MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia psittaci NJ1 chromosome

Total Repeats: 24752

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_018626	TA	3	6	142438	142443	50 %	50 %	0 %	0 %	406593063
3002	NC_018626	GTA	2	6	142545	142550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406593064
3003	NC_018626	AAG	2	6	142552	142557	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406593064
3004	NC_018626	CTT	2	6	142657	142662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406593064
3005	NC_018626	TTC	2	6	142679	142684	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406593064
3006	NC_018626	TCC	2	6	142826	142831	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	406593064
3007	NC_018626	TGC	2	6	142856	142861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406593064
3008	NC_018626	TTG	2	6	142876	142881	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406593064
3009	NC_018626	TTG	2	6	142945	142950	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406593064
3010	NC_018626	GTA	2	6	142969	142974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406593064
3011	NC_018626	G	6	6	142982	142987	0 %	0 %	100 %	0 %	406593064
3012	NC_018626	T	6	6	143102	143107	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3013	NC_018626	ATG	2	6	143189	143194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3014	NC_018626	TCCT	2	8	143280	143287	0 %	50 %	0 %	50 %	406593065
3015	NC_018626	GTT	2	6	143301	143306	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406593065
3016	NC_018626	AGAAA	2	10	143311	143320	80 %	0 %	20 %	0 %	406593065
3017	NC_018626	ATT	2	6	143323	143328	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406593065
3018	NC_018626	TAC	2	6	143341	143346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406593065
3019	NC_018626	TGA	2	6	143485	143490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406593065
3020	NC_018626	TAC	2	6	143520	143525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406593065
3021	NC_018626	CAG	2	6	143529	143534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406593065
3022	NC_018626	TTG	3	9	143589	143597	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406593065
3023	NC_018626	TA	3	6	143652	143657	50 %	50 %	0 %	0 %	406593065
3024	NC_018626	ATG	2	6	143760	143765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406593065
3025	NC_018626	TAT	2	6	143779	143784	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406593065
3026	NC_018626	ATT	2	6	143831	143836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406593065
3027	NC_018626	TAG	2	6	143868	143873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406593065
3028	NC_018626	TTC	2	6	143874	143879	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406593065
3029	NC_018626	GTG	2	6	143880	143885	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406593065
3030	NC_018626	AGA	2	6	143886	143891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406593065
3031	NC_018626	TTG	2	6	143897	143902	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406593065
3032	NC_018626	TTA	2	6	143996	144001	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406593066
3033	NC_018626	AAT	2	6	144033	144038	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406593066
3034	NC_018626	GAG	2	6	144062	144067	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406593066
3035	NC_018626	TCTA	2	8	144105	144112	25 %	50 %	0 %	25 %	406593066
3036	NC_018626	T	6	6	144198	144203	0 %	100 %	0 %	0 %	406593066
3037	NC_018626	TTG	2	6	144233	144238	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406593066
3038	NC_018626	ATA	2	6	144398	144403	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406593066
3039	NC_018626	CAG	2	6	144406	144411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406593066
3040	NC_018626	TAG	2	6	144416	144421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406593066
3041	NC_018626	ATCA	2	8	144456	144463	50 %	25 %	0 %	25 %	406593066
3042	NC_018626	CAA	2	6	144596	144601	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406593066
3043	NC_018626	TGT	2	6	144628	144633	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406593066
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3045	NC_018626	T	6	6	144789	144794	0 %	100 %	0 %	0 %	406593066
3046	NC_018626	AAT	2	6	144808	144813	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406593066
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3048	NC_018626	GGAA	3	12	144828	144839	50 %	0 %	50 %	0 %	406593066
3049	NC_018626	TCC	2	6	144840	144845	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	406593066
3050	NC_018626	AGTA	2	8	144861	144868	50 %	25 %	25 %	0 %	406593066
3051	NC_018626	A	7	7	144877	144883	100 %	0 %	0 %	0 %	406593066
3052	NC_018626	TAT	2	6	144954	144959	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3053	NC_018626	TAA	2	6	144961	144966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3054	NC_018626	AAT	2	6	145047	145052	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406593067
3055	NC_018626	A	7	7	145080	145086	100 %	0 %	0 %	0 %	406593067
3056	NC_018626	TAT	2	6	145144	145149	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406593067
3057	NC_018626	T	7	7	145181	145187	0 %	100 %	0 %	0 %	406593067
3058	NC_018626	T	7	7	145232	145238	0 %	100 %	0 %	0 %	406593067
