MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia psittaci NJ1 chromosome

Total Repeats: 24752

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_018626	A	6	6	118243	118248	100 %	0 %	0 %	0 %	406593039
2502	NC_018626	AAGG	2	8	118259	118266	50 %	0 %	50 %	0 %	406593039
2503	NC_018626	TAC	2	6	118303	118308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2504	NC_018626	CAT	2	6	118336	118341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406593040
2505	NC_018626	GAA	2	6	118360	118365	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406593040
2506	NC_018626	A	6	6	118364	118369	100 %	0 %	0 %	0 %	406593040
2507	NC_018626	AT	3	6	118387	118392	50 %	50 %	0 %	0 %	406593040
2508	NC_018626	ATT	2	6	118424	118429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406593040
2509	NC_018626	GCT	2	6	118460	118465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406593040
2510	NC_018626	GGA	3	9	118474	118482	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406593040
2511	NC_018626	GCC	2	6	118488	118493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406593040
2512	NC_018626	TC	3	6	118499	118504	0 %	50 %	0 %	50 %	406593040
2513	NC_018626	CGT	2	6	118541	118546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406593040
2514	NC_018626	AAG	2	6	118685	118690	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406593040
2515	NC_018626	T	7	7	118697	118703	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2516	NC_018626	A	6	6	118738	118743	100 %	0 %	0 %	0 %	406593041
2517	NC_018626	GTT	2	6	118783	118788	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406593041
2518	NC_018626	CAA	2	6	118806	118811	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406593041
2519	NC_018626	GTC	2	6	118896	118901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406593041
2520	NC_018626	TGC	2	6	118908	118913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406593041
2521	NC_018626	GT	3	6	118975	118980	0 %	50 %	50 %	0 %	406593041
2522	NC_018626	GTT	2	6	119041	119046	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406593041
2523	NC_018626	GAG	2	6	119124	119129	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2524	NC_018626	TTTAC	2	10	119156	119165	20 %	60 %	0 %	20 %	406593042
2525	NC_018626	AGTC	2	8	119185	119192	25 %	25 %	25 %	25 %	406593042
2526	NC_018626	ATG	2	6	119196	119201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406593042
2527	NC_018626	ATT	2	6	119334	119339	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406593042
2528	NC_018626	AGA	2	6	119393	119398	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406593042
2529	NC_018626	ATC	2	6	119409	119414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406593042
2530	NC_018626	TTA	2	6	119433	119438	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406593042
2531	NC_018626	ATT	2	6	119483	119488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406593042
2532	NC_018626	TGG	2	6	119531	119536	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406593042
2533	NC_018626	AAG	2	6	119569	119574	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406593042
2534	NC_018626	TAC	2	6	119672	119677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406593042
2535	NC_018626	CGT	2	6	119744	119749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406593042
2536	NC_018626	AGA	2	6	119768	119773	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406593042
2537	NC_018626	AAG	2	6	119848	119853	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406593042
2538	NC_018626	A	6	6	119902	119907	100 %	0 %	0 %	0 %	406593042
2539	NC_018626	GAA	2	6	119915	119920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406593042
2540	NC_018626	TTC	2	6	119971	119976	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406593042
2541	NC_018626	AGTT	2	8	119980	119987	25 %	50 %	25 %	0 %	406593042
2542	NC_018626	TTGT	2	8	120029	120036	0 %	75 %	25 %	0 %	406593042
2543	NC_018626	TTA	2	6	120070	120075	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406593042
2544	NC_018626	A	6	6	120214	120219	100 %	0 %	0 %	0 %	406593042
2545	NC_018626	AGAA	2	8	120287	120294	75 %	0 %	25 %	0 %	406593043
2546	NC_018626	CCA	2	6	120361	120366	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406593043
2547	NC_018626	AGAA	2	8	120367	120374	75 %	0 %	25 %	0 %	406593043
2548	NC_018626	ACT	2	6	120380	120385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406593043
2549	NC_018626	CGT	2	6	120407	120412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406593043
2550	NC_018626	GAT	2	6	120424	120429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406593043
2551	NC_018626	AAG	2	6	120513	120518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406593043
2552	NC_018626	GGT	2	6	120533	120538	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406593043
2553	NC_018626	TGG	2	6	120619	120624	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406593043
2554	NC_018626	TAT	2	6	120679	120684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406593043
2555	NC_018626	T	8	8	120708	120715	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2556	NC_018626	ACT	2	6	120725	120730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2557	NC_018626	TTC	2	6	120810	120815	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406593044
2558	NC_018626	CAG	2	6	120902	120907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406593044
2559	NC_018626	TTG	2	6	120932	120937	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406593044
2560	NC_018626	A	6	6	121042	121047	100 %	0 %	0 %	0 %	406593044
2561	NC_018626	TAC	2	6	121194	121199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406593044
2562	NC_018626	AGA	2	6	121248	121253	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406593044
2563	NC_018626	ACC	2	6	121264	121269	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406593044
2564	NC_018626	CGC	2	6	121275	121280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406593044
2565	NC_018626	CA	3	6	121287	121292	50 %	0 %	0 %	50 %	406593044
2566	NC_018626	A	7	7	121314	121320	100 %	0 %	0 %	0 %	406593044
2567	NC_018626	GAA	2	6	121504	121509	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406593044
2568	NC_018626	GTT	2	6	121519	121524	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406593044
2569	NC_018626	AAG	2	6	121526	121531	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406593044
2570	NC_018626	AAG	2	6	121574	121579	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406593044
2571	NC_018626	TCT	2	6	121585	121590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406593044
2572	NC_018626	TTC	2	6	121611	121616	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406593044
