MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia psittaci CP3 chromosome

Total Repeats: 24876

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_018625	ATC	2	6	22878	22883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406591823
502	NC_018625	TGAT	2	8	22903	22910	25 %	50 %	25 %	0 %	406591823
503	NC_018625	AGA	2	6	22949	22954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406591823
504	NC_018625	AAC	2	6	22979	22984	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406591823
505	NC_018625	ACA	2	6	23013	23018	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406591823
506	NC_018625	ACA	2	6	23033	23038	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406591823
507	NC_018625	AAG	2	6	23047	23052	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406591823
508	NC_018625	AAG	2	6	23074	23079	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406591823
509	NC_018625	AAC	2	6	23105	23110	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406591823
510	NC_018625	GGT	2	6	23157	23162	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406591823
511	NC_018625	CAG	2	6	23172	23177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406591823
512	NC_018625	ATG	2	6	23263	23268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406591823
513	NC_018625	AGC	2	6	23280	23285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406591823
514	NC_018625	GCT	2	6	23286	23291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406591823
515	NC_018625	CTG	2	6	23377	23382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406591823
516	NC_018625	ATG	2	6	23578	23583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406591823
517	NC_018625	TTA	2	6	23596	23601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406591823
518	NC_018625	AAG	2	6	23653	23658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406591823
519	NC_018625	GA	3	6	23667	23672	50 %	0 %	50 %	0 %	406591823
520	NC_018625	TTC	2	6	23764	23769	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
521	NC_018625	T	7	7	23800	23806	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_018625	A	6	6	23884	23889	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_018625	AGA	2	6	23899	23904	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
524	NC_018625	TTG	2	6	24009	24014	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406591824
525	NC_018625	TGT	2	6	24046	24051	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406591824
526	NC_018625	AGT	2	6	24063	24068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406591824
527	NC_018625	TTG	2	6	24075	24080	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406591824
528	NC_018625	TCC	2	6	24114	24119	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	406591824
529	NC_018625	AGCT	2	8	24164	24171	25 %	25 %	25 %	25 %	406591824
530	NC_018625	TTG	2	6	24351	24356	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406591824
531	NC_018625	GAA	2	6	24361	24366	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406591824
532	NC_018625	T	6	6	24378	24383	0 %	100 %	0 %	0 %	406591824
533	NC_018625	AAAT	2	8	24501	24508	75 %	25 %	0 %	0 %	406591824
534	NC_018625	CTT	2	6	24515	24520	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406591824
535	NC_018625	AGG	2	6	24536	24541	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406591824
536	NC_018625	GTA	2	6	24549	24554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406591824
537	NC_018625	GCA	2	6	24610	24615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406591824
538	NC_018625	TTA	2	6	24619	24624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406591824
539	NC_018625	AATT	2	8	24626	24633	50 %	50 %	0 %	0 %	406591824
540	NC_018625	ATAA	2	8	24693	24700	75 %	25 %	0 %	0 %	406591824
541	NC_018625	T	8	8	24795	24802	0 %	100 %	0 %	0 %	406591824
542	NC_018625	TGT	2	6	24817	24822	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406591824
543	NC_018625	GCT	2	6	24847	24852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406591824
544	NC_018625	TAGT	2	8	24982	24989	25 %	50 %	25 %	0 %	406591824
545	NC_018625	TTG	2	6	25007	25012	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406591824
546	NC_018625	TTG	2	6	25017	25022	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406591824
547	NC_018625	ATT	2	6	25110	25115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406591824
548	NC_018625	AGC	2	6	25373	25378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406591824
549	NC_018625	TTG	2	6	25386	25391	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406591824
550	NC_018625	GAAC	2	8	25441	25448	50 %	0 %	25 %	25 %	406591824
551	NC_018625	TA	3	6	25501	25506	50 %	50 %	0 %	0 %	406591824
552	NC_018625	GCA	2	6	25507	25512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406591824
553	NC_018625	TAG	2	6	25547	25552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406591824
554	NC_018625	GA	4	8	25607	25614	50 %	0 %	50 %	0 %	406591824
555	NC_018625	TAA	2	6	25640	25645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406591824
556	NC_018625	CTT	3	9	25646	25654	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406591824
557	NC_018625	CTC	2	6	25655	25660	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	406591824
558	NC_018625	TTA	2	6	25675	25680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406591824
559	NC_018625	TTA	2	6	25750	25755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406591824
560	NC_018625	TCA	2	6	25793	25798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406591824
561	NC_018625	CCA	2	6	25813	25818	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406591824
562	NC_018625	A	6	6	25863	25868	100 %	0 %	0 %	0 %	406591824
563	NC_018625	ATTC	2	8	25880	25887	25 %	50 %	0 %	25 %	406591824
564	NC_018625	TTC	2	6	25893	25898	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406591824
565	NC_018625	TCT	2	6	25915	25920	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406591824
566	NC_018625	T	6	6	25992	25997	0 %	100 %	0 %	0 %	406591824
567	NC_018625	TTTC	2	8	26012	26019	0 %	75 %	0 %	25 %	406591824
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570	NC_018625	AAT	2	6	26115	26120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406591824
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574	NC_018625	TAAA	2	8	26471	26478	75 %	25 %	0 %	0 %	406591824
575	NC_018625	TA	3	6	26511	26516	50 %	50 %	0 %	0 %	406591824
576	NC_018625	AGA	2	6	26520	26525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406591824
577	NC_018625	ATT	2	6	26533	26538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
578	NC_018625	T	7	7	26576	26582	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
579	NC_018625	TAT	2	6	26610	26615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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581	NC_018625	ATTA	2	8	26664	26671	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
582	NC_018625	TTA	2	6	26695	26700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
583	NC_018625	A	6	6	26770	26775	100 %	0 %	0 %	0 %	406591825
584	NC_018625	CCA	2	6	26814	26819	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406591825
585	NC_018625	TTA	2	6	26821	26826	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406591825
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587	NC_018625	TGA	2	6	26907	26912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406591825
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589	NC_018625	TAA	2	6	26970	26975	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406591825
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591	NC_018625	GTA	2	6	27062	27067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406591825
592	NC_018625	CTA	2	6	27104	27109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406591825
593	NC_018625	AAC	2	6	27110	27115	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406591825
594	NC_018625	ACTT	2	8	27128	27135	25 %	50 %	0 %	25 %	406591825
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598	NC_018625	TC	3	6	27459	27464	0 %	50 %	0 %	50 %	406591825
599	NC_018625	AGA	3	9	27564	27572	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406591825
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602	NC_018625	TA	3	6	27752	27757	50 %	50 %	0 %	0 %	406591825
603	NC_018625	TGT	3	9	27789	27797	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406591825
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608	NC_018625	TGA	2	6	27975	27980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406591825
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610	NC_018625	ATG	2	6	28010	28015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406591825
611	NC_018625	TA	3	6	28051	28056	50 %	50 %	0 %	0 %	406591825
612	NC_018625	CTA	2	6	28097	28102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406591825
613	NC_018625	ACA	2	6	28105	28110	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406591825
614	NC_018625	AGC	2	6	28146	28151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406591825
615	NC_018625	GAAA	2	8	28152	28159	75 %	0 %	25 %	0 %	406591825
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618	NC_018625	GCA	2	6	28366	28371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406591825
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620	NC_018625	T	6	6	28614	28619	0 %	100 %	0 %	0 %	406591825
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625	NC_018625	AAAT	2	8	28806	28813	75 %	25 %	0 %	0 %	406591825
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