MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Chlamydia psittaci CP3 chromosome

Total Repeats: 789

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018625	GAAAA	2	10	3352	3361	80 %	0 %	20 %	0 %	406591808
2	NC_018625	AGGAG	2	10	4410	4419	40 %	0 %	60 %	0 %	406591809
3	NC_018625	TGTTT	2	10	6758	6767	0 %	80 %	20 %	0 %	406591811
4	NC_018625	AACAT	2	10	7322	7331	60 %	20 %	0 %	20 %	406591812
5	NC_018625	AAGAA	2	10	9567	9576	80 %	0 %	20 %	0 %	406591814
6	NC_018625	ATAAA	2	10	13042	13051	80 %	20 %	0 %	0 %	406591815
7	NC_018625	AACTC	2	10	13486	13495	40 %	20 %	0 %	40 %	406591815
8	NC_018625	GTTTT	2	10	13556	13565	0 %	80 %	20 %	0 %	406591815
9	NC_018625	GAAAC	2	10	14324	14333	60 %	0 %	20 %	20 %	406591816
10	NC_018625	AACAA	2	10	15353	15362	80 %	0 %	0 %	20 %	406591816
11	NC_018625	AATAG	2	10	17065	17074	60 %	20 %	20 %	0 %	406591818
12	NC_018625	GCCGT	2	10	18923	18932	0 %	20 %	40 %	40 %	406591821
13	NC_018625	GCCTA	2	10	19901	19910	20 %	20 %	20 %	40 %	406591821
14	NC_018625	AGTGT	2	10	21115	21124	20 %	40 %	40 %	0 %	406591822
15	NC_018625	GCCAC	2	10	29444	29453	20 %	0 %	20 %	60 %	406591826
16	NC_018625	ATAAA	2	10	34278	34287	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018625	TCTAG	2	10	37996	38005	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
18	NC_018625	AAGGA	2	10	38569	38578	60 %	0 %	40 %	0 %	406591838
19	NC_018625	CCATA	2	10	38776	38785	40 %	20 %	0 %	40 %	406591838
20	NC_018625	CTTTA	2	10	38942	38951	20 %	60 %	0 %	20 %	406591838
21	NC_018625	CTTTC	2	10	43206	43215	0 %	60 %	0 %	40 %	406591845
22	NC_018625	ACAAA	2	10	43868	43877	80 %	0 %	0 %	20 %	406591846
23	NC_018625	TATGG	2	10	44278	44287	20 %	40 %	40 %	0 %	406591847
24	NC_018625	TCTTT	2	10	46087	46096	0 %	80 %	0 %	20 %	406591849
25	NC_018625	AGCCC	2	10	47084	47093	20 %	0 %	20 %	60 %	406591850
26	NC_018625	TCAAA	2	10	47439	47448	60 %	20 %	0 %	20 %	406591850
27	NC_018625	TCTAT	2	10	49558	49567	20 %	60 %	0 %	20 %	406591852
28	NC_018625	TTTGG	2	10	51472	51481	0 %	60 %	40 %	0 %	406591852
29	NC_018625	TTTTG	2	10	52481	52490	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018625	TTTTC	2	10	55341	55350	0 %	80 %	0 %	20 %	406591856
31	NC_018625	GTAAG	2	10	57389	57398	40 %	20 %	40 %	0 %	406591859
32	NC_018625	TCTTT	2	10	59405	59414	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NC_018625	AAAAT	2	10	60211	60220	80 %	20 %	0 %	0 %	406591861
34	NC_018625	TAGTT	2	10	62813	62822	20 %	60 %	20 %	0 %	406591861
35	NC_018625	GAATG	2	10	62829	62838	40 %	20 %	40 %	0 %	406591861
36	NC_018625	TCCTA	2	10	64878	64887	20 %	40 %	0 %	40 %	406591863
37	NC_018625	AGAAA	2	10	70134	70143	80 %	0 %	20 %	0 %	406591867
38	NC_018625	GGATA	2	10	70941	70950	40 %	20 %	40 %	0 %	406591868
39	NC_018625	CACTT	2	10	71124	71133	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
40	NC_018625	ATAGC	2	10	74380	74389	40 %	20 %	20 %	20 %	406591872
41	NC_018625	GCACA	2	10	77213	77222	40 %	0 %	20 %	40 %	406591874
42	NC_018625	AATTT	2	10	77737	77746	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018625	AAAGA	2	10	78166	78175	80 %	0 %	20 %	0 %	406591875
44	NC_018625	AGTTC	2	10	79171	79180	20 %	40 %	20 %	20 %	406591875
45	NC_018625	CGTAT	2	10	81544	81553	20 %	40 %	20 %	20 %	406591878
46	NC_018625	GAAAA	2	10	82754	82763	80 %	0 %	20 %	0 %	406591879
47	NC_018625	AGGAA	2	10	84753	84762	60 %	0 %	40 %	0 %	406591882
48	NC_018625	CTTTT	2	10	85642	85651	0 %	80 %	0 %	20 %	406591884
49	NC_018625	CAAAG	2	10	87113	87122	60 %	0 %	20 %	20 %	406591886
50	NC_018625	AACAA	2	10	87280	87289	80 %	0 %	0 %	20 %	406591886
