503	200508	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406594533
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4270	NC_018627	ATC	2	6	201273	201278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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