MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia psittaci NJ1 chromosome

Total Repeats: 24752

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_018626	ACA	2	6	23017	23022	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406592938
502	NC_018626	ACA	2	6	23037	23042	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406592938
503	NC_018626	AAG	2	6	23051	23056	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406592938
504	NC_018626	AAG	2	6	23078	23083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406592938
505	NC_018626	AAC	2	6	23109	23114	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406592938
506	NC_018626	GGT	2	6	23161	23166	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406592938
507	NC_018626	AGC	2	6	23177	23182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406592938
508	NC_018626	ATG	2	6	23267	23272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406592938
509	NC_018626	AGC	2	6	23284	23289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406592938
510	NC_018626	GCT	2	6	23290	23295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406592938
511	NC_018626	CTG	2	6	23381	23386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406592938
512	NC_018626	ATG	2	6	23582	23587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406592938
513	NC_018626	AAG	2	6	23657	23662	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406592938
514	NC_018626	GA	3	6	23671	23676	50 %	0 %	50 %	0 %	406592938
515	NC_018626	TTC	2	6	23790	23795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
516	NC_018626	T	7	7	23804	23810	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_018626	A	7	7	23888	23894	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_018626	AGA	2	6	23904	23909	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
519	NC_018626	TTG	2	6	24014	24019	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406592939
520	NC_018626	CTG	2	6	24050	24055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406592939
521	NC_018626	TGTC	2	8	24056	24063	0 %	50 %	25 %	25 %	406592939
522	NC_018626	AGT	2	6	24068	24073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406592939
523	NC_018626	TTG	2	6	24080	24085	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406592939
524	NC_018626	TCC	2	6	24119	24124	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	406592939
525	NC_018626	AGCT	2	8	24169	24176	25 %	25 %	25 %	25 %	406592939
526	NC_018626	TTG	2	6	24356	24361	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406592939
527	NC_018626	GAA	2	6	24366	24371	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406592939
528	NC_018626	T	6	6	24383	24388	0 %	100 %	0 %	0 %	406592939
529	NC_018626	AAAT	2	8	24506	24513	75 %	25 %	0 %	0 %	406592939
530	NC_018626	CTT	2	6	24520	24525	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406592939
531	NC_018626	AGG	2	6	24541	24546	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406592939
532	NC_018626	GTA	2	6	24554	24559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406592939
533	NC_018626	GCA	2	6	24615	24620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406592939
534	NC_018626	TTA	2	6	24624	24629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406592939
535	NC_018626	AATT	2	8	24631	24638	50 %	50 %	0 %	0 %	406592939
536	NC_018626	ATAA	2	8	24698	24705	75 %	25 %	0 %	0 %	406592939
537	NC_018626	CAG	2	6	24745	24750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406592939
538	NC_018626	T	8	8	24800	24807	0 %	100 %	0 %	0 %	406592939
539	NC_018626	TGT	2	6	24822	24827	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406592939
540	NC_018626	GCT	2	6	24852	24857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406592939
541	NC_018626	TAGT	2	8	24987	24994	25 %	50 %	25 %	0 %	406592939
542	NC_018626	TTG	2	6	25012	25017	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406592939
543	NC_018626	TTG	2	6	25022	25027	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406592939
544	NC_018626	ATT	2	6	25115	25120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406592939
545	NC_018626	ATT	2	6	25277	25282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406592939
546	NC_018626	AGC	2	6	25378	25383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406592939
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548	NC_018626	GAAC	2	8	25446	25453	50 %	0 %	25 %	25 %	406592939
549	NC_018626	TC	3	6	25498	25503	0 %	50 %	0 %	50 %	406592939
550	NC_018626	TA	3	6	25506	25511	50 %	50 %	0 %	0 %	406592939
551	NC_018626	GCA	2	6	25512	25517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406592939
552	NC_018626	TAG	2	6	25552	25557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406592939
553	NC_018626	AAC	2	6	25646	25651	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406592939
554	NC_018626	TTC	3	9	25652	25660	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406592939
555	NC_018626	TCC	2	6	25661	25666	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	406592939
556	NC_018626	TTA	2	6	25680	25685	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406592939
557	NC_018626	TCA	2	6	25798	25803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406592939
