MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia psittaci CP3 chromosome

Total Repeats: 24876

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_018625	TACT	2	8	189980	189987	25 %	50 %	0 %	25 %	406592001
4002	NC_018625	TTC	2	6	190025	190030	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406592001
4003	NC_018625	TGT	2	6	190052	190057	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406592001
4004	NC_018625	TAGT	2	8	190072	190079	25 %	50 %	25 %	0 %	406592001
4005	NC_018625	AGCG	2	8	190112	190119	25 %	0 %	50 %	25 %	406592001
4006	NC_018625	GAA	2	6	190209	190214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406592001
4007	NC_018625	TC	3	6	190219	190224	0 %	50 %	0 %	50 %	406592001
4008	NC_018625	CAG	2	6	190239	190244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406592001
4009	NC_018625	GCCTTG	2	12	190270	190281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406592001
4010	NC_018625	TTA	2	6	190307	190312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406592001
4011	NC_018625	CGG	2	6	190319	190324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406592001
4012	NC_018625	TCT	2	6	190355	190360	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406592001
4013	NC_018625	CAC	2	6	190393	190398	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406592001
4014	NC_018625	AAG	2	6	190533	190538	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406592001
4015	NC_018625	CTT	2	6	190590	190595	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406592001
4016	NC_018625	TTAT	2	8	190674	190681	25 %	75 %	0 %	0 %	406592001
4017	NC_018625	TTC	3	9	190689	190697	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406592001
4018	NC_018625	ATG	2	6	190737	190742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406592001
4019	NC_018625	GAT	2	6	190796	190801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406592001
4020	NC_018625	GT	3	6	190826	190831	0 %	50 %	50 %	0 %	406592001
4021	NC_018625	GGT	2	6	190881	190886	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406592001
4022	NC_018625	GCA	2	6	190942	190947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406592001
4023	NC_018625	TTC	2	6	191012	191017	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406592001
4024	NC_018625	GATAA	2	10	191019	191028	60 %	20 %	20 %	0 %	406592001
4025	NC_018625	ATTT	2	8	191031	191038	25 %	75 %	0 %	0 %	406592001
4026	NC_018625	CTAT	2	8	191106	191113	25 %	50 %	0 %	25 %	406592001
4027	NC_018625	TGA	2	6	191116	191121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406592001
4028	NC_018625	TCT	2	6	191151	191156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406592001
4029	NC_018625	TAA	2	6	191210	191215	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406592001
4030	NC_018625	ACA	2	6	191222	191227	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406592001
4031	NC_018625	TTA	2	6	191253	191258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406592001
4032	NC_018625	TCT	2	6	191333	191338	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406592001
4033	NC_018625	CTT	3	9	191369	191377	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406592001
4034	NC_018625	A	6	6	191380	191385	100 %	0 %	0 %	0 %	406592001
4035	NC_018625	ATA	2	6	191443	191448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406592001
4036	NC_018625	TCA	2	6	191452	191457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406592001
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4038	NC_018625	TTAA	2	8	191514	191521	50 %	50 %	0 %	0 %	406592001
4039	NC_018625	A	6	6	191533	191538	100 %	0 %	0 %	0 %	406592001
4040	NC_018625	GAA	2	6	191545	191550	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406592001
4041	NC_018625	CAA	2	6	191566	191571	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406592001
4042	NC_018625	ATT	3	9	191591	191599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406592001
4043	NC_018625	TGG	2	6	191603	191608	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406592001
4044	NC_018625	TCA	2	6	191632	191637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406592001
4045	NC_018625	ATC	2	6	191666	191671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406592001
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4047	NC_018625	GAAA	2	8	191718	191725	75 %	0 %	25 %	0 %	406592001
4048	NC_018625	ACA	2	6	191726	191731	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406592001
4049	NC_018625	TTG	2	6	191746	191751	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4050	NC_018625	AGAT	2	8	191789	191796	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4051	NC_018625	ACG	2	6	191812	191817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4052	NC_018625	TTC	2	6	191844	191849	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406592002
4053	NC_018625	AT	3	6	191869	191874	50 %	50 %	0 %	0 %	406592002
4054	NC_018625	TCT	2	6	191899	191904	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406592002
4055	NC_018625	TGC	2	6	191934	191939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406592002
4056	NC_018625	GTG	2	6	192080	192085	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406592002
4057	NC_018625	CTT	2	6	192139	192144	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406592002
4058	NC_018625	T	6	6	192186	192191	0 %	100 %	0 %	0 %	406592002
4059	NC_018625	GAAG	2	8	192243	192250	50 %	0 %	50 %	0 %	406592002
4060	NC_018625	AAG	2	6	192299	192304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406592002
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4062	NC_018625	GTG	2	6	192467	192472	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406592002