2573	NC_018626	TTA	2	6	121717	121722	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406593044
2574	NC_018626	TAAA	2	8	121743	121750	75 %	25 %	0 %	0 %	406593044
2575	NC_018626	AGC	2	6	121841	121846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406593045
2576	NC_018626	TGT	2	6	121863	121868	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406593045
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2578	NC_018626	CTG	2	6	121946	121951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406593045
2579	NC_018626	AATTA	2	10	122049	122058	60 %	40 %	0 %	0 %	406593045
2580	NC_018626	AGC	2	6	122064	122069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406593045
2581	NC_018626	GAA	2	6	122086	122091	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406593045
2582	NC_018626	CTC	2	6	122120	122125	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	406593045
2583	NC_018626	CTG	2	6	122135	122140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406593045
2584	NC_018626	CTC	2	6	122147	122152	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	406593045
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2586	NC_018626	A	7	7	122224	122230	100 %	0 %	0 %	0 %	406593045
2587	NC_018626	TAA	2	6	122232	122237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406593045
2588	NC_018626	AGT	2	6	122250	122255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406593045
2589	NC_018626	ATC	2	6	122259	122264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406593045
2590	NC_018626	ATT	2	6	122272	122277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406593045
2591	NC_018626	GAA	2	6	122290	122295	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406593045
2592	NC_018626	GAA	2	6	122302	122307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406593045
2593	NC_018626	AAAT	2	8	122316	122323	75 %	25 %	0 %	0 %	406593045
2594	NC_018626	AGA	2	6	122333	122338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406593045
2595	NC_018626	CCT	2	6	122353	122358	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	406593045
2596	NC_018626	AATT	2	8	122366	122373	50 %	50 %	0 %	0 %	406593045
2597	NC_018626	ATT	2	6	122500	122505	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406593045
2598	NC_018626	GAA	3	9	122512	122520	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406593045
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2601	NC_018626	TCT	2	6	122609	122614	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2602	NC_018626	T	6	6	122674	122679	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2603	NC_018626	ATTT	2	8	122723	122730	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2604	NC_018626	AAT	2	6	122735	122740	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2605	NC_018626	ATT	2	6	122755	122760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2606	NC_018626	TGG	2	6	122768	122773	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2607	NC_018626	CTTTT	2	10	122845	122854	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
2608	NC_018626	AAAG	2	8	122898	122905	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2609	NC_018626	T	6	6	122914	122919	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2610	NC_018626	T	6	6	122932	122937	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2611	NC_018626	T	6	6	122985	122990	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2612	NC_018626	TTTCTT	2	12	123003	123014	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2613	NC_018626	TAAT	2	8	123067	123074	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2614	NC_018626	GCG	2	6	123093	123098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2615	NC_018626	TTC	3	9	123156	123164	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2616	NC_018626	AT	3	6	123178	123183	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2617	NC_018626	AAC	2	6	123287	123292	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406593046
2618	NC_018626	AGCA	2	8	123317	123324	50 %	0 %	25 %	25 %	406593046
2619	NC_018626	TCCT	2	8	123326	123333	0 %	50 %	0 %	50 %	406593046
2620	NC_018626	AGAA	2	8	123383	123390	75 %	0 %	25 %	0 %	406593046
2621	NC_018626	GAGAT	2	10	123401	123410	40 %	20 %	40 %	0 %	406593046
2622	NC_018626	ACA	2	6	123456	123461	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406593046
2623	NC_018626	CAA	2	6	123481	123486	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406593046
2624	NC_018626	TGA	2	6	123510	123515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406593046
2625	NC_018626	CAA	2	6	123544	123549	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406593046
2626	NC_018626	AAG	2	6	123710	123715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406593046
2627	NC_018626	TAC	2	6	123745	123750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406593046
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2629	NC_018626	TTG	2	6	123848	123853	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406593046
2630	NC_018626	TA	4	8	124024	124031	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2631	NC_018626	TTG	2	6	124161	124166	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406593047
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2641	NC_018626	GTCAA	2	10	124719	124728	40 %	20 %	20 %	20 %	406593048
2642	NC_018626	TATACT	2	12	124750	124761	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	406593048
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2655	NC_018626	TAC	2	6	125268	125273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2657	NC_018626	TA	4	8	125291	125298	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2658	NC_018626	ATT	2	6	125360	125365	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406593049
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2664	NC_018626	CTG	2	6	125715	125720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406593049
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2743	NC_018626	GA	4	8	129657	129664	50 %	0 %	50 %	0 %	406593052
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2759	NC_018626	AT	3	6	130205	130210	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2873	NC_018626	TAAAA	2	10	135695	135704	80 %	20 %	0 %	0 %	406593056
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2998	NC_018626	AGT	2	6	142285	142290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406593063
2999	NC_018626	GTAC	2	8	142372	142379	25 %	25 %	25 %	25 %	406593063
3000	NC_018626	GCT	2	6	142429	142434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406593063

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