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559	NC_018626	TGG	2	6	25825	25830	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406592939
560	NC_018626	CTT	2	6	25850	25855	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406592939
561	NC_018626	A	6	6	25868	25873	100 %	0 %	0 %	0 %	406592939
562	NC_018626	TTC	2	6	25898	25903	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406592939
563	NC_018626	TCT	3	9	25920	25928	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406592939
564	NC_018626	TCA	2	6	25983	25988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406592939
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566	NC_018626	TCT	2	6	26023	26028	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406592939
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568	NC_018626	T	6	6	26054	26059	0 %	100 %	0 %	0 %	406592939
569	NC_018626	TCC	2	6	26064	26069	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	406592939
570	NC_018626	GATA	2	8	26111	26118	50 %	25 %	25 %	0 %	406592939
571	NC_018626	TGT	2	6	26213	26218	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406592939
572	NC_018626	TTC	2	6	26240	26245	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406592939
573	NC_018626	AGG	2	6	26297	26302	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406592939
574	NC_018626	GTT	2	6	26318	26323	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406592939
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578	NC_018626	AGA	2	6	26525	26530	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406592939
579	NC_018626	ATT	2	6	26538	26543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
580	NC_018626	T	7	7	26581	26587	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
581	NC_018626	TTC	2	6	26617	26622	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406592940
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583	NC_018626	ATTA	2	8	26669	26676	50 %	50 %	0 %	0 %	406592940
584	NC_018626	TTA	2	6	26700	26705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406592940
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587	NC_018626	TTA	2	6	26826	26831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406592941
588	NC_018626	TGA	2	6	26912	26917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406592941
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592	NC_018626	A	6	6	27150	27155	100 %	0 %	0 %	0 %	406592941
593	NC_018626	CTGG	2	8	27189	27196	0 %	25 %	50 %	25 %	406592941
594	NC_018626	AG	3	6	27216	27221	50 %	0 %	50 %	0 %	406592941
595	NC_018626	G	6	6	27221	27226	0 %	0 %	100 %	0 %	406592941
596	NC_018626	AAG	2	6	27277	27282	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406592941
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599	NC_018626	TA	3	6	27376	27381	50 %	50 %	0 %	0 %	406592941
600	NC_018626	AAG	2	6	27390	27395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406592941
601	NC_018626	TCT	2	6	27417	27422	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406592941
602	NC_018626	GGT	2	6	27432	27437	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406592941
603	NC_018626	TC	3	6	27461	27466	0 %	50 %	0 %	50 %	406592941
604	NC_018626	AGA	3	9	27566	27574	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406592941
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607	NC_018626	AATC	2	8	27725	27732	50 %	25 %	0 %	25 %	406592941
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610	NC_018626	TCA	2	6	27824	27829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406592941
611	NC_018626	CAG	2	6	27920	27925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406592941
612	NC_018626	CGC	2	6	27926	27931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406592941
613	NC_018626	AATT	2	8	27962	27969	50 %	50 %	0 %	0 %	406592941
614	NC_018626	CAA	2	6	27996	28001	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406592941
615	NC_018626	TAA	2	6	28010	28015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406592941
616	NC_018626	TA	3	6	28053	28058	50 %	50 %	0 %	0 %	406592941
617	NC_018626	TTG	2	6	28078	28083	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406592941
618	NC_018626	CTA	2	6	28099	28104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406592941
619	NC_018626	ACA	2	6	28107	28112	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406592941
620	NC_018626	AGC	2	6	28148	28153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406592941
621	NC_018626	GAAA	2	8	28154	28161	75 %	0 %	25 %	0 %	406592941
622	NC_018626	GAC	2	6	28199	28204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406592941
623	NC_018626	TAA	4	12	28247	28258	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406592941
624	NC_018626	CAA	2	6	28290	28295	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406592941
625	NC_018626	GCA	2	6	28368	28373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406592941
626	NC_018626	T	6	6	28616	28621	0 %	100 %	0 %	0 %	406592941
627	NC_018626	GCT	2	6	28710	28715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406592941
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