MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia psittaci NJ1 chromosome

Total Repeats: 24752

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_018626	GTT	2	6	235771	235776	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406593154
5002	NC_018626	TGA	2	6	235782	235787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406593154
5003	NC_018626	AC	3	6	235917	235922	50 %	0 %	0 %	50 %	406593154
5004	NC_018626	T	6	6	235928	235933	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5005	NC_018626	T	7	7	236020	236026	0 %	100 %	0 %	0 %	406593155
5006	NC_018626	ATC	2	6	236076	236081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406593155
5007	NC_018626	T	7	7	236093	236099	0 %	100 %	0 %	0 %	406593155
5008	NC_018626	GC	3	6	236164	236169	0 %	0 %	50 %	50 %	406593155
5009	NC_018626	GTCC	2	8	236216	236223	0 %	25 %	25 %	50 %	406593155
5010	NC_018626	GTCT	2	8	236234	236241	0 %	50 %	25 %	25 %	406593155
5011	NC_018626	T	6	6	236241	236246	0 %	100 %	0 %	0 %	406593155
5012	NC_018626	CTTA	2	8	236286	236293	25 %	50 %	0 %	25 %	406593155
5013	NC_018626	GAA	2	6	236387	236392	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406593155
5014	NC_018626	ACA	2	6	236417	236422	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406593155
5015	NC_018626	CAA	2	6	236424	236429	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406593155
5016	NC_018626	ACT	2	6	236437	236442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406593155
5017	NC_018626	TCT	2	6	236452	236457	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406593155
5018	NC_018626	TTA	2	6	236468	236473	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406593155
5019	NC_018626	GTA	2	6	236475	236480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406593155
5020	NC_018626	TC	4	8	236487	236494	0 %	50 %	0 %	50 %	406593155
5021	NC_018626	ATC	2	6	236511	236516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406593155
5022	NC_018626	TCT	2	6	236633	236638	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406593155
5023	NC_018626	TG	4	8	236651	236658	0 %	50 %	50 %	0 %	406593155
5024	NC_018626	TC	4	8	236743	236750	0 %	50 %	0 %	50 %	406593155
5025	NC_018626	CTT	2	6	236810	236815	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406593155
5026	NC_018626	ATG	2	6	236825	236830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406593155
5027	NC_018626	TGT	2	6	236860	236865	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406593155
5028	NC_018626	TGG	2	6	236889	236894	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406593155
5029	NC_018626	AG	3	6	236956	236961	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5030	NC_018626	AT	3	6	237026	237031	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5031	NC_018626	CTA	2	6	237135	237140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5032	NC_018626	CGA	2	6	237373	237378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406593156
5033	NC_018626	TGC	2	6	237384	237389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406593156
5034	NC_018626	T	6	6	237468	237473	0 %	100 %	0 %	0 %	406593156
5035	NC_018626	AAC	3	9	237543	237551	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406593156
5036	NC_018626	T	6	6	237558	237563	0 %	100 %	0 %	0 %	406593156
5037	NC_018626	GTT	2	6	237564	237569	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406593156
5038	NC_018626	TAA	2	6	237570	237575	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406593156
5039	NC_018626	TGC	2	6	237631	237636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406593156
5040	NC_018626	CTT	2	6	237650	237655	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406593156
5041	NC_018626	ACT	2	6	237702	237707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406593156
5042	NC_018626	CTTT	2	8	237727	237734	0 %	75 %	0 %	25 %	406593156
5043	NC_018626	TGC	2	6	237819	237824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406593156
5044	NC_018626	CATC	2	8	237854	237861	25 %	25 %	0 %	50 %	406593156
5045	NC_018626	GCT	2	6	237871	237876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406593156
5046	NC_018626	CTT	2	6	237932	237937	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406593156
5047	NC_018626	CGA	2	6	237988	237993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406593156
5048	NC_018626	CATG	2	8	238112	238119	25 %	25 %	25 %	25 %	406593156