4063	NC_018625	TTA	2	6	192526	192531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406592002
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4065	NC_018625	T	6	6	192656	192661	0 %	100 %	0 %	0 %	406592002
4066	NC_018625	TTG	2	6	192766	192771	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406592002
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4070	NC_018625	A	6	6	192872	192877	100 %	0 %	0 %	0 %	406592002
4071	NC_018625	A	6	6	192882	192887	100 %	0 %	0 %	0 %	406592002
4072	NC_018625	AGC	2	6	192909	192914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406592002
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4074	NC_018625	TAA	2	6	192987	192992	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406592002
4075	NC_018625	ATT	2	6	193003	193008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406592002
4076	NC_018625	AGGG	2	8	193016	193023	25 %	0 %	75 %	0 %	406592002
4077	NC_018625	GGA	2	6	193108	193113	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406592002
4078	NC_018625	GCA	2	6	193123	193128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406592002
4079	NC_018625	TTCA	2	8	193174	193181	25 %	50 %	0 %	25 %	406592002
4080	NC_018625	A	6	6	193200	193205	100 %	0 %	0 %	0 %	406592002
4081	NC_018625	CCCTT	2	10	193223	193232	0 %	40 %	0 %	60 %	406592002
4082	NC_018625	TGA	2	6	193251	193256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406592002
4083	NC_018625	CT	3	6	193273	193278	0 %	50 %	0 %	50 %	406592002
4084	NC_018625	TTA	2	6	193363	193368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406592002
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4086	NC_018625	GAAA	2	8	193405	193412	75 %	0 %	25 %	0 %	406592002
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4088	NC_018625	GGA	2	6	193522	193527	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406592002
4089	NC_018625	TCAT	2	8	193529	193536	25 %	50 %	0 %	25 %	406592002
4090	NC_018625	TTC	2	6	193559	193564	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406592002
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4092	NC_018625	T	6	6	193649	193654	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4093	NC_018625	CT	3	6	193714	193719	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4094	NC_018625	GTTT	2	8	193722	193729	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4095	NC_018625	TTA	2	6	193792	193797	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4096	NC_018625	GTT	2	6	193874	193879	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4097	NC_018625	TTTTA	2	10	193924	193933	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4098	NC_018625	TTC	2	6	193940	193945	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4099	NC_018625	TTTAT	2	10	193991	194000	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4100	NC_018625	T	7	7	194007	194013	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4101	NC_018625	TTC	2	6	194129	194134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406592003
4102	NC_018625	AGTTA	2	10	194213	194222	40 %	40 %	20 %	0 %	406592003
4103	NC_018625	TTATT	2	10	194233	194242	20 %	80 %	0 %	0 %	406592003
4104	NC_018625	CTG	2	6	194299	194304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406592003
4105	NC_018625	TTA	2	6	194346	194351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406592003
4106	NC_018625	AGG	2	6	194353	194358	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406592003
4107	NC_018625	ATG	2	6	194389	194394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406592003
4108	NC_018625	ATG	2	6	194431	194436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406592003
4109	NC_018625	ATTT	2	8	194437	194444	25 %	75 %	0 %	0 %	406592003
4110	NC_018625	TGA	3	9	194549	194557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406592003
4111	NC_018625	ACAATC	2	12	194579	194590	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	406592003
4112	NC_018625	TAG	2	6	194627	194632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406592003
4113	NC_018625	ATT	2	6	194724	194729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406592003
4114	NC_018625	TGT	2	6	194816	194821	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406592003
4115	NC_018625	TCA	2	6	194847	194852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406592003
4116	NC_018625	TGGG	2	8	194865	194872	0 %	25 %	75 %	0 %	406592003
4117	NC_018625	GTT	2	6	194897	194902	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406592003
4118	NC_018625	ATT	2	6	194954	194959	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406592003
4119	NC_018625	AC	3	6	194961	194966	50 %	0 %	0 %	50 %	406592003
4120	NC_018625	AAT	2	6	195015	195020	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406592003
4121	NC_018625	TTC	2	6	195058	195063	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406592003
4122	NC_018625	TCT	2	6	195092	195097	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406592003
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4252	NC_018625	TGT	2	6	200016	200021	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406592008
4253	NC_018625	TG	3	6	200122	200127	0 %	50 %	50 %	0 %	406592008
4254	NC_018625	A	6	6	200141	200146	100 %	0 %	0 %	0 %	406592008
4255	NC_018625	GGA	2	6	200185	200190	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406592008
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4264	NC_018625	AACT	2	8	200514	200521	50 %	25 %	0 %	25 %	406592008
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4372	NC_018625	TAG	2	6	205249	205254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4374	NC_018625	ACG	2	6	205364	205369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406592015
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