3059	NC_018626	TGTC	2	8	145250	145257	0 %	50 %	25 %	25 %	406593067
3060	NC_018626	TTG	2	6	145258	145263	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406593067
3061	NC_018626	T	7	7	145295	145301	0 %	100 %	0 %	0 %	406593067
3062	NC_018626	TTTA	2	8	145340	145347	25 %	75 %	0 %	0 %	406593067
3063	NC_018626	TTG	2	6	145363	145368	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406593067
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3070	NC_018626	TCC	2	6	145691	145696	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	406593067
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3074	NC_018626	TA	3	6	145961	145966	50 %	50 %	0 %	0 %	406593067
3075	NC_018626	AAAGA	2	10	145976	145985	80 %	0 %	20 %	0 %	406593067
3076	NC_018626	AAG	2	6	145992	145997	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406593067
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3078	NC_018626	TTAT	2	8	146058	146065	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3079	NC_018626	TTAT	2	8	146093	146100	25 %	75 %	0 %	0 %	406593068
3080	NC_018626	GTAA	2	8	146114	146121	50 %	25 %	25 %	0 %	406593068
3081	NC_018626	CCT	2	6	146277	146282	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	406593068
3082	NC_018626	TATT	2	8	146298	146305	25 %	75 %	0 %	0 %	406593068
3083	NC_018626	CTTT	2	8	146351	146358	0 %	75 %	0 %	25 %	406593068
3084	NC_018626	CTT	2	6	146378	146383	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406593068
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3088	NC_018626	CTT	2	6	146563	146568	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406593069
3089	NC_018626	TTGC	2	8	146614	146621	0 %	50 %	25 %	25 %	406593069
3090	NC_018626	GAA	2	6	146628	146633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406593069
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3092	NC_018626	GAA	2	6	146679	146684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406593069
3093	NC_018626	TCT	2	6	146745	146750	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3094	NC_018626	AAG	2	6	146770	146775	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3095	NC_018626	T	6	6	146780	146785	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3096	NC_018626	TCA	2	6	146830	146835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406593070
3097	NC_018626	ATAGGC	2	12	146896	146907	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	406593070
3098	NC_018626	GAA	2	6	146974	146979	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406593070
3099	NC_018626	TGC	2	6	147034	147039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3100	NC_018626	T	6	6	147056	147061	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3101	NC_018626	TCT	2	6	147079	147084	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3102	NC_018626	CTC	2	6	147122	147127	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	406593071
3103	NC_018626	GAG	2	6	147157	147162	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406593071
3104	NC_018626	T	6	6	147166	147171	0 %	100 %	0 %	0 %	406593071
3105	NC_018626	ACA	2	6	147181	147186	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406593071
3106	NC_018626	A	6	6	147202	147207	100 %	0 %	0 %	0 %	406593071
3107	NC_018626	TTG	2	6	147223	147228	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406593071
3108	NC_018626	TGA	2	6	147264	147269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406593072
3109	NC_018626	TAC	2	6	147346	147351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406593072
3110	NC_018626	TTTA	2	8	147388	147395	25 %	75 %	0 %	0 %	406593073
3111	NC_018626	AATA	2	8	147443	147450	75 %	25 %	0 %	0 %	406593073
3112	NC_018626	AGT	2	6	147460	147465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3113	NC_018626	ATTT	3	12	147501	147512	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3114	NC_018626	T	6	6	147557	147562	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3115	NC_018626	ATT	2	6	147571	147576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3116	NC_018626	T	6	6	147581	147586	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3117	NC_018626	T	7	7	147665	147671	0 %	100 %	0 %	0 %	406593074
3118	NC_018626	ACA	2	6	147681	147686	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406593074
3119	NC_018626	A	6	6	147702	147707	100 %	0 %	0 %	0 %	406593074
3120	NC_018626	CTT	2	6	147720	147725	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406593074
3121	NC_018626	CTT	2	6	147730	147735	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406593074
3122	NC_018626	TGA	2	6	147764	147769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406593075
3123	NC_018626	AAGTAA	2	12	147778	147789	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	406593075
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3125	NC_018626	CAT	3	9	147846	147854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406593075
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3128	NC_018626	CAT	2	6	147911	147916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3135	NC_018626	T	6	6	148316	148321	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3142	NC_018626	TTG	2	6	148664	148669	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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