5049	NC_018626	CTTG	2	8	238130	238137	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5050	NC_018626	GAAT	2	8	238181	238188	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5051	NC_018626	GAA	3	9	238195	238203	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5052	NC_018626	T	6	6	238218	238223	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5053	NC_018626	AAG	2	6	238227	238232	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5054	NC_018626	T	7	7	238242	238248	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5055	NC_018626	AAG	2	6	238281	238286	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5056	NC_018626	ACC	2	6	238300	238305	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5057	NC_018626	AATT	2	8	238320	238327	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5058	NC_018626	GAT	2	6	238361	238366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5059	NC_018626	TTTC	2	8	238420	238427	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5060	NC_018626	GTT	2	6	238448	238453	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5061	NC_018626	A	8	8	238488	238495	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5062	NC_018626	AGA	2	6	238530	238535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5063	NC_018626	GAG	2	6	238616	238621	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406593157
5064	NC_018626	T	6	6	238676	238681	0 %	100 %	0 %	0 %	406593157
5065	NC_018626	GTT	2	6	238732	238737	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406593157
5066	NC_018626	CT	3	6	238739	238744	0 %	50 %	0 %	50 %	406593157
5067	NC_018626	AGC	2	6	238792	238797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406593157
5068	NC_018626	TTG	2	6	238800	238805	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406593157
5069	NC_018626	CTC	2	6	238889	238894	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	406593157
5070	NC_018626	CTTT	2	8	238935	238942	0 %	75 %	0 %	25 %	406593157
5071	NC_018626	T	6	6	238940	238945	0 %	100 %	0 %	0 %	406593157
5072	NC_018626	AGA	2	6	239092	239097	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406593157
5073	NC_018626	GATT	2	8	239103	239110	25 %	50 %	25 %	0 %	406593157
5074	NC_018626	GCA	2	6	239136	239141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406593157
5075	NC_018626	ACTA	2	8	239312	239319	50 %	25 %	0 %	25 %	406593157
5076	NC_018626	GGA	2	6	239447	239452	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406593157
5077	NC_018626	AGGC	2	8	239470	239477	25 %	0 %	50 %	25 %	406593157
5078	NC_018626	AAG	2	6	239548	239553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406593157
5079	NC_018626	T	7	7	239576	239582	0 %	100 %	0 %	0 %	406593157
5080	NC_018626	ATTATA	2	12	239662	239673	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5081	NC_018626	A	6	6	239698	239703	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5082	NC_018626	TAT	2	6	239762	239767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5083	NC_018626	ATAA	2	8	239803	239810	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5084	NC_018626	A	6	6	239880	239885	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5085	NC_018626	GCA	2	6	239898	239903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5086	NC_018626	GCA	2	6	239908	239913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5087	NC_018626	CAA	2	6	239966	239971	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406593158
5088	NC_018626	GTTT	2	8	239981	239988	0 %	75 %	25 %	0 %	406593158
5089	NC_018626	CTTT	2	8	239998	240005	0 %	75 %	0 %	25 %	406593158
5090	NC_018626	TTC	2	6	240024	240029	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406593158
5091	NC_018626	TG	3	6	240041	240046	0 %	50 %	50 %	0 %	406593158
5092	NC_018626	TAAAA	2	10	240080	240089	80 %	20 %	0 %	0 %	406593158
5093	NC_018626	T	6	6	240125	240130	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5094	NC_018626	TCA	2	6	240132	240137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406593159
5095	NC_018626	GAA	2	6	240161	240166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406593159
5096	NC_018626	A	6	6	240366	240371	100 %	0 %	0 %	0 %	406593159
5097	NC_018626	A	6	6	240391	240396	100 %	0 %	0 %	0 %	406593159
5098	NC_018626	TAG	2	6	240497	240502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406593159
5099	NC_018626	T	6	6	240601	240606	0 %	100 %	0 %	0 %	406593159
5100	NC_018626	AAAT	2	8	240620	240627	75 %	25 %	0 %	0 %	406593159
5101	NC_018626	TCT	2	6	240670	240675	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406593159
5102	NC_018626	GAG	2	6	240701	240706	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406593159
5103	NC_018626	CTT	2	6	240709	240714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406593159
