MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Chlamydia psittaci NJ1 chromosome

Total Repeats: 2104

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018626	TA	3	6	93	98	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018626	GT	3	6	309	314	0 %	50 %	50 %	0 %	406592922
3	NC_018626	TG	3	6	498	503	0 %	50 %	50 %	0 %	406592922
4	NC_018626	TC	3	6	727	732	0 %	50 %	0 %	50 %	406592922
5	NC_018626	AC	3	6	1295	1300	50 %	0 %	0 %	50 %	406592923
6	NC_018626	GT	3	6	1461	1466	0 %	50 %	50 %	0 %	406592923
7	NC_018626	TC	3	6	1584	1589	0 %	50 %	0 %	50 %	406592923
8	NC_018626	TG	3	6	1888	1893	0 %	50 %	50 %	0 %	406592923
9	NC_018626	GA	3	6	2786	2791	50 %	0 %	50 %	0 %	406592924
10	NC_018626	GA	3	6	3340	3345	50 %	0 %	50 %	0 %	406592925
11	NC_018626	AT	3	6	4227	4232	50 %	50 %	0 %	0 %	406592925
12	NC_018626	CT	3	6	4729	4734	0 %	50 %	0 %	50 %	406592925
13	NC_018626	CT	3	6	6469	6474	0 %	50 %	0 %	50 %	406592926
14	NC_018626	GA	3	6	6893	6898	50 %	0 %	50 %	0 %	406592928
15	NC_018626	GT	3	6	7804	7809	0 %	50 %	50 %	0 %	406592928
16	NC_018626	TC	3	6	7875	7880	0 %	50 %	0 %	50 %	406592928
17	NC_018626	AT	3	6	8464	8469	50 %	50 %	0 %	0 %	406592929
18	NC_018626	GT	3	6	8687	8692	0 %	50 %	50 %	0 %	406592929
19	NC_018626	TG	3	6	10493	10498	0 %	50 %	50 %	0 %	406592929
20	NC_018626	TC	3	6	11263	11268	0 %	50 %	0 %	50 %	406592930
21	NC_018626	AC	3	6	11279	11284	50 %	0 %	0 %	50 %	406592930
22	NC_018626	AT	3	6	11523	11528	50 %	50 %	0 %	0 %	406592930
23	NC_018626	GA	3	6	11602	11607	50 %	0 %	50 %	0 %	406592930
24	NC_018626	AG	3	6	11790	11795	50 %	0 %	50 %	0 %	406592930
25	NC_018626	TC	3	6	11843	11848	0 %	50 %	0 %	50 %	406592930
26	NC_018626	GT	3	6	12058	12063	0 %	50 %	50 %	0 %	406592930
27	NC_018626	GA	3	6	12446	12451	50 %	0 %	50 %	0 %	406592930
28	NC_018626	AG	3	6	12515	12520	50 %	0 %	50 %	0 %	406592930
29	NC_018626	GA	3	6	12586	12591	50 %	0 %	50 %	0 %	406592930
30	NC_018626	GT	3	6	12867	12872	0 %	50 %	50 %	0 %	406592930
31	NC_018626	TA	3	6	13807	13812	50 %	50 %	0 %	0 %	406592930
32	NC_018626	TA	3	6	13827	13832	50 %	50 %	0 %	0 %	406592930
33	NC_018626	AT	3	6	14111	14116	50 %	50 %	0 %	0 %	406592931
34	NC_018626	CT	3	6	14791	14796	0 %	50 %	0 %	50 %	406592931
35	NC_018626	TA	3	6	15121	15126	50 %	50 %	0 %	0 %	406592931
36	NC_018626	TG	4	8	15659	15666	0 %	50 %	50 %	0 %	406592931
37	NC_018626	AG	3	6	17698	17703	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018626	GT	3	6	19395	19400	0 %	50 %	50 %	0 %	406592936
39	NC_018626	TA	3	6	19439	19444	50 %	50 %	0 %	0 %	406592936
40	NC_018626	TC	3	6	19545	19550	0 %	50 %	0 %	50 %	406592936
41	NC_018626	GT	3	6	19674	19679	0 %	50 %	50 %	0 %	406592936
42	NC_018626	AC	3	6	20115	20120	50 %	0 %	0 %	50 %	406592936
