MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia psittaci NJ1 chromosome

Total Repeats: 24752

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_018626	GTT	2	6	45718	45723	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406592961
1003	NC_018626	GAA	4	12	45739	45750	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406592961
1004	NC_018626	AGC	2	6	45780	45785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406592961
1005	NC_018626	AGA	3	9	45834	45842	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406592961
1006	NC_018626	AGA	2	6	45861	45866	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406592961
1007	NC_018626	AAG	2	6	45875	45880	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406592961
1008	NC_018626	AGA	2	6	45888	45893	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406592961
1009	NC_018626	A	9	9	45952	45960	100 %	0 %	0 %	0 %	406592961
1010	NC_018626	TAAA	2	8	45994	46001	75 %	25 %	0 %	0 %	406592961
1011	NC_018626	CAC	2	6	46035	46040	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406592962
1012	NC_018626	ACA	2	6	46046	46051	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406592962
1013	NC_018626	TCTTT	2	10	46093	46102	0 %	80 %	0 %	20 %	406592962
1014	NC_018626	CAA	2	6	46113	46118	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406592962
1015	NC_018626	ACT	2	6	46143	46148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406592962
1016	NC_018626	AAG	2	6	46165	46170	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406592962
1017	NC_018626	GTG	2	6	46174	46179	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406592962
1018	NC_018626	TGA	2	6	46181	46186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406592962
1019	NC_018626	AGA	2	6	46196	46201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406592962
1020	NC_018626	TCT	2	6	46218	46223	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406592962
1021	NC_018626	AGA	3	9	46226	46234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406592962
1022	NC_018626	AGA	2	6	46238	46243	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406592962
1023	NC_018626	CAG	2	6	46276	46281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406592962
1024	NC_018626	GTT	2	6	46323	46328	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406592962
1025	NC_018626	CAG	2	6	46431	46436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406592962
1026	NC_018626	TAG	2	6	46438	46443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406592962
1027	NC_018626	GAT	2	6	46551	46556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406592962
1028	NC_018626	AAT	2	6	46590	46595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406592962
1029	NC_018626	A	6	6	46628	46633	100 %	0 %	0 %	0 %	406592962
1030	NC_018626	GAA	2	6	46695	46700	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406592962
1031	NC_018626	TGC	2	6	46724	46729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406592962
1032	NC_018626	AAG	2	6	46762	46767	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406592962
1033	NC_018626	CAG	4	12	46776	46787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406592962
1034	NC_018626	GAA	2	6	46818	46823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406592962
1035	NC_018626	AGC	2	6	46856	46861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406592963
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1037	NC_018626	GAAA	2	8	46976	46983	75 %	0 %	25 %	0 %	406592963
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1039	NC_018626	CTG	2	6	47035	47040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406592963
1040	NC_018626	CA	3	6	47063	47068	50 %	0 %	0 %	50 %	406592963
1041	NC_018626	TCTT	2	8	47082	47089	0 %	75 %	0 %	25 %	406592963
1042	NC_018626	AGCCC	2	10	47090	47099	20 %	0 %	20 %	60 %	406592963
1043	NC_018626	TCAAA	2	10	47445	47454	60 %	20 %	0 %	20 %	406592963
1044	NC_018626	TCA	2	6	47465	47470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406592963
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1051	NC_018626	TTG	2	6	47653	47658	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406592963
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1053	NC_018626	GAA	2	6	47721	47726	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406592963
1054	NC_018626	GCA	2	6	47745	47750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406592963
1055	NC_018626	TAG	2	6	47773	47778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406592963
1056	NC_018626	TC	4	8	47822	47829	0 %	50 %	0 %	50 %	406592963
1057	NC_018626	AAGA	2	8	48053	48060	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_018626	AAG	2	6	48171	48176	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406592964
1059	NC_018626	ATT	2	6	48182	48187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406592964
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1061	NC_018626	AT	3	6	48265	48270	50 %	50 %	0 %	0 %	406592964
1062	NC_018626	AAATCA	2	12	48435	48446	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	406592964
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1064	NC_018626	AT	3	6	48517	48522	50 %	50 %	0 %	0 %	406592964
1065	NC_018626	AAC	2	6	48531	48536	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406592964
1066	NC_018626	CT	3	6	48574	48579	0 %	50 %	0 %	50 %	406592964
1067	NC_018626	TAA	2	6	48778	48783	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406592964
1068	NC_018626	AGC	2	6	48807	48812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406592964
1069	NC_018626	CAG	2	6	48818	48823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406592964
1070	NC_018626	TTG	2	6	48849	48854	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406592964
1071	NC_018626	CTT	2	6	48862	48867	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406592964
1072	NC_018626	TA	3	6	48877	48882	50 %	50 %	0 %	0 %	406592964
1073	NC_018626	TAC	2	6	48914	48919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406592964
1074	NC_018626	TAT	2	6	48997	49002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406592964
1075	NC_018626	A	7	7	49140	49146	100 %	0 %	0 %	0 %	406592964
1076	NC_018626	A	7	7	49189	49195	100 %	0 %	0 %	0 %	406592964
1077	NC_018626	TAC	2	6	49219	49224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406592964
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1081	NC_018626	A	6	6	49540	49545	100 %	0 %	0 %	0 %	406592965
1082	NC_018626	TCTAT	2	10	49564	49573	20 %	60 %	0 %	20 %	406592965
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1085	NC_018626	A	7	7	49716	49722	100 %	0 %	0 %	0 %	406592965
1086	NC_018626	AAGC	2	8	49729	49736	50 %	0 %	25 %	25 %	406592965
1087	NC_018626	CCAA	2	8	49753	49760	50 %	0 %	0 %	50 %	406592965
1088	NC_018626	A	6	6	49777	49782	100 %	0 %	0 %	0 %	406592965
1089	NC_018626	A	7	7	49842	49848	100 %	0 %	0 %	0 %	406592965
1090	NC_018626	A	6	6	49884	49889	100 %	0 %	0 %	0 %	406592965
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1096	NC_018626	A	6	6	50020	50025	100 %	0 %	0 %	0 %	406592965
1097	NC_018626	AGA	2	6	50031	50036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406592965
1098	NC_018626	AAG	3	9	50057	50065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406592965
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1101	NC_018626	AAG	3	9	50171	50179	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406592965
1102	NC_018626	TTA	2	6	50272	50277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406592965
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1104	NC_018626	TGT	2	6	50526	50531	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406592965
1105	NC_018626	TA	3	6	50552	50557	50 %	50 %	0 %	0 %	406592965
1106	NC_018626	ATT	2	6	50584	50589	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406592965
1107	NC_018626	CT	3	6	50599	50604	0 %	50 %	0 %	50 %	406592965
1108	NC_018626	ATG	2	6	50606	50611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406592965
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1110	NC_018626	TCC	2	6	50863	50868	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	406592965
1111	NC_018626	AACA	2	8	50877	50884	75 %	0 %	0 %	25 %	406592965
1112	NC_018626	ACT	2	6	50895	50900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406592965
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1118	NC_018626	AGT	2	6	51189	51194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406592965
1119	NC_018626	TGA	2	6	51309	51314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406592965
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1121	NC_018626	ATG	2	6	51457	51462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406592965
1122	NC_018626	TTTGG	2	10	51478	51487	0 %	60 %	40 %	0 %	406592965
1123	NC_018626	CTC	2	6	51544	51549	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	406592965
1124	NC_018626	CAA	2	6	51616	51621	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406592965
1125	NC_018626	CAT	2	6	51623	51628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406592965
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