51	NC_018625	AGAAA	2	10	87350	87359	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018625	AAAGA	2	10	89185	89194	80 %	0 %	20 %	0 %	406591889
53	NC_018625	TTTTC	2	10	90200	90209	0 %	80 %	0 %	20 %	406591889
54	NC_018625	AGGAT	2	10	90723	90732	40 %	20 %	40 %	0 %	406591889
55	NC_018625	ATAAC	2	10	90809	90818	60 %	20 %	0 %	20 %	406591889
56	NC_018625	TGGCA	2	10	93294	93303	20 %	20 %	40 %	20 %	406591890
57	NC_018625	AATTA	2	10	93958	93967	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018625	TGTTT	2	10	95020	95029	0 %	80 %	20 %	0 %	406591893
59	NC_018625	TCACC	2	10	96594	96603	20 %	20 %	0 %	60 %	406591894
60	NC_018625	AAAAT	2	10	96729	96738	80 %	20 %	0 %	0 %	406591894
61	NC_018625	TTAAT	2	10	97773	97782	40 %	60 %	0 %	0 %	406591895
62	NC_018625	ATTTG	2	10	98955	98964	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018625	AAAAT	2	10	99676	99685	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018625	ATTAC	2	10	102904	102913	40 %	40 %	0 %	20 %	406591903
65	NC_018625	CTACA	2	10	103278	103287	40 %	20 %	0 %	40 %	406591903
66	NC_018625	AATTA	2	10	104825	104834	60 %	40 %	0 %	0 %	406591905
67	NC_018625	CTATA	2	10	105815	105824	40 %	40 %	0 %	20 %	406591906
68	NC_018625	CTTTT	2	10	108357	108366	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
69	NC_018625	AGCTT	2	10	108468	108477	20 %	40 %	20 %	20 %	406591910
70	NC_018625	GTTTG	2	10	108775	108784	0 %	60 %	40 %	0 %	406591910
71	NC_018625	AGTTA	2	10	115580	115589	40 %	40 %	20 %	0 %	406591925
72	NC_018625	AGTTT	2	10	116070	116079	20 %	60 %	20 %	0 %	406591926
73	NC_018625	TTTAC	2	10	119182	119191	20 %	60 %	0 %	20 %	406591931
74	NC_018625	AATTA	2	10	122075	122084	60 %	40 %	0 %	0 %	406591934
75	NC_018625	CTTTT	2	10	122872	122881	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
76	NC_018625	AGATG	2	10	123429	123438	40 %	20 %	40 %	0 %	406591936
77	NC_018625	GTCAA	2	10	124747	124756	40 %	20 %	20 %	20 %	406591938
78	NC_018625	TAGGG	2	10	127219	127228	20 %	20 %	60 %	0 %	406591941
79	NC_018625	AACTT	2	10	128151	128160	40 %	40 %	0 %	20 %	406591941
80	NC_018625	TTCTT	2	10	131356	131365	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
81	NC_018625	TGTCA	2	10	132037	132046	20 %	40 %	20 %	20 %	406591944
82	NC_018625	AAAAG	2	10	135443	135452	80 %	0 %	20 %	0 %	406591946
83	NC_018625	TAAAA	2	10	135724	135733	80 %	20 %	0 %	0 %	406591946
84	NC_018625	GATTT	2	10	137983	137992	20 %	60 %	20 %	0 %	406591948
85	NC_018625	TTGTT	2	10	138325	138334	0 %	80 %	20 %	0 %	406591948
86	NC_018625	AAGAA	2	10	138806	138815	80 %	0 %	20 %	0 %	406591948
87	NC_018625	TTCTT	2	10	139399	139408	0 %	80 %	0 %	20 %	406591950
88	NC_018625	CTTTG	2	10	141303	141312	0 %	60 %	20 %	20 %	406591952
89	NC_018625	AGAAA	2	10	143340	143349	80 %	0 %	20 %	0 %	406591955
90	NC_018625	AAAGA	2	10	146005	146014	80 %	0 %	20 %	0 %	406591957
91	NC_018625	TTTTA	2	10	148184	148193	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018625	TACTC	2	10	149636	149645	20 %	40 %	0 %	40 %	406591964
93	NC_018625	CGTTT	2	10	149683	149692	0 %	60 %	20 %	20 %	406591964
94	NC_018625	ATTTT	2	10	149823	149832	20 %	80 %	0 %	0 %	406591964
95	NC_018625	ACCAT	2	10	151854	151863	40 %	20 %	0 %	40 %	406591965
96	NC_018625	CAGAA	2	10	152819	152828	60 %	0 %	20 %	20 %	406591966
97	NC_018625	TTCAT	2	10	153389	153398	20 %	60 %	0 %	20 %	406591966
98	NC_018625	AAAGG	2	10	154219	154228	60 %	0 %	40 %	0 %	406591967
99	NC_018625	ATAGG	2	10	155911	155920	40 %	20 %	40 %	0 %	406591969
100	NC_018625	TTTGA	2	10	155997	156006	20 %	60 %	20 %	0 %	406591969
