MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia psittaci MN chromosome

Total Repeats: 24827

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1502	NC_018627	AGT	2	6	70638	70643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406594962
1503	NC_018627	ATA	2	6	70700	70705	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406594962
1504	NC_018627	AGG	2	6	70823	70828	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406594962
1505	NC_018627	GAA	3	9	70870	70878	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406594962
1506	NC_018627	T	7	7	70902	70908	0 %	100 %	0 %	0 %	406594962
1507	NC_018627	GGATA	2	10	70943	70952	40 %	20 %	40 %	0 %	406594962
1508	NC_018627	TTC	2	6	71013	71018	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406594962
1509	NC_018627	T	7	7	71068	71074	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_018627	A	7	7	71118	71124	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_018627	CACTT	2	10	71126	71135	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
1512	NC_018627	ATA	2	6	71234	71239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_018627	AAT	2	6	71287	71292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406594384
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1515	NC_018627	TCG	2	6	71335	71340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406594384
1516	NC_018627	TGT	2	6	71410	71415	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406594384
1517	NC_018627	TAT	2	6	71447	71452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406594384
1518	NC_018627	TGT	2	6	71515	71520	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406594384
1519	NC_018627	TCA	2	6	71628	71633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406594384
1520	NC_018627	A	6	6	71678	71683	100 %	0 %	0 %	0 %	406594384
1521	NC_018627	T	6	6	71712	71717	0 %	100 %	0 %	0 %	406594384
1522	NC_018627	A	6	6	71736	71741	100 %	0 %	0 %	0 %	406594384
1523	NC_018627	GA	3	6	71754	71759	50 %	0 %	50 %	0 %	406594384
1524	NC_018627	ATC	2	6	71831	71836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406594384
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1527	NC_018627	AAC	2	6	71902	71907	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406594384
1528	NC_018627	GT	3	6	72030	72035	0 %	50 %	50 %	0 %	406594384
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1530	NC_018627	AGA	2	6	72073	72078	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406594384
1531	NC_018627	GAA	2	6	72088	72093	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406594384
1532	NC_018627	T	6	6	72119	72124	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1533	NC_018627	ATGT	2	8	72151	72158	25 %	50 %	25 %	0 %	406594734
1534	NC_018627	TGTT	2	8	72170	72177	0 %	75 %	25 %	0 %	406594734
1535	NC_018627	T	6	6	72202	72207	0 %	100 %	0 %	0 %	406594734
1536	NC_018627	AGA	2	6	72229	72234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406594734
1537	NC_018627	T	7	7	72267	72273	0 %	100 %	0 %	0 %	406594734
1538	NC_018627	TGC	2	6	72298	72303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406594734
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1541	NC_018627	ATG	2	6	72417	72422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406594734
1542	NC_018627	ACA	2	6	72447	72452	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406594734
1543	NC_018627	TCA	2	6	72561	72566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406594734
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1545	NC_018627	ATA	3	9	72647	72655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406594734
1546	NC_018627	CAG	2	6	72664	72669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406594734
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1550	NC_018627	AGC	2	6	72906	72911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406594734
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1552	NC_018627	CCTGAT	2	12	72942	72953	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	406594734
1553	NC_018627	T	8	8	73027	73034	0 %	100 %	0 %	0 %	406594734
1554	NC_018627	T	7	7	73064	73070	0 %	100 %	0 %	0 %	406594734
1555	NC_018627	TCAT	2	8	73095	73102	25 %	50 %	0 %	25 %	406594734
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1557	NC_018627	GCA	2	6	73200	73205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406594692
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1559	NC_018627	ACG	2	6	73399	73404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406594692
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1561	NC_018627	GTAA	2	8	73540	73547	50 %	25 %	25 %	0 %	406594692
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1564	NC_018627	TAG	2	6	73676	73681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406594692
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1569	NC_018627	CAA	2	6	73979	73984	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406594692
1570	NC_018627	TTA	3	9	74086	74094	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1573	NC_018627	TTAT	2	8	74330	74337	25 %	75 %	0 %	0 %	406594765
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1593	NC_018627	CTTA	2	8	75591	75598	25 %	50 %	0 %	25 %	406593968
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1598	NC_018627	CAA	2	6	75900	75905	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406593968
1599	NC_018627	ATT	2	6	75974	75979	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406593968
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