MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia psittaci CP3 chromosome

Total Repeats: 24876

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_018625	GCC	2	6	118514	118519	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406591929
2502	NC_018625	TC	3	6	118525	118530	0 %	50 %	0 %	50 %	406591929
2503	NC_018625	CGT	2	6	118567	118572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406591929
2504	NC_018625	AAG	2	6	118711	118716	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406591929
2505	NC_018625	T	7	7	118723	118729	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2506	NC_018625	A	6	6	118764	118769	100 %	0 %	0 %	0 %	406591930
2507	NC_018625	GTT	2	6	118809	118814	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406591930
2508	NC_018625	CAA	2	6	118832	118837	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406591930
2509	NC_018625	GTC	2	6	118922	118927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406591930
2510	NC_018625	TGC	2	6	118934	118939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406591930
2511	NC_018625	GT	3	6	119001	119006	0 %	50 %	50 %	0 %	406591930
2512	NC_018625	GTT	2	6	119067	119072	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406591930
2513	NC_018625	GAG	2	6	119150	119155	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2514	NC_018625	TTTAC	2	10	119182	119191	20 %	60 %	0 %	20 %	406591931
2515	NC_018625	AGTC	2	8	119211	119218	25 %	25 %	25 %	25 %	406591931
2516	NC_018625	ATG	2	6	119222	119227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406591931
2517	NC_018625	AAG	2	6	119323	119328	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406591931
2518	NC_018625	ATT	2	6	119360	119365	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406591931
2519	NC_018625	AGA	2	6	119419	119424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406591931
2520	NC_018625	ATC	2	6	119435	119440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406591931
2521	NC_018625	TTA	2	6	119459	119464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406591931
2522	NC_018625	ATT	2	6	119509	119514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406591931
2523	NC_018625	TGG	2	6	119557	119562	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406591931
2524	NC_018625	AAG	2	6	119595	119600	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406591931
2525	NC_018625	TAC	2	6	119698	119703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406591931
2526	NC_018625	CGT	2	6	119770	119775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406591931
2527	NC_018625	AGA	2	6	119794	119799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406591931
2528	NC_018625	AAG	2	6	119874	119879	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406591931
2529	NC_018625	A	6	6	119928	119933	100 %	0 %	0 %	0 %	406591931
2530	NC_018625	GAA	2	6	119941	119946	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406591931
2531	NC_018625	GAA	2	6	119957	119962	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406591931
2532	NC_018625	TTC	2	6	119997	120002	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406591931
2533	NC_018625	AGTT	2	8	120006	120013	25 %	50 %	25 %	0 %	406591931
2534	NC_018625	TTA	2	6	120096	120101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406591931
2535	NC_018625	A	6	6	120240	120245	100 %	0 %	0 %	0 %	406591931
2536	NC_018625	AGAA	2	8	120313	120320	75 %	0 %	25 %	0 %	406591932
2537	NC_018625	CCA	2	6	120387	120392	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406591932
2538	NC_018625	AGAA	2	8	120393	120400	75 %	0 %	25 %	0 %	406591932
2539	NC_018625	ACT	2	6	120406	120411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406591932
2540	NC_018625	CGT	2	6	120433	120438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406591932
2541	NC_018625	GAT	2	6	120450	120455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406591932
2542	NC_018625	AAG	2	6	120539	120544	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406591932
2543	NC_018625	GGT	2	6	120559	120564	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406591932
2544	NC_018625	TGG	2	6	120645	120650	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406591932
2545	NC_018625	TAT	2	6	120705	120710	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406591932
2546	NC_018625	T	8	8	120734	120741	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2547	NC_018625	ACT	2	6	120751	120756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2548	NC_018625	TTC	2	6	120836	120841	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406591933
2549	NC_018625	CAG	2	6	120928	120933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406591933
2550	NC_018625	TTG	2	6	120958	120963	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406591933
2551	NC_018625	A	6	6	121068	121073	100 %	0 %	0 %	0 %	406591933
2552	NC_018625	TAC	2	6	121220	121225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406591933
2553	NC_018625	AGA	2	6	121274	121279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406591933
2554	NC_018625	ACC	2	6	121290	121295	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406591933
2555	NC_018625	CGC	2	6	121301	121306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406591933
2556	NC_018625	CA	3	6	121313	121318	50 %	0 %	0 %	50 %	406591933
2557	NC_018625	A	7	7	121340	121346	100 %	0 %	0 %	0 %	406591933
2558	NC_018625	GAA	2	6	121530	121535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406591933
2559	NC_018625	GTT	2	6	121545	121550	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406591933
2560	NC_018625	AAG	2	6	121552	121557	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406591933
2561	NC_018625	AAG	2	6	121600	121605	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406591933