5104	NC_018626	GTTT	2	8	240853	240860	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5105	NC_018626	TAG	2	6	240921	240926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5106	NC_018626	A	7	7	241013	241019	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5107	NC_018626	AG	3	6	241055	241060	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5108	NC_018626	TAT	2	6	241071	241076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5109	NC_018626	TCAT	2	8	241083	241090	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5110	NC_018626	ATA	2	6	241098	241103	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5111	NC_018626	CGT	2	6	241119	241124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406593160
5112	NC_018626	GAA	2	6	241156	241161	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406593160
5113	NC_018626	ATC	2	6	241203	241208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406593160
5114	NC_018626	TAT	2	6	241240	241245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406593160
5115	NC_018626	GAG	2	6	241255	241260	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406593160
5116	NC_018626	GAT	2	6	241279	241284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406593160
5117	NC_018626	TCAGT	2	10	241310	241319	20 %	40 %	20 %	20 %	406593160
5118	NC_018626	TTG	2	6	241384	241389	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406593160
5119	NC_018626	CAT	2	6	241501	241506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406593160
5120	NC_018626	ATT	2	6	241511	241516	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406593160
5121	NC_018626	GTTT	2	8	241622	241629	0 %	75 %	25 %	0 %	406593160
5122	NC_018626	AGG	2	6	241648	241653	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406593160
5123	NC_018626	TG	3	6	241706	241711	0 %	50 %	50 %	0 %	406593160
5124	NC_018626	ATT	2	6	241746	241751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406593160
5125	NC_018626	TTC	2	6	241807	241812	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406593160
5126	NC_018626	AGA	2	6	241820	241825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406593160
5127	NC_018626	TGA	2	6	241855	241860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406593160
5128	NC_018626	TTG	2	6	241905	241910	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406593160
5129	NC_018626	CGG	2	6	241912	241917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406593160
5130	NC_018626	TTG	2	6	241923	241928	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406593160
5131	NC_018626	ATT	2	6	241958	241963	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406593160
5132	NC_018626	ATG	2	6	242060	242065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406593160
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5138	NC_018626	AT	3	6	242286	242291	50 %	50 %	0 %	0 %	406593160
5139	NC_018626	TGA	2	6	242410	242415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406593160
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5141	NC_018626	ATT	2	6	242435	242440	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406593160
5142	NC_018626	TGA	2	6	242479	242484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406593160
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5144	NC_018626	TTA	2	6	242555	242560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406593160
5145	NC_018626	TTTAG	2	10	242599	242608	20 %	60 %	20 %	0 %	406593160
5146	NC_018626	TGT	2	6	242619	242624	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5147	NC_018626	AG	3	6	242669	242674	50 %	0 %	50 %	0 %	406593161
5148	NC_018626	T	7	7	242700	242706	0 %	100 %	0 %	0 %	406593161
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5156	NC_018626	ATCG	2	8	243120	243127	25 %	25 %	25 %	25 %	406593161
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5174	NC_018626	TTGAAT	2	12	243977	243988	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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5176	NC_018626	AG	3	6	244021	244026	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5177	NC_018626	T	7	7	244035	244041	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5180	NC_018626	AAG	2	6	244237	244242	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406593163
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5247	NC_018626	ATC	2	6	247561	247566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406593166
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5250	NC_018626	AAT	2	6	247767	247772	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406593167
5251	NC_018626	TCA	2	6	247804	247809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406593167
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5260	NC_018626	TATT	2	8	248244	248251	25 %	75 %	0 %	0 %	406593168
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5359	NC_018626	T	6	6	253144	253149	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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