MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia psittaci NJ1 chromosome

Total Repeats: 24752

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5502	NC_018626	TTC	2	6	259461	259466	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406593179
5503	NC_018626	AAT	2	6	259518	259523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406593179
5504	NC_018626	GTT	2	6	259616	259621	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406593179
5505	NC_018626	AAG	2	6	259633	259638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406593179
5506	NC_018626	A	6	6	259838	259843	100 %	0 %	0 %	0 %	406593180
5507	NC_018626	TTTAA	2	10	259961	259970	40 %	60 %	0 %	0 %	406593180
5508	NC_018626	ATC	2	6	259990	259995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406593180
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5510	NC_018626	CAG	2	6	260043	260048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406593180
5511	NC_018626	CTT	2	6	260049	260054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406593180
5512	NC_018626	ATC	2	6	260131	260136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406593180
5513	NC_018626	GTT	2	6	260142	260147	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406593180
5514	NC_018626	ATGC	2	8	260150	260157	25 %	25 %	25 %	25 %	406593180
5515	NC_018626	TTG	2	6	260318	260323	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406593180
5516	NC_018626	AAG	2	6	260353	260358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406593180
5517	NC_018626	GGA	2	6	260696	260701	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406593180
5518	NC_018626	CTT	2	6	260754	260759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406593180
5519	NC_018626	CGTA	2	8	260781	260788	25 %	25 %	25 %	25 %	406593180
5520	NC_018626	GCT	2	6	260810	260815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406593180
5521	NC_018626	TCT	2	6	260855	260860	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406593180
5522	NC_018626	TTC	2	6	260884	260889	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406593180
5523	NC_018626	TCC	2	6	260911	260916	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	406593180
5524	NC_018626	TTCA	2	8	260995	261002	25 %	50 %	0 %	25 %	406593180
5525	NC_018626	TCC	2	6	261035	261040	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	406593180
5526	NC_018626	ATCTC	2	10	261083	261092	20 %	40 %	0 %	40 %	406593180
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5529	NC_018626	GT	3	6	261181	261186	0 %	50 %	50 %	0 %	406593180
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5534	NC_018626	AAT	2	6	261346	261351	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406593180
5535	NC_018626	CAT	2	6	261355	261360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406593180
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5537	NC_018626	GTGTAA	2	12	261389	261400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406593180
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5540	NC_018626	T	6	6	261541	261546	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5541	NC_018626	GT	3	6	261564	261569	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5542	NC_018626	A	6	6	261708	261713	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5543	NC_018626	ATATAA	2	12	261729	261740	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5544	NC_018626	T	6	6	261757	261762	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5545	NC_018626	AGA	2	6	261829	261834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406593181
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5547	NC_018626	TGC	2	6	261955	261960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406593181
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5549	NC_018626	AG	3	6	262094	262099	50 %	0 %	50 %	0 %	406593181
5550	NC_018626	TGA	2	6	262168	262173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406593181
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5552	NC_018626	TGA	2	6	262246	262251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406593181
5553	NC_018626	CGT	2	6	262286	262291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406593181
5554	NC_018626	AG	3	6	262327	262332	50 %	0 %	50 %	0 %	406593181
5555	NC_018626	TTA	2	6	262346	262351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406593181
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5559	NC_018626	GCG	2	6	262592	262597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406593181
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5564	NC_018626	CTT	3	9	262833	262841	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406593181
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5570	NC_018626	TAAA	2	8	262971	262978	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5571	NC_018626	ATT	2	6	262984	262989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5572	NC_018626	GTT	2	6	263005	263010	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5573	NC_018626	T	8	8	263009	263016	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5574	NC_018626	TTTA	2	8	263067	263074	25 %	75 %	0 %	0 %	406593182
5575	NC_018626	CGCT	2	8	263092	263099	0 %	25 %	25 %	50 %	406593182
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5585	NC_018626	TGT	2	6	263415	263420	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406593182
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5594	NC_018626	GTT	2	6	263671	263676	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406593182
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5599	NC_018626	TATTT	2	10	263814	263823	20 %	80 %	0 %	0 %	406593182
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5603	NC_018626	AAAGG	2	10	264137	264146	60 %	0 %	40 %	0 %	406593183
5604	NC_018626	GA	3	6	264219	264224	50 %	0 %	50 %	0 %	406593183
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5607	NC_018626	GA	3	6	264283	264288	50 %	0 %	50 %	0 %	406593183
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5613	NC_018626	GGT	2	6	264522	264527	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406593184
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5623	NC_018626	T	6	6	264949	264954	0 %	100 %	0 %	0 %	406593184
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