2562	NC_018625	TCT	2	6	121611	121616	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406591933
2563	NC_018625	TTC	2	6	121637	121642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406591933
2564	NC_018625	TTA	2	6	121743	121748	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406591933
2565	NC_018625	TAAA	2	8	121769	121776	75 %	25 %	0 %	0 %	406591933
2566	NC_018625	AGC	2	6	121867	121872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406591934
2567	NC_018625	TGT	2	6	121889	121894	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406591934
2568	NC_018625	T	6	6	121931	121936	0 %	100 %	0 %	0 %	406591934
2569	NC_018625	CTG	2	6	121972	121977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406591934
2570	NC_018625	AATTA	2	10	122075	122084	60 %	40 %	0 %	0 %	406591934
2571	NC_018625	AGC	2	6	122090	122095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406591934
2572	NC_018625	GAA	2	6	122112	122117	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406591934
2573	NC_018625	CTC	2	6	122146	122151	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	406591934
2574	NC_018625	CTG	2	6	122161	122166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406591934
2575	NC_018625	CTC	2	6	122173	122178	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	406591934
2576	NC_018625	AGA	2	6	122230	122235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406591934
2577	NC_018625	A	7	7	122251	122257	100 %	0 %	0 %	0 %	406591934
2578	NC_018625	TAA	2	6	122259	122264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2579	NC_018625	AGT	2	6	122277	122282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2580	NC_018625	ATC	2	6	122286	122291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2581	NC_018625	ATT	2	6	122299	122304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2582	NC_018625	GAA	2	6	122317	122322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2583	NC_018625	GAA	2	6	122329	122334	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2584	NC_018625	AAAT	2	8	122343	122350	75 %	25 %	0 %	0 %	406591935
2585	NC_018625	AGA	2	6	122360	122365	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406591935
2586	NC_018625	ATT	2	6	122373	122378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406591935
2587	NC_018625	CCT	2	6	122380	122385	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	406591935
2588	NC_018625	AATT	2	8	122393	122400	50 %	50 %	0 %	0 %	406591935
2589	NC_018625	ATT	2	6	122527	122532	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406591935
2590	NC_018625	GAA	3	9	122539	122547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406591935
2591	NC_018625	CTT	2	6	122585	122590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406591935
2592	NC_018625	AGA	2	6	122598	122603	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406591935
2593	NC_018625	TCT	2	6	122636	122641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2594	NC_018625	AGT	2	6	122665	122670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2595	NC_018625	T	6	6	122701	122706	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2596	NC_018625	ATTT	2	8	122750	122757	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2597	NC_018625	AAT	2	6	122762	122767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2598	NC_018625	ATT	2	6	122782	122787	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2599	NC_018625	TGG	2	6	122795	122800	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2600	NC_018625	CTTTT	2	10	122872	122881	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
2601	NC_018625	AAAG	2	8	122925	122932	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2602	NC_018625	T	6	6	122941	122946	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2603	NC_018625	T	6	6	122959	122964	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2604	NC_018625	T	6	6	123012	123017	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2605	NC_018625	TTTCTT	2	12	123030	123041	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2606	NC_018625	TAAT	2	8	123094	123101	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2607	NC_018625	GCG	2	6	123120	123125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2608	NC_018625	TTC	3	9	123183	123191	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2609	NC_018625	AT	3	6	123205	123210	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2610	NC_018625	AAC	2	6	123314	123319	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406591936
2611	NC_018625	AGCA	2	8	123344	123351	50 %	0 %	25 %	25 %	406591936
2612	NC_018625	TCCT	2	8	123353	123360	0 %	50 %	0 %	50 %	406591936
2613	NC_018625	AGAA	2	8	123410	123417	75 %	0 %	25 %	0 %	406591936
2614	NC_018625	AGATG	2	10	123429	123438	40 %	20 %	40 %	0 %	406591936
2615	NC_018625	ACA	2	6	123483	123488	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406591936
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2617	NC_018625	TGA	2	6	123537	123542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406591936
2618	NC_018625	CAA	2	6	123571	123576	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406591936
2619	NC_018625	AAG	2	6	123737	123742	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406591936
2620	NC_018625	TAC	2	6	123772	123777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406591936
2621	NC_018625	AGA	3	9	123842	123850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406591936
2622	NC_018625	TTG	2	6	123875	123880	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406591936
2623	NC_018625	TTG	2	6	124189	124194	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406591937
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2625	NC_018625	AGC	2	6	124273	124278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406591937
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