101	NC_018625	AAGGT	2	10	160938	160947	40 %	20 %	40 %	0 %	406591972
102	NC_018625	TTTTG	2	10	161877	161886	0 %	80 %	20 %	0 %	406591974
103	NC_018625	GGGGC	2	10	162024	162033	0 %	0 %	80 %	20 %	406591974
104	NC_018625	AAATG	2	10	166430	166439	60 %	20 %	20 %	0 %	406591977
105	NC_018625	GGGGA	2	10	168205	168214	20 %	0 %	80 %	0 %	406591978
106	NC_018625	TTTTC	2	10	169255	169264	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
107	NC_018625	CTGTT	2	10	169734	169743	0 %	60 %	20 %	20 %	406591980
108	NC_018625	AATGA	2	10	169769	169778	60 %	20 %	20 %	0 %	406591980
109	NC_018625	ATTTT	2	10	173229	173238	20 %	80 %	0 %	0 %	406591985
110	NC_018625	GAGAG	2	10	173246	173255	40 %	0 %	60 %	0 %	406591985
111	NC_018625	CAAAA	2	10	173576	173585	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
112	NC_018625	CGCAT	2	10	173946	173955	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
113	NC_018625	CTAAG	2	10	181193	181202	40 %	20 %	20 %	20 %	406591992
114	NC_018625	TTTTC	2	10	181793	181802	0 %	80 %	0 %	20 %	406591992
115	NC_018625	GGTAC	2	10	183788	183797	20 %	20 %	40 %	20 %	406591994
116	NC_018625	AGGGA	2	10	186974	186983	40 %	0 %	60 %	0 %	406592000
117	NC_018625	AATGT	2	10	187383	187392	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018625	AGGAA	2	10	187997	188006	60 %	0 %	40 %	0 %	406592001
119	NC_018625	TTCTT	2	10	188376	188385	0 %	80 %	0 %	20 %	406592001
120	NC_018625	GATAA	2	10	191019	191028	60 %	20 %	20 %	0 %	406592001
121	NC_018625	CCCTT	2	10	193223	193232	0 %	40 %	0 %	60 %	406592002
122	NC_018625	TTTTA	2	10	193924	193933	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018625	TTTAT	2	10	193991	194000	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018625	AGTTA	2	10	194213	194222	40 %	40 %	20 %	0 %	406592003
125	NC_018625	TTATT	2	10	194233	194242	20 %	80 %	0 %	0 %	406592003
126	NC_018625	CCCTA	2	10	195286	195295	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
127	NC_018625	AGGGT	2	10	197156	197165	20 %	20 %	60 %	0 %	406592005
128	NC_018625	TGGAT	2	10	197597	197606	20 %	40 %	40 %	0 %	406592005
129	NC_018625	CTAAA	2	10	197654	197663	60 %	20 %	0 %	20 %	406592005
130	NC_018625	CTTTA	2	10	197957	197966	20 %	60 %	0 %	20 %	406592005
131	NC_018625	AAAAT	2	10	198134	198143	80 %	20 %	0 %	0 %	406592005
132	NC_018625	GTTTT	2	10	198636	198645	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
133	NC_018625	ATTAA	2	10	201060	201069	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_018625	TTGGT	2	10	201436	201445	0 %	60 %	40 %	0 %	406592009
135	NC_018625	AGCAA	2	10	203913	203922	60 %	0 %	20 %	20 %	406592012
136	NC_018625	ATGTG	2	10	204299	204308	20 %	40 %	40 %	0 %	406592013
137	NC_018625	TAATG	2	10	205028	205037	40 %	40 %	20 %	0 %	406592013
138	NC_018625	AAAAT	2	10	206974	206983	80 %	20 %	0 %	0 %	406592017
139	NC_018625	TGGTT	2	10	207893	207902	0 %	60 %	40 %	0 %	406592017
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269	NC_018625	AAGGA	2	10	381106	381115	60 %	0 %	40 %	0 %	406592172
270	NC_018625	GAAAA	2	10	381173	381182	80 %	0 %	20 %	0 %	406592172
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380	NC_018625	AAATA	3	15	559413	559427	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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388	NC_018625	TAAAA	2	10	572259	572268	80 %	20 %	0 %	0 %	406592366
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397	NC_018625	ACAAA	2	10	586425	586434	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
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