MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia psittaci MN chromosome

Total Repeats: 24827

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_018627	T	6	6	211161	211166	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4502	NC_018627	AAT	2	6	211258	211263	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406594377
4503	NC_018627	AAGC	2	8	211273	211280	50 %	0 %	25 %	25 %	406594377
4504	NC_018627	ATT	2	6	211318	211323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406594377
4505	NC_018627	AAG	2	6	211344	211349	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406594377
4506	NC_018627	GTT	2	6	211366	211371	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406594377
4507	NC_018627	GTA	2	6	211424	211429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406594377
4508	NC_018627	GA	3	6	211458	211463	50 %	0 %	50 %	0 %	406594377
4509	NC_018627	GTAG	2	8	211745	211752	25 %	25 %	50 %	0 %	406594923
4510	NC_018627	TGA	2	6	211759	211764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406594923
4511	NC_018627	TTG	2	6	211791	211796	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406594923
4512	NC_018627	AT	3	6	211819	211824	50 %	50 %	0 %	0 %	406594923
4513	NC_018627	TTC	2	6	211830	211835	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406594923
4514	NC_018627	GTTT	2	8	211870	211877	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4515	NC_018627	T	6	6	211889	211894	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4518	NC_018627	GTT	2	6	212302	212307	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406594242
4519	NC_018627	AGG	2	6	212322	212327	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406594242
4520	NC_018627	ATT	2	6	212478	212483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406594242
4521	NC_018627	ATT	2	6	212682	212687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406594242
4522	NC_018627	GTT	2	6	212688	212693	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406594242
4523	NC_018627	TCC	2	6	212722	212727	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	406594242
4524	NC_018627	AGA	3	9	212730	212738	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406594242
4525	NC_018627	TGA	2	6	212820	212825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406594242
4526	NC_018627	TTG	2	6	212990	212995	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4527	NC_018627	ATC	2	6	213070	213075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4528	NC_018627	TGC	2	6	213186	213191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4529	NC_018627	AGC	2	6	213199	213204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4530	NC_018627	CAT	2	6	213240	213245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4531	NC_018627	AT	3	6	213244	213249	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4532	NC_018627	AAAG	2	8	213265	213272	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4533	NC_018627	TAC	2	6	213291	213296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4534	NC_018627	GGT	2	6	213345	213350	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4535	NC_018627	TCT	2	6	213469	213474	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4536	NC_018627	CATA	2	8	213542	213549	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4537	NC_018627	CCT	2	6	213601	213606	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4538	NC_018627	ATGT	2	8	213658	213665	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4539	NC_018627	ACA	2	6	213670	213675	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4540	NC_018627	GCC	2	6	213700	213705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4541	NC_018627	AAG	2	6	213710	213715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4542	NC_018627	A	7	7	213744	213750	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4543	NC_018627	T	7	7	213768	213774	0 %	100 %	0 %	0 %	406594093
4544	NC_018627	TTG	2	6	213805	213810	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406594093
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4546	NC_018627	ATG	2	6	213875	213880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406594093
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4550	NC_018627	GAAAA	2	10	214204	214213	80 %	0 %	20 %	0 %	406594093
4551	NC_018627	TGC	2	6	214227	214232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406594093
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4553	NC_018627	GTA	2	6	214296	214301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406594093
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4564	NC_018627	ACG	2	6	214697	214702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406594573
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4569	NC_018627	T	7	7	215033	215039	0 %	100 %	0 %	0 %	406594573
4570	NC_018627	TTC	2	6	215233	215238	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406594573
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4572	NC_018627	AAG	2	6	215284	215289	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4573	NC_018627	TGA	2	6	215321	215326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4575	NC_018627	T	6	6	215391	215396	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4577	NC_018627	GA	3	6	215496	215501	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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4582	NC_018627	T	6	6	215712	215717	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4585	NC_018627	TC	3	6	215861	215866	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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4590	NC_018627	GACA	2	8	216160	216167	50 %	0 %	25 %	25 %	406594228
4591	NC_018627	AG	3	6	216189	216194	50 %	0 %	50 %	0 %	406594228
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4608	NC_018627	TAG	2	6	217291	217296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406594236
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4610	NC_018627	AT	3	6	217542	217547	50 %	50 %	0 %	0 %	406594971
4611	NC_018627	AGAA	2	8	217847	217854	75 %	0 %	25 %	0 %	406594971
4612	NC_018627	TTG	2	6	217859	217864	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406594971
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4617	NC_018627	TGT	2	6	218345	218350	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406594971
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4623	NC_018627	GTTAG	2	10	218554	218563	20 %	40 %	40 %	0 %	406594971
4624	NC_018627	CTA	2	6	218578	218583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406594971
4625	NC_018627	TAAG	2	8	218622	218629	50 %	25 %	25 %	0 %	406594971
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4627	NC_018627	CTG	4	12	218768	218779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406594971
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