43	NC_018626	TC	3	6	21146	21151	0 %	50 %	0 %	50 %	406592937
44	NC_018626	GA	3	6	22448	22453	50 %	0 %	50 %	0 %	406592938
45	NC_018626	GA	3	6	23671	23676	50 %	0 %	50 %	0 %	406592938
46	NC_018626	TC	3	6	25498	25503	0 %	50 %	0 %	50 %	406592939
47	NC_018626	TA	3	6	25506	25511	50 %	50 %	0 %	0 %	406592939
48	NC_018626	TA	3	6	26516	26521	50 %	50 %	0 %	0 %	406592939
49	NC_018626	AG	3	6	27216	27221	50 %	0 %	50 %	0 %	406592941
50	NC_018626	TA	3	6	27376	27381	50 %	50 %	0 %	0 %	406592941
51	NC_018626	TC	3	6	27461	27466	0 %	50 %	0 %	50 %	406592941
52	NC_018626	AC	3	6	27629	27634	50 %	0 %	0 %	50 %	406592941
53	NC_018626	TA	3	6	28053	28058	50 %	50 %	0 %	0 %	406592941
54	NC_018626	GA	3	6	28762	28767	50 %	0 %	50 %	0 %	406592941
55	NC_018626	AG	3	6	29925	29930	50 %	0 %	50 %	0 %	406592943
56	NC_018626	AG	3	6	30586	30591	50 %	0 %	50 %	0 %	406592944
57	NC_018626	GA	3	6	31108	31113	50 %	0 %	50 %	0 %	406592945
58	NC_018626	GA	4	8	31238	31245	50 %	0 %	50 %	0 %	406592945
59	NC_018626	TC	3	6	31851	31856	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_018626	GT	3	6	33081	33086	0 %	50 %	50 %	0 %	406592947
61	NC_018626	AG	3	6	34610	34615	50 %	0 %	50 %	0 %	406592950
62	NC_018626	AG	3	6	34682	34687	50 %	0 %	50 %	0 %	406592950
63	NC_018626	AT	3	6	34728	34733	50 %	50 %	0 %	0 %	406592950
64	NC_018626	TG	3	6	34817	34822	0 %	50 %	50 %	0 %	406592950
65	NC_018626	CG	3	6	35129	35134	0 %	0 %	50 %	50 %	406592950
66	NC_018626	AT	3	6	35448	35453	50 %	50 %	0 %	0 %	406592950
67	NC_018626	GA	3	6	35929	35934	50 %	0 %	50 %	0 %	406592951
68	NC_018626	TG	3	6	36853	36858	0 %	50 %	50 %	0 %	406592951
69	NC_018626	TA	3	6	37502	37507	50 %	50 %	0 %	0 %	406592951
70	NC_018626	TC	3	6	37740	37745	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_018626	GA	3	6	38472	38477	50 %	0 %	50 %	0 %	406592952
72	NC_018626	CG	3	6	38501	38506	0 %	0 %	50 %	50 %	406592952
73	NC_018626	TA	3	6	38507	38512	50 %	50 %	0 %	0 %	406592952
74	NC_018626	GC	3	6	39839	39844	0 %	0 %	50 %	50 %	406592954
75	NC_018626	AG	3	6	39850	39855	50 %	0 %	50 %	0 %	406592954
76	NC_018626	AG	3	6	40730	40735	50 %	0 %	50 %	0 %	406592955
77	NC_018626	GC	3	6	41447	41452	0 %	0 %	50 %	50 %	406592955
78	NC_018626	AT	3	6	41779	41784	50 %	50 %	0 %	0 %	406592955
79	NC_018626	CT	3	6	41889	41894	0 %	50 %	0 %	50 %	406592955
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81	NC_018626	AG	3	6	45655	45660	50 %	0 %	50 %	0 %	406592961
82	NC_018626	CA	3	6	47063	47068	50 %	0 %	0 %	50 %	406592963
83	NC_018626	TC	4	8	47822	47829	0 %	50 %	0 %	50 %	406592963
84	NC_018626	TA	3	6	48251	48256	50 %	50 %	0 %	0 %	406592964
85	NC_018626	AT	3	6	48265	48270	50 %	50 %	0 %	0 %	406592964
86	NC_018626	AT	3	6	48517	48522	50 %	50 %	0 %	0 %	406592964
87	NC_018626	CT	3	6	48574	48579	0 %	50 %	0 %	50 %	406592964
88	NC_018626	TA	3	6	48877	48882	50 %	50 %	0 %	0 %	406592964
89	NC_018626	AG	3	6	49405	49410	50 %	0 %	50 %	0 %	406592964
90	NC_018626	GC	3	6	49974	49979	0 %	0 %	50 %	50 %	406592965
91	NC_018626	TC	3	6	50379	50384	0 %	50 %	0 %	50 %	406592965
92	NC_018626	TA	3	6	50552	50557	50 %	50 %	0 %	0 %	406592965
93	NC_018626	CT	3	6	50599	50604	0 %	50 %	0 %	50 %	406592965
94	NC_018626	TA	3	6	52214	52219	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018626	GT	3	6	53104	53109	0 %	50 %	50 %	0 %	406592967
96	NC_018626	AT	3	6	53291	53296	50 %	50 %	0 %	0 %	406592967
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101	NC_018626	CA	3	6	57544	57549	50 %	0 %	0 %	50 %	406592972
102	NC_018626	AG	3	6	58520	58525	50 %	0 %	50 %	0 %	406592973
103	NC_018626	GA	3	6	59298	59303	50 %	0 %	50 %	0 %	406592973
104	NC_018626	AG	3	6	60275	60280	50 %	0 %	50 %	0 %	406592974
105	NC_018626	AG	3	6	60576	60581	50 %	0 %	50 %	0 %	406592974
106	NC_018626	GA	3	6	61820	61825	50 %	0 %	50 %	0 %	406592974
107	NC_018626	AG	3	6	62108	62113	50 %	0 %	50 %	0 %	406592974
108	NC_018626	TC	3	6	62560	62565	0 %	50 %	0 %	50 %	406592974
109	NC_018626	AG	3	6	63203	63208	50 %	0 %	50 %	0 %	406592974
110	NC_018626	TG	3	6	63276	63281	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018626	TC	3	6	64755	64760	0 %	50 %	0 %	50 %	406592976
112	NC_018626	TG	3	6	65520	65525	0 %	50 %	50 %	0 %	406592976
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114	NC_018626	GA	4	8	66546	66553	50 %	0 %	50 %	0 %	406592977
115	NC_018626	AT	3	6	67325	67330	50 %	50 %	0 %	0 %	406592978
116	NC_018626	GA	4	8	67432	67439	50 %	0 %	50 %	0 %	406592978
117	NC_018626	AG	3	6	67545	67550	50 %	0 %	50 %	0 %	406592978
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120	NC_018626	TA	3	6	68579	68584	50 %	50 %	0 %	0 %	406592979
121	NC_018626	TA	3	6	69282	69287	50 %	50 %	0 %	0 %	406592979
122	NC_018626	AG	3	6	70205	70210	50 %	0 %	50 %	0 %	406592981
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125	NC_018626	GA	3	6	74608	74613	50 %	0 %	50 %	0 %	406592986
126	NC_018626	TC	3	6	75196	75201	0 %	50 %	0 %	50 %	406592987
127	NC_018626	TC	3	6	76001	76006	0 %	50 %	0 %	50 %	406592987
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131	NC_018626	CA	3	6	76538	76543	50 %	0 %	0 %	50 %	406592988
132	NC_018626	CT	3	6	76726	76731	0 %	50 %	0 %	50 %	406592988
133	NC_018626	CG	3	6	76836	76841	0 %	0 %	50 %	50 %	406592988
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136	NC_018626	AG	3	6	79160	79165	50 %	0 %	50 %	0 %	406592989
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143	NC_018626	TG	3	6	82771	82776	0 %	50 %	50 %	0 %	406592992
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